G155346


Basic Information

Item Value
gene id G155346
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 15891095 ~ 15892034 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU210546
taataataatactaataataataataataacagtctatgttatatatacaatataaagtattttcacagtcagGCTATGTGGTACATTTACTGGCAGCTCCTTTAGGATCAAGTTGTTTACGTAATAATTTTCATCACATGATGCtttgcgctctctctctcacaatgTAAGAAGATATATTCTCTGCAAGCCCTATGTGCTGTTattacaaacattttaaatcattttgatGACATAAGTTTTTTTCACAGAAAAATTTGACAATCCAGGTGGAAACTGGTGTTGTCTATGCGTCTCTTTAAGTCTATTCATTGATATATGCTCAGTCAATCAGATAACATAATAATTTGGGTAATTGCATTTAGATTAACCTTAGTTATTGCAAAACAAATTGCCTGGGTGGTTTGTTACTGAGCATATTAAGTGCATGGTTTGACAAAAGGAGCGGTGGACTGAAAACATGTCAGAAAAGGTACCACATACACAGCTTTGAGACAA
>TU210547
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>TU210548
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>TU210549
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU210546 False 499 lncRNA 0.33 1 15891095 15891593
TU210547 False 835 lncRNA 0.29 1 15891095 15891929
TU210548 False 747 lncRNA 0.30 1 15891095 15891841
TU210549 True 940 lncRNA 0.28 1 15891095 15892034

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ppap2d LOC104918584,LOC104945815,LOC103364129,LOC101077623 coding upstream 18745 15856143 ~ 15872350 (+)
tnfsf14 NA coding upstream 46458 15835598 ~ 15844637 (+)
dnm2a dnm2,LOC102793658,LOC101473937,LOC102206614 coding upstream 56491 15796625 ~ 15834604 (+)
trim35-12 LOC101076486 coding upstream 149375 15737932 ~ 15741720 (+)
gipc1 gipc1,LOC106529657 coding upstream 153634 15732662 ~ 15737461 (+)
LOC120574506 NA coding downstream 175157 16067191 ~ 16077570 (+)
ptger1c LOC104954248 coding downstream 186542 16078576 ~ 16082640 (+)
slc27a1a slc27a1,LOC104954246 coding downstream 190520 16082554 ~ 16089754 (+)
LOC120574519 NA coding downstream 207024 16099058 ~ 16101743 (+)
pgls pgls coding downstream 212031 16104065 ~ 16111351 (+)
G155257 NA non-coding upstream 159280 15661368 ~ 15731815 (+)
G155212 NA non-coding upstream 346546 15544242 ~ 15544549 (+)
G155197 LOC104918611,LOC104960327,LOC102777936,LOC100691075,LOC101487576 non-coding upstream 382776 15507053 ~ 15508319 (+)
G155180 metrnl non-coding upstream 441537 15446884 ~ 15449558 (+)
G155104 NA non-coding upstream 717732 15173092 ~ 15173363 (+)
G155342 adgrl1,LOC103392844 non-coding downstream 1840 15893874 ~ 15900522 (+)
G155384 NA non-coding downstream 266617 16158651 ~ 16201112 (+)
G155393 NA non-coding downstream 324480 16216514 ~ 16241082 (+)
G155413 NA non-coding downstream 422732 16314766 ~ 16314974 (+)
G155602 NA non-coding downstream 760899 16652933 ~ 16653513 (+)
LOC120574525 NA other upstream 67 15887175 ~ 15891028 (+)
rasd2 NA other upstream 362625 15526854 ~ 15528470 (+)
arl16 arl16 other upstream 378285 15510093 ~ 15512810 (+)
ndel1b ndel1,LOC104940291 other upstream 486490 15366920 ~ 15404605 (+)
G155088 NA other upstream 751389 15135791 ~ 15139706 (+)
LOC120574544 pet100 other downstream 367650 16259684 ~ 16262058 (+)
camsap3 NA other downstream 423798 16315832 ~ 16387522 (+)
col5a3a col5a3,LOC104952480,LOC102201017,LOC101485068,LOC102299321,LOC100695815,LOC107378343,LOC108243746 other downstream 559199 16451233 ~ 16501704 (+)
olfm2a olfm2,LOC104918560,LOC107378344,LOC100706999 other downstream 628948 16520982 ~ 16563997 (+)
cmc4 NA other downstream 841422 16733456 ~ 16734344 (+)

Expression


Co-expression Network