dnajc5aa (dnajc5,LOC104933326,LOC101169856,LOC107090698)


Basic Information

Item Value
gene id dnajc5aa
gene name dnajc5,LOC104933326,LOC101169856,LOC107090698
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053116.1
NCBI id CM020913.1
chromosome length 44101041
location 12233105 ~ 12237737 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039801709.1
AGCCAGCGTACTGCTGCAGCTGTCCATGATTGTGTAGTTGGCAGAGAGGGTCCGGGTACGTGCGAGATGCAGCCATAGTCACGCTCCACTGTCCAACATTTAGAACCTGCTGGGATCGTTAGTGTTGCAGCGCATCACAGCCGACTGAAAGCCTGTGGACGTGAGACATCATGGCTGAGCAGCAGAGGCAGCGCTCTCTGTCCACCGCTGGGGAGTCTCTCTACCTAGTGTTGGGCGTTGAGAAGGTGGCAACACCAGATGATATTAAGAGATCTTACAGGAAACTGGCGTTGAAGTTCCACCCTGACAAGAACCCTGACAATCCAGAGGCAGCTGATAAGTTCAAGGAGATAAACAACGCTCATGCAATTCTGAATGACCCCACGAAGCGTAATATTTATGACAAATATGGTTCTCTGGGACTATATGTGGCTGAGCAGTTTGGAGAGGAGAATGTCAACACTTACTTTGTCCTTTCAAGCTGGTGGGCAAAGGCTCTGTTTGTATTCTGCGGCCTGGCCACTGGCTGCTACTTCTGTTGCTGCCTATGTTGCTGCTGTAACTGCTGCTGTGGCAAATGTAAACCCCGGCCTCGGGAGGGCCATGAGCAGGAATTTTACGTGTCCCCTGAGGACCTGGAGGCTCAGCTGCAATCTGATGAGAGAGTAGAGGCTGGGGGTGACCCTATAATGCTGCAACCATCAGCAACAGAGACAACCCAGTTAACATCGGATGGGCACCACTCCTACCACACCGACACCGGCTTCAACTAACCCTCCGTTCCCGTCAATCCTGGCCTGCGGTTCTGCCTGCTTCCCTGCTCCACCTCAGTGAGATGAAAGAAAGGGGAAATCCACTTCAGAAAGACAGCCATGCGGAGGAGAGGGACTAGTAAGCATGGTCTATGAAAGGAACTAATGAAGTCACATCCCTTACTCCCCTCCCTAATTGGTTCACAACTTATTTCCCCCAAGTACAAGAAGATAAGAGAAACAActtaagtttcctttttattttttttgtatttcttggCCTTTAACCGCACAGGTCGCCTATCCCACTTTCCTTCTCCCACACTTTGCATCATGGTGTAGCATGCACTGTTTATGAAACATGGTCTCCAAATTTTCTTTAATCTTTTGCAACATGTTTACTTTGCAAGACTCATAATGTAGGTGCAATATGTTCAAATTCTTACAGTTCACACAGAGGAGAAgtaggaggtggaggagggggtAAAGTTTAAGAGATATATTATGCTAAAGGAAAGAAGAGCCATGGCTCAGGGAAGTGCTGGTTAGAGAGATGCGTTTGTTTGCTGAGGTGATCAGTGCCATCATTAAACCTTCAAGAAGTTGTCATATATTAGTGCAATTTTGCAATACTGTTTGAGTTGAAAATGCCACCTGCCATTGTCAGACCTACAGTACGTCTTTagcactgtttgtctgcagTGTGCTCCCCTGAGAGTTTTCAATGTGAATAACAAGGTTGTTGAGGCACAGAGCTTTATTTGCAGACTTTTCTTTCATAAATGCCTGCTGACGTAACATTTCTACTCAAGTTATTAATTAGTATTGGCTTTCTACTCCTTTGCCTCAGCTTCATTTCAGCTTGTCTTTGCAGGATGGAGACTACCTTCCTGTTATCTGCAGCACTGAACAGGTCATCatgactgattttttttttttcttttttttgtatttttatgtgtgCTCATAATTTCTTGCATTATACATCTATTTATGGCAGGTTTCAGCCCAGGTGGATTAGTTATAGTGTCACATTTTTATGTTGCTGTATTGTtttcaaccagccaaaagtttttgtttttgtttcattttattttctgttgctttttcaTCAAATCATCAGGCACATCTGATAGATAAAATCAGataattaacatttaaatgatGTAGTTTTTCATTGGTGGAGgaaatgttatttttaatttgtctaaCGGTTGGTAAAGCATCTACGTTTGTTAGTGTATACCAATAGCAAACATAATTTGTAACCGAGACATCACAACTAATCAagactgaaatatttatttCATCTAATTAttgcaggttttttttgtttacttattgatATCTCGGTATATGAAGCCAAGAAGCTCCAGGCAATCCAGCCAGTTGTGATGACAGCTGTTAATAGTAGAAATAGCAGACCTCTGTCAGCAGCTGCCGGGGTTCGGAGAATGACATGTTTTTATCTCTGAGCTATCTTAAATATGTTAAGTAGTTAATGTGgtgtggaaaaaaacatgttacacTCTTCATAGTTGGGCTGACTGCAGAACATGGGGATACTTTAGGTAGTGAAGAGTATGAGTTTCATCATGTTTTTAGTCCTTGTGTTCTGGTGACATTTTGTCCGATGCTGTGATCGTTTATCATTGTTGACTTTTTTGAATCCATGTAGAGTAAGAAGCTCGTCAGGCATATCATCTGTGAGCTCAGTGCTACAGGCAGCTCCAAGTAAAATGACTCTAGATTTTTCAAACTACTGAATTTGCATATATTATTGACACACACTTGCAAATTGCCATACATTGTCATGAACTTCCTTGCCACTTTGTCCTTTTCATAAACGCTAATAATGTGTTTCAATGGTTTACAATTGGTGAGCTCCTGTTGCCCACTCTCTGCTATTAACGGTATGGATGTTGACCTCTGTGGCCCTTGTATGATGTTTCCTGTAACCGTTGATGAAACATAGATGTTCCTGTCATGGCTTTTTCATCAAGATACTgaaaaatgctactgtaaatgTTCTAAGTTGAATGCACTGtgtgtttaaaagaaaatactaTAATGGATCAATGATCAGGAAATGCCTCCACAAAAAGACAACATAGTATATAGTTTAACTATAGTGAAATGGTTATATGATGCATTTTtggaattttatttatttcatacttGAGGATGGCTATAGTTTTAACTGGTATGGTGTTGTAATGTAACCATTAAATTTAGCAAGGAATGGTTTAATGGTTAAAGTTGCTTGTACATACACTTGGCCCATATAAAGTATAAACCCTAACGTTTATGTTGTAGCATGGTAATTGTGTGTCTGGAAGAAAACAAGTGGATCATTGATCTGAGTTGCTGTTGTTGAATAAATGTTCCTGAACATTT
>XM_039801710.1
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GTCCATGATTGTGTAGTTGGCAGAGAGGGTCCGGGTACGTGCGAGATGCAGCCATAGTCACGCTCCACTGTCCAACATTTAGAACCTGCTGGGATCGTTAGTGTTGCAGCGCATCACAGCCGACTGAAAGGTGAGGCCCAAAGCCTGTGGACGTGAGACATCATGGCTGAGCAGCAGAGGCAGCGCTCTCTGTCCACCGCTGGGGAGTCTCTCTACCTAGTGTTGGGCGTTGAGAAGGTGGCAACACCAGATGATATTAAGAGATCTTACAGGAAACTGGCGTTGAAGTTCCACCCTGACAAGAACCCTGACAATCCAGAGGCAGCTGATAAGTTCAAGGAGATAAACAACGCTCATGCAATTCTGAATGACCCCACGAAGCGTAATATTTATGACAAATATGGTTCTCTGGGACTATATGTGGCTGAGCAGTTTGGAGAGGAGAATGTCAACACTTACTTTGTCCTTTCAAGCTGGTGGGCAAAGGCTCTGTTTGTATTCTGCGGCCTGGCCACTGGCTGCTACTTCTGTTGCTGCCTATGTTGCTGCTGTAACTGCTGCTGTGGCAAATGTAAACCCCGGCCTCGGGAGGGCCATGAGCAGGAATTTTACGTGTCCCCTGAGGACCTGGAGGCTCAGCTGCAATCTGATGAGAGAGTAGAGGCTGGGGGTGACCCTATAATGCTGCAACCATCAGCAACAGAGACAACCCAGTTAACATCGGATGGGCACCACTCCTACCACACCGACACCGGCTTCAACTAACCCTCCGTTCCCGTCAATCCTGGCCTGCGGTTCTGCCTGCTTCCCTGCTCCACCTCAGTGAGATGAAAGAAAGGGGAAATCCACTTCAGAAAGACAGCCATGCGGAGGAGAGGGACTAGTAAGCATGGTCTATGAAAGGAACTAATGAAGTCACATCCCTTACTCCCCTCCCTAATTGGTTCACAACTTATTTCCCCCAAGTACAAGAAGATAAGAGAAACAActtaagtttcctttttattttttttgtatttcttggCCTTTAACCGCACAGGTCGCCTATCCCACTTTCCTTCTCCCACACTTTGCATCATGGTGTAGCATGCACTGTTTATGAAACATGGTCTCCAAATTTTCTTTAATCTTTTGCAACATGTTTACTTTGCAAGACTCATAATGTAGGTGCAATATGTTCAAATTCTTACAGTTCACACAGAGGAGAAgtaggaggtggaggagggggtAAAGTTTAAGAGATATATTATGCTAAAGGAAAGAAGAGCCATGGCTCAGGGAAGTGCTGGTTAGAGAGATGCGTTTGTTTGCTGAGGTGATCAGTGCCATCATTAAACCTTCAAGAAGTTGTCATATATTAGTGCAATTTTGCAATACTGTTTGAGTTGAAAATGCCACCTGCCATTGTCAGACCTACAGTACGTCTTTagcactgtttgtctgcagTGTGCTCCCCTGAGAGTTTTCAATGTGAATAACAAGGTTGTTGAGGCACAGAGCTTTATTTGCAGACTTTTCTTTCATAAATGCCTGCTGACGTAACATTTCTACTCAAGTTATTAATTAGTATTGGCTTTCTACTCCTTTGCCTCAGCTTCATTTCAGCTTGTCTTTGCAGGATGGAGACTACCTTCCTGTTATCTGCAGCACTGAACAGGTCATCatgactgattttttttttttcttttttttgtatttttatgtgtgCTCATAATTTCTTGCATTATACATCTATTTATGGCAGGTTTCAGCCCAGGTGGATTAGTTATAGTGTCACATTTTTATGTTGCTGTATTGTtttcaaccagccaaaagtttttgtttttgtttcattttattttctgttgctttttcaTCAAATCATCAGGCACATCTGATAGATAAAATCAGataattaacatttaaatgatGTAGTTTTTCATTGGTGGAGgaaatgttatttttaatttgtctaaCGGTTGGTAAAGCATCTACGTTTGTTAGTGTATACCAATAGCAAACATAATTTGTAACCGAGACATCACAACTAATCAagactgaaatatttatttCATCTAATTAttgcaggttttttttgtttacttattgatATCTCGGTATATGAAGCCAAGAAGCTCCAGGCAATCCAGCCAGTTGTGATGACAGCTGTTAATAGTAGAAATAGCAGACCTCTGTCAGCAGCTGCCGGGGTTCGGAGAATGACATGTTTTTATCTCTGAGCTATCTTAAATATGTTAAGTAGTTAATGTGgtgtggaaaaaaacatgttacacTCTTCATAGTTGGGCTGACTGCAGAACATGGGGATACTTTAGGTAGTGAAGAGTATGAGTTTCATCATGTTTTTAGTCCTTGTGTTCTGGTGACATTTTGTCCGATGCTGTGATCGTTTATCATTGTTGACTTTTTTGAATCCATGTAGAGTAAGAAGCTCGTCAGGCATATCATCTGTGAGCTCAGTGCTACAGGCAGCTCCAAGTAAAATGACTCTAGATTTTTCAAACTACTGAATTTGCATATATTATTGACACACACTTGCAAATTGCCATACATTGTCATGAACTTCCTTGCCACTTTGTCCTTTTCATAAACGCTAATAATGTGTTTCAATGGTTTACAATTGGTGAGCTCCTGTTGCCCACTCTCTGCTATTAACGGTATGGATGTTGACCTCTGTGGCCCTTGTATGATGTTTCCTGTAACCGTTGATGAAACATAGATGTTCCTGTCATGGCTTTTTCATCAAGATACTgaaaaatgctactgtaaatgTTCTAAGTTGAATGCACTGtgtgtttaaaagaaaatactaTAATGGATCAATGATCAGGAAATGCCTCCACAAAAAGACAACATAGTATATAGTTTAACTATAGTGAAATGGTTATATGATGCATTTTtggaattttatttatttcatacttGAGGATGGCTATAGTTTTAACTGGTATGGTGTTGTAATGTAACCATTAAATTTAGCAAGGAATGGTTTAATGGTTAAAGTTGCTTGTACATACACTTGGCCCATATAAAGTATAAACCCTAACGTTTATGTTGTAGCATGGTAATTGTGTGTCTGGAAGAAAACAAGTGGATCATTGATCTGAGTTGCTGTTGTTGAATAAATGTTCCTGAACATTT
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Function

symbol description
dnajc5 Predicted to enable ATP-dependent protein binding activity. Predicted to be involved in synaptic vesicle exocytosis. Predicted to act upstream of or within negative regulation of neuron apoptotic process. Located in Golgi apparatus and plasma membrane. Implicated in neuronal ceroid lipofuscinosis 4B.

NR:

description
PREDICTED: dnaJ homolog subfamily C member 5 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K09525 DNAJC5; DnaJ homolog subfamily C member 5

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_039801712.1 False 3146 mRNA 0.41 5 12233105 12237737

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120558333 NA coding downstream 2817 12224304 ~ 12230288 (-)
LOC120559362 LOC102786474,LOC103354471 coding downstream 113959 12103891 ~ 12119146 (-)
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srxn1 srxn1 other downstream 341966 11885965 ~ 11891139 (-)
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LOC120558437 NA other upstream 1070623 13308360 ~ 13312729 (-)

Expression


Co-expression Network