G340197


Basic Information

Item Value
gene id G340197
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047617.1
NCBI id CM018563.1
chromosome length 20335669
location 8399218 ~ 8411358 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU403089
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU403089 True 12110 lncRNA 0.39 2 8399218 8411358

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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si:dkeyp-120h9.1 si:dkeyp-120h9.1,LOC108257412,LOC106570559 coding downstream 325801 8737159 ~ 8750226 (+)
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G339830 NA non-coding upstream 585354 7813632 ~ 7813864 (+)
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G340257 NA non-coding downstream 202128 8613486 ~ 8617041 (+)
G340297 NA non-coding downstream 257221 8668579 ~ 8668782 (+)
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G340339 NA non-coding downstream 439610 8850968 ~ 8859663 (+)
G340208 LOC108256789 other upstream 114014 8282960 ~ 8285204 (+)
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G339324 NA other upstream 1682072 6711015 ~ 6717146 (+)
mturn mturn,LOC107559763,LOC107572558 other upstream 1783195 6604605 ~ 6616023 (+)
LOC113535938 tmem196,LOC106588729,LOC107667578,LOC107568813,LOC107755951,LOC107571147,LOC107655099 other upstream 2055309 6333989 ~ 6343909 (+)
sem1 NA other downstream 501570 8912928 ~ 8915846 (+)
sgce sgce,LOC107722147,LOC107669779,LOC107665667,LOC107731676 other downstream 707656 9119014 ~ 9134179 (+)
bet1 bet1,LOC107669829,LOC107722155 other downstream 813246 9224604 ~ 9229638 (+)
zgc:91910 zn706,LOC108425704,LOC107653862,LOC101168967,LOC107556412,LOC104931588,LOC107710523,LOC107670289 other downstream 1782389 10193747 ~ 10197002 (+)
G341451 col8a2,LOC107565043,LOC107710560 other downstream 2063125 10474483 ~ 10481970 (+)

Expression


Co-expression Network