strn (strn,LOC108271087,LOC108430145,LOC107702041,LOC107701064)


Basic Information

Item Value
gene id strn
gene name strn,LOC108271087,LOC108430145,LOC107702041,LOC107701064
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047605.1
NCBI id CM018551.1
chromosome length 26640196
location 7296707 ~ 7354330 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026930513.2
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>XM_034308645.1
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Function

symbol description
strn Predicted to enable armadillo repeat domain binding activity; calmodulin binding activity; and protein phosphatase 2A binding activity. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in dendrite. Orthologous to human STRN (striatin).

NR:

description
striatin-like isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K17608 STRN1_3_4; striatin 1/3/4

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026930513.2 False 6160 mRNA 0.44 18 7296707 7354052
XM_034308645.1 True 6330 mRNA 0.44 17 7296707 7354330

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cfap410 c10h21orf2,cunh21orf2,LOC107713232,LOC107564578 coding downstream 44114 7248348 ~ 7252593 (-)
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Expression


Co-expression Network