znf385b (znf385b)


Basic Information

Item Value
gene id znf385b
gene name znf385b
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 32155295 ~ 32312355 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021579542.2
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Function

symbol description
znf385b Predicted to enable nucleic acid binding activity and zinc ion binding activity. Predicted to be involved in intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator. Predicted to act upstream of or within apoptotic process. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in brain; cardiovascular system; gut; notochord; and retina. Orthologous to human ZNF385B (zinc finger protein 385B).

NR:

description
zinc finger protein 385B-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

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Neighbor

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LOC110501767 LOC106582273 coding downstream 4768 32317123 ~ 32374208 (+)
LOC110501768 LOC106582274 coding downstream 73057 32385412 ~ 32420120 (+)
LOC110501775 LOC106582275 coding downstream 118743 32431098 ~ 32607822 (+)
ttn.1 NA coding downstream 310632 32622987 ~ 32809521 (+)
LOC110502125 LOC106582208 coding downstream 499627 32811982 ~ 32816908 (+)
G1799951 NA non-coding upstream 66737 32087155 ~ 32088558 (+)
G1799909 NA non-coding upstream 146499 32008504 ~ 32008796 (+)
G1799863 ub2e3 non-coding upstream 156981 31944586 ~ 31998314 (+)
G1799871 NA non-coding upstream 198689 31951261 ~ 31956606 (+)
G1799859 NA non-coding upstream 217126 31937151 ~ 31938169 (+)
G1800724 NA non-coding downstream 498725 32811080 ~ 32811350 (+)
G1800759 NA non-coding downstream 590571 32902926 ~ 32903150 (+)
G1800761 NA non-coding downstream 605714 32918069 ~ 32918687 (+)
G1800800 NA non-coding downstream 858884 33171239 ~ 33176016 (+)
G1798597 NA other upstream 857876 31293552 ~ 31297419 (+)
G1798579 NA other upstream 863090 31246481 ~ 31292205 (+)
G1798397 NA other upstream 1264228 30888661 ~ 30891067 (+)
G1798168 NA other upstream 1609341 30500656 ~ 30545954 (+)
LOC118943632 LOC100194703 other upstream 2229913 29917773 ~ 29933035 (+)
G1800754 NA other downstream 598438 32910793 ~ 32914182 (+)
LOC110501795 LOC106596205 other downstream 3428084 35740427 ~ 35760519 (+)
G1804873 NA other downstream 3562207 35874562 ~ 35875452 (+)
G1805191 NA other downstream 4051241 36363596 ~ 36363930 (+)

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