G2091464


Basic Information

Item Value
gene id G2091464
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 50792048 ~ 50807425 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2392486
agtgtggtgtggtgtggtgatctctagagggtggtgtggtgattTCTATAggttagtgtggtgtggtgatctctagagtgtggtgtggtgtggtctctagagggtagtgtggtgtggtgatctctagagggtggtgtggtgatctctagagggtagtgtggtgatctctagagggtagtttggtgatctctagagggtagtgtggtgtggtgatctctagagggtggtgtggttatctctatagggtagtgtagtgtggtgaattctagagggtggtgtggtgatctctataggttagtgtggtgtggtgatcgctagagggtagtgtggtgtggtgatctctagagggtagtgtggtgatctctagagggtagttttgtgatctctagagggtggtgtggtgatttctagagggtagtgtggtgatatctagagggtagtgtggtgtggtgatctttataggttagtgtggtgtggtgatcgctagagtgtggtgtggtgatctctatagggtagtgtggtgatctctagagggtggtatggtgatctctagagggtagtgtggtgatctctagagggtagtgtggtgatctctataggttagtgtggtgatctctagaaggaagtgtggtgatctctagagggtggtgtggtgatctctagagggtagtgtggtgatttctagagggtagtgtggtgatttctagagggtagtgtggtgttaTGATCTCTAGAGGGCAGTGTGGTGTGGGGatatctagagggtagtgtggtgatctctagtgGGTAGTGTGGCTATCTCTTgggggtagtgtggtgatctctaagggttagtgtggtgatctctagggggtagtgtggtgatatctagagggtggtgtggtgatctctatagggtagtgtggtgtggtgatctctatagggtagtgtggtgtggtgatctctatagggtagtgtggtgatctctagagggtggtgtggtgatctctagagggtagtgtggtgatttctagagggtagtgtggtgatttCTAGAAGGTAGTGTGGTGATATCTAGatggtggtgtggtgatctctagagggtagtgtggtgatctctag
>TU2392487
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>TU2392480
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>TU2392483
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>TU2392484
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106569825, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2392486 False 1101 lncRNA 0.49 5 50792048 50807425
TU2392487 False 904 lncRNA 0.49 3 50792640 50801388
TU2392480 False 612 lncRNA 0.49 3 50794007 50807279
TU2392483 False 797 lncRNA 0.49 6 50794790 50807425
TU2392484 True 1038 lncRNA 0.49 2 50794790 50801388

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508133 fbxo40 coding upstream 315440 50465883 ~ 50476608 (+)
LOC118944717 NA coding upstream 1468182 49323013 ~ 49323866 (+)
pgr LOC100846969 coding upstream 1525413 49201448 ~ 49266635 (+)
trpc6b LOC106581586 coding upstream 1605935 49089883 ~ 49186113 (+)
zmp:0000001236 LOC106581583 coding upstream 2017367 48633372 ~ 48774681 (+)
LOC110508131 LOC106613338 coding downstream 666095 51473520 ~ 51510450 (+)
G2091459 NA non-coding upstream 17008 50774256 ~ 50775040 (+)
G2091453 NA non-coding upstream 27941 50763543 ~ 50764107 (+)
G2091448 NA non-coding upstream 34049 50757385 ~ 50757999 (+)
G2091446 NA non-coding upstream 37009 50754476 ~ 50755039 (+)
G2091444 NA non-coding upstream 37632 50753925 ~ 50754416 (+)
G2091483 NA non-coding downstream 34741 50842166 ~ 50844365 (+)
G2091410 NA non-coding downstream 54580 50862005 ~ 50869242 (+)
G2091411 NA non-coding downstream 57172 50864597 ~ 50882759 (+)
G2091488 NA non-coding downstream 62246 50869671 ~ 50870463 (+)
G2091414 NA non-coding downstream 64357 50871782 ~ 50874409 (+)
G2091093 NA other upstream 438881 50352368 ~ 50353167 (+)
G2090638 NA other upstream 704357 50082063 ~ 50087691 (+)
G2090508 NA other upstream 1003243 49782101 ~ 49788805 (+)
G2090103 NA other upstream 1457865 49333447 ~ 49334183 (+)
G2091895 NA other downstream 562339 51369764 ~ 51370763 (+)
G2091960 NA other downstream 662463 51469888 ~ 51470391 (+)

Expression


Co-expression Network