G192381


Basic Information

Item Value
gene id G192381
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053130.1
NCBI id CM020927.1
chromosome length 36824488
location 7907763 ~ 7952125 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU261268
ACTTTTATTAAGACGTGCCATGCGCCTACTTAATGACAACCAGCTTTGGCAGAAAGGTAACTGATAAATCTAGCAGagaaaaaacaaactacaaatgCAAAGTAAACAGGTATTACACAAGTCAAGAAGtttgttaaatattaaatataaggGACAGCTTCATTAGAATTTTTACCACATTTTCACCACCAGCAGGTATTAAGTGGGATTTAAGAGCTTGTTAACACTGGAACCATTCAGCTAACCACAAGTCAATCAAAAATCATGTCAAGCTGTGGAGTCAGGCAGCTGTAAATTCATTACAAGATCTCTCTTCAACATTCAACAAAGGTTTGTCCAAAAGCACGTTTGCTGCCATGTACAGACTCCGAAGGCTAGCCCAAACCTTTAAGGCCAACTTCTGCCAAATGATTCTGGGTTGTTGCGAGGTTTTGAGGAGGGCAACAACTAacttgaaacacacacagaattagTGTGAAAatcaaaaactaaacattaaatagaatgtattgtgttgtctgtgtACCCCCCTCAAGAATACGTTGCCCACatagttgtgttgtgtgtgtttctaggaCCAGACCTGTACAACACAGGTGATACcacatatttacatttgcatAGACACCATTTCTTCTGGTTCCATTTCATAACAAACTGAGAAATTATTGTCAAAAACATGAGGTGCTAGTGCTGGTCAAACGAACCATGAACCTCCTACTTTGTATGCTGCTACAGTAGCTAGACACAGGGCAGATTACACTGTAAACTCGTGAAAATAACTGTAGCAACCAAGGCACGCACTATGATTGCCTACTGTGAGTGCACttttaaaacacttaaaatgaaagtaaacaaaagaagaaaacaccaaaatatttcaacaaatgcTACAGAACACAAACCAGGCCTATACTTTTAAGCGGTTGTTTCAATACCATGGCAATTAAAGACTACATCTCAAAAGGATTAAAACTAAACAGTGCAGCCATATTTGTACATGAATATGgccaaataaatacaaagagaAACTCAGTGCAAGTCTTGAAATACAGATAAAACAACAGTGCATTTGGCAAATTATATTCCTATTGACAACTTTGATTGGCAATAACCAGATCGAGATAAATTGGCAGTTTTAGCTCCAGTCTGTTAAATGATTTCACCTTCCAAAATGTTCAGTTTAGTCAGAATCTGTTTCATTTTAAGTTCAACTCATCAAcatggtggctcagtggttagcactgctgcTTCTCAGCAAGTAGGCACTGATGAGTACTGGGCTGGGTCCCCGGTATGGGCAGGGCCCTTCTGTGTGGTTATCCCCATGTACTGCAACTCCCTACTTCAAACAAAGATCTTCATAAAACCCAACAACTCAAATCAATTGTAGAGGTTTACTTATCCCACACTACAATACAATCTAGGTTAGGTAATGAAGACCTGATTAGTCCGGATGTTTCTATCTAGGGAGAGCGCAGATAAAGCAGCAGGGTTATATGGTTTTtaccacacattcaaaatagTCTACAAACATGCGCCTCTgctcaaaacacacattttctcccacaccactGATGGCTGATCTGAGTTCAGTTATTGGGTGCTGCATGCATTGTTCTGGTTAACTTAAGTAATAAGTGGGACATTTAACATAATTTGTTGCTGACACAAGTTGGCCTACAAAAACGTTAGACCGCATGGGACTTCCTCACCAACAAAGAAGAAACAATGGCATGAGAGGTCAACAACAGTCAATATATAGACTTGCAGCAGCTGCTCTCTCTGGTTAGTGCCATCCTTTTTCTTGCAGATGTGAGTGCAGCTAACGAGGAGAACATTAGCTGCGTTTTCTGGGTATACCTCTCGTCTGGGACAAAAACATcctaaaataaaacttaaagATTCAGCAGGACAAGTGTTTGGTAAAATGTGGGTATAATAAATGTATCCAAACAAAATGGGGGGGATGAAAAGCAGGAGATGAAGAAAGCTATAGCAAGACCTTGAAACTTAATATCATACTGTTAACACAATTGATGATGTCCTGATTCACAGCAGGTTTGTCTTAAGATGCACTTGGTTTGATTTCATCTTTTCTCACCAATCAACAAAACTATAAATaacatgtatgtactgtagttacattttaaatgtaaaaatactgtaATAAACTGTGATATTTAGCAAATTACACAGGCACCCCAGACACTGAGTGGGGTCAGGGTCAGTGAAGGAATTAAGATTTAAGCATGTTTAAGTTTCTGCTGCGCCTAAAGACAAACCATTTGTGAACCAGCAGTTCtaaaatcacaaatcacaacTTTTAACAAATCATGCCTAAAAGAACCTTATAGGGTAAATTATAGAATACTGACTAGGTCAGTCCCCACATACAGAGCATTATCAGCAGCCAACTGCTCCCATTGAGAAAAAAAGCCTTAAGATTTAAACTACAATCATCAACCTGACACCTTCGCAGTCAATCAAACTCAAAAGGCCATAATATGTTGGCATCATTTTAGGCAATAAAGTTAGACAACTGTATTATTACATATGATGAATATAATGCAGTATGTTAATGTTTTTCATTATGAATACACACCATTTACTACATCGCCTACATAATCTCCTCTACGTGGTTTGTCTTAGTCATTtagacaaaagtaaaagtgtGATTGATGTAGTTTTTGGTTGCaaggaaaaacaatattgttCAACTATTGTTGGTGACAATCCTTGTTCACTTATATTGCTTAAAAATGCCACCTGTCTATCATGGCCAATACCAACACCTTTAGTTTGGACCGAATGATCCGACAGCCCTGGCCCTCTTCTGGACTCTCTGCAACTACAATGGCTGAGACTCTGTCTCACAGGGGGTGCTGGGACTCTGCTCGGATTccacctcttcctccttctgAACCCCgtctttttcctcctcctcctgctgctgctgctcctcctgctgctgctgctccactgATTGGCTCTCACTCTCTACTTCTTTAGTGGGTCCTTCATCTTCTACCAACTCTCTCTCATCTCCAGAAGGGGGTGCActctcctctgtgtctgtcccagAACGCGGCGTTGGTCCAGGGGAACGGGATTCTGCTCGCAGCCTCCTCTCGTAGCTGAACTCTGGAAGCCTGGGAGCCTGAGGGCGTGTCTTCCTGGCTGGATTCAGGAAGTAGCAATA
>TU261269
ACTTTTATTAAGACGTGCCATGCGCCTACTTAATGACAACCAGCTTTGGCAGAAAGGTAACTGATAAATCTAGCAGagaaaaaacaaactacaaatgCAAAGTAAACAGGTATTACACAAGTCAAGAAGtttgttaaatattaaatataaggGACAGCTTCATTAGAATTTTTACCACATTTTCACCACCAGCAGGTATTAAGTGGGATTTAAGAGCTTGTTAACACTGGAACCATTCAGCTAACCACAAGTCAATCAAAAATCATGTCAAGCTGTGGAGTCAGGCAGCTGTAAATTCATTACAAGATCTCTCTTCAACATTCAACAAAGGTTTGTCCAAAAGCACGTTTGCTGCCATGTACAGACTCCGAAGGCTAGCCCAAACCTTTAAGGCCAACTTCTGCCAAATGATTCTGGGTTGTTGCGAGGTTTTGAGGAGGGCAACAACTAacttgaaacacacacagaattagTGTGAAAatcaaaaactaaacattaaatagaatgtattgtgttgtctgtgtACCCCCCTCAAGAATACGTTGCCCACatagttgtgttgtgtgtgtttctaggaCCAGACCTGTACAACACAGGTGATACcacatatttacatttgcatAGACACCATTTCTTCTGGTTCCATTTCATAACAAACTGAGAAATTATTGTCAAAAACATGAGGTGCTAGTGCTGGTCAAACGAACCATGAACCTCCTACTTTGTATGCTGCTACAGTAGCTAGACACAGGGCAGATTACACTGTAAACTCGTGAAAATAACTGTAGCAACCAAGGCACGCACTATGATTGCCTACTGTGAGTGCACttttaaaacacttaaaatgaaagtaaacaaaagaagaaaacaccaaaatatttcaacaaatgcTACAGAACACAAACCAGGCCTATACTTTTAAGCGGTTGTTTCAATACCATGGCAATTAAAGACTACATCTCAAAAGGATTAAAACTAAACAGTGCAGCCATATTTGTACATGAATATGgccaaataaatacaaagagaAACTCAGTGCAAGTCTTGAAATACAGATAAAACAACAGTGCATTTGGCAAATTATATTCCTATTGACAACTTTGATTGGCAATAACCAGATCGAGATAAATTGGCAGTTTTAGCTCCAGTCTGTTAAATGATTTCACCTTCCAAAATGTTCAGTTTAGTCAGAATCTGTTTCATTTTAAGTTCAACTCATCAAcatggtggctcagtggttagcactgctgcTTCTCAGCAAGTAGGCACTGATGAGTACTGGGCTGGGTCCCCGGTATGGGCAGGGCCCTTCTGTGTGGTTATCCCCATGTACTGCAACTCCCTACTTCAAACAAAGATCTTCATAAAACCCAACAACTCAAATCAATTGTAGAGGTTTACTTATCCCACACTACAATACAATCTAGGTTAGGTAATGAAGACCTGATTAGTCCGGATGTTTCTATCTAGGGAGAGCGCAGATAAAGCAGCAGGGTTATATGGTTTTtaccacacattcaaaatagTCTACAAACATGCGCCTCTgctcaaaacacacattttctcccacaccactGATGGCTGATCTGAGTTCAGTTATTGGGTGCTGCATGCATTGTTCTGGTTAACTTAAGTAATAAGTGGGACATTTAACATAATTTGTTGCTGACACAAGTTGGCCTACAAAAACGTTAGACCGCATGGGACTTCCTCACCAACAAAGAAGAAACAATGGCATGAGAGGTCAACAACAGTCAATATATAGACTTGCAGCAGCTGCTCTCTCTGGTTAGTGCCATCCTTTTTCTTGCAGATGTGAGTGCAGCTAACGAGGAGAACATTAGCTGCGTTTTCTGGGTATACCTCTCGTCTGGGACAAAAACATcctaaaataaaacttaaagATTCAGCAGGACAAGTGTTTGGTAAAATGTGGGTATAATAAATGTATCCAAACAAAATGGGGGGGATGAAAAGCAGGAGATGAAGAAAGCTATAGCAAGACCTTGAAACTTAATATCATACTGTTAACACAATTGATGATGTCCTGATTCACAGCAGGTTTGTCTTAAGATGCACTTGGTTTGATTTCATCTTTTCTCACCAATCAACAAAACTATAAATaacatgtatgtactgtagttacattttaaatgtaaaaatactgtaATAAACTGTGATATTTAGCAAATTACACAGGCACCCCAGACACTGAGTGGGGTCAGGGTCAGTGAAGGAATTAAGATTTAAGCATGTTTAAGTTTCTGCTGCGCCTAAAGACAAACCATTTGTGAACCAGCAGTTCtaaaatcacaaatcacaacTTTTAACAAATCATGCCTAAAAGAACCTTATAGGGTAAATTATAGAATACTGACTAGGTCAGTCCCCACATACAGAGCATTATCAGCAGCCAACTGCTCCCATTGAGAAAAAAAGCCTTAAGATTTAAACTACAATCATCAACCTGACACCTTCGCAGTCAATCAAACTCAAAAGGCCATAATATGTTGGCATCATTTTAGGCAATAAAGTTAGACAACTGTATTATTACATATGATGAATATAATGCAGTATGTTAATGTTTTTCATTATGAATACACACCATTTACTACATCGCCTACATAATCTCCTCTACGTGGTTTGTCTTAGTCATTtagacaaaagtaaaagtgtGATTGATGTAGTTTTTGGTTGCaaggaaaaacaatattgttCAACTATTGTTGGTGACAATCCTTGTTCACTTATATTGCTTAAAAATGCCACCTGTCTATCATGGCCAATACCAACACCTTTAGTTTGGACCGAATGATCCGACAGCCCTGGCCCTCTTCTGGACTCTCTGCAACTACAATGGCTGAGACTCTGTCTCACAGGGGGTGCTGGGACTCTGCTCGGATTccacctcttcctccttctgAACCCCgtctttttcctcctcctcctgctgctgctgctcctcctgctgctgctgctccactgATTGGCTCTCACTCTCTACTTCTTTAGTGGGTCCTTCATCTTCTACCAACTCTCTCTCATCTGAGGAGAAGATATGCAAGTAAGACATGTATATAACCAGTACATGACTATACAGAACAATATGGAAGggtgagagaaagagggataATGTGAATAGTTTGCAATGCAACAAATGATTGGTTGTTGGGATTTAAAATAATCAGTGATGAATCAAAGAAAATTAGCAGCATTCCCTTTGTTAGGGTGAACATAAGTTACACAAGACATAGGAAAAGAAAAGATTGTAAGAGGCTTTACTAACATCCCTTAAAATCTCCCTTCTCCCATCCAACAACACGGTTTATAAGAGGataattcaaactgtaaaatgtctgttcaacacaaagaaaagcccTTTCATCATCAAAATCAACAGCAGAGGCTATGGTGCTGCAGATACACATATGTTAAGAAGAtcatataattatattattagaaATCACTGGGTCTTAATGTAACGCTTAGTATGTATGTTTCACTGTGTATCTTCACAATCTAAATGCACCATTATTTGCACACTTTGAGATTAATtccattacataaaaaaatcatgtttGGACAGGATTAATATTCCAGGTCATCCAATAACACGAGAATATTCTGGAGAACAATCACATGAAACACGTCACCTGCTGAACTGAAAATAACTGGAAACGCATGTCTGAATGGGTAAAAACTCAAAactatattttaaaaaggtgccTGTACAGATTGGCCTTAAATTATGGGATGAACAATAAAAAGTAGGTATTGGGCCCTCTAATTACATCTAGGTTAATGTAGGCGTAAAAATCATGTTTGGACAGGATTAATATTCCAGGAGAAGACAGGTAATACAGCCCTGCTCTTTGGTGACTACTGTAAAACGTATTGCTGTGGACTGCACTGTCAAGAGTACTTTTGGCTTTTTTAAGACAATTTAgacattaattaacattaattCTGTTGATTGGAGGAGAGCAAATCAATCAATTATAAAATCCATCCAAATATACTGTGCACTCAGTGAAGACCAGATCTGGGTcaaacaagtgttttttttttaatttaattcagaCAATACTAAGTCAGTTGTTCAGTTTCTGTGATTTTCTAAACTTTGCAGGACGGAATTTGAATTCTCTGAATAGGATGAAATGTATTTGGAAACACGGTTTGACCCAGATTTGGTCTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU261268 False 3202 lncRNA 0.40 2 7907763 7913357
