G2085126 (LOC106581526)


Basic Information

Item Value
gene id G2085126
gene name LOC106581526
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 43739139 ~ 43743757 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2384435
aaaaaaaggtcttCCCGCACACACATTCCAAAAAGGTGTCTATAATATGGTCTGGTTGTGTTCTATTTCATTCCTTCCACAGTTCTAGAATAGAGGTTTAGTTCTAGAATAGATGTTTAGTTCTAGAATAGATGTTTAGTTCTAGAGAGAGAGTGGTCACTTGGTCACTTGAGACCTTGTAGCAGCATTagggaggcggcagggtagcctagtggttagagcgttgtgccaataaccgaaaggttgctggatcaaaatcaaccgagctgacaaggtagaaatcagtcgttaacccactgttcctaggccgtcagcGTAAATATGAAtctgttctgaactgacttgcctcgttaaataaaaaaaaaaaggttaattACCTGCTGGTCAAATGGTCCCTGGCAGGTAGGTACTGTAATGTCTACTCCAATAGTTAAGGTCTTGAGGTGAAGTCTTATGCTTTTCCCACAGACAGCCTGTCAGGTTGTTACAAGAAAAGGAgggttggagggggagggggggggggggggggttagtagCAAGCATAGAAGGCGTACAAAGATGAGTAGTTGGAGCCCGAGAAGGTCAGAGCACTGCTGCAGCTGGGTGTCCTTTAAGGGTTAAGGCTTGGACTTCAGCATGGGGCAGACAGTAGTAACACTGCCTCCGGCAGACACACTAcgagcacaaaaaaaaaaaacagacatccaGATACCTACAGCGCTtttagagggagggagaaaaaacaTTGACTCCACAGTTAGACAAAAAGGTGTGACATGTAATCTAGAAAAAGCGAGAAAAAAAAAAGTCTGTCATTTAACCCAATGTCAACCCCTACACACTTCCAATGTGGTTCTGACGAGGCAGGCTTGTAAACTCACTACAATGtaaaaaagaggggggggggggccttttGAGGCTGCAggatggtgctgagaggacactGGTCTCCCACCTTAGGTCACAAATCAATTTGGCTCATCCTTCTGAAATCATAGCATtgggctttaaaaaaaacaacaaaaaaaacaacacactGCATATAAATTATAATATTGTCATTTAAATTAAGCTATGTCAGAACTACGCTGCATGGAAAGCAATAttaaatgaaacaaaaataaaaagtcATGTGACTAGAGTAACATTAAACCCACTGATTACTATCCCCCTCCAACAAATGGTCTAaaaataaaaattttaaaaaataatttaaaagtcaAATCCATCCTTCAAAACAAATGACCTCCCATACTTTCAAAGACCAGAGTTCATCTGTAAAAAGGAACTGAAGTGTTTGTTTTAGAATACAACAAATTGATGGGTTAAACCTACAATATTGTTCACTGTATTAGTCACAAGCTCATGACCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGTtgtgtattggccaatgagaggcttttGAAGCCACTGGTCCTCCATATTAGTACAGAAGAAGCAGTCCTCCATATTAGTACAGaagaagcagtcctccataggaatgaatggaattcttcagtatttcaattaacaatGTCTCTCAAGGACAAAAATCACATGTATTTAGGAattttgttgtagtggggacagtaacattagaacttaaaacaaaaaaaattaaggTGTTTAGTTGAATATCTGTGGCAAAAACAAAATGTAGACGTTAATGCATTTCTTTAgcctccattttttttttttacaatggttGTTGACCCATGTTGTTGGCACGTGACTTCAACACAGCGCCCCCTATCAGTCATGGTGTGTATACGTATATAAATCATGGCACATTTGAGTTTAAATTGTCCTACCTTTGTGGTGACACCTGGGTAAAAACATTTTTCTCAGTCTGCGTCCTAAACGACGCACTATCCCCTGGCCGTTGACTACGACGAGGGGGCTGCGGTGACAAAATAATATAGTAGGGTATTCCATGTCTCCTATGGAGAGAGTGACAGTGAGGCACAGTGTATTCTCCTGGTGGTCAGAGCTACACTGGTTCAGATACAAAATAAGTTATCAAAACCCCCaaattaaaatttaaaaaaagacaaaagtaagaaaattaactttaaaaaaaaaaaggaaaaaaaagtgGCGGTTTGTGAGATTTCCAAGATGAAACGTAACTTTTGGAAAAATCTCTGTTCTCTTCTTAGAGAAGTCAAATAAATAGTTAGCTCCTTGGATTGGTGTGAGGGGGGGCTGGTCCCATCCTGGATGcttcttgctgtgtgtgtgtgtgtgtctcagcccAGGCAGGCTCGTGAAGGCCCATAGCTCTGGGCCAGTAGGAAGGTCTGTACCACTTCCTGTGTCTGCTGGGGACTAGTATTAACATCCTCTAGGGCGTCCGCCACAGCAAACTGCCTATCCCGGAGCTGGTTCCAGTTGGACAGGACGTTGTGATACTCAAACACCTTCTCATAGTTCCCTACTGAGTTGTAGAGTTTGATCAGCCCCCGGTAGTCGTACTCCAGACCGCTGTAGCCCT
