G24516


Basic Information

Item Value
gene id G24516
gene name NA
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047596.1
NCBI id CM018542.1
chromosome length 35203048
location 9863367 ~ 9868278 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU29080
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>TU29081
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>TU29083
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU29080 False 3413 TUCP 0.39 3 9863367 9868278
TU29081 True 4468 lncRNA 0.37 2 9863367 9868278
TU29083 False 3881 lncRNA 0.39 3 9863367 9868278

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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ilrun c11h6orf106,cunh6orf106,zgc:101577,LOC107724532,LOC107595408,LOC107666165 coding downstream 326463 9519378 ~ 9536904 (-)
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LOC113534196 dnttip1 coding upstream 114787 9983065 ~ 9992886 (-)
pcif1 pcif1,LOC107666074,LOC107696439 coding upstream 126071 9994349 ~ 10006093 (-)
ctsa ctsa,LOC107587598,LOC107696438,LOC107744356,LOC107666023,LOC107560512 coding upstream 157146 10025424 ~ 10033450 (-)
G24268 NA non-coding downstream 187628 9675522 ~ 9675739 (-)
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LOC113532571 NA non-coding downstream 247784 9612380 ~ 9615583 (-)
LOC113532565 NA non-coding downstream 266882 9594496 ~ 9596485 (-)
G24572 NA non-coding upstream 69978 9938256 ~ 9939043 (-)
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G24617 NA non-coding upstream 292754 10161032 ~ 10161241 (-)
G24620 NA non-coding upstream 299933 10168211 ~ 10168469 (-)
G24623 NA non-coding upstream 302692 10170970 ~ 10171175 (-)
tnnt2b tnnt2,LOC108441587,LOC107696448,LOC107595452 other downstream 137316 9715516 ~ 9726051 (-)
tusc2a LOC108271982,LOC108433681,LOC104930950,LOC107595412,LOC107724521 other downstream 421522 9435506 ~ 9441845 (-)
tcta glyctk,tcta,LOC106582802,LOC106565977 other downstream 1379186 8479374 ~ 8484181 (-)
arl6ip5a arl6ip5,LOC107680705,LOC107750278,LOC107599422,LOC108424109,LOC107667022,LOC107713508,LOC107584514 other downstream 1511673 8343624 ~ 8351694 (-)
mitfa mitf,LOC108424034 other downstream 1598138 8260485 ~ 8265229 (-)
G24760 NA other upstream 621015 10489293 ~ 10490295 (-)
itcha itcha,LOC108271999,LOC108431834,LOC107681287,LOC107666068 other upstream 1047764 10916042 ~ 10934164 (-)
kif5ab kif5a other upstream 1574193 11442471 ~ 11485469 (-)
LOC113526127 LOC108272031,LOC108431803 other upstream 1818467 11686745 ~ 11764135 (-)
slc5a8l slc5a8l,LOC108272176,LOC108427595,LOC107708058,LOC107685825,LOC107554166,LOC107666019,LOC107596840,LOC105007571,LOC107729725 other upstream 3625234 13493512 ~ 13502170 (-)

Expression


Co-expression Network