G4831


Basic Information

Item Value
gene id G4831
gene name NA
gene type unknown
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030121.1
NCBI id CM030121.1
chromosome length 57050121
location 28062363 ~ 28103211 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU5898
agagagagagacacagagagagagagagagagagagagacggaaaaATCAAAAGAGGGAAAGCACGCTAGATCATGCGAGCTAAATTTGTGATCGCTGGAAATCGGGATGTTAGATTGATGCGGAAGATCGCCCTGATTCAGAGAAAAAGTTTTCATCTCACACGTGTGGAACAGAGGGCCCACGGGGAAACATGGCCGAAGGAGGGGCGGGTAAAGGTGGCGGAGACGATCCTGGGAAATTGCCCGAGCAGGAAGAAGAGGATGCATCCCAGATTCTGCACGGAACAGGCCACTGTAAATGGTTTAATGTCCGGATGGGCTTCGGATTTATATCCATGACCAGCCGAGGGGGGAGTCCTATCGAAACCCCTTTGGATGTATTCGTACACCAAATGCTACAACTGTGGTGGCCTGGATCACCACGCTAAGGAATGTAATTTACCTCCTCAGCCAAAGAAGTGCCATTACTGTCAGAGCATCATGCACATGGTGGCCCACTGTCCTCACAAGACTCTCACGCAGCAGCAGCCCGCCAGCGCTCAGGGAAGATACGAAGCCGAACCGCAGCCTTCTACCTCTGCTTTCCAGAGAGAAGGAGCCTACTCAACACCACCCTACTCTCAGGAGGGAAGAGCGGAGGTGCCGGAGAGACCGGGCCGCTCCCCCCAGGAAGCTTCCTCAAGTAAGTCTTCTGCGTCCCCGGAAGATCCCAGTCGGAAAGGACCATCTgtccaaaaaaggaaaaagacctaaaaaaaaggtattttctaAAAGTTCTCAAGCTTTTATGCTTCCTTTTTGAATCTGGATACAGCATCTACCTCATACTTGCAAAAGTACAGGGGAAGAAATCTCACTCAGTGCAGCTCAAGCTTTAAAAccaaggaacaaaacaaactactgtCTTACAAACTGTGAATTTGTCTTAAAGTATTTAACCAGTCCTCTTCTGATGTTTTGTGGACCCGAGGGCACGTTTAAGgttggtttttaaatgtacctcACTTTAATCCATCTCCATTCAATCATGCCATCCTTTTATGTGTCAGAGGCTTCCATTCCAGACACAATCATTGTAATGTTCCTTCAATGCGTTCCCTTACTGTGTATAAACCAATCCTGTTTTTctagatttaatttgattttttaagAACTTTTTTAAGATTTTGTTGAAAGGCCTTCCTCCCTTTCTAGGGAGATCATGACTGTTACCAATCAGAAACCAAAGGATACTTTGATCGGTATCTTAACCCCAGGAAAGAAGAACACCAAGGAAAcccttaaaataaacacacattggtaaaaacattcaaaagatGCAAATATTATGGCAGTGTTTGGCCCAATCAAGgcaatatattgtattcaaaatgCTGACAACTGCCATCAgcttatatttttccttttctttttttaatgaatgtttcTATTGTGTGCCTGTGTTGCGAATGCTGTTTTACTGGATATTTGATGAATTCTGTGAAACCTTAGTAtccgtttaaaaaaaatgttgcttgaaagatgtttttatgtgtttctaCTGCCATGTAGAATCTGTTCCTGTTGTGAATACAAAAGCAGCATGTCGGAATCATTGTATACCTGCTGATGTTTCTTGAGGcctgctttcatttcatttcttagGACTTACTTGCGTTATTAGTCTAGTGTAATTAGCCCACATTAATCTTTAAAAGGTCATTGTTGAATAGAAAACCCTATACAAGAATATCAGCAAAAATATTCTTTATATAGGTAATATGAAATAGATTACACTGCAGAAATATCCCCgtatttaatctgaattatGGTATCTAAAGAAAATGCTTGTTTAGCTGTGAGCAAAGACTATATTACAGCTGTaaagaattaatttaattcctgaaaatatgtacataaatatatctatataaaataagttttaatgtTAAACCTATCAAAtgataacaatttatttttaagtgttcttttttaatatacctTTTGTGTTTGATAAGGCACTCTCTTAAGTGCATACATTCGCCTATGCATGGCCTCAAGTTACTTAATTCAGCACTAAAtagttgttttccttttgcttAAGAGTAAGAGAATTACTGCTGCTTTTGTTGTCCACCGTTCAGAATGTTGcctgaggaaaataataataataataataataataataataataataataataatggcacaGTTTATATATGACTACACTTGAATtcttcaaatgtgttaaaaaaaaaggctgacCAATGATATGATGCTGTACATTTCGAAACTTACTCTGCTTTGACGATAATGAATGTGAAATATACCTCTAGAAAGTGCATCCTCACAATATCAGAGGATTCTcactttatttaatgtgttttgacaAATCAAATGACATTTCCTTATATTATAGTAATCAAGAAGACagccaattatttttgttataagGTGCATGTcattttggaaaagaaaaaaagaaaaacgataCCAAAGTTTCTTTATTGAAGGAATAAAGTATGAATAATGCCTACGTGGTATTCCCTGTTACtccaaaaacataaatgcaaatggTTCAGCACGCAGATATTTAACACTGCTCTAGAACCTGTATGTTGGCATGCATTGAAGTCAATCTGCAAAGTGCACTGCAAAGCAACAAACTAAGCAACAGCACAAACCAAATGAATTCTGTGACTGTTGATTTGGCATTTTCtatgctatatatacacattcacaaAACATCTCAGGATGAAGAACTATACTCAGGGAAGATACCAGGAAAGTGTACTTTTTCTTTACAGAATAGTTTGCAAACTTCTTTAATGTACTCTGATCAAGCAAAATAGAATTAGTGTTTAATATCTATATGTTTTATGTACTGATATTAGTAACTACCTCTGAGTTATACATAGTCATACATTTCTGATAATCTGAtgacttttttgtattttacttcatATAAACGTAACTGTAGAATTGTATTGTACTGAAAGCTTGTGTAAACATCAGTTTTCTCTTACATGACTTTTACACAGGTGAagatttttatactgttttaaagATGGTAATATGACGGTAATCTCAGTTTTCTGTTTACAGCAAAAGCCTACCTCATTCTTTCTGTTTGGTAAACCTTGATGCTCGGGGGGCTAAAGATTATTTGGTAGAATCTGATAAATATGTAAGATTTCAAACTGCAATTTTATGAACAAAACAAGTGTGCTGTCcttgattttcattttgaagatgtGCATATCAGTGAAAGTGGATCACTTGTGAACACGAATGTCTAGCCCTGATTTGGAAAATTCCGGATATAAACATCAAACATGAGTgatcagagattttttttttaaagcactgatgCTGAATCCAGGTCCCAAAGGGACCTTACATTGAATCCACAATGGACTATGCCTTTTGGACAGTGGCAGTTCAGAccaattatgtaaataattcaTAAGTCATTTAGACATTAGGTTGATTGAAAAACAGATGACACTGCTGCCGTTTAGGATCAAGAGGGCATATCACTAAAATAAGCCTTATGAGTCTCTGAACTGCAGACCAGAAATGAGTCCTTGATTCTGCAAACCCGAATGGactgcagtttgtgtttgtgtttacagtgtTGCTCCAGAGTTGGACTGTAGATGTGGGAAATATTGATCTCATATCAGAACATCAGTTTAGAGATTCTCACTACCCAAGATGCATTGAGAATGATTGATGAAGTCACCCTGGTAGGAATTACttgaactttgttttttaatggcttAACAATCAAAAGTAGTGTTTCACCAAGTATTGCTGAAACTTGACAGTCTAGGAGCAAATATGCCCAAACAGCACATTAAGGACTCATAGTTTAAACCAAGAATCTGCTGAGCATTCAAGGAATATAACATTGTTTGattcttttatttctgtttttttttctactattGGTATTTCTTGTCTCTCTTGTGGAATCAGCCACATTTGTATTCAGGCAAGAAGGAGTATTTTAAACAATCTGCATACAGAGGTCAATTTCCATTCAGACATGATGTTCATCAGATACAAAATGTAGGCATGTGAAGATATTTGTTAAACAATTGTGCATACATGTGGCATTATTAGCAagagattttgtattaaaatatttaaatggcatATATAGAGATCTCATTTTAAGACGTTTATAAACCTATGTTTTCTTCCGTTTAATTTAAACCCTTTAAATTCACtggttttgtaatatttcacaaatgtaaatgaaaagctTACTGCAGCttgtttacattaaatgtgtaattgaacATACAATGAAGCTCTCCACTATGGTATGAAATGTTAATTCCCgatgaatacaatacaatttctCTGATCAATATAactactgatttttttttctcctcttttctttctttagcaGAAAAATACAGGGATACGGTATTTATCAAATCACCACTAGATGCATTTAACAATGTAATGAAGACCACAAACTACTAGGGCTACCTCATGGTTTAAAACATACAGGGCTCTATTTGGCAATGTGTGCAAAGCCCAAACTGCCAGGTGTTGAAATAGATGCACAGGACTGTCCTGCCTGGCATGTGTGTGGAGTAATGTGGCAACGCATCCACagatgtgagtgtgtgagtttCATCTTGCATGTGAAAAGCCGCTCTAAACTGCGCACAAATGACAATATCACCATAGAAACGGTGAGCAAAGCAGTGAAAgacacaaaaagagagagagagagagagagagagagagaacaaacatAGGCTCACATTTTTAAGTATGCACTGGAAATGTTCCTGGTTACAAAGATGATAACTGGATTTGGAATATACCTTTGTTTTTTGGATCTCTCTGACAAGCTAatatatgttattgtttttattgtattgactATAGCTTaatctcaaaatgtattaatatattttagggAAAAAAAGGTGTTTGTTGGGTTAGTAATATAGAATAagtagtgtatttatttatttttattaatttgcgGTTC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>TU5899
GGCTAACCTATTGTTGTAGCTCTCCCAAAATGTTATGTACCGCCCCCATTGATTCACAAAATGCAAAGCTTCCTTGGGCTATTGTTgggcttgtttgtgtgtgatcaAGGACAGTTTTGGAGAGTAAGCAGGGGAAACGTTTGAACACCTGCCCTTTGAGTTTGATAGAAAGTTACTGAAGTGGATGGACGGGGGGTGATAGCACTGCATGTGTGGGGACAAATTGTGCAATCGTCGTCTTGCTGCTCGCCGCGcaattacattgcattttggTTTTACACTGTGGATTATGGGATCGGTCCAAAATCAGCACTATGCAAGAGGGGCGGGTAAAGGTGGCGGAGACGATCCTGGGAAATTGCCCGAGCAGGAAGAAGAGGATGCATCCCAGATTCTGCACGGAACAGGCCACTGTAAATGGTTTAATGTCCGGATGGGCTTCGGATTTATATCCATGACCAGCCGAGGGGGGAGTCCTATCGAAACCCCTTTGGATGTATTCGTACACCAAGATGAGGTCAGCCATCCCACCATTTCCACCATGGTCCATGTCTGAAACCTTATCCAGGGCGTCCCAGTATTTCAACTCACAACCTACTGACTCTTAACACAGGACTGTGTGGGGTGAATTGCCCACATTGAGGAGATTCTGTTTAGAACACTCTAATACTAATTTACGTCCATTATTTTTACCCAGCACTTGTCTGCCTTTTGTTAAATACTGTAACCTAGCACTTACTGAAAATCTGTAACATTTCACAAAGTACATTCATATTGTGGTATTAGTGTAGCCTCTGGTGGACATgctattttaataaagaaatctaAGAGACTACGACTGCAGCTAACACATTATTGCATAGTTGTAGCCTCAGAATGGGCAGTCACTAAGGCTAACCTACCTTCTCAATTCCACTTTAGGACATTTTTAAACCCTTCAGTGCTTCAGAAACGTTATCTGAGTGTTGATTTCTATAATGGTGTCCTAAACAAGATTTGAAAGTGGTTTTGGAGCCAGTTTGAGGAAAATTTTACTTtggtgtgtgtgcaggggttgatggttaaatatatttttttaacatacaatcATAGATTTATTCAATGTTGAGATGAATATTCTAGCTTTTAAACttggatttaaattattatatattcataagGCATCAGATAATACAAGTGGCCTTTTTGcttagatgtatttttttaatattaacaaatatacagacttgtattattatcattcttTGTTGGATATCTGTGCTTTATTAAACGGTCACATTTGTGAAAGAGAATACATATAGCCTAATTAACATTAGGTGGATTTTAATGCTACAATTGTTTACCACAGTGTGTGGcaactataattatttttattgttttaacactgcatttgttttatgatttcactgattatggatttccttgccaTTAATTTCAAATCATTGAATACAAATCTTTTTCAGTAATTAGGCtactaaaaatgaattattacaGGTAAACCTCAAGAGTGATCAATCTATTGGAATACATTAAAGCATGTTATCTTTAAAGAttgattgcattttgtttatccATGTTATATAATGTCCtcagtaaaagaaaatgtgtatttgtgtgccTCAAGTGTTCATGCTggttatataaaacaaagtatCGCCAAACTGTTTTTGGTGTTTACAATAAGCATTATGGGTATTTGAGAGCTGTCAAACCCCTACAGTTGTACCctcatgaaataaaacatattgttttatttgaaagcatTGTTAAATAACTATTTCTTGGGTGGAgtgcagtttgtttgtgtgtgagatgtTGACCATGGTTGAATGTgcaattttcaaatgtttttaatgttggtcTCTTGCCTTTGATGACCACTGCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU5898 True 5639 TUCP 0.38 3 28062363 28103211
