AMCG00013730


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00013730
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 40386061 ~ 40428625 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00013730
ATGATCGACTTATATGTAAGGATCCCTGACCTCttcttttcttatgttttaGTTGTGAAATGTGAAGAACCTCCTTCCATTCCTGATGGTACACAGAGTCCACAGCAACCAATATTTGAATACGGTGCGGTAGTCAAATATACGTGTAATCGAGGCTTCGACATGGTTGGAAATGAAAATGGTGAATCAGTTTGTAGTGCAGATGGGACCTTCAAACCAGCACCTCCGGAATGCAAAGTCATTGAGTGCCCCAATCCAACACTTGAATTTGGCTACAAGGTCACTGGACGTGTATCACCTTATAGAAAAAATcatcaaattacttttaaatgcaatgaTGGCTACACAATGAATGGATCAAGCACTGTTACTTGTGGAGAAAATGGCTGGTCCCCTGCTATTCCAACATGTTTCACAGGATTTACTACAACAACTCAAGGAACCAGGACTGAGGAGACACCTGTGAAGGgtggcACTAATGAAACTCCTCACACAGCGGTTATCACTCCACTTGTACTAATAGGAATAGGAATAGGGGCAGTGGTGTTACATAACATGAAGAAAAAGGAAGGGTGA
>TU57809
NTTTTTATTCCTGTCAAATAACCATCATTTTGGTTTCTTCTTTAGAAAAGAACTGTGGATCTCCAGGAGAAATACTAAATGGGGGATTTGATCTTTCTGAAGGTACCCTGTTTGGTGCAAAGGCAACAGGTCATTGTGATGAAGGATACCAGATTGTGGGAAGGAAGGTGAGACTTTGCTTGGCTGATGGTTGGAGCGGGGAGGTTCCACGTTGTGAAGTTGTGAAATGTGAAGAACCTCCTTCCATTCCTGATGGTACACAGAGTCCACAGCAACCAATATTTGAATACGGTGCGGTAGTCAAATATACGTGTAATCGAGGCTTCGACATGGTTGGAAATGAAAATGGTGAATCAGTTTGTAGTGCAGATGGGACCTTCAAACCAGCACCTCCGGAATGCAAAGTCATTGAGTGCCCCAATCCAACACTTGAATTTGGCTACAAGGTCACTGGACGTGTATCACCTTATAGAAAAAATcatcaaattacttttaaatgcaatgaTGGCTACACAATGAATGGATCAAGCACTGTTACTTGTGGAGAAAATGGCTGGTCCCCTGCTATTCCAACATGTTTCACAGcCCCTATAGTCCCCACTACTATTTCAACCACTTCCAaagcatcaacaacaacaaaatcaccaGTAACTGgtggcACTAATGAAACTCCTCACAATGGGTCACCTGATGGTAATGTCTCAGGTGGTGTAATAGCTGCAGCCATCCTGTTGAGTGTGACGCTGTCTATTAATTTGATGTCGCTTCCGTGAGAGACTGACCTTGgctgcaaaaaaattaaataaaaagtgcacAGACCCTTCCGCTGCGAAAGAGAATGTAGATATTGTATTCTGTCTGCTGGGCTGTTAATATTAATGCTTCAATCGGGGCTGGTAATCTGAGCTCAGGAGGGGAGGGGTGTGGAGATCCATCTTGGTGTGTCTTAGGCAAATTGTGCAGGTAGATTCTGTGTTTCCCTATTgagtatatattaaaatgtataattttctgCTTGTAAGAGTCACATTATCAGTCCACTGCAATGTAATATTTAGCCTTATGCATCTATCGTACACCTACAGACAGAATTATCTTGCCACTGAGAACCCAGCATTGTACAAGCAAAATGTCAGCTTATGTCTAAAAATCTTCCTGTTTATaccttatgtttttttttttttttaagcttaatTTCAGTCGTGCAGCCACAAGAAGCTGATTAAGTTGCCTATTGAGCAATTGCTGTCAACCATCCGATTGCATCACTTTAACAATCTTAATTAGTCATTCTGTTACTACAAGAGTACATGCGTCCGCATGCCGAATTACAGAAAAATGCATACGgctaatgtatgtaaataaacgATTTTTTATCaggaatacacacacatcagaaaataaatttaaaaaatgcatgtaagCCTTAAAGCAAAACCATATAATTTGAAGAGAATATattggtatttaaaaaatgtatacaccaTCATTTTGTTCAGTGAAAACTTtccacataaataaacatgtccGCATTATTTTCAGAGGCAAGCTTTAATTCCAACTATTCCTTCTCCATCAGTCCTATCATTCACCTTCGTGATTCGTTCAAAAAGAGAAATCAAGGTAATACTGTCCGTACAGTTCCACCGACAAGCTCCTATAGGATAAACTacttataggagaaaataaatctctgggggtccatggtTTAAGGCTTAGGCCTCGTGGTTGCCTCAACTCCAGGCGATGGAATGAAAATCATCAGTGTGAAGATCAAGAAGTGCTCATGTAGTGCTGCTGTCTGTGGTTTCCCGCTGGCGTGGCTCGACTCCCTTCTGGGGCGGGGGCTCGTCTGTGACAGGAAGACAAGAGATAACAGTAGAGTGTGCATAACCTGTCTGTGCAACACTGGTAGCACTAGGGGTTATGAGGACTACAAAACCAGATTCAAAAAAGTGGATCTTCAGTTGTGATTGGAAGCCTCTTGCGTAGGCTGGAGGATCATTCCACTATTTAGGGCTTATATTTAGGGAATATGTGAAAACGTTCACTTAATCAGCTAATAGCTTCAATCGGGGGACTGTTTATTACAAGAAAATCTATTATATAGTTCCTAGTTTATCAGGATGAGAGAAGTTCTTGGGAGcagtactatttatttttaccagtaAATTGTAGTATTATGTGAGTAACTGATAGTGTAATCTTATTTTCCATTGAACTAgccaaatgtataattttaaaatgtgtgtaaattgccttaaaaatgcttttcttgtttaataGCTATATACCAATTAATGTGATAcccagtataaaaaaaaacctgctttaTTGCATCACCTCTGCAGGGGCCACAGTCTCAGTCCTCCTGTAAAGGCGTCAATTTATTGAATGTCCACAAATAATcatcatggttttgtttttctcattagtCAGAGcttaatgtgttaatttgtgCTGTATTACTTGCTTTAGTTGAACTGGATTGACTGTGTAGACACCTGCAGGTTAGCGAATGAGTAAGTGTATAAAAATAGGTTATGATTAACGTAGGGCCCTACATATTGTTGCAGTACATTCTAAACAAATCTTTACATCAGTGCTGTGGTGTAAgtgtaagaaataataataaaagtaataataataatgtgtgtgtgtatatgtatatgtatgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgcgcGCACTGGTTCAGTAACTAGGTGTACAAATTCGAGGCATATTGTGAATACTATATACATCGTTTAgaagtcattttgttttaaaatgtatttttgtaccattctattaattatgattttacCATGTATTAATGCTGTACATGCTGTCTAAAAATCATTGAAACCACTGTAGGTTGAcaagtttaattttgttcataTTGTTAGTGTGAAAACCCAACATCGTCCCACATCGTCGTTTTGAGCCCCTGATTAACTTCTGTGATCACTTTAAAGATTGTCTTGTATGTTTTAACACCACTATTATAACTTAACTTAAGTCATGTCTGGAGGGGTGTGATTTGACTGCATTGCCATCGTCTTTCCTGCCAGTAATCCGCACATTCAAGCATTTAAGAAACGCCACTTTAAAGTCTTTGTTGCAGATTCTGTCCCAAATGAATcccattttatttcagaaaaattgcactattttttccttattttcttttttgattgtaatttaaaactttaaaaattgTCTTGTTTGTATTGTGCATTGTATCATGCAAATTCCACTTGTCAAAATAGCAAACCACAAATAATGAGCAAACACTAAAGAGCATATTTTTATTGAGGCtgaaagatttaaaagatttgtactttgtttcccccccctctctcctgtggacataaaaaaaatgaattaatttcacTAAAACTTGTTATTTCTCATACCACTGTTGCCTTACACAAAGAGGGGCCTAGAAAATAGGTTTTGCCTGTGGCTCATGCTTAGACAGCTGGATAACCTCCTTTTCTCCAAGATAGAAAACCTGCTAGTCCATGTCTAGTGTTTTTGATCAGCAACTTACTATGAGAAGGATTATGGAatacttttgaaatgtatacatattagaTTTGGATAGTCAGTACAGTAATTTAGAGACATTTGAAATCTCACGGTGTGAATAGTACTATAGTATAATACTAGAATATCTTGTATATGTTTGACTATTTGACTTGTTTTCCAATTGAGATGTATGATTCAACACATTCAGGTCTTAATTGCATTTGTGCATGGGAGACGCTACATCGGTGTGTGACTGGTTCAGCTCCTCTCTCCCGTCTCTCAGCTCACATAATTACTTTGTGAGCAATACCTGTTAAAACCTTGAAGAGTAAAACCAACTGTATATGTATGGTTTCATTTATCATCTTAGAGCCTTAAATTAAGTACCTGTAATTACCTTCTATTGTTCAAATGGGGAAAAGACTTATTGCATGTAAAGATGTGAATATCATGTGTTAAAAGCTTCAAAACATCcatcattaactttttttttgttttgctcctaACCTGAAGGGTGggtaaatacatttatgtagTGCTAGAATTTTTAAGTTTTGGATACTATATGAatgctgtaataaaataacttgaCAGTCCTGTAAttcttacagaaaaaaaaatctggccATATCCTTAAAATCCACTTCTACAATTGTCAGTTTTTCCAATATTTATCACAGCTATATCTTAATGCAtcagcagtaaaataaaataaaactaaattgttaatgtaatttattggaaatgttaatattttaatgtatttctattgTGAGAGCTGTGAAAGAGACCTAAAAGTATTACTTTGTTCGAGTGATTGTCGACTGTCTTGAAAGCTAAAGATTCATGACCCAAGTACAAGTTTGATGTCCCTGTCTTTTATAGAACCTTTCAACTGGTATTGGAGTGGATTGTTCATTCCCAGTTATACCACAGATGTGTCTGTAAGCCTCCTGTCCTATATTTAAAAGGCCTGAATTGTTTGTTTCTGGGGATAAtgtatgtttagtttttcactgattgtaaaaaataaaactcagttaaaact

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00013730 False 576 mRNA 0.42 5 40392893 40412634
TU57809 True 4602 TUCP 0.36 8 40386061 40428625

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00013723 NA coding downstream 480393 39900104 ~ 39905668 (-)
AMCG00013722 NA coding downstream 489599 39876427 ~ 39896462 (-)
AMCG00013716 NA coding downstream 529741 39855358 ~ 39856320 (-)
AMCG00013718 NA coding downstream 547753 39837346 ~ 39838308 (-)
AMCG00013715 NA coding downstream 551305 39761339 ~ 39834756 (-)
AMCG00013733 NA coding upstream 212451 40641076 ~ 40647148 (-)
AMCG00013737 NA coding upstream 456329 40884954 ~ 40888451 (-)
AMCG00013738 NA coding upstream 461104 40889729 ~ 40927189 (-)
AMCG00013742 NA coding upstream 564164 40992789 ~ 40995408 (-)
AMCG00013747 NA coding upstream 774439 41203064 ~ 41222134 (-)
G46370 NA non-coding downstream 303 40385349 ~ 40385758 (-)
G46368 NA non-coding downstream 4063 40381550 ~ 40381998 (-)
G46263 NA non-coding downstream 758871 39622363 ~ 39627190 (-)
G46245 NA non-coding downstream 823765 39562097 ~ 39562296 (-)
G46240 NA non-coding downstream 832816 39545571 ~ 39553245 (-)
G46395 NA non-coding upstream 13685 40442310 ~ 40446394 (-)
G46419 NA non-coding upstream 164523 40593148 ~ 40593420 (-)
G46420 NA non-coding upstream 168733 40597358 ~ 40597898 (-)
G46421 NA non-coding upstream 172573 40601198 ~ 40601532 (-)
G46458 NA non-coding upstream 554507 40983132 ~ 40983557 (-)
G46333 NA other downstream 110963 40273391 ~ 40275098 (-)
AMCG00013691 NA other downstream 1414482 38942775 ~ 38971579 (-)
AMCG00013685 NA other downstream 1602628 38782024 ~ 38783433 (-)
AMCG00013677 h3f3b,H3F3A,LOC101073377,LOC105909691,LOC107572204,LOC105896821,LOC107388308 other downstream 1684987 38697395 ~ 38701074 (-)
AMCG00013669 NA other downstream 1794859 38588979 ~ 38591202 (-)
G46418 NA other upstream 158191 40586816 ~ 40587392 (-)
G46423 NA other upstream 174976 40603601 ~ 40608528 (-)
AMCG00013732 NA other upstream 189718 40618343 ~ 40637228 (-)
AMCG00013773 NA other upstream 2000152 42428777 ~ 42455758 (-)
G46742 NA other upstream 2270881 42699506 ~ 42701068 (-)

Expression


Co-expression Network