G191571


Basic Information

Item Value
gene id G191571
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053130.1
NCBI id CM020927.1
chromosome length 36824488
location 2770633 ~ 3018448 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU260168
gtgtgtatctgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgccggggCCAGGTTGTTGTTTATCTACCTCTCTGGCAGtctgtccatccatccttcccccccccctcctccactgTGTCTCTTCCACTCACACAGCCAGTCC
>TU260171
tgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgggtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcggttctgtgcatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260173
gtgtgtatctgtgtgtgtgtatctgtttgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcttgtttaattaTATTCGTGGgatccaaaaaccgggagtccagtatacttggtTGGGACAGCTTTGTGGGACCAAAATGTTGGACCCCACAagggattagggatagaattaggttatggttagggttaaggtaagggttaaggttagtcatttagttgtgatggttaaggttagggtaaggggctagggaatgcattatgtcaatgacgggtccccacaaagatagtgaaa
>TU260175
gtttgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgccggggCCAGGTTGTTGTTTATCTACCTCTCTGGCAGtctgtccatccatccttcccccccccctcctccactgTGTCTCTTCCACTCACACAGCCAGTCC
>TU260177
tgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgcgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcggttctgtgcatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260178
gtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcggttctgtgcatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260179
tgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgggtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtttgtgcatgtctgtgtttctgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcggttctgtgcatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260180
gtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgcgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtctgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtc
>TU260181
tgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtc
>TU260182
tgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtc
>TU260183
gtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtgcgtg
>TU260185
gtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttggtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtctgtgtctgtctgtcggtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260187
tgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtc
>TU260188
tgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260189
tgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctgtctgtgtctcttgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgt
>TU260190
gtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctttttc
>TU260191
tgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcggttctgtgcatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtgtgtgtgtgtgtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU260168 False 388 lncRNA 0.51 2 2823567 2824381
TU260171 False 437 lncRNA 0.50 2 2999740 3000635
TU260173 False 438 lncRNA 0.45 2 2823567 2884123
TU260175 False 258 lncRNA 0.53 2 2823297 2824381
TU260177 False 353 lncRNA 0.50 2 2999740 3000635
TU260178 False 380 lncRNA 0.50 3 2950159 3000635
TU260179 True 577 lncRNA 0.49 2 2999740 3000635
TU260180 False 375 lncRNA 0.50 2 2832721 2921724
TU260181 False 448 TUCP 0.50 5 2823364 2921724
TU260182 False 304 lncRNA 0.50 3 2920418 2921724
TU260183 False 259 lncRNA 0.50 3 2770633 2833233
TU260185 False 405 lncRNA 0.50 3 2950159 3000635
TU260187 False 302 lncRNA 0.50 2 2920418 2921724
TU260188 False 246 lncRNA 0.49 2 2999740 3000635
TU260189 False 324 lncRNA 0.49 3 2920418 2950362
TU260190 False 291 lncRNA 0.49 3 2950159 3000635
TU260191 False 326 lncRNA 0.50 3 2999740 3018448

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120548306 NA coding upstream 106955 2657857 ~ 2663678 (+)
LOC120548433 NA coding upstream 133357 2529180 ~ 2637276 (+)
rps27a rps27a coding upstream 262252 2504767 ~ 2508381 (+)
LOC120548117 LOC103362069,LOC108229017,LOC106525817,LOC101169632,LOC101471088,LOC100695262 coding upstream 570176 2193300 ~ 2200457 (+)
trnat-agu_15 NA coding upstream 649168 2121392 ~ 2121465 (+)
znf365 znf365,LOC100708019,LOC101465348,LOC102787219 coding downstream 105319 3123767 ~ 3137751 (+)
trnar-acg_20 NA coding downstream 131366 3149814 ~ 3149886 (+)
trnah-gug_17 NA coding downstream 132025 3150473 ~ 3150544 (+)
adob ado,LOC107097159,LOC103372108 coding downstream 155157 3173605 ~ 3176172 (+)
kif11 kif11 coding downstream 196796 3215244 ~ 3250866 (+)
G191560 LOC108247402,LOC107090937 non-coding upstream 30580 2738144 ~ 2740053 (+)
G191556 LOC104953499 non-coding upstream 45108 2716036 ~ 2725525 (+)
G191555 NA non-coding upstream 62702 2703198 ~ 2707931 (+)
G191548 NA non-coding upstream 70186 2697963 ~ 2700447 (+)
G191340 NA non-coding upstream 127179 2642020 ~ 2643454 (+)
G191617 NA non-coding downstream 37454 3055902 ~ 3056236 (+)
G191610 NA non-coding downstream 123609 3142057 ~ 3146849 (+)
G191650 NA non-coding downstream 290600 3309048 ~ 3314217 (+)
G191654 NA non-coding downstream 378947 3397395 ~ 3397727 (+)
G191656 NA non-coding downstream 414898 3433346 ~ 3433604 (+)
G191567 sptbn1 other upstream 4571 2762050 ~ 2766062 (+)
G191565 sptbn1 other upstream 8954 2756154 ~ 2761679 (+)
LOC120548303 usp54,LOC106455943,LOC108247408,LOC104941643,LOC107104721 other upstream 454231 2268828 ~ 2316402 (+)
G191236 NA other upstream 665936 2047957 ~ 2104697 (+)
G191230 NA other upstream 766405 2002812 ~ 2004228 (+)
LOC120548437 NA other downstream 75519 3093967 ~ 3110958 (+)
LOC120547552 NA other downstream 145376 3163824 ~ 3339085 (+)
arfgef3 arfgef3,LOC102791283 other downstream 1232157 4250605 ~ 4347579 (+)
G191903 NA other downstream 1269449 4287897 ~ 4288644 (+)
LOC120548449 NA other downstream 1348703 4367151 ~ 4368326 (+)

Expression


Co-expression Network