XLOC_003213 (klhl26)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_003213
gene name klhl26
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 6881001 ~ 6895981 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00006330
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>TCONS_00006331
CAACTCTGACAGGTGGCCAAAACTGTAATGTGATTGGTTATGAAAGGCACACGTGATGTAAGTATTCCGTTACCCTTCCATCTCCCAAATAAAGACCATCCCAGTGAGCGAAGCAAGCAAGCAGCccttgagagagtgtgtgtgttcgcgCGCAGACCGAGCATGGTTAGCGGTAATTTGGGCTTCTGCACATGATGACCTTCCTCATCATCTTCCTCGCTGAGCATGGCGGAGTCAGATGGTGTGGAGTTCTTTGCGAATCGAGCTCAAAGCAGCATGGCTGACAACAAGAATAGCGTGCTTCGTTGTACTTTCTCAGCCCCCAGCCACAGCAGCACTCTCCTGAGGGGCTTGTCTGCATTGCGTGATCAAGGTCAGTTGCTGGATGTGGTTCTGGCCATTGACAACGAGCGCTTCGAGGTTCACAAAGCGGTTTTAGCCTCCTGCAGTGACTACTTCAGAGCCATGTTCACTGGTGGAATGAAGGAGTCGAACCAGAACACCATAGAGCTAATAGGTCTTTCGGCTAGAGGACTGAAGCACATCATTGATTTCGCCTACAGTTCTGAAGTCACCCTGGACTTGGACTGCATACAGGATGTTCTCGGTGCAGCTGTCTTTCTGCAGATGGTGCCTGTGGTGGAGCTTTGTGAGGAATTTCTCAAATCTGCCATGAGTGTCGAGACTTGTTTAAACATCGGGCAAATGGCCACCACTTTCAGTCTCTCATCTCTCAAACAGTCAGTCGATGCGTACACGTTCCGTCACTTTCTGCAAATCGCTCAGGAGGACGACTTCCTTCACATTCCAATGGAACGACTGACTTTCTTTCTTCAGAGCAACAAGTTAAAGAACTGTAGCGAGATTGACTTGTTCCATGCGGCAATCCGCTGGCTACAGCATGATGCTTCAAGACGAACTGTGGCCAGCGAAGTGCTCTGCCATGTGCGCTTCCCATTGATGCGATCGTCCGAGCTTGTGGACAGTGTCCAAATTGTCGACATCATGGTGGAAGATGTACAATGTCGACACTTTCTCCTAGAGGCCTTCAATTATCAGATACTTCCATTCCGACAACATGAAATGCAATCACCGCGAACTTCCATTCGCTCAGACATCACATCGCTAATTACTTTCGGCGGGACACCTTACACGGACAACGACCGTACAGTCAGCAGCAAAGTTTATTTTCTTCCCGACATCACAGTTCGACAATTCAAAGAGTTGACCGAAATGGAGATGGGATGCAGCCATGCCTGCGTATCGGTTCTTGACAATTTTGTGTATGTGGTGGGTGGGCAGCATTTGCAGTATCGTAGTGGAGAAGGTGCAGTTGACATCTGCTTCCGCTACGACCCGCATCTAAACCAATGGCTTCGGATTCAACCCATGCAGGAGAGCCGCATTCAGTTTCAACTCAACGTACTTGATGGTCAACTTTACGCTACTGGGGGGCGCAACAGGTCTGGCAGCTTATCATCTGTTGAATGCTATTGTCCAAAGAAGAATGAATGGACTAATGTGGACTCCCTAAAGAGGAGGATCTGGGGTCACGCCGGAGCCACCTGCGGAGACAAGCTTTACATCTCTGGAGGTTATGGAGTGTCTGTGGAAGATAAGAAGACTCTCCATTGCTATGATTCAGCCTTGGATCAGTGGGATTTCAAGTGTCCCATGAATGAACCTAGAGTTCTGCATGCTATGATCAGCGCTAACAATCGTATTTACGCTCTCGGTGGCAGAATGGATCATGTAGACCGTTGCTTTGATGTTCTTGCTGTAGAGTATTACATTCCAGAGACAGACCAATGGACAACTGTCAGTCCGATGCGTGCTGGTCAGTCAGAGGCTGGCTGCTGTTTGCTGGACAAAAAGATCTATATCGTTGGAGGATACAACTGGCATCTTAATAACGTCACAAGTATTGTGCAGGTTTATAATACTGAGACGGATGAGTGGGAAAGAGATCTTCATTTTCCAGAATCTTTTGCAGGAATAGCTTGTACGCCCATAATACTACCCCAAACAACCACTCAGCGCTGAGCACAAAATCTTTCACGATTGCTGTTTTAAGCTCAAGTTACAAGTGCCCACCTGGACAGCATAAGTAATGGAATAAATGTCTATTCATCATTAAAAAATAGACAGCGTAATGTCTTCATTTTCAAGGCATTGATGATTTAAGGTTCGAAACAGTGTACCTAAATAACATTATAGCACAAACTGTCCTTTTTGAGATTGTGCCACTTTCTATATGCTTCTCAATCCTGTGTCATGATGAAGGTTTCAAATAAGTGCCTGTGTGATTTACAATTACGACCAATAACATTGGGGAATATCTTTTTGCCCTTTTAGTAAATGCTTTAAACCCTTCAAGCTACAGGGTTTTAAAACAGGTTCTTGCTGGTGTGGCTAAATGACactagaaaacaaaacaaaacaaaaatgattcattttgaACTATTTATAACTTCAatatatacaaaaacatttatgccaaaaatcattgtAATCTAGTACAGAATCAAgtatttttctgaaaataaataagtCTTGACGGAACCCGTTGTGATCTTTTAAATTTGGTCTGAAGTTCAAATGGCTAGCTACAATTTGGACAACACGGTCGTCGACAACACTATGGACTTTTGCTAACACTTTCTGAGTTGGGTTTAGGTGTCAAATTATGAATACGTTTTCCTAATTATCCCGTTGATAACATGGAGTACCTGTCTGCTCATCTCAAGAACTTGGCACATGTTTCTTGTAAATTGCCTCAGCGTGTTACATACCTTGCCTACAAGACAGGTCTCCATCACCGCTTTGCAGGGCTAGCTTAAGCTTGTGCCAGCCCTGCATTACACTCCAAATAAACATGACCAAGAGACATGTGAATATGTGGGACATTTTGTAAAATTGCACTAACATAAAAGTATACGCAAGTAATTATATGTACAGAATGCCAGGAGTGGCAGTCTGGCACATAAGTGAAATAAGGGCTGCATTCCTGTCCAGTCTTTTTATGCTCTTCACTCGCTAACTTCCCTTCATCTTGTTCCCTCGGATGTATGTCATGGATTACATTAAGCAAGTGTCCACTACTGGTGGGAAAGCTGGATGGGTTTAAATGGATTGCACTAAACCCTTGAGCACTTGAGaactacactgttagacatttcaaagggtttttacagtaacttactggcaacactgttgccagtaagttactgtattttagatttacagtatacaactgtaaatccgtttacagcatgttactgtagtgtctgaaaatggttaactactgtaaaaacctaagttaacagttagctactgtaaaccttttaattttgtcctaaatattttataatataattttattaatattattttaatactatagacctaaaaaagacacaattacaaaatattaacaaaataaacactctttatttaaaacattggagatgcttaaaacaagcttaaaaatgtgtaaaaacattacatttcaatcattcaaaatattttaagaaaaaaaaacattgaaaatgacaaagcacattaacatacatgtacaaaactaatttaagtgtctgacctgcatattgttgagaaaaaaaaccccaattgtactaagtactactgacattaaaccagacacaattacaaaatattccattctttaaaacattaataatgcttaaagcatttaaggaaaatgtgtgaaaattacattaagcaataaaatcaacacattaaaaataaataaatcacacaaagcactagaacatacatgtacaataaaaatttaaacttctgaattgcatattgttggaaaaataaatatttgtaactattagccgactcagaaacaacccaactttaaaatattactagttctggtgtcaaatgctcaacaaggtctgaattcacatgttcaaatgcaattcatctttatttctattgcacttttacaatgtagatcaatgatgtcaaagcagcttaacatagaagttcttgtaaattgaagctgcttcagtccagttttcagaattgaagcagtaaatgtcactgctgaaagtccaaacactgaagagcaaatccaccgatccaccaatcgtagccaagtgatccagtggcgacagtggcatggaacaaacttcaccaactgacgaaagtgtagaataaaatcccttgagagataccaggctcagttgggcacgaccagttctcctctagccaaacttgtgcaaggccgcagtctaggcaccagaggcttgaaagttcacgagcgggtggtcaggctggcccattggatcaatgcggaaactcattgatcacgtgtgtcttttaggattcactcctccatgaccaccacagcatctggtcaggatttggcccagtccaggattatgaagaactctggataaggacaaacagactaacataagcatagaagaagcttgtttaaaaaaaaataaatcatatactggttaattattttgaagcatggcagctaggttggggtagttttcagctggtactgagcaactggctcctgctcataacctgctcactaccatgtttaaaagataactaaccagaatgtcctgtttatttttttccctaacaaggttttacaaaaacattgtagcatttgtgatgggttgattcactgcaggacagattagactatttgttttatgtattcctaataaactaaaactgactgaatactgataaaactattgagagtgtctcacctaatccaagttctcagttagctggtgaaagaaggataactcactgttgttcatggttgtcattctcttcagtacttctcctgctatcttctggctcactctggttgttgctgtgcattttgtttcatcctctggaattatttatacaaaaaattgtattattttatttattacaaaatatttaggcaacatgaaatggggaaaaagacatttaatacatagacaaatgcatgtatc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>TCONS_00006332
