syt17 (syt17,LOC107729446,LOC107658452,LOC107564007,LOC107732856,LOC107674134)


Basic Information

Item Value
gene id syt17
gene name syt17,LOC107729446,LOC107658452,LOC107564007,LOC107732856,LOC107674134
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 11411985 ~ 11429179 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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>TU28479
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Function

symbol description
syt17 Predicted to act upstream of or within exocytosis. Predicted to be located in membrane. Orthologous to human SYT17 (synaptotagmin 17).

NR:

description
PREDICTED: synaptotagmin-17-like

GO: NA

KEGG:

id description
K19915 SYT17; synaptotagmin-17

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU28478 False 2321 lncRNA 0.54 1 11411985 11414305
TU28479 False 899 lncRNA 0.37 1 11413407 11414305
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XM_043235872.1 False 3594 mRNA 0.44 8 11413409 11429178

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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elob tceb2,LOC107564001,LOC108280902,LOC103036770,LOC108427344,LOC105012960 coding downstream 56673 11352808 ~ 11355312 (-)
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LOC122342175 itpripl2,LOC107729564,LOC107583043,LOC107674135,LOC107564006,LOC107658454,LOC107732846 coding upstream 2604 11431783 ~ 11435061 (-)
LOC122341818 coq7,LOC107658455,LOC107583049,LOC107729533,LOC107581445,LOC107677563,LOC107740598,LOC106564609,LOC102792864 coding upstream 8408 11437587 ~ 11441308 (-)
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moto LOC107729445,LOC107658460,LOC107583041,LOC107674174,LOC107721968 coding upstream 168061 11597240 ~ 11602381 (-)
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G19108 NA non-coding downstream 76185 11333756 ~ 11335800 (-)
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lrrc4ba lrrc4ba,lrrc4b,LOC107551155,LOC107680881,LOC107667844,LOC103034410,LOC107563987,LOC107732840 other downstream 347387 11011936 ~ 11064598 (-)
eef2kmt eef2kmt,LOC107690238,LOC107733874,LOC107568155,LOC107680861,LOC107738633 other downstream 1015644 10394314 ~ 10396341 (-)
rbfox1 rbfox1,LOC107733849,LOC107690317,LOC107685930 other downstream 1201369 9993833 ~ 10210616 (-)
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map3k3 map3k3,LOC107658467,LOC107583042,LOC107570753,LOC107674169,LOC107721962 other upstream 265093 11694272 ~ 11714719 (-)
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G19383 NA other upstream 424569 11853748 ~ 11880959 (-)
LOC122341756 NA other upstream 480596 11909775 ~ 11920767 (-)
LOC122342093 LOC107583078,LOC107754431,LOC107583076 other upstream 910008 12339187 ~ 12343872 (-)

Expression


Co-expression Network