G691038


Basic Information

Item Value
gene id G691038
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 26758140 ~ 26766768 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU786790
CAGTAAATAACTTTATTCCAATCATAGCAAACATCTAAAAATGACATCACATTTGTCTACATTTCTGATATTTGGATATACAAGTTCAAATAAATCCTTCAAACTAACTTTTAAGACCTTGGAATGAGCTTTCTGAAAACATCACCATCTTACATATATAGCTATAGACAACACAGTCTGTATAGATGGCAGATAACATCTTACAAATGTTATGCATGTTCAATGAAAAGACTGCCTATTTCCTTTAGTACTAAAAAGAGTTCATGACACAGAACCATTAATGGGTTTGTTCACTTACTTTTAGGCTGTTGTTTATTGACCCAGACAGATTTAAATACATAGTTGGGTATTTCGTTTGTTTCAGCAACCTCTGACTAGCGTTTTAGAATTTCAAAAAAAAACGACTGCTTTTCCTAGGTAAAGCATTATTCAACAAAAACGATTTAACCAAAACGCATCCAATCTAATCACTGTTCCCAATTGCTCTATCAAACACGACCTAACTGGAAGTATTGCTAACAGAGATTTGATTGGAGGAGAATGAAATCAGGTAGAAACTGCATTTAAGCCAATTCTTATGAAAAACAGATGTCTGAAGTACATTATATATGATATACTAAACccaaatattatattattacatacatttaaataatacTCCTAAAGGTctatgatgtaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaactggcacATAGCACTTTATGTcaagtaaaataataaaataacttgagattgtaaataaaaaataaatgcttACTTATGTGCCAGTGGCTGGTCAGGAAGAACACATTTTATTTTGGATTATGATAAGGAAAGAGCATTAATGTTTTCTGCATTTCTTATTCAAAAATGAATAACAGATCCCTTATAAAGAGTAGGAGAGGGGATCTGAAAGGACTAAGTGATCGTAGATCACTAGTCCTACTCAGAGACGTGGCTGTTATATTTCATGTCATCCTGTCCTCTGTTATTTGTGTAGTAGGCCTACTACTGCGGAGCCTGtgtttttttcaaccactccaaacaaGAAGGGAAAATAcatctcttattattattattcacaaTGATAAAATGTTGCAGAGTGCACATACAGTATAAAAACTGTTTGGGTTGATCGACAACAGCCTAGAGAAGTGtaaaaaatcatacaaatgtGTAATTTTGGTGAAACTAACCCTGAACAATGCTGCAGTAGATGCGTACCAATCAAGACAGTTTTATTTAAGACAacaataataacaaagcaaacaGCCTAATCAATTTCTTTCTTTGCATTAGTCgtgctttaaaaaataaatgtatatattttgtgTAACTGAGTGCATGGACAGTCTACTATGAGTGCGAATGCAGGATACATAAATTATATTAATAAATACATTACATTAAATTCAATGAGTTATTGCTCAGAGGCATGTATAGGCCAATATGCAGCTAGCCATGTTCTAAATAAATGAGGTAGGCCTAATTGCAGTCATAACAACAATCCCTTTGCTACGCACTAGATAGAAACCGTGGGAATGTGGCACCATCATTGTGCTAGTTGGTACATAGGATAAAACATTGATATGACAGCTTCCAAGAGCAAGCAATCCATTTACACCATAGATCTCCAAAAAACACTGGCCAGCTTCAATGCTACAACATTTGCAAAATGGGATAAACACTAATAGCTCAATGAGCATGGTCCCAAGAACCAATGGGCTGGGacagagccagaacacacgtgGGTGAAGCAGAGTTTTGAAAATGTGTCATACTCTGATcggttagagatgatccaatcaccaatttatttttaaCAACACTCCTCATTTAGACATCACCACAAACGACGTCAaagatggcagtctcagactgaagtatgcAGCAAATGATAAGGCAGCTGAAGAATTCTGATTTGGTCGTCAGGCAAAATATTGGTACCATTGACTTacattggatttgtgccacaaatgctcaaaagttagcatttggaaacagtggccaggtaaacaaaacTAAAGCATGGATAGCTGTCgaaccttgtccatagactgatCACAGGTTAAGGAAACCTatatcattttgtaatttgggcaaactatccctttaagttaAATGGAGCATTGTGTGTCACCTCTTTCTTATGCTTCTCTAATGAGAGTTTTGAGCAATGTCTGGCATTTTCCATGCACCAGTATCACAGAtggaacaatgagacagatatataaatgtgaagcatccgcttagtgagaggaagcccagtggcagGCAGTTGGAGAAGATGGAACGAAATGGATTTTGTCCATTCTGCTAATTTTCTAATCggtgaaacatttgatctcaatacagttttctgttcccaaaactagaatctactatgaacagagtggacaaaGTTTTTTTTAGACTTTTACCCTTtgccaaaataaaaaataaagtgttCTCGAAGGACTGCAAAgacgaattgagttattgcacacgcgcacttcacagtgtaggcgttccctaacggaaatacgCTAATTCATGCTAGaatgcgccaataggatctcgctagctcatgcttggctctgcccacctccttgcttgttctgcccactatgactaatttgttcccATTTGAAACGACGTGCTGTGGTCTAccttggtttagttataaaaaAATCTTTGCCGGTATGCTCAGAACCAAAACATCATTACTCTACAATATACATGCATTCAGATGACAAGATAAATGCTCAATCTGGTACAGTCCAGAAGTAGTCTGATTAATGAGGCTGCTCAAAGTTCGACTTAATATAGAAATAATACTGAGGAGAAGATGAGTTAACTTAAAATAAAAGATTTGGGAACCCCTGAGGTAGGCAACACAAATGTAAGCTAATGTTAAATCAGTGATGGAATTACAATCAATGTCAAACTGCAGTCTTGTAACACACAGGGCAGTTAAACAACATTCCTCTTAGTCTGATCTGTGAGTCTTGCTCTGACCTGAATATGGGACTGGAATGGGAACAGGAACTGGTGAGTAAAGTGAAGGGAGAACATAAATTAAGGATCTGTATCCAACTTTGTAAAGGCCAGGTGGTATATCCATGCGACTGACACTTCTCCCTCCCTGTGCTATCAACGCTCCCTCCGTTACTACTGCCTTTCTGAACTGCCTCGACACCTTGGCCTATCAGCTGTGGAAGACCATCGCCAAGTCAAGACCTGCCACTGCAAGAACCCTGCAAATCATGCCTGAAATGAAAGGCCTCTCTGAAAATTAGCTTTCCTGGCAATGACCAAAACAAAGAAGTTAGAATAGCCTAATGAATGAAACTAACATCCATTTCTCACTGGTCAGCCAATTACAACTGCTCTTGGACATGACAGTCCTCCCATTTTTACCTGCCCTGCAGCATCCCTAAAGCCTGGGAGGTTTTATGATAAGCTGACTGTGATCAAAACCAACAAAGCCCCAGGTTCCGACGGTATGCCATAGCAGATCCTCCAAGAATTTACCTGCGAGTTGAGCCAACCCATCTCTGACATCCTCAACATATCATTCCAGCAGgggaattcctctcccagtggaAGACATCACGGTCGAGCCAATCCCAAAAGATACACCCCCTGTCAGTCGACCAACAAAACAAAGGTGTAACAAAACCTTACATTTTTCGTTATGATAAAGACAGACAGTTGTGCTAAGCTCATCATACTCTTTAAGAACCAATGGGTACATAACAAGAATTTAAATAACCGCAAACAGCTTTCCAAATCCCAAACTGTAGCTTTAGATGCTCCCAGGCTATTTACTTATTTTTCTTTGTATTGTTAGAATAAGTCCCTTGTCTGCCCCTTCATCAATGTATTTATATAGGCCTATGCCATTTGTATGGTCATGGATTTCCGTTTGTTTTAGAATAGGGGTGTAAATTAACTTTGACTAAATCATGCAGGTGAGGGTTATTGTGTTCAGTGCAAAAACTAAACGCTATCAAGATAGAAACACAGTCTTTGCAACAGGTTGAAACTATTAACTTTGTTAAATCGTGCAGTTGGTACCATGCATGCCAATGTACTACACTTcatgaatatatatataatttttactTTAAGATTGGGGACCAAGACGTTCATTCAAAAGGTAAAGTAGCCAAATGATGCACAGTTGACGTCAAACTGGAGAGGAAATTACGTTTTTCATTATGGTTGCCTGACATGCAAAAGTTCaactcagtgtttcccctaggactTTTTTCAGCAGTGGTGGCCGTGGCCAATGGCGTGGTTTTAGAGGCCCTCCAATTAGCCGCAGAGATAGCATTTAGCtttttttaaaacacattttcaccaattaaacacattttgtcatggggcccgtgagaaaatgtacagttttaaagttaatttcctgcaaataTACAAATGTTTTATACACATTTGTTCATATGCTATcggagtgactcaaacattacaagTAAATCAATGGCGGCCCCATTCCATGACATTATTTGAATTTTAGATTCTTCCTGACTGTCTAGTTATacttttggtgattgttagttctcaaagattatcTCATAaacaaatacactgagtgtacaaaacattaggaatcgcttcctaatattgagttgcacccccttttgccctcaaaacatcctcaattcatcggggcatggactctacaaggtgtcgaaagcgttccacacggatgctggcccatgttgaccccaatgctcaccacagttgtgtcaagttggctgaatgtcctttgggtggtggaccattctcaatacacacgagaaactgttgagcgtggaaaaacccagcagcgttgcagttcttgacacactcaaaccggtaaacatggcacctattaccataccatGTTCAAAAGCACTTACATATTTTGTGTTGCCTATTTACCCTCTGaagggcacacacacaatccatgtctcaattgcctcgTCAGTGGGAAGAGCATGTTTTGTACAA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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU786790 True 8607 lncRNA 0.37 2 26758140 26766768

