G129424 (LOC107738763,LOC107549607,LOC107686336,LOC107742881,LOC107583870)


Basic Information

Item Value
gene id G129424
gene name LOC107738763,LOC107549607,LOC107686336,LOC107742881,LOC107583870
gene type unknown
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056716.1
NCBI id CM032085.1
chromosome length 26409628
location 25921267 ~ 26174156 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU191105
CCAGTAGCACCTAATAATAGACGTGTGTTGGATCACGGCTGGAGCTGGAGTTTTTAGGTTGGGTACCCCTGGTCTAAATTGAAGAACTGATATTAAAACATGGGCTCTGGATTTGGTGGACATCGTCTTATCGATCAgGTCTGGATATTGGTTCTCCGTGGCCAGACGGGCAGACTGGACGGCGGAGCGCAGGGCCCATCTGCGTCTGCGTTTTTTAGAGAGGAACGGACGGCTTTGAGAGTACGAACCGAAAGAAATCTCCCCGTCCGTGTGGCATCTTTTGTGCCTGGAGGATTTGTGTTCCTTTTTTCTGTAATGCTCGCTGTCTGTGCGTCTGAACCTTGCGGGAGCCTCCAAAGAATCGGTGACCTTCTGGTAGCGGGTGACTCTACCCCCGCGACCCTTATTGTAGAAGACCTTCCTCAGCTTGAGGACCATGGTGGAGGGCCCTTTGGACAAGCTCTGAGATTCTGCTGAGCTGGATCTGCGGCTCTGAAAAGACATCAATGACGTGCTTTCCGTCTCTTCATCGGTGCTATCAGAGGAGAAGTCATCCGAGGTCAAAGGTCGCCCCCAGGCAGAGTTCTCAGGCTCTTCTTCGATCTTTACCTCCACATGTGGTCCACTGTCAGTGGAAGTCACAGGAGACACTTCCCATTCATCTCTGTCTAAGGAACTGACGACGCTCCACCTCGCCGGTTCCTCTGTGAGCTCATCCTCTTGTGACGATGAACTGGTCTCCTCTAAAAACGTCCTCTTGGAGGAAATCTTTACTctgcctttctttttctttctctggaGGCAAAATTGTTTTTCCAGCTTGTCCACACATGTGGTTTCCGGTGTGAGAGGTCTGGAGGACTCGAGGTAGAATTCCTCAGCGCCATTCACACAGCCGGCTGATTCATCTGAGCTGTCCGTGCTCTCGCTCTTGAACGCTAAGCTGGTTTCTACTcctgtaaaaagaaaagaacaggaaTTTAGTATCAGCATTTCTTGACTGACAAGTATAAAGCTAGattataattaaagaaaaattaattaaccaGGCTTAGAATGGATTAGCATTGACTAAAGCAGAATATTGCTAGTTTAcgataaaagttattatttagtCAGCGTCAAGTTACTTTCTTCGACATATACATtccataattatatattatctttaaatattCCAATATTGTTCTAAATATCTTTTAGGTTCCACAGAAGCAATACaatcatgcaggtttggaaaaacTTTAAGGTgcgtaaatgacagaattagaATTTCTGGGTAAACTATCAACTAATGAAGGCTCATTAGCATATTTACAGATTGAATAGAATGatcattttttcagctttatttatacaaatcACTCAAAATAGAATTCCTTAAACAATGGAATCAGCTTCATGAGGAaagattttcagaaaaaaaaataaatataaaattcaaaccACTTTCATGGaacatagcttttttttaagttgtttggtttaattgtttggttttttttgagCTCAACAAAAAAGCCAGgtatattttgtttcatattacaggctgaaattattaaatgaaatgtaattttattctgAGATAATATTGGATTAAGAAATTTTAGCTGCTGCctgaattttgaaaatgttacagtgtaaattgttgatttaaaacaaaaaaagcatttaaagacCCAGTTTTCATTATGAACACAACCTTATGATACCTGATGATATCATTTGACTGGTAACATGATGGGGACAATACAATCAATACAATGTGATCAAACTGGTTTtctaataatagaaaaaatattacttaacaaTGACAAGAAAAACAATAGGCCATTTGGTGAAACATAATACGCGACAGAATATTTTTCCAATGTgtcagaaattatttaaaaaaggctaaAGGTGAtagaacagaaacaaaaaaaagtgtgtcttaagaaaaaacaaaaaaaaccaaactgcTGCACTATTAACTATGTGCGAGTTAATGTTCAAAAGAGGTAAAACTAATTGAGTGCCGTAACTGATGACAGACAGCTGTCTAAATCTGGAGGACCGTAAATGGCACTGCAGGTGAGAAATGCAACGCCACTGCATATGGCAACTCCTTCCAACCTCCAAAAGCACATTAACTTCCTTCcttgaaactgaaatatatcCTAAAGCATATCACTGTTCCGTTCCAGACAATATCTGATCAGAAACACACCTGCAACAAAACTGCACCAACAAGGAACTATAAGCAgctcaaaaatgtataaagccCTCTCTAAACAAAACTATTTGTGATTGGAGAAGGAGTTCTGGGGACAAGGTAATAAGAAGGTACCTGGGCATTTTTTGGACACCATCTGTAGCAGTGGaatctgcaaaaacaaatgtgtatcAAATCAAAAAAGTATGACAAaagtatgattaaaaaaacaaaaaaaacaaaaacaaaaacaaaacatgaacattAGGACTACAGGTATGCACCATGTACggttgattttaatataaaaataattaatgtaaacatacaatattaaaataattcaaataactGGCTGTTCAAAACCAAATAGgctttttatatcaaataatatgAAATTTATATAACTTTTAGCATTTACAGTATATGCTAAGCATACACATCACTGGGATTTAAACCGTAATATTAGTgattagaatatttaaatattttatatctaaagAACAAGATCTTAGCCAGAATGTTGTACAAAATCCATGTTGTACTATCATCCAAAAGGCACAACAGAAACGTGGAACtgaaaattaagtttattaaaatgataacaaagTTTCAGTATGCACATTCATCCTTCTAACTACTACAAatgttattatagtatttaacCCCAAATTAACCTCCATCAAGTAATGTTTtcatgaaaatggaaaataatatgCTTGTAAAATGTTATCTGTTCTTGTAGAAAGAAACCGGTTACCAAAAAATGGAACCACAAGTCTGATAATTATGAGTGTTttcttgaaatgaaaattccaCAGTAATGTTTTAAGCAACAAAGATAAAAGCTCCATCATCACCACAGCACCAGTCAGATCCAAAACTGAGCAATGATCTAATTAAAGAATTGTATTAGGGgtgccaaaatgttttttaagcatgcaacaataatatatgtaaatattaattcacataatatttaatgttatggCCAACAAATGATACATGGTTGATATACCATTCTGTACTATTGCCTATATTTAAACTGTacttaaaaaaacctaaaaacaattattttaaaagctacAGGAAAATTTAGCACAACAGTATAatttacaatgttaaaaatagtattaatttTGAGATTTCCTAAAGAGCGTGATTAACTGTTAATGTAGGTTATTGATATAATCTAAATATGAAACAGGACCTATTTCTAATTTAGTATCATATGGACtaataccttaaaaaaaataaaaaataaaaataaatcactgatATCAACCATTAATGGATACAATGCAAATATCTTGTGGATGCtgtagaagtttttttttccacaacaaTTCAACACTTTTTGATTACTATGCTAATAAAGATCAGTCATTCAGCACTCACCAAGGAACTTGCAGACACTGGCATGATAGAGAAGGTTAAGGACATCAGGGTATATATCTGGCAGATGTTTAAGGGACAGAAGTCTCCGTAGTTTGGAAGAGAAGGCCTTTCTGTGGAGCTGAGTCAGCTGCCTCTCCTCTGTGAGGGTGGTGGGCCTGAGCTCAACCCGATGCTCCTGCAGGACCTGGTCTATGAATGCACCTTGAACCTGAGAAAACAGCACCTCTTTGACCACCAACATGGGAATGAACACACTTTGAGCCCTCATGACATGAGGAAAGGGACATTCTCGGCTTTCAACATACTTTTGAAGTTGGAAGACCACCTTTTTAAGAGCCACTTCCATCTCATCACCTTTCAGCCATACCTCCTCATTTTGAGCCCAAGAGACAAGACACCTTCTGATCTTTGCCTGAGTCACGAAGGTCCAGTCTGCATAACCAGTCCCTGAGGTCCTGACATGGGGTTTGATTAACGCAGCAGTATATGAGTCTACAGAGAGACTGATGAAGCTCCATAAACTGGTGACGAGCATGTTTGCTGCTACTTATAATTGGCTTGGTCTCTAGTGGAGACTGAGGAACCTCAACAGGTTGGGTTACTGGAGCTTTCAGAACCTCAGGGATGACTATTTTAAAGTTGGCCAATTTGAGGCAATGAGGTGGGATTTTAGTGAGGGAGAATTTAGTCAGCACTGGAGGTGTTGCGGGCAACGTAGAAAATGGAATGTAGTCCATATTGTCTTTCACAGCAATCTCAGTCTTGCATGTGGCTAAAGATTCAGATTTTTCTACCAAGAAAGGATTGCTTTCTTCTTCAAAGTCACTCTTTACTATAACATGACAAGGAAGAGAGTCAGATGTATTCATGTCTGGCTCCCCTTGCTCCTCTTTGACCTCAGAACTGTCCTCCTGATGATTCATCTCCTCAGCAATGCTCACTTTCATTTCCGACTGACAAGCCGGTTCATCTGTAtccaatttttcttttttgatctTTACAGTCTCTGGCATTTCAACTGGAATGTCACTGTTAGCTGGTGACATCTGGGTGTCTTGTTTCAAGCTGAGGTCACTTTCACCTGAATTTGGTTCTGCATCACAGTTTTGAATTTCCGCTCTTGTTTAAGCAGTGTCGCCTCAGGCTGTGGCTTGGGACTTTTGAATTCCCTAGTGAAGACAACATGCCTGTAGCTtcgaaatatattttataaggaGCCAAGctaaaaactttattaataacTGGCATGGGTGGGGAGGATGGTGACTGAGGCTCATTATCTGACAATACATGGGTTGTgtcagtttttgctttttactgACCATGTCCGTTTCAAGTTCCTCTCTGGGCCTTTTAGCTAATACATCTTTGTCAGCTGGATCTGAAACACAATGCCTTATCTTAAGTACATCTTCACAGGAGTTTGTGGGAAATTCTTTGGAACTGTCTACAATAAAGCTAGTTTCAGACATCTCTGAGTGTTCAAGGTTAGTGGTGTTACTGAGACGTCTGTAGTGGGCCGGAAAAGGATGGAAAGCCCCAGTGGTTCCAGGCTGTTTGCAAAGCTCCCGAGGGGAGTCAGGTGTCTGCACCCTTCGTATGGAGAAATCAAGTGGTCGCTCTGATTGATGGACTGGGAAAGGTGGGTGTGGCTTATTATGCATTGGTGCTTGGTTACTATTAAAATGCATCCTATACGAATTATAAGTAGGATATTTTGGAATTATAGGATGGTGTGGGGGTACAACAGAACAGGATGGTGACATCAAGTCAGCTCGAGGGGAATGGAACTGACCCATGTGATGATGCTGAGCATGCTCATCTGTAATAACATTAGGATTCGCTTGGTAAGCCTCGTGGTGACTCTGAGGGTAATAGACAGTGGGACATGGAGGCATTGATGTGTATTTGGATATGCGAGGATGGTCCTGATATATTTTCGAAGGAACTCCATGGTGTGCCAATGTCCTTGGGTCATAAGTGTGGGGAAGACCCTTGTATATTTGTGGGGGAACTGGGGCACGTTGGCAGTACTCTGGTGTGGAACCAATAAACTGATGTGCAGTGTTGTAAGAATAGCTCGGTTGCATTAAAGAAAGTGACCTTCTTGTCTCATTTGATCTAATACCATGGTAACTCTCAGTCTTTCCATCTTTTATTCCCTCCGCGCCGTGCTCTAACTGCAAAACCCTTTGTTGCGCCAATGCCTCCTGGCCCTTTTTATGCAGGTAAGCCAAGCGACTGAAATGAGCAGCCCATTCGTCATCATAAATGCGAGGGGACATCCTTTGTGGTCCATGTTCCACACCGTAGTGCCCTGCAGTGCATCCACGCTCAGTACAGCAGGGGCTATGCCCATATATCGGTTTTGGAATAGCCAACCCAACACAGCTTTCTGCATCTGATCCTCCAGTGTGACTCTTGGGAACTGCCACTGGAGAGATGACTCCAGCCGCCCTGGGACTGTGCTGTCTGGGACTGCTAGCATAATAGGCCAACCTTTGCTTGGCTGCCAACTCTTGCGGTACAGCACAGCGCGTCCACCACCAGCATCCACAGGAAGGAGACTTTATCAGGCCTGTAAATGGTTGGAACTGGAATTGAACCCTCGGTGGCTGATGAGTGGATCCCTGGGCTCGGCCCATTTCTAATGCAGGTTTTTGAAGGACCCCATGGAGAAGGAAAGTCAAGTGCATCTTGTCCACCAAGAGAGTATGGGTAGTACGCTCTGCTGATTGGCAGAGCTTTGTCATGGGAATATTGTGGAAGACTGTCAGCTTTAGGGAGCCCTGTGGGGACTACAGAGCCCATTGCACCTTCCATATTACTTTGAATTAGAGGGTCGATGCAGCTCCGTCCCTGCTTACTGTTCATCTTGGACTGCCGACTCTGGCTTGACCCAGCTAAATCATAGCTATAG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC107738763

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU191105 True 6512 TUCP 0.40 3 25921267 26174156

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
