LOC120547552


Basic Information

Item Value
gene id LOC120547552
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053130.1
NCBI id CM020927.1
chromosome length 36824488
location 3163824 ~ 3339085 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU260238
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttaggtTGTTGCTAATAAGGACTGGTTGATATGGGCTGCAATTATACAGATTATTCTcattgtggattattttctggatgatgattagttgtttggtcctcaaatgtctaaaatgatgatcagtgtttcccaaagagcccaagatgacgtcatcAAATATCTTGTTCTGTCCACAACTCAgatcttcagtttcctgtcccagtgGAGAGAAggaactagaacaatattcacatttaacaagctgacaccTGAGAACATTGACTCAAAACAATTGCTTGATTaccaaaatagttgccgattaatttaataattgacaactaatcgattaatctttgcattTCAGCGTGCGATTCATAGAATTATGACAATCACACATGATCCAAAGAGAGGCTGCCAAATTAAAGGGTGAGATATTAATTTCCACCCAGCTCTGAAGAAGCCAAAAGACAGAGTCACCTCTGACTCATCGGTGACTCATGGGAATAATCTCTAGAAACATTTAGAGGAACTGTGTTTAAGTTTGGATGAACTCGACCAAAACGCAGAAGCACTGATTTAAACCATGGCTTTAAATACTAACTATTTTGGACTGTTCTACAtgggaaggtttttttttttttttaatctttcttCAATTAAAGAAGACATGAGTTGAATGTACATATTGTAAACATATCATATTACACATGCTGTTATGACAAGGTAAAAAGttgatgtgatttttttttttttttaagtgtatgttAAAGGTAGATGTCAAAGCATTTGGACAATCCATATACAGCATGCTACGTATGCTATGAATCAACCTGGACTATCATCTTTTTCTAAGCACtgtctagggctgcacgatatcagcaaaatgtctaattgtgattattttgactaacgTTGTGATTCAAGATATTGACGGGAATGATAATGTTTGTATCTGTATCAAACAAAGCTGgtttctgtagtctgtaggagAGGATCTGGAGTCTGGGACGTCCCTGCAGCACCACAGGACTTCATTCAGGATGGTTGGAcacattttgcctttaacaaatattgcacccTCTGCAACATTAGTCCATATTGCAATTTTGATAAAATTGTGATTGTATTATACATGGTGTGTTTTGCTTTTATTGTCGTCCTCATTTAGTCACATGTCATCTTGTTGATGAGGCAGGGATCAGGAAAAAAACCACTTGAtgccaatttttttatttattatagttCGCACCTGTGTTTTAATTTGCTGTTTATAAAATGTGCCTTATCAATAAATCTGTGACACCGCTA
>TU260243
tgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttaggtTGTTGCTAATAAGGACTGGTTGATATGGGCTGCAATTATACAGATTATTCTcattgtggattattttctggatgatgattagttgtttggtcctcaaatgtctaaaatgatgatcagtgtttcccaaagagcccaagatgacgtcatcAAATATCTTGTTCTGTCCACAACTCAgatcttcagtttcctgtcccagtgGAGAGAAggaactagaacaatattcacatttaacaagctgacaccTGAGAACATTGACTCAAAACAATTGCTTGATTaccaaaatagttgccgattaatttaataattgacaactaatcgattaatctttgcattTCAGCGTGCGATTCATAGAATTATGACAATCACACATGATCCAAAGAGAGGCTGCCAAATTAAAGGGTGAGATATTAATTTCCACCCAGCTCTGAAGAAGCCAAAAGACAGAGTCACCTCTGACTCATCGGTGACTCATGGGAATAATCTCTAGAAACATTTAGAGGAACTGTGTTTAAGTTTGGATGAACTCGACCAAAACGCAGAAGCACTGATTTAAACCATGGCTTTAAATACTAACTATTTTGGACTGTTCTACAtgggaaggtttttttttttttttaatctttcttCAATTAAAGAAGACATGAGTTGAATGTACATATTGTAAACATATCATATTACACATGCTGTTATGACAAGGTAAAAAGttgatgtgatttttttttttttttaagtgtatgttAAAGGTAGATGTCAAAGCATTTGGACAATCCATATACAGCATGCTACGTATGCTATGAATCAACCTGGACTATCATCTTTTTCTAAGCACtgtctagggctgcacgatatcagcaaaatgtctaattgtgattattttgactaacgTTGTGATTCAAGATATTGACGGGAATGATAATGTTTGTATCTGTATCAAACAAAGCTGgtttctgtagtctgtaggagAGGATCTGGAGTCTGGGACGTCCCTGCAGCACCACAGGACTTCATTCAGGATGGTTGGAcacattttgcctttaacaaatattgcacccTCTGCAACATTAGTCCATATTGCAATTTTGATAAAATTGTGATTGTATTATACATGGTGTGTTTTGCTTTTATTGTCGTCCTCATTTAGTCACATGTCATCTTGTTGATGAGGCAGGGATCAGGAAAAAAACCACTTGAtgccaatttttttatttattatagttCGCACCTGTGTTTTAATTTGCTGTTTATAAAATGTGCCTTATCAATAAATCTGTGACACCGCTA
>TU260248
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttaggtTGTTGCTAATAAGGACTGGTTGATATGGGCTGCAATTATACAGATTATTCTcattgtggattattttctggatgatgattagttgtttggtcctcaaatgtctaaaatgatgatcagtgtttcccaaagagcccaagatgacgtcatcAAATATCTTGTTCTGTCCACAACTCAgatcttcagtttcctgtcccagtgGAGAGAAggaactagaacaatattcacatttaacaagctgacaccTGAGAACATTGACTCAAAACAATTGCTTGATTaccaaaatagttgccgattaatttaataattgacaactaatcgattaatctttgcattTCAGCGTGCGATTCATAGAATTATGACAATCACACATGATCCAAAGAGAGGCTGCCAAATTAAAGGGTGAGATATTAATTTCCACCCAGCTCTGAAGAAGCCAAAAGACAGAGTCACCTCTGACTCATCGGTGACTCATGGGAATAATCTCTAGAAACATTTAGAGGAACTGTGTTTAAGTTTGGATGAACTCGACCAAAACGCAGAAGCACTGATTTAAACCATGGCTTTAAATACTAACTATTTTGGACTGTTCTACAtgggaaggtttttttttttttttaatctttcttCAATTAAAGAAGACATGAGTTGAATGTACATATTGTAAACATATCATATTACACATGCTGTTATGACAAGGTAAAAAGttgatgtgatttttttttttttttaagtgtatgttAAAGGTAGATGTCAAAGCATTTGGACAATCCATATACAGCATGCTACGTATGCTATGAATCAACCTGGACTATCATCTTTTTCTAAGCACtgtctagggctgcacgatatcagcaaaatgtctaattgtgattattttgactaacgTTGTGATTCAAGATATTGACGGGAATGATAATGTTTGTATCTGTATCAAACAAAGCTGgtttctgtagtctgtaggagAGGATCTGGAGTCTGGGACGTCCCTGCAGCACCACAGGACTTCATTCAGGATGGTTGGAcacattttgcctttaacaaatattgcacccTCTGCAACATTAGTCCATATTGCAATTTTGATAAAATTGTGATTGTATTATACATGGTGTGTTTTGCTTTTATTGTCGTCCTCATTTAGTCACATGTCATCTTGTTGATGAGGCAGAGatcaggaaaaaaaacacttgatgcc
>TU260254
ctgtatgtgtgtgtgtgtctgtattaggtTGTTGCTAATAAGGACTGGTTGATATGGGCTGCAATTATACAGATTATTCTcattgtggattattttctggatgatgattagttgtttggtcctcaaatgtctaaaatgatgatcagtgtttcccaaagagcccaagatgacgtcatcAAATATCTTGTTCTGTCCACAACTCAgatcttcagtttcctgtcccagtgGAGAGAAggaactagaacaatattcacatttaacaagctgacaccTGAGAACATTGACTCAAAACAATTGCTTGATTaccaaaatagttgccgattaatttaataattgacaactaatcgattaatctttgcattTCAGCGTGCGATTCATAGAATTATGACAATCACACATGATCCAAAGAGAGGCTGCCAAATTAAAGGGTGAGATATTAATTTCCACCCAGCTCTGAAGAAGCCAAAAGACAGAGTCACCTCTGACTCATCGGTGACTCATGGGAATAATCTCTAGAAACATTTAGAGGAACTGTGTTTAAGTTTGGATGAACTCGACCAAAACGCAGAAGCACTGATTTAAACCATGGCTTTAAATACTAACTATTTTGGACTGTTCTACAtgggaaggtttttttttttttttaatctttcttCAATTAAAGAAGACATGAGTTGAATGTACATATTGTAAACATATCATATTACACATGCTGTTATGACAAGGTAAAAAGttgatgtgatttttttttttttttaagtgtatgttAAAGGTAGATGTCAAAGCATTTGGACAATCCATATACAGCATGCTACGTATGCTATGAATCAACCTGGACTATCATCTTTTTCTAAGCACtgtctagggctgcacgatatcagcaaaatgtctaattgtgattattttgactaacgTTGTGATTCAAGATATTGACGGGAATGATAATGTTTGTATCTGTATCAAACAAAGCTGgtttctgtagtctgtaggagAGGATCTGGAGTCTGGGACGTCCCTGCAGCACCACAGGACTTCATTCAGGATGGTTGGAcacattttgcctttaacaaatattgcacccTCTGCAACATTAGTCCATATTGCAATTTTGATAAAATTGTGATTGTATTATACATGGTGTGTTTTGCTTTTATTGTCGTCCTCATTTAGTCACATGTCATCTTGTTGATGAGGCAGGGATCAGGAAAAAAACCACTTGAtgccaatttttttatttattatagttCGCACCTGTGTTTTAATTTGCTGTTTATAAAATGTGCCTTATCAATAAATCTGTGACACCGCTA
>TU260255
TGTATGGATCCAAGAAGTCCCCCAGCCTGAGGTGGTGGCACCAGAGACATGCTCCCCCGCTTTGGACAATTGTACTCTGACCTGTGACGCAGACACCACAGACGCTGGACCGGTCACCTACAGCTGGAAGATGGGAGACGGAGAGTGGAAGGAGTCGGGAAAGGAAATGACCATCACCTGCCGGATAAAGAACCCAGTCAGTGAGAAAGAAAGTACACCCTGAAAACAATCCACTCTGCCAACTTGTTTTGACTAATGaagttaataatatagacaatATTATTTAGATGTTATGCTGCATGCAGATATAAGAAACCAATTAAATGTTGCTTGAGAGATTTATTTTGCCTTcattatgttttgtgtgtaattgtgctctaagtgatgtcacgcgtttttttagGCTTTAACACAGCAGGTAATATAACAATGTTAGATACATATAGGCTATAAGAAAGAATCAggttattaaaagtaaaaatcaaAAGGTGGTGGATTTTGAAATTTGTTATGAGTCAAGAAATACAGTTCTGAACTGCTGCAGTTACAGCACAGTTCAGACGAACTTTGCTTCCATTTAAATTCTACTTTATACTCATTTATACTTCAATTTAATACATGTAATAAGCAGAGTTTGTACTTTTTACATCTTAATGTTTGGACTGTCTTATTATCTGCTTGTCAGTCAACAGTAAAAGACTTTAAATGGCACCAACCTGTATGAAAATAAAGATTGAT
>XM_039783019.1
GTAACTGCCCTCCCACCCTCAGAACAGAGGAGACAAACTGAGCTGTGAAGTTGTTTTGCTGATCTGAAAACAGATATTCTTCAAGTCGTGTGTTGATCTGAGAACCATGGAGAAACTGACAgggtttttgttgctgttggcGGCGCTGAACTTCGCTCTAGCCCAGGACGAGGTAACCCCGACATACTTCAAGGATGGCGGGGAGCTAACGTTGGACGTGAGGCCTCCTCCTCCTGAACCTCTCTACAACATCCTGTGGATTATTAACGGTAACCTGGTAGCTGAGTGGATCAAAGATCAAGTCACAGGTTCAGTTTTAGTCCCTTTGACTTATTACAGACCCTTTAATGGCCGCACAACCCTGGATGTAACCACTGGACGTTTGGTAATCAACAACATGACTAAAGCTGACATGGGGCTGTATTCAGTGGAAGTCAACAACAAGGTCCAGAATGAGCGCTATAACGCTGTATTGATGAAAGAAGTCCCCCAGCCTGAGGTGGTGGCACCAGAGACATGCTCCCCCGCTTTGGACAATTGTACTCTGACCTGTGACGCAGACACCACAGACGCTGGACCGGTCACCTACAGCTGGAAGATGGGAGACGGAGAGTGGAAGGAGTCGGGAAAGGAAATGACCATCACCTGCCGGATAAAGAACCCAGTCAGTGAGAAAGAAAGTACACCCTGAAAACAATCCACTCTGCCAACTTGTTTTGACTAATGaagttaataatatagacaatATTATTTAGATGTTATGCTGCATGCAGATATAAGAAACCAATTAAATGTTGCTTGAGAGATTTATTTTGCCTTcattatgttttgtgtgtaattgtgctctaagtgatgtcacgcgtttttttagGCTTTAACACAGCAGGTAATATAACAATGTTAGATACATATAGGCTATAAGAAAGAATCAggttattaaaagtaaaaatcaaAAGGTGGTGGATTTTGAAATTTGTTATGAGTCAAGAAATACAGTTCTGAACTGCTGCAGTTACAGCACAGTTCAGACGAACTTTGCTTCCATTTAAATTCTACTTTATACTCATTTATACTTCAATTTAATACATGTAATAAGCAGAGTTTGTACTTTTTACATCTTAATGTTTGGACTGTCTTATTATCTGCTTGTCAGTCAACAGTAAAAGACTTTAAATGGCACCAACCTGTATGAAAATAAAGATTGATTGAGCAATTGA

