LOC113538473



Basic Information


Item Value
gene id LOC113538473
gene name NA
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047596.1
NCBI id CM018542.1
chromosome length 35203048
location 22547254 ~ 22552299 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>XM_026933565.2
TTTTTTACTCCGTTATATAGCCTTTTCCTCATCTCGCTAACTGGTCTGGGAAGGATAATGATCCTCTGGTGAAGAAAATGAAAGGTTTGTCTGTTTTCATGGCTATAGtacTGTCCTTATCATTGGCCAAACACAGAACGTCTGATgAACTTGTTCTGACTGCCTGGCCGAAGAGGCAGCACTTCTACCTCGGGGAATCCATCGTTCTGACATGTAAGGTAGAAGGGAACTCTTCAGCGGTGTGGAACTACAGTTGGTTTAGACACAACCTCAGTAATGCTTCTACCCCCAGCCCTGCTCACATAGTGAACCATCACACGTACAACATTTCAGCGCTGACCTATGAGGACAGTGGCACTTACTGGTGTACAGCTCAGGAACAGGGCAGAAATTCCACCCTCCTGAGGAACTCTTTAAATGTCACAGCAGCTGTAGATATCTCCAAAGATCACTCAGAGGAAGAAAACACCTTTCTAGGGGCCTGGGTCTGGGCCATCTGTGTCATTGTCATCATTCTGCTTCTAATCCCTATCACCTTTCTGCTCGTACCAAGCCTCAGAAAGAGATTAAAGTTGTTTTCAACATGCGGAGAGTATAGTGCCCATCAGGAAATGCCTAGAACCAAACAGGATGTGACAGAGATCCAGTGGGACCTGGCCTGGATGGAGATGACTAATCTGCTGGACAAGCCATATCCTGGCAGCTGAGCAGCTCTTAAACTATTTACATACTATTAGACTACTCATAATACAACAGTGCTTTGTTGTATGAGAAGGTAATGTTTATCAGAGAAGGTAAATGAGTATCAATGTATCCTCACGAAGCTGAAATGTGACAGTAAAGAAGAGCAAATAGTGAAAAACTAACCCAAGTCAATATTTAGTGTGACCACACTTTTCCTTGAAACGGATCACTTAATCAGATCACTTCAGTACACACTGTTATGCAGTCTTTTAAGAAAATTGGCTGGTAAGTTTTTCAAGCATCTTTTTTCTGAAGACTTTGGCTATCACTGATAATGTGCCgtaatgtattattttctttaacaccatacaaatatttctttgtaacataattttttttttgtaaaatgaataTTTGGAAACTTAAAATTTGTGATTTTCTCCTGAGCCAGTAATACAGAAGAcattaaaatctcaaaaaaattatataatctctaaaatattatcaaaatctcttttctgaaaaaaaaagagataacaaaagacaacaaaacttttaaaaaaattcaataaactTCACGCTTTGTGTATGTCAGGTAActgcataatgtgtgtgtgtggacacacacacacacacacacacacatatatatatatacatgttctattctattctattctattaggCAATCAAGCAATCagagttagaaaaaaaaagtgtctcatttttaaatataatttgttcTGTTCTTGCAGATCCACAAGACAACACTGCTTTAGCTCtcttcctgctctaacacacttgaAGTTGATCAGTGGCTTTATAAcaagcttttaatttttttaaaataagaaatgcagctttcgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcagttgtcAAGGTCACAAGGTCAAAAGGGTCATATATTCCTATCCCTAGCAAGACataaacacctacacacactcacatacaacctgttctgtgtttaaaaaacactAGAGGGCAGAGCTGGCATTATGAGATTGCCTGTTGTTGTTTTGTCCAGCCTTCATGCGACAGtcagatttaataaaaacaccTTTGCACTGTGATCAGAGCAATATCATGATAATGCATTATAGTAGTGATAAATCTGATAGGATTCTTACAGTCAGGTTAAcaaaagagtgtgagagaaaacTGTGACTCTAACagtatttttcttatttttattgctCTGTTCTCGAAGCgtggttgtttttgttttatatggTAGAGCTTTGTCTCAATGGCTAGTGGTTGAGTGGTCTGTGTATCACAGCTCATTGCCttacagcattacagcattacagaAGGCAACATTAGGTGctgttttataaatattgtaagGCAGAAACATGGACAGGACAACCCTTAGGCAAGAAATAGGCTTCTGCTGCTCTTGTGCTTTCTTCCACACTTTATTGATTCTTCCTGGTGCCACACTCCTTCTCCACACAGCCTTAATTACAGCAGTGTGCAGTAATCTTTCACCTTCCCATTCCTCTGTTATTCCCCTTCTCTTCTCCTAGAGGGCAGACTGTAATTGTGCATGCGCATTTTCACAACCATGCTTCATTGTCTGGGGCCTGCTGATTCTaaggagagaacacacacacacaca
