G17381


Basic Information

Item Value
gene id G17381
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030122.1
NCBI id CM030122.1
chromosome length 54868152
location 40268425 ~ 40284772 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU21569
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>TU21571
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04391 Hippo signaling pathway - fly

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU21569 False 3675 lncRNA 0.38 2 40268425 40284772
TU21571 True 3898 lncRNA 0.38 2 40268425 40284772

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00016986 NA coding upstream 467774 39798135 ~ 39800651 (+)
AMCG00016985 manf,LOC106583751,LOC102787989 coding upstream 470862 39790933 ~ 39797563 (+)
AMCG00016984 dock3 coding upstream 479609 39669200 ~ 39788816 (+)
AMCG00016982 NA coding upstream 839136 39399757 ~ 39429289 (+)
AMCG00016983 NA coding upstream 871829 39375260 ~ 39396596 (+)
AMCG00016989 NA coding downstream 159158 40443930 ~ 40460889 (+)
AMCG00016995 NA coding downstream 1117985 41402757 ~ 41426060 (+)
AMCG00016994 NA coding downstream 1148920 41433692 ~ 41446610 (+)
AMCG00016998 rnf123 coding downstream 1165483 41450255 ~ 41457202 (+)
AMCG00016997 rnf123,LOC102204603 coding downstream 1173600 41458372 ~ 41464821 (+)
G17361 NA non-coding upstream 477858 39790089 ~ 39790567 (+)
G17274 NA non-coding upstream 1188528 39079415 ~ 39079897 (+)
G17230 NA non-coding upstream 1462479 38754521 ~ 38805946 (+)
G17221 NA non-coding upstream 1642402 38625526 ~ 38626023 (+)
G17214 NA non-coding upstream 1732092 38536061 ~ 38536333 (+)
G17419 NA non-coding downstream 931723 41216495 ~ 41216809 (+)
G17424 NA non-coding downstream 960530 41245302 ~ 41245519 (+)
G17482 NA non-coding downstream 1317176 41601948 ~ 41605391 (+)
G17491 NA non-coding downstream 1386606 41671378 ~ 41673353 (+)
G17498 NA non-coding downstream 1403238 41688010 ~ 41690199 (+)
AMCG00016979 NA other upstream 1013935 39239073 ~ 39254490 (+)
G17193 NA other upstream 1764793 38496051 ~ 38503632 (+)
AMCG00016934 acly,aclya,LOC103369716,LOC108273769 other upstream 5064193 35158597 ~ 35204232 (+)
G16550 NA other upstream 6167562 34100315 ~ 34100863 (+)
AMCG00016909 mien1,LOC107566883,LOC107755209 other upstream 6168829 34093276 ~ 34099596 (+)
G17697 NA other downstream 2106525 42391297 ~ 42397787 (+)
AMCG00017078 LOC106565757 other downstream 3841442 44126214 ~ 44137931 (+)
G18192 NA other downstream 4369880 44654652 ~ 44656098 (+)
AMCG00017099 cav3,LOC107673475,LOC107749619,LOC107584510,LOC107577493 other downstream 4664262 44949034 ~ 44961601 (+)
AMCG00017167 NA other downstream 9087250 49372022 ~ 49382218 (+)

Expression


Co-expression Network