LOC118944717


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944717
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 49323013 ~ 49323866 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005040013.1
gtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggtCTACGTAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAGGCAtctacgtaggtctatgggtCTACGTAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAGACATCTACGTAGGTTTGTGGGTCTACATAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAGGCAtctacgtaggtctatgggtCTACGTAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAAGCAtctacgtaggtctatgggttatgaatggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggttatgaggggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggtTATGAAGGGTTTGTAAAGCATCTACGTAGGTTTATGGGtctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaagcatctacgtagGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAGGCAtctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaggcatctacgtaggtctatgggtctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaggcatctacgtaggtctatgggtctacgtaggtctatgggtTATGAAGGGTTTGTAAAG
>TU2390856
GGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAGACATCTACGTAGGTTTGTGGGTCTACATAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAGGCAtctacgtaggtctatgggtCTACGTAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGTAAAGCAtctacgtaggtctatgggttatgaatggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggttatgaggggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggtTATGAAGGGTTTGTAAAGCATCTACGTAGGTTTATGGGtctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggttatgaagggtttgtaaagcatctacgtaggtctatgggtCTACGTAGGTTTATGGGTTATGAAGGGTTTGCAAGGCAtctacgtaggtctatgggtC

Function

NR:

description
zinc finger protein 385A-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005040013.1 False 704 mRNA 0.42 3 49323013 49323866
TU2390856 True 435 TUCP 0.42 1 49323169 49323603

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pgr LOC100846969 coding upstream 56378 49201448 ~ 49266635 (+)
trpc6b LOC106581586 coding upstream 136900 49089883 ~ 49186113 (+)
zmp:0000001236 LOC106581583 coding upstream 548332 48633372 ~ 48774681 (+)
gab2 gab2 coding upstream 698565 48460449 ~ 48624448 (+)
nars2 nars2 coding upstream 864574 48401253 ~ 48458439 (+)
LOC110508133 fbxo40 coding downstream 1142017 50465883 ~ 50476608 (+)
LOC110507254 nectin1 coding downstream 1341853 50665719 ~ 50850459 (+)
LOC110508131 LOC106613338 coding downstream 2149654 51473520 ~ 51510450 (+)
G2090100 NA non-coding upstream 908 49321853 ~ 49322105 (+)
G2090093 NA non-coding upstream 5922 49316628 ~ 49317091 (+)
G2090086 NA non-coding upstream 60039 49262567 ~ 49262974 (+)
G2090085 NA non-coding upstream 60574 49262060 ~ 49262439 (+)
G2090079 NA non-coding upstream 72174 49250602 ~ 49250839 (+)
G2090102 NA non-coding downstream 9297 49333163 ~ 49333394 (+)
G2090104 NA non-coding downstream 10409 49334275 ~ 49334820 (+)
G2090105 NA non-coding downstream 11022 49334888 ~ 49337253 (+)
G2090106 NA non-coding downstream 14671 49338537 ~ 49338934 (+)
G2090108 NA non-coding downstream 17031 49340897 ~ 49341159 (+)
G2090091 LOC106581584 other upstream 6787 49312743 ~ 49316226 (+)
G2089935 NA other upstream 264118 49058005 ~ 49058895 (+)
G2089906 NA other upstream 395721 48926975 ~ 48927292 (+)
G2089124 NA other upstream 867527 48432478 ~ 48455486 (+)
G2089020 NA other upstream 1131651 48188209 ~ 48191362 (+)
G2090103 NA other downstream 9581 49333447 ~ 49334183 (+)
G2090508 NA other downstream 461261 49782101 ~ 49788805 (+)
G2090638 NA other downstream 758197 50082063 ~ 50087691 (+)
G2091093 NA other downstream 1028502 50352368 ~ 50353167 (+)
G2091895 NA other downstream 2045898 51369764 ~ 51370763 (+)

Expression


Co-expression Network