CGTCATTGTAATGTGTTGTTTTCCCGATTTTATTAAGACCGAGCATGGTTAGCGGTAATTTGGGCTTCTGCACATGATGACCTTCCTCATCATCTTCCTCGCTGAGCATGGCGGAGTCAGATGGTGTGGAGTTCTTTGCGAATCGAGCTCAAAGCAGCATGGCTGACAACAAGAATAGCGTGCTTCGTTGTACTTTCTCAGCCCCCAGCCACAGCAGCACTCTCCTGAGGGGCTTGTCTGCATTGCGTGATCAAGGTCAGTTGCTGGATGTGGTTCTGGCCATTGACAACGAGCGCTTCGAGGTTCACAAAGCGGTTTTAGCCTCCTGCAGTGACTACTTCAGAGCCATGTTCACTGGTGGAATGAAGGAGTCGAACCAGAACACCATAGAGCTAATAGGTCTTTCGGCTAGAGGACTGAAGCACATCATTGATTTCGCCTACAGTTCTGAAGTCACCCTGGACTTGGACTGCATACAGGATGTTCTCGGTGCAGCTGTCTTTCTGCAGATGGTGCCTGTGGTGGAGCTTTGTGAGGAATTTCTCAAATCTGCCATGAGTGTCGAGACTTGTTTAAACATCGGGCAAATGGCCACCACTTTCAGTCTCTCATCTCTCAAACAGTCAGTCGATGCGTACACGTTCCGTCACTTTCTGCAAATCGCTCAGGAGGACGACTTCCTTCACATTCCAATGGAACGACTGACTTTCTTTCTTCAGAGCAACAAGTTAAAGAACTGTAGCGAGATTGACTTGTTCCATGCGGCAATCCGCTGGCTACAGCATGATGCTTCAAGACGAACTGTGGCCAGCGAAGTGCTCTGCCATGTGCGCTTCCCATTGATGCGATCGTCCGAGCTTGTGGACAGTGTCCAAATTGTCGACATCATGGTGGAAGATGTACAATGTCGACACTTTCTCCTAGAGGCCTTCAATTATCAGATACTTCCATTCCGACAACATGAAATGCAATCACCGCGAACTTCCATTCGCTCAGACATCACATCGCTAATTACTTTCGGCGGGACACCTTACACGGACAACGACCGTACAGTCAGCAGCAAAGTTTATTTTCTTCCCGACATCACAGTTCGACAATTCAAAGAGTTGACCGAAATGGAGATGGGATGCAGCCATGCCTGCGTATCGGTTCTTGACAATTTTGTGTATGTGGTGGGTGGGCAGCATTTGCAGTATCGTAGTGGAGAAGGTGCAGTTGACATCTGCTTCCGCTACGACCCGCATCTAAACCAATGGCTTCGGATTCAACCCATGCAGGAGAGCCGCATTCAGTTTCAACTCAACGTACTTGATGGTCAACTTTACGCTACTGGGGGGCGCAACAGGTCTGGCAGCTTATCATCTGTTGAATGCTATTGTCCAAAGAAGAATGAATGGACTAATGTGGACTCCCTAAAGAGGAGGATCTGGGGTCACGCCGGAGCCACCTGCGGAGACAAGCTTTACATCTCTGGAGGTTATGGAGTGTCTGTGGAAGATAAGAAGACTCTCCATTGCTATGATTCAGCCTTGGATCAGTGGGATTTCAAGTGTCCCATGAATGAACCTAGAGTTCTGCATGCTATGATCAGCGCTAACAATCGTATTTACGCTCTCGGTGGCAGAATGGATCATGTAGACCGTTGCTTTGATGTTCTTGCTGTAGAGTATTACATTCCAGAGACAGACCAATGGACAACTGTCAGTCCGATGCGTGCTGGTCAGTCAGAGGCTGGCTGCTGTTTGCTGGACAAAAAGATCTATATCGTTGGAGGATACAACTGGCATCTTAATAACGTCACAAGTATTGTGCAGGTTTATAATACTGAGACGGATGAGTGGGAAAGAGATCTTCATTTTCCAGAATCTTTTGCAGGAATAGCTTGTACGCCCATAATACTACCCCAAACAACCACTCAGCGCTGAGCACAAAATCTTTCACGATTGCTGTTTTAAGCTCAAGTTACAAGTGCCCACCTGGACAGCATAAGTAATGGAATAAATGTCTATTCATCATTAAAAAATAGACAGCGTAATGTCTTCATTTTCAAGGCATTGATGATTTAAGGTTCGAAACAGTGTACCTAAATAACATTATAGCACAAACTGTCCTTTTTGAGATTGTGCCACTTTCTATATGCTTCTCAATCCTGTGTCATGATGAAGGTTTCAAATAAGTGCCTGTGTGATTTACAATTACGACCAATAACATTGGGGAATATCTTTTTGCCCTTTTAGTAAATGCTTTAAACCCTTCAAGCTACAGGGTTTTAAAACAGGTTCTTGCTGGTGTGGCTAAATGACactagaaaacaaaacaaaacaaaaatgattcattttgaACTATTTATAACTTCAatatatacaaaaacatttatgccaaaaatcattgtAATCTAGTACAGAATCAAgtatttttctgaaaataaataagtCTTGACGGAA

