G91857


Basic Information

Item Value
gene id G91857
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 284398 ~ 290696 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU123615
gtgtcattcggttttcgtcatgacaagttgacattaaattagtttgggatgtctttgtaatgaaaacttgacattaaattagtttgggatgtctttgtaatgacaacttgacattaaattagtttgggatgtctttgtaatgacaacttgacattaaattagtttgggatgtctttgtaatgacaacttgacattaatcaggATGACATCACCAGAGGATgtcttgacataatgtcatcctgttgacaaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacgaCTTCTGgttaatatcactttgattaatgtcaacatgTCATGACCAAGACGACTTCTGgttaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagataACTTCTGgttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaaTATCAcgttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgttgtggaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttctcatgacaaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatgtcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggtaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggtaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggtaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggtaatatcactttgattaatgtcaacatgtcatgaccaagacaacttctggttaatatcactttgattaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacctAAACAATATCAGcttttcatgacaaaaaccgaatgacccttaatgacagaagtcataaacgttcatgacttgtttataacgtttatgacttgtttataacgtttatgacttattcatgacagtgtcacgtcatagttatgacagtgtcatgtcacgattatgtcgataccttcaagtaaagtgttaccaaaaactTGCTTGCTTTGCTTACCAATTTCCCCTCAGAATTACGTACGTGTAGCTTCATCAACACTGATGCACAAAATAACCTTCAAAAAACATACTGATACATCCATTTACAATGGTCTTATCACCATGGCGCCCGATACTTTTTAAGTACAGGATTATGCTATACCAACAACAGAGGAAAAAGGTTctttaaatacatacaaaaaaaaaataaaatgacaaaaataaaataaaggaaagaggaaagttTACAACTTTAAACCAGTTCCcagaaagaaattaaaaataaaaataattccccccccccaaaagaaCAGTTCTAGTAATAATGTGGCCTCGATACAAACAATCAGAAAAATTCACAACActattttttcctcattttatcaatgttacaaaaagtcctgcattataAAATAGGGCAGCTTTAAAATCAGTGTAATTAATAAAACTATACAACATTACAAACATGTCTCCCCCACGCTCCGCCCCCTCTACTGTCCCGTTAAGAGCTAACCCTTTCTCTGCCGTACCAGAACTAAAGGTCGCGCTTTAAATCGAAGGtagctacataagagtgacgtgacagtgtcatgtgttgtGTCATGTGGTCATATGACAGTGCCATGTGTTCATAACACTGTCATGTGTTCATTTGACAGTGtaatgtgttcatgacagtgtcacctgttcatgacagtgtcatatgACAGTGCcatgtattcatgacagtgCCATGTgttgtgtcatgtgttcatatgACAGTGtcacatgttcatgacagtgtcacgtgttcatgacagtgccatgtgttgtgtcatgtgttcatatgACAGTGtcacatgttcatgacagtgtcatatgttcatatgacagtgtcatgtgttgtgtcatgtgttcatatgacagtgtcatgtgttcatgacagtgccaTGTGTTGTGTCATATTCattcacatgacactgtcatgaacccatgacactgtcatatgaacacatgtcactgtcatatgaacacatgacacaacatatgacagtgtcatgaacccatgacactgtcatatgaacacatgtcactgtcatatgaacacatgacacaacatatgacactgtcatgaacacatgacactgtcatgaacacatgacacaacacatgacactgtcatgaacacatgacactgtcatcatgaacacatgacagtgtcatcataaacacatgacactgtcataaacacatgacactgtcatgaacacatggcACTGTCATCATGAACTcgtgactagggttgggtaccgaaacgtgccGACCTAAACGGCAGTAACGAggccgaataagaacgaaaatttcggttcctcatttcggtgcctgactttacactacacctgaaggcaggtaacgttagcctaccgttagctagcagctggattaaacacagcgGTTAAAATGCTAAcgttaaacggtgtaaagtgtgactgttaTTTCAccgtagaggattccaacagcgggacagCGTTCACTTacaacaggtagcctcgtggtgcattcaaagttattgtgaaatacccttttcccatctgatggttgtttttgtcgttcaacagcaatttaacGATTAATACAGATTAGCGGCGCCTGCTGTTATTACcttctcgcgcacgcgcagaacgcaCGCTCAAATCGGCGTCTCTTCGGCGTGTTcagaggcactttttggacctgtGGGAGTCGACTGCAACGCTTTGAGACGTTTATAATGGTTATGACATGtctatgacagtgtcatgtcactctcatgtagataccttcaagtaaagtgtaaccgaactaaattacacacacaaacacaagaacaaaaaaaaaaaaacacactgcccAAACTATTGCTTTTATATTCTcttgttcatttttttctttctgtaaaaAGGGTGCAATTTTGTCGTTTATCTTACACACAACACAGCCAAAAGTCGCTGATTAGATGCTATAGGCTGTTTCACAAGGATTTTGTGACACTTCAAAAAATGTCCgtgcaattttttattttttttaaatttttttttaattcccttCGCTCTTTTTTAAGCCCTGGAAgctgtattttaaattttttatatgCAATACTTTTTCCACTATTGTCATTAATTTTATATTTAGTGCAGATAATTAAGGAAGTAATGCCCAACGCATGGCTAAAGGGTAGGCAAGAACAGAGAGACAAGACAAATATGTCACACTAGGGGcctctattttaacgatctgaggtCACGGCGTGCAGCGCCTGGCGcaaggtgcgtttagggcgtgtccaaatccacttttgctagtttaatgaccttggagcattgctgttatgatggaggatttgcaccgtaatatttttatgtgtaatcttctgcatgtgtgtgtccctgtgtgtgtaacaagcatagtgtgcgcgctgtgcacgagccaataggagcattttactaatttgctgttaaaataacaatgaaatgctgcgttattgactttagaccaggtttttgttggtcaatggcgccatcacttcgcgctgcctcaagatatcaatacgcccagaatgcacctgaacacacctccctgtaagaccagcacgcccagaatgcacctgaacacacctccctgtaagaccagcacgcccagaatgcacctgaacacaccgccctgtaagaccagcacgcccagaatgcacctgaacacacctccctgtaatcccagcatgcccagaatgcacctgaacacaccgccctgtaagaccagcacgcccagaatgcacctgaacacacctccctgtaagaccagcacgcccagaatgcacctgaacacacctccctgtaatcCCAGCATGCCCATGGGTCCACAGaagggcgcaggtgcatttgttatttaaacaatgtgggcgctggacgggaaattgacaactgggtcggtcttaaactagcaaagacacttgtttcgggctttgcgctgcgccgcgtgcaagatagggccccaagAGGAAAACGCACAACCCACACAAGTGGAACTACTAAACCATCGCAGCTGACGGCATCACGCCGCGGCTGTCCGACGGACTAAACACAGAACGGGTAAACAATTTATTCACCAAAACCTCTGCCGAAGCAACACCTTCTCACTCCCCTCGCGTAAAggacggacgc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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU123615 True 6098 lncRNA 0.40 2 284398 290696