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110529714 LOC106571503 coding downstream 155206 26599030 ~ 26602934 (-)
LOC110529713 l3hypdh coding downstream 161402 26591530 ~ 26596738 (-)
LOC110529710 LOC106571501 coding downstream 294779 26444117 ~ 26463361 (-)
cenpw LOC106571497 coding downstream 327252 26428702 ~ 26430888 (-)
LOC110529708 LOC106571496 coding downstream 332066 26422495 ~ 26426074 (-)
LOC110529723 NA coding upstream 404170 27170938 ~ 27186859 (-)
esr2a erb1 coding upstream 477791 27244559 ~ 27284491 (-)
LOC110529724 NA coding upstream 520347 27287115 ~ 27308032 (-)
LOC110529221 NA coding upstream 848232 27615000 ~ 27616094 (-)
brf1b LOC106571710 coding upstream 1057382 27824150 ~ 27951450 (-)
G691010 NA non-coding downstream 38297 26719644 ~ 26719843 (-)
G691008 NA non-coding downstream 42633 26715217 ~ 26715507 (-)
G690801 LOC106571494 non-coding downstream 372414 26384583 ~ 26385726 (-)
G690783 NA non-coding downstream 396825 26361027 ~ 26361315 (-)
G691054 NA non-coding upstream 27641 26794409 ~ 26794617 (-)
G691056 NA non-coding upstream 28069 26794837 ~ 26795095 (-)
G691465 NA non-coding upstream 120668 26887436 ~ 26887742 (-)
G691466 NA non-coding upstream 123126 26889894 ~ 26891529 (-)
G691469 NA non-coding upstream 129765 26896533 ~ 26896759 (-)
G690073 NA other downstream 766997 25990678 ~ 25991143 (-)
G690033 NA other downstream 792647 25965179 ~ 25965493 (-)
LOC110529694 LOC106571481 other downstream 952665 25801320 ~ 25805570 (-)
G689810 LOC106571475 other downstream 1093475 25664165 ~ 25664665 (-)
G691447 LOC106571509 other upstream 97442 26864210 ~ 26868078 (-)
G691747 NA other upstream 548800 27315568 ~ 27315935 (-)
G692859 NA other upstream 1348968 28115736 ~ 28116048 (-)
si:dkey-85n7.8 NA other upstream 1712049 28478817 ~ 28481944 (-)
G693383 btbd7 other upstream 1826573 28593341 ~ 28594431 (-)

Expression


Co-expression Network