G188168


Basic Information

Item Value
gene id G188168
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053129.1
NCBI id CM020926.1
chromosome length 36987114
location 29138073 ~ 29143547 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU254855
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>TU254856
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>TU254857
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU254855 False 2493 lncRNA 0.38 2 29138073 29140622
TU254856 True 2529 lncRNA 0.38 2 29138073 29140622
TU254857 False 2429 lncRNA 0.38 3 29138073 29143547

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120547117 gpr31,LOC104934219,LOC104957175 coding upstream 213310 28917291 ~ 28924763 (+)
gpr31 NA coding upstream 231693 28902376 ~ 28906380 (+)
LOC120547119 NA coding upstream 265470 28866213 ~ 28872603 (+)
plg plg coding upstream 351255 28773325 ~ 28786818 (+)
vgll2a vgll2,LOC102778318 coding upstream 389881 28741168 ~ 28748192 (+)
slc30a2 slc30a3,LOC102796772 coding downstream 52622 29196169 ~ 29220727 (+)
LOC120546480 NA coding downstream 172212 29315759 ~ 29371150 (+)
LOC120546866 LOC103363081,LOC108247050,LOC101159876,LOC107104461 coding downstream 717827 29861374 ~ 29875824 (+)
LOC120546867 NA coding downstream 733374 29876921 ~ 29882724 (+)
LOC120546870 NA coding downstream 751878 29895425 ~ 29943833 (+)
G188122 NA non-coding upstream 92527 29044283 ~ 29045546 (+)
G188104 NA non-coding upstream 154193 28983644 ~ 28983880 (+)
G188101 NA non-coding upstream 156449 28978955 ~ 28981624 (+)
G188100 NA non-coding upstream 160448 28976970 ~ 28977625 (+)
G188097 NA non-coding upstream 164162 28973599 ~ 28973911 (+)
G188172 NA non-coding downstream 13758 29157305 ~ 29161893 (+)
G188206 clvs2,LOC101073081 non-coding downstream 240663 29384210 ~ 29384442 (+)
G188208 NA non-coding downstream 283878 29427425 ~ 29428647 (+)
G188177 smpdl3a non-coding downstream 299800 29443347 ~ 29447023 (+)
G188281 NA non-coding downstream 394628 29538175 ~ 29538452 (+)
G188167 ucn other upstream 1156 29134171 ~ 29136917 (+)
trim54 trim54,LOC103375614 other upstream 5373 29110958 ~ 29132700 (+)
G188063 NA other upstream 246709 28886490 ~ 28891364 (+)
ttll2 ttll2 other upstream 254952 28872686 ~ 28883121 (+)
afdna afdn,LOC102779179 other upstream 488950 28539400 ~ 28649123 (+)
si:ch211-245h14.1 NA other downstream 149158 29292705 ~ 29312364 (+)
G188207 clvs2,LOC107675107 other downstream 275829 29419376 ~ 29420727 (+)
G188268 fabp7,LOC105924611,LOC105419070,LOC101079341,LOC102793361,LOC107727581 other downstream 318302 29461849 ~ 29463874 (+)
G188296 LOC107662224,LOC107746645,LOC107750038,LOC107712283,LOC107663761 other downstream 501707 29645254 ~ 29645823 (+)
btbd9 btbd9 other downstream 941001 30084548 ~ 30097239 (+)

Expression


Co-expression Network