G2090508


Basic Information

Item Value
gene id G2090508
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 49782101 ~ 49788805 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2391336
caacaacacatggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacaTCTGGTAATGGGGTGTTAGATAAAACACATGACCTAACATCTGGTAAAtgggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatttggtaatggggttttagataaatcaacaacacatggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatttgataatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacacctggtaatggggttttagataaatcacCAACACatggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaagCAACAACACATGGTAACAGGGTTTTAGATAAAGGAACAACACatggtaatggggttttagataaatcaacaacacATGGTAACGGGGTTTTAGATAAAGGAACAACACatggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacaTCTGGTAATGGGTTTAggataaatcaacaacacatggtaattgggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgaccAAACATCTGGTAATTGAtttttagataaatcaacaacacatggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatttgataatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacatttgataatggggttttagataaatcaacaacacatgacCTAACATctggtaatggggttttagataaatcaacaacacatgacctaacaGCTGGTAATCTGGTTTTAGATAAAGGAACAACACatggtaatggggttttagataaagCTACAACACATGACCAAACATCTGGTAATGGagttttagataaatcaacaacacctgacctaacatctggtaatggggttttagat
>TU2391342
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>TU2391337
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Function

NR:

description
PREDICTED: proteoglycan 4-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2391336 False 1264 lncRNA 0.35 5 49782101 49788805
TU2391342 False 820 lncRNA 0.35 4 49783011 49788805
TU2391337 True 1471 TUCP 0.36 4 49785127 49788805

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944717 NA coding upstream 458235 49323013 ~ 49323866 (+)
pgr LOC100846969 coding upstream 515466 49201448 ~ 49266635 (+)
trpc6b LOC106581586 coding upstream 595988 49089883 ~ 49186113 (+)
zmp:0000001236 LOC106581583 coding upstream 1007420 48633372 ~ 48774681 (+)
gab2 gab2 coding upstream 1157653 48460449 ~ 48624448 (+)
LOC110508133 fbxo40 coding downstream 677078 50465883 ~ 50476608 (+)
LOC110507254 nectin1 coding downstream 876914 50665719 ~ 50850459 (+)
LOC110508131 LOC106613338 coding downstream 1684715 51473520 ~ 51510450 (+)
G2090497 NA non-coding upstream 9303 49756657 ~ 49772798 (+)
G2090501 NA non-coding upstream 16568 49765007 ~ 49765533 (+)
G2090499 NA non-coding upstream 23285 49757942 ~ 49758816 (+)
G2090479 NA non-coding upstream 51157 49729209 ~ 49730944 (+)
G2090454 NA non-coding upstream 92588 49688685 ~ 49689513 (+)
G2090526 NA non-coding downstream 39312 49828117 ~ 49828635 (+)
G2090529 NA non-coding downstream 51426 49840231 ~ 49840717 (+)
G2090548 NA non-coding downstream 89328 49878133 ~ 49883194 (+)
G2090551 NA non-coding downstream 100490 49889295 ~ 49895683 (+)
G2090562 NA non-coding downstream 124144 49912949 ~ 49913869 (+)
G2090103 NA other upstream 447918 49333447 ~ 49334183 (+)
G2090091 LOC106581584 other upstream 465875 49312743 ~ 49316226 (+)
G2089935 NA other upstream 723206 49058005 ~ 49058895 (+)
G2089906 NA other upstream 854809 48926975 ~ 48927292 (+)
G2090638 NA other downstream 293258 50082063 ~ 50087691 (+)
G2091093 NA other downstream 563563 50352368 ~ 50353167 (+)
G2091895 NA other downstream 1580959 51369764 ~ 51370763 (+)
G2091960 NA other downstream 1681083 51469888 ~ 51470391 (+)

Expression


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