G16998


Basic Information

Item Value
gene id G16998
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 37414114 ~ 37418704 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU21081
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>TU21082
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>TU21083
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>TU21085
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU21081 True 4377 lncRNA 0.36 1 37414114 37418490
TU21082 False 3520 lncRNA 0.36 1 37414971 37418490
TU21083 False 706 lncRNA 0.33 1 37414114 37414819
TU21085 False 3734 lncRNA 0.36 1 37414971 37418704

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00016951 LOC105894324,LOC105023857,LOC106566981,LOC103373809 coding upstream 854133 36533936 ~ 36559981 (+)
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AMCG00016948 NA coding upstream 1211912 36102366 ~ 36202202 (+)
AMCG00016960 NA coding downstream 666586 38085290 ~ 38087536 (+)
AMCG00016966 NA coding downstream 903261 38321965 ~ 38336646 (+)
AMCG00016965 NA coding downstream 918941 38337645 ~ 38351463 (+)
AMCG00016970 NA coding downstream 976995 38395699 ~ 38399287 (+)
AMCG00016972 mcm2,LOC106583719 coding downstream 982026 38400730 ~ 38415204 (+)
G16990 NA non-coding upstream 110671 37247428 ~ 37303443 (+)
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G16969 NA non-coding upstream 732562 36681339 ~ 36681552 (+)
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G16814 NA non-coding upstream 1964943 35399828 ~ 35449171 (+)
G16999 NA non-coding downstream 5783 37424487 ~ 37424697 (+)
G17000 NA non-coding downstream 6962 37425666 ~ 37425871 (+)
G17001 NA non-coding downstream 7843 37426547 ~ 37426788 (+)
G17002 NA non-coding downstream 10449 37429153 ~ 37429396 (+)
G17003 NA non-coding downstream 15654 37434358 ~ 37434868 (+)
AMCG00016934 acly,aclya,LOC103369716,LOC108273769 other upstream 2209882 35158597 ~ 35204232 (+)
G16550 NA other upstream 3313251 34100315 ~ 34100863 (+)
AMCG00016909 mien1,LOC107566883,LOC107755209 other upstream 3314518 34093276 ~ 34099596 (+)
G16546 NA other upstream 3366394 34047371 ~ 34047720 (+)
AMCG00016901 NA other upstream 3739753 33668593 ~ 33674361 (+)
G17193 NA other downstream 1077347 38496051 ~ 38503632 (+)
AMCG00016979 NA other downstream 1820369 39239073 ~ 39254490 (+)
G17697 NA other downstream 4972593 42391297 ~ 42397787 (+)
AMCG00017078 LOC106565757 other downstream 6707510 44126214 ~ 44137931 (+)
G18192 NA other downstream 7235948 44654652 ~ 44656098 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location