arih1 arih1,LOC107742882,LOC107672283,LOC108423892,LOC107549652,LOC107686289 coding upstream 292 25906919 ~ 25920975 (+)
LOC122322950 LOC107549654,LOC107576747,LOC107672203,LOC107742895,LOC107686352 coding upstream 18352 25897542 ~ 25902915 (+)
trnal-cag_32 NA coding upstream 23762 25897423 ~ 25897505 (+)
st3gal2 st3gal2,LOC107742884,LOC107672232,LOC107686287 coding upstream 45535 25854441 ~ 25875732 (+)
siah1 siah1,LOC107742888,LOC107549647,LOC106573709 coding upstream 117357 25787334 ~ 25803910 (+)
LOC122362626 LOC107672296,LOC107738726,LOC107742880,LOC107686290,LOC107596982,LOC107583769 coding downstream 16848 26191004 ~ 26196388 (+)
LOC122362692 LOC107719968,LOC107671151,LOC101886608 coding downstream 126760 26300916 ~ 26303177 (+)
LOC122323090 LOC107710382,LOC107686534,LOC107560047,LOC107719970,LOC107671152,LOC107599867 coding downstream 171856 26346012 ~ 26357471 (+)
G129370 NA non-coding upstream 244406 25676557 ~ 25676861 (+)
G129368 NA non-coding upstream 245957 25675071 ~ 25675310 (+)
G129360 NA non-coding upstream 257682 25662497 ~ 25663585 (+)
G129270 fam192a non-coding upstream 478826 25440048 ~ 25442441 (+)
G129262 NA non-coding upstream 572229 25348756 ~ 25349038 (+)
G129446 NA non-coding downstream 38774 26212930 ~ 26213344 (+)
G129455 NA non-coding downstream 158070 26332226 ~ 26335988 (+)
G129491 chkb,LOC107686538,LOC107710386,LOC107559534,LOC107719962,LOC107577700 non-coding downstream 205547 26379703 ~ 26380285 (+)
LOC122323030 LOC107719968,LOC107671151,LOC101886608,LOC108264446 non-coding downstream 233633 26407789 ~ 26408862 (+)
mt2 NA other upstream 572673 25346392 ~ 25348594 (+)
kiaa0513 zgc:91860,LOC107583795,LOC107740318,LOC107686269,LOC107738753,LOC107549630 other upstream 611527 25294743 ~ 25309740 (+)
LOC122323037 NA other upstream 1332930 24583845 ~ 24588337 (+)
G128858 NA other upstream 1463707 24449765 ~ 24457560 (+)
cdh13 cdh13,LOC107722459,LOC107684661,LOC107587012,LOC107738387,LOC107666219,LOC107553949 other upstream 2184419 23457100 ~ 23736848 (+)
G129454 frmd4a,si:ch211-220f12.1,LOC107719967,LOC107599825 other downstream 54938 26229094 ~ 26332010 (+)
G129468 cpt1b,LOC107710383,LOC107686536,LOC107599889,LOC107671150 other downstream 129731 26303887 ~ 26306806 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000013_04805165_04810980 NA coding CI01000013 null 4804479 ~ 4810980 (+)