ankha (ankh,ankha,LOC108256444,LOC108434238,LOC107724566)


Basic Information

Item Value
gene id ankha
gene name ankh,ankha,LOC108256444,LOC108434238,LOC107724566
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047616.1
NCBI id CM018562.1
chromosome length 21037487
location 11717415 ~ 11748559 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU391847
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Function

symbol description
ankha Predicted to enable inorganic diphosphate transmembrane transporter activity and inorganic phosphate transmembrane transporter activity. Predicted to act upstream of or within phosphate ion transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in autosomal dominant craniometaphyseal dysplasia and chondrocalcinosis. Orthologous to human ANKH (ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator).
ankh Enables inorganic diphosphate transmembrane transporter activity and inorganic phosphate transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in ATP export and regulation of bone mineralization. Is integral component of membrane. Implicated in autosomal dominant craniometaphyseal dysplasia and chondrocalcinosis.

NR:

description
PREDICTED: progressive ankylosis protein homolog

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU391847 True 7652 TUCP 0.38 4 11738158 11748559
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XM_026938297.2 False 3870 mRNA 0.43 13 11717498 11743711

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G330856 NA non-coding downstream 77580 11826139 ~ 11826390 (+)
G330869 NA non-coding downstream 125433 11873992 ~ 11874192 (+)
G330908 NA non-coding downstream 147107 11895666 ~ 11895891 (+)
G330911 cdv3 non-coding downstream 195471 11944030 ~ 11946238 (+)
G330962 NA non-coding downstream 276017 12024576 ~ 12034059 (+)
acad11 acad11,LOC107715568,LOC104947469 other upstream 733206 10874209 ~ 10984209 (+)
G330257 NA other upstream 742500 10973264 ~ 10974915 (+)
gli3 gli3,LOC108444237 other upstream 949055 10595130 ~ 10768360 (+)
G330038 NA other upstream 1284551 10431333 ~ 10432864 (+)
cdh19 LOC108256684 other upstream 1778947 9856182 ~ 9938468 (+)
prkag2a prkag2,prkag2a,LOC108256599,LOC108434244,LOC106590432,LOC106579597,LOC107729655,LOC107590261,LOC107757712 other downstream 313773 12062332 ~ 12156787 (+)
G331263 LOC108256200,LOC100304628 other downstream 958380 12706939 ~ 12712678 (+)
G331476 NA other downstream 1509335 13257894 ~ 13258416 (+)
stau2 stau2,LOC107691439 other downstream 3385794 15134353 ~ 15314968 (+)
si:ch73-173p19.2 LOC108256301 other downstream 3503076 15251635 ~ 15265895 (+)

Expression


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