>TU2384430
ACCAGAGTTCATCTGTAAAAAGGAACTGAAGTGTTTGTTTTAGAATACAACAAATTGATGGGTTAAACCTACAATATTGTTCACTGTATTAGTCACAAGCTCATGACCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGTCATTGATGTATAGATgctgtgtattgatgtgtagATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGTCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATgctgtgtattgatgtgtagatgctgtgtattggccattgatgtatagatgctgtgtattggccaatgatgtatagatgctgtgtattggccattgatgtatagatgatgtgtattggccattgatgtatagatgctgtgtattgatgtgtagATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGTTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGTCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGTtgtgtattggccaatgagaggcttttGAAGCCACTGGTCCTCCATATTAGTACAGAAGAAGCAGTCCTCCATATTAGTACAGaagaagcagtcctccataggaatgaatggaattcttcagtatttcaattaacaatGTCTCTCAAGGACAAAAATCACATGTATTTAGGAattttgttgtagtggggacagtaacattagaacttaaaacaaaaaaaattaaggTGTTTAGTTGAATATCTGTGGCAAAAACAAAATGTAGACGTTAATGCATTTCTTTAgcctccattttttttttttacaatggttGTTGACCCATGTTGTTGGCACGTGACTTCAACACAGCGCCCCCTATCAGTCATGGTGTGTATACGTATATAAATCATGGCACATTTGAGTTTAAATTGTCCTACCTTTGTGGTGACACCTGGGTAAAAACATTTTTCTCAGTCTGCGTCCTAAACGACGCACTATCCCCTGGCCGTTGACTACGACGAGGGGGCTGCGGTGACAAAATAATATAGTAGGGTATTCCATGTCTCCTATGGAGAGAGTGACAGTGAGGCACAGTGTATTCTCCTGGTGGTCAGAGCTACACTGGTTCAGATACAAAATAAGTTATCAAAACCCCCaaattaaaatttaaaaaaagacaaaagtaagaaaattaactttaaaaaaaaaaaggaaaaaaaagtgGCGGTTTGTGAGATTTCCAAGATGAAACGTAACTTTTGGAAAAATCTCTGTTCTCTTCTTAGAGAAGTCAAATAAATAGTTAGCTCCTTGGATTGGTGTGAGGGGGGGCTGGTCCCATCCTGGATGcttcttgctgtgtgtgtgtgtgtgtctcagcccAGGCAGGCTCGTGAAGGCCCATAGCTCTGGGCCAGTAGGAAGGTCTGTACCACTTCCTGTGTCTGCTGGGGACTAGTATTAACATCCTCTAGGGCGTCCGCCACAGCAAACTGCCTATCCCGGAGCTGGTTCCAGTTGGACAGGACGTTGTGATACTCAAACACCTTCTCATAGTTCCCTACTGAGTTGTAGAGTTTGATCAGCCCCCGGTAGTCGTACTCCAGACCGCTGTAGCCCT
>TU2384433
ACCAGAGTTCATCTGTAAAAAGGAACTGAAGTGTTTGTTTTAGAATACAACAAATTGATGGGTTAAACCTACAATATTGTTCACTGTATTAGTCACAAGCTCATGACCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGTCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATgctgtgtattgatgtgtagatgctgtgtattggccattgatgtatagatgctgtgtattggccaatgatgtatagatgctgtgtattggccattgatgtatagatgatgtgtattggccattgatgtatagatgctgtgtattgatgtgtagATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGTtgtgtattggccaatgagaggcttttGAAGCCACTGGTCCTCCATATTAGTACAGAAGAAGCAGTCCTCCATATTAGTACAGaagaagcagtcctccataggaatgaatggaattcttcagtatttcaattaacaatGTCTCTCAAGGACAAAAATCACATGTATTTAGGAattttgttgtagtggggacagtaacattagaacttaaaacaaaaaaaattaaggTGTTTAGTTGAATATCTGTGGCAAAAACAAAATGTAGACGTTAATGCATTTCTTTAgcctccattttttttttttacaatggttGTTGACCCATGTTGTTGGCACGTGACTTCAACACAGCGCCCCCTATCAGTCATGGTGTGTATACGTATATAAATCATGGCACATTTGAGTTTAAATTGTCCTACCTTTGTGGTGACACCTGGGTAAAAACATTTTTCTCAGTCTGCGTCCTAAACGACGCACTATCCCCTGGCCGTTGACTACGACGAGGGGGCTGCGGTGACAAAATAATATAGTAGGGTATTCCATGTCTCCTATGGAGAGAGTGACAGTGAGGCACAGTGTATTCTCCTGGTGGTCAGAGCTACACTGGTTCAGATACAAAATAAGTTATCAAAACCCCCaaattaaaatttaaaaaaagacaaaagtaagaaaattaactttaaaaaaaaaaaggaaaaaaaagtgGCGGTTTGTGAGATTTCCAAGATGAAACGTAACTTTTGGAAAAATCTCTGTTCTCTTCTTAGAGAAGTCAAATAAATAGTTAGCTCCTTGGATTGGTGTGAGGGGGGGCTGGTCCCATCCTGGATGcttcttgctgtgtgtgtgtgtgtgtctcagcccAGGCAGGCTCGTGAAGGCCCATAGCTCTGGGCCAGTAGGAAGGTCTGTACCACTTCCTGTGTCTGCTGGGGACTAGTATTAACATCCTCTAGGGCGTCCGCCACAGCAAACTGCCTATCCCGGAGCTGGTTCCAGTTGGACAGGACGTTGTGATACTCAAACACCTTCTCATAGTTCCCTACTGAGTTGTAGAGTTTGATCAGCCCCCGGTAGTCGTACTCCAGACCGCTGTAGCCCT
>TU2384434
ACCAGAGTTCATCTGTAAAAAGGAACTGAAGTGTTTGTTTTAGAATACAACAAATTGATGGGTTAAACCTACAATATTGTTCACTGTATTAGTCACAAGCTCATGACCAATGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTGTAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTGTAGACGCTGTGTATTGGCCAATGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGACGCTGTGTATTGGCCATTGATGTATAGATGTtgtgtattggccaatgagaggcttttGAAGCCACTGGTCCTCCATATTAGTACAGAAGAAGCAGTCCTCCATATTAGTACAGaagaagcagtcctccataggaatgaatggaattcttcagtatttcaattaacaatGTCTCTCAAGGACAAAAATCACATGTATTTAGGAattttgttgtagtggggacagtaacattagaacttaaaacaaaaaaaattaaggTGTTTAGTTGAATATCTGTGGCAAAAACAAAATGTAGACGTTAATGCATTTCTTTAgcctccattttttttttttacaatggttGTTGACCCATGTTGTTGGCACGTGACTTCAACACAGCGCCCCCTATCAGTCATGGTGTGTATACGTATATAAATCATGGCACATTTGAGTTTAAATTGTCCTACCTTTGTGGTGACACCTGGGTAAAAACATTTTTCTCAGTCTGCGTCCTAAACGACGCACTATCCCCTGGCCGTTGACTACGACGAGGGGGCTGCGGTGACAAAATAATATAGTAGGGTATTCCATGTCTCCTATGGAGAGAGTGACAGTGAGGCACAGTGTATTCTCCTGGTGGTCAGAGCTACACTGGTTCAGATACAAAATAAGTTATCAAAACCCCCaaattaaaatttaaaaaaagacaaaagtaagaaaattaactttaaaaaaaaaaaggaaaaaaaagtgGCGGTTTGTGAGATTTCCAAGATGAAACGTAACTTTTGGAAAAATCTCTGTTCTCTTCTTAGAGAAGTCAAATAAATAGTTAGCTCCTTGGATTGGTGTGAGGGGGGGCTGGTCCCATCCTGGATGcttcttgctgtgtgtgtgtgtgtgtctcagcccAGGCAGGCTCGTGAAGGCCCATAGCTCTGGGCCAGTAGGAAGGTCTGTACCACTTCCTGTGTCTGCTGGGGACTAGTATTAACATCCTCTAGGGCGTCCGCCACAGCAAACTGCCTATCCCGGAGCTGGTTCCAGTTGGACAGGACGTTGTGATACTCAAACACCTTCTCATAGTTCCCTACTGAGTTGTAGAGTTTGATCAGCCCCCGGTAGTCGTACTCCAGACCGCTGTAGCCCT