TU261269 True 4198 lncRNA 0.38 2 7907763 7952125

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
chrna1 chrna1,LOC103363491,LOC446087 coding upstream 2018 7887988 ~ 7905745 (+)
cdh11 cdh11 coding upstream 117545 7693588 ~ 7790218 (+)
supt3h supt3h coding upstream 1047577 6842493 ~ 6860186 (+)
LOC120547615 LOC102195517,LOC102294040,LOC101480586,LOC100690426,LOC101068904 coding upstream 1069773 6829571 ~ 6837990 (+)
LOC120548221 NA coding upstream 1235739 6596041 ~ 6672024 (+)
LOC120548260 LOC102194925,LOC102289369,LOC102779125,LOC100534467,LOC101476625,LOC104955261 coding downstream 15247 7967372 ~ 7970313 (+)
mtx2 mtx2 coding downstream 20306 7972431 ~ 7981678 (+)
cdh5 LOC104953929 coding downstream 68535 8020660 ~ 8057884 (+)
LOC120548392 LOC104932692,LOC100711168,LOC102780655,LOC102196724,LOC101475056 coding downstream 178457 8130582 ~ 8137806 (+)
LOC120548244 LOC101474016,LOC102312708,LOC102214986 coding downstream 303289 8255414 ~ 8328929 (+)
G192375 NA non-coding upstream 823 7906570 ~ 7906940 (+)
G192359 NA non-coding upstream 72056 7835423 ~ 7835707 (+)
G192333 NA non-coding upstream 688739 7128852 ~ 7219024 (+)
G192329 LOC108281047 non-coding upstream 784585 7122200 ~ 7123178 (+)
G192282 LOC103387761,LOC103476592,LOC106529247,LOC108242979,LOC102217296 non-coding upstream 973085 6834017 ~ 6934678 (+)
G192412 NA non-coding downstream 121656 8073781 ~ 8074959 (+)
G192413 NA non-coding downstream 172793 8124918 ~ 8125993 (+)
LOC120548141 NA non-coding downstream 174593 8126718 ~ 8129363 (+)
G192464 NA non-coding downstream 417253 8369378 ~ 8377699 (+)
G192530 NA non-coding downstream 905866 8857991 ~ 8904877 (+)
LOC120547751 LOC103371019,LOC107095977 other upstream 1103211 6800514 ~ 6804552 (+)
zc3h15 zc3h15 other upstream 1118677 6775743 ~ 6789086 (+)
LOC120548025 ppp1r1c,LOC106939859 other upstream 1401912 6485581 ~ 6505851 (+)
si:dkey-22n8.3 LOC103376236 other upstream 1510864 6020122 ~ 6396899 (+)
bean1 bean1,LOC102779979 other downstream 114211 8066336 ~ 8119063 (+)
meis1b meis1,LOC101073206,LOC106613898,LOC103387108 other downstream 1162531 9114656 ~ 9195416 (+)
kcnq5a LOC101074332,LOC101486129 other downstream 1544666 9496791 ~ 9602882 (+)
ddx43 ddx43,LOC107693529,LOC107588708 other downstream 1654400 9606525 ~ 9624564 (+)
arhgef33 arhgef33,LOC107098984 other downstream 1701779 9653904 ~ 9673252 (+)

Expression


Co-expression Network