LOC122362698


Basic Information

Item Value
gene id LOC122362698
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056700.1
NCBI id CM032069.1
chromosome length 25613461
location 1925860 ~ 1929567 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XR_006253155.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_006253155.1 True 3629 lncRNA 0.37 2 1925860 1929567

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:dkey-119f1.1 si:dkey-119f1.1,LOC107593797,LOC107701334,LOC107722422,LOC107560764 coding upstream 24113 1880691 ~ 1901747 (+)
rgs13 LOC107715509,LOC107593894,LOC107681737,LOC107560784,LOC107722654,LOC107701324 coding upstream 48974 1874022 ~ 1876886 (+)
rgs1 LOC107681696,LOC107560781,LOC107701325,LOC107722662 coding upstream 58669 1864505 ~ 1867191 (+)
rgs18 rgs18,LOC107681733,LOC107715502,LOC107701327,LOC107560778,LOC107722673 coding upstream 70625 1848086 ~ 1855235 (+)
LOC122361145 dbt,LOC107681723,LOC107715513,LOC107593857,LOC108411488 coding upstream 327597 1591993 ~ 1598263 (+)
ipo13a si:ch73-182a11.2,LOC107593890,LOC107681711,LOC107560786,LOC107722396 coding downstream 27609 1957176 ~ 1971483 (+)
prdx1 prdx1,LOC107577377,LOC107681736,LOC107560788,LOC108267618 coding downstream 53674 1983241 ~ 1987091 (+)
zte38 zte38,LOC107681728,LOC107593889,LOC107719267,LOC107722624 coding downstream 57762 1987329 ~ 1991484 (+)
uck2b uck2b,LOC107593786,LOC107719266,LOC107681732,LOC107560789,LOC107722061 coding downstream 67871 1997438 ~ 2001435 (+)
czib si:ch211-284b7.3,c7h1orf123,cunh1orf123,LOC107681739,LOC107719286,LOC107671679,LOC107722617,LOC103022465 coding downstream 72524 2002091 ~ 2004413 (+)
G8586 NA non-coding upstream 3637 1919412 ~ 1922223 (+)
G8585 LOC107701323,LOC107593893,LOC107719279,LOC107560771,LOC107722646 non-coding upstream 6547 1918706 ~ 1919313 (+)
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G8508 NA non-coding upstream 252105 1599046 ~ 1673755 (+)
G8519 nos1apb,LOC107715504,LOC107593855,LOC107681742,LOC107560777,LOC107701337 non-coding upstream 289238 1632316 ~ 1636622 (+)
LOC122355709 LOC107593853,LOC107719278,LOC107681699 non-coding downstream 17561 1947128 ~ 1948362 (+)
G8670 tmem125b,LOC107681734,LOC107719290,LOC107593887 non-coding downstream 123744 2053311 ~ 2055730 (+)
G8691 NA non-coding downstream 241029 2170596 ~ 2170820 (+)
G8700 NA non-coding downstream 282186 2211753 ~ 2212073 (+)
G8701 NA non-coding downstream 282691 2212258 ~ 2212609 (+)
LOC122360854 si:dkey-119f1.1,LOC107593796,LOC107715495,LOC107719281,LOC107701334,LOC107681697,LOC107593797,LOC108443183 other upstream 15181 1903067 ~ 1910679 (+)
rc3h1b LOC107681708,LOC107560775,LOC107722144 other upstream 366086 1544773 ~ 1559774 (+)
ccdc39 ccdc39,LOC107722234,LOC107701322,LOC107708988,LOC107568623 other upstream 517139 1397524 ~ 1408721 (+)
st6galnac5a st6galnac5a,LOC107681827,LOC107708707,LOC107599846,LOC107751866 other upstream 1097455 799932 ~ 828405 (+)
LOC122360757 fam73b,miga2,miga1,LOC107599369,LOC107705989,LOC107675762,LOC107737175,LOC107661559,LOC107708777,LOC107681767,LOC107722319,LOC107703235,LOC107558173 other upstream 1468115 447162 ~ 457745 (+)
arl14 arl14,LOC107722413,LOC107719289 other downstream 3945 1933512 ~ 1936759 (+)
LOC122358138 LOC107593886,LOC107719261,LOC107671769,LOC107559363,LOC107754779,LOC107681703,LOC106568718 other downstream 249199 2178766 ~ 2191448 (+)
sgip1b sgip1b,LOC107719259,LOC107593781,LOC107709351,LOC107671695,LOC107559342,LOC107681818,LOC108430747 other downstream 341112 2270679 ~ 2288216 (+)
G8725 sec22ba,LOC107681807,LOC107727533,LOC107709355,LOC107671713,LOC107559355,LOC105891393 other downstream 469387 2398954 ~ 2401745 (+)
LOC122358652 slc35a3b,LOC107559354,LOC107593843,LOC107671667,LOC107709347 other downstream 477175 2406742 ~ 2419955 (+)

Expression


Co-expression Network