Function

NR:

description
amyloid protein-binding protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2384435 False 2735 lncRNA 0.42 3 43739139 43743757
TU2384430 False 3187 lncRNA 0.41 2 43740459 43743757
TU2384433 False 2942 lncRNA 0.41 3 43740459 43743757
TU2384434 True 1640 lncRNA 0.42 2 43740459 43743757

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-167j9.5 LOC106581520 coding upstream 10800 43701561 ~ 43728339 (+)
usp32 LOC106581527 coding upstream 38436 43573336 ~ 43700703 (+)
LOC110508093 ift20 coding upstream 182080 43549252 ~ 43557059 (+)
LOC110508082 LOC106613355 coding upstream 445298 43193515 ~ 43293841 (+)
LOC118944687 NA coding upstream 520830 43190777 ~ 43218309 (+)
sult3st1 LOC106581508 coding downstream 35315 43779072 ~ 43799038 (+)
LOC110508083 LOC106581524 coding downstream 57345 43801102 ~ 43844791 (+)
LOC110508084 LOC105012849 coding downstream 129369 43873126 ~ 44069585 (+)
LOC118944688 NA coding downstream 152790 43896547 ~ 43898559 (+)
zgc:110333 LOC106581535 coding downstream 344834 44088591 ~ 44090215 (+)
G2085125 NA non-coding upstream 2981 43735857 ~ 43736158 (+)
G2085124 NA non-coding upstream 3598 43735316 ~ 43735541 (+)
G2085108 NA non-coding upstream 33872 43704798 ~ 43705267 (+)
G2085080 NA non-coding upstream 145668 43591180 ~ 43593471 (+)
G2085078 NA non-coding upstream 149823 43587876 ~ 43589316 (+)
G2085137 NA non-coding downstream 10610 43754367 ~ 43754854 (+)
G2085153 NA non-coding downstream 40591 43784348 ~ 43854950 (+)
G2085167 NA non-coding downstream 97864 43841621 ~ 43842239 (+)
G2085175 NA non-coding downstream 114162 43857919 ~ 43858227 (+)
G2085178 NA non-coding downstream 128406 43872163 ~ 43872432 (+)
G2085122 NA other upstream 5245 43732395 ~ 43733894 (+)
G2085037 NA other upstream 206561 43532270 ~ 43532578 (+)
G2084659 NA other upstream 674882 43063288 ~ 43064257 (+)
G2084156 NA other upstream 1477502 42260523 ~ 42261637 (+)
G2083851 NA other upstream 1627103 41971259 ~ 42112036 (+)
G2085314 NA other downstream 374466 44118223 ~ 44119239 (+)
G2085969 NA other downstream 664296 44408053 ~ 44410050 (+)
LOC110508103 LOC106581548 other downstream 1742880 45480328 ~ 45487737 (+)
mtus2b LOC106593344 other downstream 1785699 45493223 ~ 45664305 (+)
G2087149 NA other downstream 2053342 45797099 ~ 45798593 (+)

Expression


Co-expression Network