TU5899 False 1885 TUCP 0.38 3 28062674 28067786

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00003973 grik2,LOC103365520,LOC107103501,LOC105917636 coding upstream 556214 27492506 ~ 27506149 (+)
AMCG00003972 grik2,LOC107667969 coding upstream 612469 27430090 ~ 27449894 (+)
AMCG00003977 grik2,LOC101466412,LOC102291713,LOC102207761,LOC107740554 coding upstream 680361 27380559 ~ 27382002 (+)
AMCG00003971 NA coding upstream 1182498 26878702 ~ 26879865 (+)
AMCG00003969 NA coding upstream 1307948 26721890 ~ 26754415 (+)
AMCG00003983 NA coding downstream 156485 28259696 ~ 28275388 (+)
AMCG00003985 NA coding downstream 251304 28354515 ~ 28369974 (+)
AMCG00003989 NA coding downstream 269935 28373146 ~ 28379173 (+)
AMCG00003992 rnf146,LOC107735261 coding downstream 484620 28587831 ~ 28591593 (+)
AMCG00003994 NA coding downstream 586677 28689888 ~ 28698767 (+)
G4808 NA non-coding upstream 284704 27777290 ~ 27777659 (+)
G4806 NA non-coding upstream 285921 27721460 ~ 27776442 (+)
G4804 NA non-coding upstream 478329 27583571 ~ 27584034 (+)
G4787 NA non-coding upstream 780122 27282004 ~ 27282241 (+)
G4694 NA non-coding upstream 1410796 26651285 ~ 26651567 (+)
G4837 NA non-coding downstream 999 28104210 ~ 28105707 (+)
G4917 NA non-coding downstream 363706 28466917 ~ 28468944 (+)
G4981 NA non-coding downstream 789473 28892684 ~ 28893031 (+)
G5005 NA non-coding downstream 849342 28952553 ~ 28953065 (+)
G5085 NA non-coding downstream 1251310 29354521 ~ 29361679 (+)
AMCG00003962 NA other upstream 1475471 26582667 ~ 26586892 (+)
AMCG00003948 sesn1,LOC102782344 other upstream 1977241 26081283 ~ 26085122 (+)
AMCG00003930 wasf1,LOC107661360,LOC107556997,LOC107739187,LOC107564591,LOC107667835 other upstream 2266568 25785173 ~ 25795795 (+)
G4360 NA other upstream 3378443 24683400 ~ 24683920 (+)
AMCG00003910 zbtb2b other upstream 3932471 24118384 ~ 24129892 (+)
AMCG00003988 NA other downstream 276600 28379811 ~ 28399741 (+)
AMCG00003990 NA other downstream 351208 28454419 ~ 28465646 (+)
AMCG00003991 NA other downstream 464973 28568184 ~ 28585674 (+)
AMCG00003993 NA other downstream 536963 28640174 ~ 28683981 (+)
AMCG00004011 ccnc other downstream 1424203 29527414 ~ 29541358 (+)

Expression


Co-expression Network