LOC120558602


Basic Information

Item Value
gene id LOC120558602
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 6955204 ~ 7036375 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU63669
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>TU63670
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>TU63671
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>TU63672
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>XM_039799657.1
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Function

GO:

id name namespace
GO:0019538 protein metabolic process biological_process
GO:0006508 proteolysis biological_process

KEGG:

id description
ko04610 Complement and coagulation cascades
ko05168 Herpes simplex virus 1 infection
ko05133 Pertussis
ko05150 Staphylococcus aureus infection
ko05322 Systemic lupus erythematosus

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU63669 False 1166 lncRNA 0.39 4 6955204 6962388
TU63670 True 3040 TUCP 0.39 5 6955204 7036375
TU63671 False 2149 lncRNA 0.37 4 6962488 6967475
TU63672 False 2242 lncRNA 0.37 6 6962488 6967475
XM_039799657.1 False 1183 mRNA 0.39 6 6955238 6964792

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120558601 NA coding downstream 106835 6846035 ~ 6848369 (-)
LOC120558600 NA coding downstream 117154 6827685 ~ 6838050 (-)
LOC120558793 NA coding downstream 131668 6816707 ~ 6823536 (-)
tcea2 LOC103367858,LOC108232081 coding downstream 527281 6406363 ~ 6427923 (-)
LOC120559579 LOC103144399 coding downstream 1213251 5738321 ~ 5741953 (-)
LOC120558623 NA coding upstream 260191 7296566 ~ 7299426 (-)
LOC120558800 NA coding upstream 283650 7320025 ~ 7359408 (-)
LOC120558624 NA coding upstream 339351 7375726 ~ 7407678 (-)
LOC120558801 NA coding upstream 402808 7439183 ~ 7447849 (-)
hsd17b10 hsd17b10 coding upstream 554526 7590901 ~ 7599774 (-)
G47641 NA non-coding downstream 127684 6826253 ~ 6827520 (-)
G47498 NA non-coding downstream 383080 6571892 ~ 6572124 (-)
G47485 NA non-coding downstream 581661 6366360 ~ 6373543 (-)
G47459 NA non-coding downstream 718366 6232908 ~ 6236838 (-)
G47447 NA non-coding downstream 813315 6118484 ~ 6141889 (-)
LOC120558809 NA non-coding upstream 13373 7049748 ~ 7270452 (-)
G47677 NA non-coding upstream 14939 7051314 ~ 7051795 (-)
G47693 NA non-coding upstream 143733 7180108 ~ 7266048 (-)
LOC120558811 NA non-coding upstream 179088 7215463 ~ 7218392 (-)
LOC120558805 NA non-coding upstream 263450 7299825 ~ 7303561 (-)
G47638 NA other downstream 149498 6804141 ~ 6805706 (-)
G47624 NA other downstream 233475 6696445 ~ 6721729 (-)
G47254 NA other downstream 2221919 4732796 ~ 4733285 (-)
G47252 NA other downstream 2224063 4730501 ~ 4731141 (-)
dedd dedd,LOC103374682 other downstream 2333368 4591447 ~ 4621836 (-)
G47814 NA other upstream 449052 7485427 ~ 7498802 (-)
G47934 LOC103363443,LOC106920718,LOC105016959,LOC102211704,LOC108251018 other upstream 735561 7771936 ~ 8187551 (-)
G47937 gpr182,LOC103467901,LOC103130457,LOC106963994 other upstream 778776 7815151 ~ 7886850 (-)
ada ada other upstream 1344742 8381117 ~ 8409734 (-)
LOC120559289 LOC106911506,LOC106515592 other upstream 1666590 8702965 ~ 8705483 (-)

Expression


Co-expression Network