Function

symbol description
klhl26 Orthologous to human KLHL26 (kelch like family member 26).

GO: NA

KEGG:

id description
ko04121 Ubiquitin system

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-030131-5975 Orthologous to human KLHL26 (kelch like family member 26).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000053876

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00006330 False 928 mRNA 0.49 4 6881001 6889563
TCONS_00006331 False 7453 mRNA 0.39 4 6882049 6895981
TCONS_00006332 True 2444 mRNA 0.45 3 6882362 6891090

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_003211 rab3ab coding upstream 30408 6819050 ~ 6850593 (+)
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XLOC_003209 pde4cb coding upstream 86857 6684968 ~ 6794144 (+)
XLOC_003208 CR381534.1 coding upstream 202792 6658656 ~ 6678209 (+)
XLOC_003214 crtc1b coding downstream 6325 6902306 ~ 6958042 (+)
XLOC_003215 FQ976909.1 coding downstream 50610 6946591 ~ 6956379 (+)
XLOC_003216 CR925817.1 coding downstream 199195 7095176 ~ 7103536 (+)
XLOC_003217 NA coding downstream 253090 7149071 ~ 7152007 (+)
XLOC_003218 CU929070.2 coding downstream 254839 7150820 ~ 7150906 (+)
XLOC_003250 BX324177.11 misc downstream 4449822 11345803 ~ 11346099 (+)
XLOC_003255 BX324177.14 misc downstream 4476905 11372886 ~ 11373182 (+)
XLOC_003257 BX324177.13 misc downstream 4490381 11386362 ~ 11386658 (+)
XLOC_003260 BX324177.2 misc downstream 4522052 11418033 ~ 11418323 (+)
XLOC_003262 BX324177.15 misc downstream 4533412 11429393 ~ 11429689 (+)
XLOC_003206 NA non-coding upstream 238514 6636422 ~ 6642487 (+)
XLOC_003205 NA non-coding upstream 367983 6460624 ~ 6513018 (+)
XLOC_003224 NA non-coding downstream 385258 7281239 ~ 7286310 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000057_04473417_04481843 KLHL26 coding CI01000057 null 4473222 ~ 4481894 (+)
bowfin (Amia calva) AMCG00006104 klhl26,LOC106613638,LOC106573902 coding CM030142.1 CM030142.1 15947208 ~ 15957100 (+)