Function

GO:

id name namespace
GO:0008152 metabolic process biological_process
GO:0000152 nuclear ubiquitin ligase complex cellular_component
GO:0005680 anaphase-promoting complex cellular_component

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU260238 False 1321 lncRNA 0.36 2 3195794 3258079
TU260243 True 1335 lncRNA 0.36 2 3211461 3258079
TU260248 False 1228 lncRNA 0.36 4 3163824 3276062
TU260254 False 1310 lncRNA 0.36 2 3211256 3258079
TU260255 False 738 lncRNA 0.38 2 3328596 3339074
XM_039783019.1 False 1217 mRNA 0.42 1 3337869 3339085

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnah-gug_17 NA coding upstream 13280 3150473 ~ 3150544 (+)
trnar-acg_20 NA coding upstream 13938 3149814 ~ 3149886 (+)
znf365 znf365,LOC100708019,LOC101465348,LOC102787219 coding upstream 26073 3123767 ~ 3137751 (+)
LOC120548310 NA coding upstream 334076 2829059 ~ 2829748 (+)
LOC120548306 NA coding upstream 500146 2657857 ~ 2663678 (+)
LOC120548100 LOC103372105 coding downstream 7953 3347038 ~ 3382091 (+)
LOC120548518 LOC103361435,LOC104937509 coding downstream 141236 3480321 ~ 3492373 (+)
LOC120548444 LOC108246626 coding downstream 193629 3532714 ~ 3534228 (+)
fgfbp3 fgfbp3 coding downstream 209019 3548104 ~ 3561420 (+)
ppp1r3ca ppp1r3c coding downstream 250140 3589225 ~ 3591796 (+)
G191610 NA non-coding upstream 16975 3142057 ~ 3146849 (+)
G191617 NA non-coding upstream 107588 3055902 ~ 3056236 (+)
G191596 NA non-coding upstream 187573 2970984 ~ 2976251 (+)
G191595 NA non-coding upstream 198144 2964930 ~ 2965680 (+)
G191594 NA non-coding upstream 211206 2952230 ~ 2952618 (+)
G191654 NA non-coding downstream 58310 3397395 ~ 3397727 (+)
G191656 NA non-coding downstream 94261 3433346 ~ 3433604 (+)
G191785 NA non-coding downstream 284265 3623350 ~ 3624702 (+)
G191787 NA non-coding downstream 287570 3626655 ~ 3626919 (+)
G191789 NA non-coding downstream 299094 3638179 ~ 3640170 (+)
LOC120548437 NA other upstream 52866 3093967 ~ 3110958 (+)
G191571 NA other upstream 145376 2770633 ~ 3018448 (+)
G191573 sptbn1,LOC107396444 other upstream 385457 2775308 ~ 2778367 (+)
G191567 sptbn1 other upstream 397762 2762050 ~ 2766062 (+)
G191565 sptbn1 other upstream 402145 2756154 ~ 2761679 (+)
arfgef3 arfgef3,LOC102791283 other downstream 911520 4250605 ~ 4347579 (+)
G191903 NA other downstream 948812 4287897 ~ 4288644 (+)
LOC120548449 NA other downstream 1028066 4367151 ~ 4368326 (+)
LOC120548511 LOC101485366,LOC100693926 other downstream 1289972 4629057 ~ 4678348 (+)
G192040 LOC104951079 other downstream 1547291 4886376 ~ 4887023 (+)

Expression


Co-expression Network