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565788 LOC100695038,LOC103366337,LOC107380922,LOC107082714,LOC105918713,LOC105028844,LOC106604646,LOC106611650 coding upstream 124941 141925 ~ 159457 (+)
stx6 stx6 coding downstream 493503 784199 ~ 808239 (+)
LOC120565732 NA coding downstream 496006 786702 ~ 787874 (+)
wdr18 wdr18 coding downstream 541545 832241 ~ 854498 (+)
grin3bb grin3b coding downstream 595663 886359 ~ 955236 (+)
med16 med16 coding downstream 692955 983651 ~ 1009213 (+)
G91843 NA non-coding upstream 39557 196596 ~ 244841 (+)
G91840 NA non-coding upstream 132454 151624 ~ 151944 (+)
G91839 NA non-coding upstream 133472 150540 ~ 150926 (+)
G91829 NA non-coding upstream 145841 92274 ~ 138557 (+)
G91862 NA non-coding downstream 39773 330469 ~ 331021 (+)
G91866 NA non-coding downstream 73714 364410 ~ 447169 (+)
G91877 NA non-coding downstream 117091 407787 ~ 452499 (+)
G91879 NA non-coding downstream 118759 409455 ~ 410825 (+)
LOC120566002 NA non-coding downstream 162446 453142 ~ 465715 (+)
G91887 NA other downstream 165013 455709 ~ 566466 (+)
G91897 NA other downstream 250995 541691 ~ 542909 (+)
G91903 bmpr1a other downstream 290111 580807 ~ 593877 (+)
G92019 NA other downstream 431677 722373 ~ 758976 (+)
G92146 NA other downstream 878125 1168821 ~ 1170046 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) LOC110524078 nfia misc NC_048569.1 CM023223.2 55546163 ~ 55726193 (-)
eurasian perch (Perca fluviatilis) G158551 NA non-coding NC_053126.1 CM020923.1 27799515 ~ 27801912 (+)
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G181588 NA non-coding NC_047605.1 CM018551.1 14867927 ~ 14930862 (+)
tiger barb (Puntius tetrazona) G150970 NA non-coding NC_056720.1 CM032089.1 9025901 ~ 9029910 (+)