LOC118944696


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944696
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 46742996 ~ 46745025 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005039994.1
gtagacagaggacaatagaggcaggttggtagcctggtaaaaccctacaggatcattagtaccagctgtagacagaggacaagagaggCAGGTTGGTAGCCTGGTAAAACCCTACAGTATCATTAGTACCAGCTGTAGACAGAGGACAAGAGGCAGGTTGGTAGCCTGGTAAAACCCTACAGGATCATTAGCCTGGAATCTCTGGATGGAAATATATGGTTTTATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGACAGAAAAGGTGTTGAGATGGTGCAGAAAGGTGTTGATAtggtgcagacagacagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgctatggtgcagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgatatggtgcagacagacaaaggtgtTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGGGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGgtgtTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATAtggtgcagacagacagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgatatggttcagacagacagaaaggtgtTGATATGGTGCAGACAGACATAAAGGTGTTGAtatggggcagacagacagaaaggtgttgatatggggcagacagacagaaaggtgtTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCCGCTTTTTTCATGTTCAAATAAGGAGACTGGCAGACGACCT
>XR_005039995.1
gtagacagaggacaatagaggcaggttggtagcctggtaaaaccctacaggatcattagtaccagctgtagacagaggacaagagaggCAGGTTGGTAGCCTGGTAAAACCCTACAGTATCATTAGTACCAGCTGTAGACAGAGGACAAGAGGCAGGTTGGTAGCCTGGTAAAACCCTACAGGATCATTAGCCTGGAATCTCTGGATGGAAATATATGGTTTTATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGACAGAAAAGGTGTTGAGATGGTGCAGAAAGGTGTTGATAtggtgcagacagacagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgtTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGGGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGgtgtTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATAtggtgcagacagacagaaaggtgttgatatggtgcagaaaggtgttgatatggttcagacagacagaaaggtgtTGATATGGTGCAGACAGACATAAAGGTGTTGAtatggggcagacagacagaaaggtgttgatatggggcagacagacagaaaggtgtTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTTCAGAAAGGTGTTGATATGGTGCCGCTTTTTTCATGTTCAAATAAGGAGACTGGCAGACGACCT

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106511947

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005039994.1 False 1149 mRNA 0.44 3 46742996 46745025
XR_005039995.1 True 1017 mRNA 0.44 3 46742996 46745025

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cysltr2b LOC106581558 coding upstream 166809 46573221 ~ 46576187 (+)
nek3 nek3 coding upstream 331829 46375319 ~ 46411167 (+)
LOC118944693 NA coding upstream 388344 46351995 ~ 46354652 (+)
LOC110508109 LOC105029023 coding upstream 393429 46203597 ~ 46349567 (+)
LOC118944695 NA coding upstream 965017 45776962 ~ 45777979 (+)
mlnr LOC106581570 coding downstream 29387 46774412 ~ 46783031 (+)
zgc:153184 LOC106581572 coding downstream 76902 46821927 ~ 46897922 (+)
LOC110508118 cssa20h3orf52 coding downstream 161825 46906850 ~ 46930260 (+)
guca1c LOC106581568 coding downstream 201845 46946870 ~ 46959779 (+)
LOC110508116 thrsp coding downstream 226262 46971287 ~ 46972031 (+)
G2087756 NA non-coding upstream 33116 46708908 ~ 46709880 (+)
G2087704 NA non-coding upstream 105573 46636620 ~ 46637423 (+)
G2087664 NA non-coding upstream 197107 46545496 ~ 46545889 (+)
G2087659 NA non-coding upstream 206868 46535508 ~ 46536128 (+)
G2087654 NA non-coding upstream 217481 46510111 ~ 46525515 (+)
fndc3a LOC106581557 non-coding downstream 13177 46579620 ~ 46761993 (+)
G2087799 NA non-coding downstream 72068 46817093 ~ 46820232 (+)
G2087812 NA non-coding downstream 97030 46842055 ~ 46848568 (+)
G2087829 NA non-coding downstream 155578 46900603 ~ 46903258 (+)
G2087833 NA non-coding downstream 170342 46915367 ~ 46915941 (+)
G2087592 LOC106592078 other upstream 246109 46493922 ~ 46499497 (+)
G2087569 NA other upstream 419302 46323084 ~ 46323694 (+)
G2087149 NA other upstream 944403 45797099 ~ 45798593 (+)
mtus2b LOC106593344 other upstream 1213057 45493223 ~ 45664305 (+)
LOC110508103 LOC106581548 other upstream 1255259 45480328 ~ 45487737 (+)
G2087865 NA other downstream 282094 47027119 ~ 47028563 (+)
prcp prcp other downstream 292017 47020501 ~ 47056921 (+)
G2088729 NA other downstream 780415 47525440 ~ 47528548 (+)
G2088732 NA other downstream 787397 47532422 ~ 47537945 (+)
G2088870 NA other downstream 1109081 47854106 ~ 47864829 (+)

Expression


Co-expression Network