XLOC_035502


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_035502
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 13756013 ~ 13760915 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00072161
gatctcatgactGTGACGCAGCTTAAAAAATTAGTTTCTAACTGGAAGTATAAATTTGCTCGAAATTAGGCgaaaacaaacaattttcactttttagtgaaatatttgtgtcctaatagtgtttttagcagtgtgggacacatatacgaccgtcaacagctcaaaaaaaggTGTTTTACTGTTTTGTGAGCCTGTAAGTGCAAgtacttaaataattttatatttaggtCATTACTATAACCTTTTAAGCGAATTCTACTTTTTTGTAGACAAAGTTTATTGGATGAATAACTTTAAGTACAATAGAGTTTTTGTCTGATCCTGCACCTGCTCCCAACCTGACTTACTGTTCAGGCTATGGCATTTTCTCGTGGCTGCAGTTGCAGGACACTTCTGGTGagtatactgtaaacatttcaccCAGTTTTTATTTTTCGGCTGTTTGTGAATACAGGAAAACACTGTTTTAAGTATGTTTCGCTTAAAATGTATACTAAATAGTTCATGGGAGCTGTTAATGTAGACAAATGAGACACGTGATTATATTTAGAAGGACCAACTGaattaatctttttcttttttctccacaCAGATATTGTGAGGTGTTATTTGTTAGCTTGTTAAAGCTACTTGTAGTGTAAGTAAATAGTATGTTTAAATTTTGttctaaactttattttatttcattgaatACCAGGGGACTTAAAGACAGTATTAAGAGAAAAGCAATATTCTTATTTTGCAAAAGTCAACAGGCACAATGTATATTTTTACAAGAGACACATTCCAGCGCAGAGGACTCAACCTTCTGGAGAAACCAATGGGGTGATACTATACTGTTTAGTCATGGAACTATAGATCTGCTGGCGTAGTCATATGCTTGAATAACTGTCCTGGTAAAGTAGTTAAAGTGAAAGAAGATAAGGATGGACACTGGATTGCTGCAGTTTTGATGATTGAAGGTACTCCACTGATTCTTCTAAATGTTTACGGATATAATGGTCAATATAAAAAGAGAATTTAGCTGGAATGCATTTCAGAAACTATTAGAGAGTTGAAAACATTTTTCCCAACTGAAAATATGTTGGTGACTTTAATTGTGTccctgatgaatggatggatagattttcAACAAAATACGGTTATTATGAAATGAATGTATTACAAATTTTTGTATTAATACTTCCCTAATAGACGTTTGGAATCATGTTAACCCTGAAGTAAGGCAATATTCATGGATTAGACCCAATGGAAATTGTAAAACAAGAATAGATTTTTGGTTGGTAACCCaagaaatttttaaatatgttttgcaaGCTAAAATCTCTGCAGCTCCTACAACTGATCATTGTGTAATTACTGTCACACTGATCCCAGGCTCTGAAAGAACATGTAGGCAAAAATATTGGAAATTTGATGCAAACTTGTTAAAAGAAGAATATTTTTGTGACatggttaaaaaaatcttatattcaATTATGACAAATGATGAGATAAAGTGAGAATGTACTCAATTAATTATGgtaaaatattgtgtaataaGCAAAAAGAATTAGAAAAACAGCTGATAAAAGACATTAATGATTGTTGTAAAAAGGATTTATTATTAGAACCTATTAAAGAGGAAATGATTAGATTACAAACTAAATTGAACGATTTCTCCTTAAATATGGCACAAGGGGCATATATACGATTTAGAGCAAAATGGATGGAAGTTGGTGTAAAAAAACAGCTCTTATTTTAGTAGATTAGAAAAAAGTAGACAGAAATGCAATTACCACcttaaatctaaataataaaattgtaactgatccaaaagaaataagtaatgagatttttaaattttatcaaaGCCTATATTCATCATCATTTTCCATGAAAATTTCTGAGAATTTCTTCAAAAATTCTATAATTTTATTCCTAAAATTGATGAAGATTTTAAAATGATATGTGACTCTGATTTAAAAATTGAAGAACTTGATGCTGCTATTAAAAAAATGGCTTTAGGTAAATCACCAGGTCAAGATGGACTTGCAACTAACTTTTATCTTTTTTCTGGAATGATATGAGAGAAATGCTCTTTAAAGCACTAAAAGAATGTTTAGAAAGTAATACACTACTAACTACAATGAAACAGGCTATAATTATTTTCATACCTAAACCAAAAAAGACAACACTCTTATTGATAATTTAAGACCAATTACTTTACTTAACATTGATTACAAAATATTCACTCATGCATTAGCTAGTAGACTTAAAGGTGGTATAGGTAAAATTATTAGTGATACACAATCTGGGTTTCTTCCAAATCGACTAATACATAATAACATTCGCATGGTGTTAGATTTATTAGACTATTCACATTTGATAGAGGATGATGGTATAATACTATTTCTGGATTTTCTAAAAGCTTTTGATAAACTTGAACACCCTTTTGTTTTTCAGTCTCAACAATATTTTGGGTTTGGCAcaaaatttattaatattctttCAATGTTGacaatataacaaataacaagTGCTGTTTTACTTCAATCGGGTACTACAAAGAGATTTGATAACAGAAGGGGAATACGACAGAGAGATCCAGTCAGCCCCCTTCTTTCTTACTTGCTGCCGAATTATTAgcactgtatattaaaatattaagccATTAAAAGTAGATCCTTGGTAATTACACAATTAGCTGATGATACAACTTGATTTCTGAAGGACTCTAATCAAATACCGATTGCCTTAAAGTCTATATCATTGTTTTCTAATGCTTCAGggttacatttaaatttgaaaaaatgtgAGATTCTTCACAATAATACATAAAACTCATTGTATAATATCCCAATTAAAAGCTAAATAACATACTTGGGAATAACTATTACAAAAAATTTTAGGGACagggaaaataataatattcatactgttgtacagaaaaataaaaaacattaagtaGCTGGTTACAAAGAAATATTTCAATTTTGGGGagaatattattaacaaaaatggAAGCAATATCAAGATTAATCTATCCAGCATATTCCTTAGGTGTACCAGAAAGatgtattaaacaaattaacagagttcattatgagtttatttgGAACAATAAGCAACATTTAATTCGAAAAAATGATTTGGTAAAGTTATCAGAGGAAGGGGGGTTGAATGTTAGTGATTTTGGCGTTATAAATGGAGTAATGAAGTTAAAATGGTTACAAAGCTTTGTTAAAGGTGAACCGTCTTTATGGTTTAGCATcccttttcatatttttcaaaggATGGGAGGAATTTCTTTTCTTCTAAAATGTGATTTTGACTTACTAAAATTGCCATTTAAATTGTCTGGTTTTCATGCAGAAGTGTTACTATATTGGAAGATGTTGTACAAGCACAATTTTACTCCACATAATGTTATCATTTGGAATAACAGGTGTATTTTTCTACATGACaggaaatctttattttttaaagactggTTTGGCAAAGGAATTTGGAATGTAATTCATTTAATGGATGATGATGGTAATATGTTGAGCTATGATCATTTTAGGTTAAAATTCAATTGTAATTGTGCATATAGAGAATTCTCTTTGGTTGTCAAAGCTATTAATGTAGCTTTGAGGAACTTAGTTAAAGGTATAGTGCAATACTCCTCTGTAATACCTACACTAGttgatttgtttataaataattattcttttttgGATATTAAACGTAACAACAAGGTCTTGAGATCACTACTGACAAAAGAATATTTTCCTCTTCCTgttaaaagaaaagttttatCTGAGAGATTTTCTAAAGCGAACACTATTGATATTAGAAAAAGATACCTGTCATTTCCCTTGTTACCTAAAATGAAAGAagtacatttcaaaacaattaatgacATCTATCCATGTAACGAATTTCTTAGAATAAGATTTCATTTAGACAGTAATGCTTGTATTTTTTGCTTGAAAGATATAGAATCCCATGAACATCTTTTTTATAGTTGTTCCAGTGTCAAATCCTTTTGGGACAGATTGTATTAGTGGTTGATAACTAAAAATGTAACACCTGCGTTTGACTatcacattgtgaaatttggcatttttatgaaaaacaaggAAGTTAAATTTCTATGTAATAATATGTCGATTGTAGCAAAATTTTATGtacacaaatgtagatttgttaaagtttctccttgtttcaaagcatttacaaattatttcaatatattatataaatctataaaacaagtaaaaacaaaaggTGCCTTAAAGCTCTCTAAGCTTTTGTCAACATATATGGACTGACCCCTCTGAATGTAATGTATTTTCCTTTGtattatttaaggtttatttttatgttattattaatttgtactgttttgtttattataagcTGCTTGGATATAATGATATATATGTTTAACGATGGAAGTTGAAAAtgcctgtttgttttttgaagtttaaataaaaaaaaaaaagttcgtCAAGAGAATAATAAAATACGAGATTGCTAGAATATAAATGTGTCACTGTGGTATTGGATATACACaatttatcaatatatataaacatgtagcCTATCAAAAAATAGAAGTGCAAGTCACTGATGATATTTTAAGCATGAGGATTAAAATATCAGCCATACTTATTAGAGTCGAGTAAaaccattcatttatacattcattaaaGAATTTACCCATACAAAATGTCAACCTCAACACTGTCAGTGAAacatatacacacgcacgcagtacaataaagaatgaatgaataaattaggaGCAAAAATATTatgtcaatagaaaaaaaaagcatgcatcCAAAATCAAAAGAATGCTGAGTTTATACGAAGAACGAAAccggcaaaaataaataaataaataaatgaataaatacgcaaaaaaaaaaaa

