G2137814 (LOC106597294)


Basic Information

Item Value
gene id G2137814
gene name LOC106597294
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 42220922 ~ 42226965 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2444984
TGGGGGGGTGACGCGGCATTTAATGAAGCAGCTTGCTTGGTCCAAACAAAATGTTTTCTTTCAGATCAAGACATCCGTTTTACATGTCTACTGCTACAGAGGTCATCTGACACTGAGACACTTGCTCTGAACGATAGCACCAAGGATTAATGATTTATTACATAGAGGGAATTCCCtgctgacaacacacacatctgTTACCTGGAACGTTGGAGGACTGAATAATCCATCCAAGGTTGGGAGCCTTCAAGGGTTAATGAGGCTGAtacagagaggagtgtgtgtgtggttgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtcagcatctAAACAAGTGAACCCAGACAAACTGTTTATAGAGAAAATGCTACATGATATACTGGACATTAGAGACCATTcccctaaacacacacatatgTTAACAGTCTGTGTCCAGCTGTTCAGTATCTTCATTTTGACCAGGTTGTCTATAGGGAGGATGTTTAATGTTTAACTTTGATGTTTAAAACATATGGAGTGATGTCATATCCTGTTCTGTCTTTGATCTACAAACAACATAAAATAagtttgttaaaaaaaaacacacaaaaaaaaccatTATTTTACAGTAACCTTCCTGTTTAATGCTGTGTTCATGTGCTGCTTGGAAAAATCTGACTGGGAATTATGGAACTGGGAACAGTCTGACTGGGAATTATGGAACTGGGAACAGTCTGACTGGGAGATGTTACAACTTAGAAGCTCATAACAAACTGTTTTAGACATCTGAAACTAGTTTCTGTTACGGGAGTTTTTCAGGAGTTTCCCGGTTGGATGGTCCTGATAATTCAGAGAGCACATGAACACAGTGTAACACAATCTCttacacagtctgacacacaatCGTCATTATCAGACATAAAAACACAACTAAAACACAGTGATTGTAAATTAGCGACGAAGTACGAATGGACATTCATAATGAGGGAGACTAAACTCTAAAGCATGTGGTCCAAGCCCTGACCCTTGCACTCAGGCCTGGGAGACCCTGCGGGACACGGTCTGGTAGAACACGCCACGCAGCAGAGATGGGTAGTCTGGGACGCGGAACAGGTGGCGCTGGGCGTAGGTGACGTCGTAACTCCTCCCCCTGCTGACCAGCGAGCGCAGGTTGGCCTCGCTCACCTGGTTGCCCACGGTGATAACGTACAGCTCCACTCCTGCCTCCGACACCAGCCGCACGCGCTTCTCCAGCATCGCCTCGGTAACGCCCTGCGACCTCCCGTCAGAGAACAGCACCagcttcctcttcctgttcccgCCCCCTGATGTCTTGAATTGCTCCATGGCGAAGGCCATCGCCTTGGTAACGTCAGTACCGTCATTCTGGAAGATGGCGGCATCGATCTTACGGGTCAGCTCCGCCTCCATGCGGCGTTCACGGCTGTACTGGCCCACGGCGACACGCACGGCAGCGCGGCCGGACCTCTCGGCAGACAGGAAGCGCTCAGCCAGACGCTTGACGAAGGTCTTGCTGGAGTCAAAGTTCCTCTGTCCCACACTGGCTGAACTGTCCATCATCAATACGATGTCTGTGTCCCCTGAGAACGAGATGGGACATTTGTAGTTAGGACACTTCTTATcttcacAGATGCGTGTGGTGAGGTTCTGTAAGAAGCTGTCATCCAGCAGCTCAGCGAAGTTCTCCAGTACGAAGGAGAAGCCTGGTTTAGGGTCACTCGTACAGACCACAGCACTGAGCTGTTCATGGTTGGGTTGACGGCCAGAGTAGTCCTTCACTCCCAGACCTCccacCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGTGTTGAGCGGTGTTTTATCTCTGGTGATATCAGAGCGTCCGTCAGTGAGCACTAGGACCACGCGGTTCTCCTGCTGCAGGCGGTCAATCATGTTGGTCAGAGAGAACTGCAGAGCCTCCCCTGTATAGGTGGCCTCAGCCAGCCAGCGCAGGTCCCGCACTGcctgTTTAAGCTCAGTCAGTGTGTTAATGTTGGGGTCTCCCAGTCTGACAGCCTCCTGGGCCCCATCCCCACTGTACTGCACCACGCCTACCCTGGACTCATTAAAACcaaactatacacacacacacacacacacacacagacacacagacagacacacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacagacaggatgggacgttaaacgggtgtcctgactctctatGGATACTAAAGCTCCCATGGAAcatatcgtaagagtaggggtgttaatccAGGTGGCGTGGATAAATTTCCAATCtgtccctcaaaccatcatggtcatcAGGGTcaataaaacattaaaataagggttaataaaaacattaaaataag
>TU2444991
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>TU2444989
TGGGGGGGTGACGCGGCATTTAATGAAGCAGCTTGCTTGGTCCAAACAAAATGTTTTCTTTCAGATCAAGACATCCGTTTTACATGTCTACTGCTACAGAGGTCATCTGACACTGAGACACTTGCTCTGAACGATAGCACCAAGGATTAATGATTTATTACATAGAGGGAATTCCCtgctgacaacacacacatctgTTACCTGGAACGTTGGAGGACTGAATAATCCATCCAAGGTTGGGAGCCTTCAAGGGTTAATGAGGCTGAtacagagaggagtgtgtgtgtggttgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgcatgtgcgtgtgtgtgtgtaccttcacAGATGCGTGTGGTGAGGTTCTGTAAGAAGCTGTCATCCAGCAGCTCAGCGAAGTTCTCCAGTACGAAGGAGAAGCCTGGTTTAGGGTCACTCGTACAGACCACAGCACTGAGCTGTTCATGGTTGGGTTGACGGCCAGAGTAGTCCTTCACTCCCAGACCTCccacctgacagagagaggggggcagggttggtgtgtgtgtgtgcgtaagcgTGTGCATGCCTAATGGATTGTGCGTTGTTGGTCGTACTGAAGCTTGCCTCCATCCTTCGAGACAGATGCTCAAAACTGGAAATAACTGGACAGTTACTGGTGTGAAGCAGACAGGGAGGTTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCAACTTGATGTCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATACCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTACAGAGTAGTGTTCCTCACCCTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGATGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTGCAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCATGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGTCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTATTCCTCACCCTGATGCCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGCTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTATAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCAACTTGATGTCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATACCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTACAGAGTAGTGTTCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTGCAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTAACACAGAGTGGTGTCCCTCACCATGATGCCCTTCACACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGTCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTATTCCTCACCCTGATGCCCTTCCTACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGCTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCTATAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCACAGAGTGGTGTCCCTCACCTTGATGCCCTTCCCA