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ATTTGATACGCAAGAATGAGATGCAGTCTGTTTGAAGAATATTATTGACATTTAtttcctaataataaatCCTTTTCCTCATCTCGCTAACTGGTCTGGGAAGGATAATGATCCTCTGGTGAAGAAAATGAAAGGTTTGTCTGTTTTCATGGCTATAGtacTGTCCTTATCATTGGCCAAACACAGAACGTCTGATgAACTTGTTCTGACTGCCTGGCCGAAGAGGCAGCACTTCTACCTCGGGGAATCCATCGTTCTGACATGTAAGGTAGAAGGGAACTCTTCAGCGGTGTGGAACTACAGTTGGTTTAGACACAACCTCAGTAATGCTTCTACCCCCAGCCCTGCTCACATAGTGAACCATCACACGTACAACATTTCAGCGCTGACCTATGAGGACAGTGGCACTTACTGGTGTACAGCTCAGGAACAGGGCAGAAATTCCACCCTCCTGAGGAACTCTTTAAATGTCACAGCAGCTGTAGATATCTCCAAAGATCACTCAGAGGAAGAAAACACCTTTCTAGGGGCCTGGGTCTGGGCCATCTGTGTCATTGTCATCATTCTGCTTCTAATCCCTATCACCTTTCTGCTCGTACCAAGCCTCAGAAAGAGATTAAAGTTGTTTTCAACATGCGGAGAGTATAGTGCCCATCAGGAAATGCCTAGAACCAAACAGGATGTGACAGAGATCCAGTGGGACCTGGCCTGGATGGAGATGACTAATCTGCTGGACAAGCCATATCCTGGCAGCTGAGCAGCTCTTAAACTATTTACATACTATTAGACTACTCATAATACAACAGTGCTTTGTTGTATGAGAAGGTAATGTTTATCAGAGAAGGTAAATGAGTATCAATGTATCCTCACGAAGCTGAAATGTGACAGTAAAGAAGAGCAAATAGTGAAAAACTAACCCAAGTCAATATTTAGTGTGACCACACTTTTCCTTGAAACGGATCACTTAATCAGATCACTTCAGTACACACTGTTATGCAGTCTTTTAAGAAAATTGGCTGGTAAGTTTTTCAAGCATCTTTTTTCTGAAGACTTTGGCTATCACTGATAATGTGCCgtaatgtattattttctttaacaccatacaaatatttctttgtaacataattttttttttgtaaaatgaataTTTGGAAACTTAAAATTTGTGATTTTCTCCTGAGCCAGTAATACAGAAGAcattaaaatctcaaaaaaattatataatctctaaaatattatcaaaatctcttttctgaaaaaaaaagagataacaaaagacaacaaaacttttaaaaaaattcaataaactTCACGCTTTGTGTATGTCAGGTAActgcataatgtgtgtgtgtggacacacacacacacacacacacacatatatatatatacatgttctattctattctattctattaggCAATCAAGCAATCagagttagaaaaaaaaagtgtctcatttttaaatataatttgttcTGTTCTTGCAGATCCACAAGACAACACTGCTTTAGCTCtcttcctgctctaacacacttgaAGTTGATCAGTGGCTTTATAAcaagcttttaatttttttaaaataagaaatgcagctttcgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcagttgtcAAGGTCACAAGGTCAAAAGGGTCATATATTCCTATCCCTAGCAAGACataaacacctacacacactcacatacaacctgttctgtgtttaaaaaacactAGAGGGCAGAGCTGGCATTATGAGATTGCCTGTTGTTGTTTTGTCCAGCCTTCATGCGACAGtcagatttaataaaaacaccTTTGCACTGTGATCAGAGCAATATCATGATAATGCATTATAGTAGTGATAAATCTGATAGGATTCTTACAGTCAGGTTAAcaaaagagtgtgagagaaaacTGTGACTCTAACagtatttttcttatttttattgctCTGTTCTCGAAGCgtggttgtttttgttttatatggTAGAGCTTTGTCTCAATGGCTAGTGGTTGAGTGGTCTGTGTATCACAGCTCATTGCCttacagcattacagcattacagaAGGCAACATTAGGTGctgttttataaatattgtaagGCAGAAACATGGACAGGACAACCCTTAGGCAAGAAATAGGCTTCTGCTGCTCTTGTGCTTTCTTCCACACTTTATTGATTCTTCCTGGTGCCACACTCCTTCTCCACACAGCCTTAATTACAGCAGTGTGCAGTAATCTTTCACCTTCCCATTCCTCTGTTATTCCCCTTCTCTTCTCCTAGAGGGCAGACTGTAATTGTGCATGCGCATTTTCACAACCATGCTTCATTGTCTGGGGCCTGCTGATTCTaaggagagaacacacacacacaca
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Function


GO:

id name namespace
GO:0019825 oxygen binding molecular_function

KEGG:

id description
ko00460 Cyanoamino acid metabolism

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
adcyap1r1b adcyap1r1b,LOC108271541,LOC108441855,LOC107731652,LOC107717143,LOC107692394 coding downstream 33196 22484092 ~ 22514058 (-)
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gpbp1l1 gpbp1l1,LOC107731630,LOC107551044,LOC107725200 other upstream 30004 22582303 ~ 22593861 (-)
dmrt2b LOC108271504 other upstream 669994 23222293 ~ 23225548 (-)
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nbeal1 nbeal1 other upstream 3127791 25680090 ~ 25738817 (-)

Expression



Co-expression Network