lrch3 (lrch3,LOC103027580)


Basic Information

Item Value
gene id lrch3
gene name lrch3,LOC103027580
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047600.1
NCBI id CM018546.1
chromosome length 31307711
location 29727090 ~ 29766747 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026913659.2
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GGGGGAAGGAAATAAGGCAGGGACGGGGAGAATCAGTGGGAGTTCGCTGTGTAATGGCGGCCTCGGTGTTGCTCTCTGCGGAAAGCACCGTGCCTGGATTCGCTGTCGGTGGGAGCGCCGGTGCGTCAGCGACCACCGGGAACGGATTAACCGTGCCAGGACCCGCGAGCTGGAACCGATCCCTGGACCGGGCGTTCGAGGAAGCCGCGGCCACCGGCTGCCTGAACCTGAGCGGCAGGAAGCTGAAGGAGTTCCCGAGGAGCTCCGCTAATCACGACCTCACCGACACGACCCGGGCCGACCTGTCGCGTAACAGACTGCCCGAGCTGCCGGTGGAGGTGTGTATGTTCGTGTCGTTGGAGAATCTGAACCTGTACCAGAACTGCCTGCGCTCTCTACCTGAGAGTCTGATCAACCTGCAGGCCCTCACCTACCTGAacatcagTCGTAACCAGGTGTCCACTCTGCCTGCTCACCTGTGCAGTCTGCCGCTCAAGGTGCTCATCGCCTGCAACAACAAGCTCGTGTCCCTGCCTGAAGAGCTCGGCCAGCTCCGACAGCTCACTGAACTGGATGTGAGCTGTAATGAGACTCAGACGTTACCTGCGCAGGTCGGCCAACTCGAAGCTCTGCGAGACCTGAACATTCGCCGAAACCACCTGGTTCGCCTGCCTCCTGAACTGGCGGAGCTTCCTCTGGTGCGCTTGGATTTCTCCTGTAACAAGGTGACGTCCATCCCGGTGTGTTACCGCAACCTCCGACACCTGCAGAGCATCGTGCTGGACAACAACCCGCTCCAGAGCCCACCTGcgcagaTCTGCATCAAGGGGAAGATCCACATATTTAAGTATTTGAACGTAGAGGCGTGTAAAATAGCTCCAGATCTCTCGGATTACGACAGGAGGCCACTGGGCTTTGGGTCCTGtgtggagGAGCTTTATCCTGGCCGGCCGTACGGAGCTCTGGACTCTGGGTTTAACAGCGTGGACAGTGGAGACAAGCGCTGGTCAGGCAATGAACTGTCAGACCTGCCGTTACGAGTAGCGGAGTTAACCAGAGAGCAGAGACATCGgcgagagcgagagcgagacgAGCACAAGACGGGATCGCTGTTGGCTAACGGAATACTGGAGGCAGAGCTCGACCAGATCGACTTTATTGACAGCTGCACAggggaggaagaagaggaagatggGCGGAGCCGAGGACGAGAACCAGTCAGCCTCAGCTCTCAGTTTATGGCCTACATCGAGAGACGAATCACccgagaggGCTCACCGGTGAAAGCATGTTCCTCCAGAGATGCAAGAAATGACGATTCAAGACGCTACGGCTCTTTACACAaccgTGTATCGGATACAGCGGGCACGTTGTCATCTCCGTCTCATAGCCAGcgGGCGGGGTCAGGCGCCGGTGTGGAACGCATGCGGCGAGAGGCTCAGCTCGCTGCTCAGAGGTACGAAGAGGAGAGGCAGCGAGCGCGAGGTGTTCAGAGAGAACCCGTGAGGAGTTACGTCAAGCAGAAGTCAGCTCAGAGTCCGCCTAAGCTCAGTCCCACAGACAGCGAGAACCTGTACCCTTCCAGACGCTCTACTCATACAGATGACTCCGCCCTCTTTATGAGTGAGTCCGAGCCCTTAATGGCGTTTGAAATAGACATAAACACCAACACTATAAAGAAGAGGCCGAGTCCTCAGAAGCAGcaagGAGAAGATCGCGCCTCGCTGTCCCCGACTGCGCTCCAGTCGCCCTCTTACCCCGGCCCCGCTGCGCCGACCTCCTGCCGCGGAGCCGCGTCGCGCCCCGAGAGCTTCCTGTACCGCCTCGGTCAGCGAGAGGAGAAGAAACGAGgagacgCGAGAGCTGGGAGGTCCGAGCCGGATCACGCGACTCCTACACCATCACCAGCTCCAGGACTCACAGGAGAAGAAGCTGAACTGGTGGAACAGCTCAGAAAGAACATCGAGTCTCGGCTGAAAGTTTCGTTGCCTAGCGACCTGGGGGCGGCGCTGACGGACGGGGTGGTGCTGTGCCATCTGGCCAATCACGTGCGGCCTCGCTCAGTACCCAGCATTCACGTGCCCTCGCCTGCGGTGcCCAAACTGACTATGGCTAAATGTCGACGGAACGTGGAGAACTTCCTGGAGGCGTGTCGTAAAATCGGCGTCCCTCAGGGAAGCCTGTGTTCAGTTGGCGAGGTGTTGGAGGGCAAAGCACTGTGTTTATACAGACTGATCGACGCTTTGCTCTCGCTAGCGCCCCCTATGCGTCCGTCGCCTCCGTCCCAGCTGGCCGGCTTCGCGCTGTTCTACCTGTCCTTCATGTCTCTGTTATGTGCTCTCTACTGCCACCTGGTGCCGTGTTTTTAATCAGCACTCGTACACTTACAGTGTGTCTTCTGCACTGAAACTAGAACAAAAGCGTTTAACGTTCGCACTAATAAACCagacaatcatcatcatcatcatcttcctacGAAATCCCTAGAGGTTTACTCTTAAATTCGGAGGATGATCTTCAGCATAATTAACTAATGATCGAATACCACATGGTCAGATTGTAAAGCACAACAGCTCATTGGATGATGGATTAATAACAGACAGCACGAGGAAACGTTTTCAATTTTTGTCTGAGTCCTCTCTCAagaactgttttttgtttttattgtttggtTTTTACCATCGTGTTAGTTAATTTATTCCTTCAAACaagattgaatttttttcttcactgatAACTAGCTTTGATACCGAAACACACACCAGGTATCCGTCCAGTTCCGTGCTCATTTACTCGTACTCgatttggaaaaaaatcactCGCTCAGAagtttagttcctacctgcagttagttcccatttactgacTGATGGAAGAAAACTTATAACTGTGGTTTCGTCTTACCCTGCTGTATACGAACTCTCATGAAATGTGTgtagagacattacaaagaaaaataaaaaccaagcttggaaggaagtagcagagatcttTGGTTCCTTCGATGAATGTACGTAGCTTGTGCAGTTAGCTCGCTTTGGTCGTTTAATCTGAGAACGTCGCTGTGTAAATGAAACAAGCAATTTTTACACCGATTagtgaattatttaatttctatttaacctgttagctttagaagctttATATAGCTACTAGTATTTCTCATgacaagccacgcccacaagagacaaacttcGAGCAGCttgtcagtggttagtgtgaACGTAGGAAATGGGGTTCAAACTGAAGCtccatttaaataatgtactCGTGAATAATACGAATAGACTGCGTacaattttgtgtttgtttatgattGTTTTTGATAGctgatggaataaaaaaaaaataaaaacagtttttgtttgtAGACTCAGACATTTGGATACTATTTGTATCAGGAATTTTCCCAAATGCTGACTCGGAAAACATCTCACTGCTTAAAGGAAGTAGCCATACGTTTATTAAGCCGATAAGTGCCCCTGTTCAAATCCAAACATTTTACAATCTCTCCTTCCAAAGAGTGGATTTGTTGAACTCTTTACTGAGAAACGCTGCTGTTATTTCCGAGCTTCTTATCGGCTGCTTTTAGTGGTGCGCATTTCTAAGCATACAGTAACGATTGTTTTTAATCTGCAATAATGTATTCTGGGTTTCAGGGTTGAGAAATTCAAGCCTTTTTGTTCTGTTGATAAAAAGGACTGTTGAAATAGCGTATCTGTAACTTTGTAAGTTAAATAGATAGCTAGAACATAGCTTTGGAAATGAATGTtagggtttttgtgtgtgtgagatgatctAAGACCAGTatgagaggtttgatagtttaAACCAGTGTTTTTCAAATAGAAGGTATTTCCAGATACTACTGAGCAGAAAAGACTTTTAAGGGGAAAAGGGTACTaattaatactgtttttttcccctagatattattttaatgtaataattagaACTACGAATTCCATTCCAAAGGTCTAGTAAATATATGACGAGCGTGCCGCTCCACTGGCATTGCACCTGACCTTTAACCCTTATCTTGTTGGTGGTGAGCCCACAAGATGGCTCCACATTGCCGTTTGGGCTGAGATTGACTGCGCAGTCACCAGTCACTCACCTGCGGACACTACCTCCAGGCCTGGCTCCACCCTTTATCATGGTGATGAGCCTACAAGATGGGGTCTCGTTGACATTTCGGGCTGAGCTAGACCCGCTCGCCTGCAGATACTACCCTCAGGTCTCGCTCCACCCTTCACCTTGCAGATGGTTGAGCCCACATGATGGCTCCATGACTCCATTTTGGGTTGAGTTCGACCCGATTACAAGATTGGCCCAGTCACCAGAAGCTGACCTGCAGACTCTACCCCCAGGCCTGGCTCCACCCTTCATCTTGCAGGTAGTGAGCCAACAAGATGGTCCATGTAATCATTTCAGGCTGAGCTCGCCTGGGTTACGTGAGTGACCCGGTCTCCAGGTCTGTGAACACCACCCCCAGGTTTTGCTCCAATGGTGGGTTCCTTTAAACCTTATTCCATGCAGGGTACATCTAGTCTGTTTTGTAGCTTTTATAGCGGTCATCACTCCTTGCCTGATTTCTCCTCTTAGACCTGTTCAGCAAGGGCGGCCCTACTGGGAGCATTAAGCTCCCGGTGACGTAGCCCTGAGGTTCACTGAAGGACACCCCTCTAACTGTTGCAGCATTACAGTCACTTCACCGATCCGTTGCGGTGAAGCAGGAACTCGGTTTGTAGATGAAGCGCACTGTTTATCGGTCATTCTACGTGTTTATAAGTTCTCAAGTACAGGTTgtggaaatgaggttcctctaCATGCTCTCTGTGATACGGTGAGTAGTTTGATGACCTGGAAGAGCCTCTGAGTAGTGTTGCTGCTTCTTGCTTTGATTCCTTGCTTACAAGGATGCCTCCTGGTTGGAGATGGTTCAGGCACGTAGCAATGGACTGAGACTCCGGGGCAGACCCAGGACCCACTGGAGATGGTATGTAGGGATAGAGAAAGTCTGGTCTAAACTTCTCAGCTGGTTTCCATCATGACTTCCACcatctatttatatataatatatattgcaATCTGCAGTGTATGTAGCTGTGCAGTGAATGCTCTTCATACAGGAACTATGGTCTTTCCCTTACAGATATCTTCCTAGTGTTTCTAGTGCAGTAAAGGGATACTTGACTTAAATGATCATTGAAAGGGGTCTACAGCCAAAAGAAAAGTTTGGAAACCACTGGTTTAAACACCTTCAgtcagtatttgtgtgtgtgggttataCACGCTGATGCCTAATGTTCTGATAATCCTTTAAGTTTATGACTCTTCCAAAACTTTTACAATAAAATTGAATCCTTGTCCTTCACTGTTTCTGGCTCTTTTGCTGCTACTTACTCCAGTGTTATTCATCCTAATCTCTATCCACCAATTCTGACGACAATTTAGTCACTTCAACCTGGTCACTTTTAAACTCCGTCAagcaataaacatttaaaatacacaaatttaaaGCACAGATTCAAACCTGCAGCTATTAGATGTGAGAGAAAGTCGTACCAGATCTAGAAATCTTCTCCTTTTGTTGTAGCGTTCAGGAGTGTTTTAGGGATGTGGATTTGTAAAGAACTCTAAAAAATGAGAGTTGTGTTTGTGGTAATTTTGGCATAAAcgcaatttttttcttcttaaaaaagTCGTACCTGTCGTGATGTCACGTTATAAACAAAGTGACTCCCACAGTTAACAGTTTTTAGGAGTATGAGGTCAGGATTTAACTTTatccttctatctatctatctattggaCATTCCTTTAGTATTAATACAGACTTACGAACCTTCCGGGATTTTGCGTAGGATCTCCGCATTTTATCGTTAAAGTACGATACTCCAACATATGCCAAAAGCGCTAAATAAAAACCTCAAACGAAATAATTCGAATCATATGAATCCAGTTGCGTAGGTGATTTTTACTAATCGAAATTAATTGATCCCCCtcgaagccccgcccccttctgAGATTTCACGTTAGTAACGTTTCAGTCTCGATTCATTTAGATTTTTATGCGAGAAAAAAAACGCAATAACGTGGCGTCTTTGCTTTCTGTCATGGTAAATTGAGTATGTTTTGAGTttattaatgagaaataaaattgatcaatatactgtatgttctttTGGTAGTACGTTCCATaaaattattagtttatttatttatatttattagcgaTGTGACTGAAATAATCTCGGGAGGAAAACAATCGAAAACAGCATTTCTGCTTTTCGTGTTTAGGTTTATTGACGGAGTTTAATAGCTGCTTTTAGACTTCGGTTCTAGTTGAGTTCGGAGTGAACGCGGAAATTCATATTTGTGatgaaatatcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactgcagatacAGTGGAGAGAGGTTAGGTTTAAAAACACTGGAGAGTTCTCTCTTTTCTGATTGGCCTCTCTTCTATTCCGCTTTTACTCTTCTGCGTTTTCCCCACAgtcatggttttgttttttttttttttcccctcattcatCTCTCACTCCATTATTAattttacacagttttatttttaagtttgacatgttttctttttttttatttaattatatcattgttttttt

Function

symbol description
lrch3 Predicted to be active in cytosol. Orthologous to human LRCH3 (leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3).

NR:

description
PREDICTED: leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 3 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network