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00072161 True 4903 lncRNA 0.30 1 13756013 13760915

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_035500 pimr107 coding upstream 60001 13694950 ~ 13696012 (+)
XLOC_035499 NA coding upstream 64007 13687104 ~ 13692006 (+)
XLOC_035498 NA coding upstream 158121 13518522 ~ 13597892 (+)
XLOC_035497 fut9d coding upstream 250527 13503377 ~ 13505486 (+)
XLOC_035496 jak3 coding upstream 343416 13389115 ~ 13412597 (+)
XLOC_035503 NA coding downstream 34066 13794981 ~ 13799369 (+)
XLOC_035504 doc2d coding downstream 89084 13849999 ~ 13955872 (+)
XLOC_035505 CT025854.1 coding downstream 210502 13971417 ~ 14020139 (+)
XLOC_035506 NA coding downstream 241162 14002077 ~ 14006807 (+)
XLOC_035507 ugt5e1 coding downstream 297731 14058646 ~ 14060244 (+)
XLOC_035489 NA non-coding upstream 692875 12766030 ~ 13063138 (+)
XLOC_035486 CR933523.1 non-coding upstream 1895869 11860028 ~ 11860144 (+)
XLOC_035485 NA non-coding upstream 1943849 11794658 ~ 11812164 (+)
XLOC_035509 NA non-coding downstream 480670 14241585 ~ 14246353 (+)
XLOC_035511 BX294388.1 non-coding downstream 654783 14415698 ~ 14415823 (+)

Expression


Co-expression Network