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2444984 False 2409 TUCP 0.49 7 42220922 42226364
TU2444991 False 1010 TUCP 0.44 2 42220922 42226965
TU2444989 True 2454 lncRNA 0.54 2 42222095 42226364

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508267 LOC106596213 coding downstream 84731 41906782 ~ 42137364 (-)
LOC110509166 LOC106596257 coding downstream 580929 41630582 ~ 41641166 (-)
znf414 znf414 coding downstream 595255 41587299 ~ 41626840 (-)
si:ch211-106k21.5 LOC106596230 coding downstream 653350 41551990 ~ 41568745 (-)
LOC110509161 rs8 coding downstream 685898 41532971 ~ 41536197 (-)
cfap410 cunh21orf2 coding upstream 134383 42360747 ~ 42368140 (-)
LOC118944818 NA coding upstream 143501 42369865 ~ 42370480 (-)
LOC110509173 NA coding upstream 174151 42400515 ~ 42410701 (-)
LOC110509174 them6 coding upstream 245527 42471891 ~ 42493837 (-)
them6 them6 coding upstream 271919 42498283 ~ 42508205 (-)
G2137751 NA non-coding downstream 182011 41974537 ~ 42040084 (-)
G2137748 NA non-coding downstream 211259 41958837 ~ 42010836 (-)
G2137749 NA non-coding downstream 246181 41966944 ~ 41975914 (-)
G2137741 NA non-coding downstream 272927 41948500 ~ 41949168 (-)
G2137729 NA non-coding downstream 305872 41912766 ~ 41916223 (-)
G2137854 NA non-coding upstream 2637 42229001 ~ 42229225 (-)
G2137868 NA non-coding upstream 51125 42277489 ~ 42277689 (-)
G2137873 NA non-coding upstream 57799 42284163 ~ 42284378 (-)
G2137874 NA non-coding upstream 60039 42286403 ~ 42286606 (-)
G2137877 NA non-coding upstream 61644 42288008 ~ 42288329 (-)
G2137648 LOC106596196 other downstream 407894 41810795 ~ 41814201 (-)
G2137555 NA other downstream 485706 41731714 ~ 41736389 (-)
G2137419 NA other downstream 960824 41260800 ~ 41261271 (-)
G2137111 NA other downstream 1746394 40472088 ~ 40475701 (-)
G2138294 LOC106594920 other upstream 122852 42349216 ~ 42351452 (-)
emilin2a LOC106595984 other upstream 1148383 43343531 ~ 43398034 (-)

Expression


Co-expression Network