fndc3a (LOC106581557)


Basic Information

Item Value
gene id fndc3a
gene name LOC106581557
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 46579620 ~ 46761993 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036965065.1
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>TU2387809
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>TU2387787
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>TU2387789
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>TU2387811
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LOC110508109 LOC105029023 coding upstream 230053 46203597 ~ 46349567 (+)
foxo1a LOC106581554 coding upstream 787825 45703165 ~ 45791795 (+)
mlnr LOC106581570 coding downstream 16095 46774412 ~ 46783031 (+)
zgc:153184 LOC106581572 coding downstream 63610 46821927 ~ 46897922 (+)
LOC110508118 cssa20h3orf52 coding downstream 148533 46906850 ~ 46930260 (+)
guca1c LOC106581568 coding downstream 188553 46946870 ~ 46959779 (+)
LOC110508116 thrsp coding downstream 212970 46971287 ~ 46972031 (+)
G2087664 NA non-coding upstream 33731 46545496 ~ 46545889 (+)
G2087659 NA non-coding upstream 43492 46535508 ~ 46536128 (+)
G2087654 NA non-coding upstream 54105 46510111 ~ 46525515 (+)
G2087799 NA non-coding downstream 58776 46817093 ~ 46820232 (+)
G2087812 NA non-coding downstream 83738 46842055 ~ 46848568 (+)
G2087829 NA non-coding downstream 142286 46900603 ~ 46903258 (+)
G2087833 NA non-coding downstream 157050 46915367 ~ 46915941 (+)
G2087836 NA non-coding downstream 159580 46917897 ~ 46918268 (+)
G2087592 LOC106592078 other upstream 82733 46493922 ~ 46499497 (+)
G2087569 NA other upstream 255926 46323084 ~ 46323694 (+)
G2087149 NA other upstream 781027 45797099 ~ 45798593 (+)
mtus2b LOC106593344 other upstream 1049681 45493223 ~ 45664305 (+)
LOC110508103 LOC106581548 other upstream 1091883 45480328 ~ 45487737 (+)
G2087865 NA other downstream 268802 47027119 ~ 47028563 (+)
prcp prcp other downstream 278725 47020501 ~ 47056921 (+)
G2088729 NA other downstream 767123 47525440 ~ 47528548 (+)
G2088732 NA other downstream 774105 47532422 ~ 47537945 (+)
G2088870 NA other downstream 1095789 47854106 ~ 47864829 (+)
LOC118944696 NA coding upstream 13177 46742996 ~ 46745025 (+)
G2087756 NA non-coding upstream 48322 46708908 ~ 46709880 (+)
G2087704 NA non-coding upstream 120779 46636620 ~ 46637423 (+)
G2087656 NA non-coding upstream 232850 46511535 ~ 46525352 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_008949 fndc3a coding NC_007126.7 CM002899.2 2987593 ~ 3078600 (-)