XLOC_007231 (si:ch211-111e20.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_007231
gene name si:ch211-111e20.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 18781082 ~ 18789781 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00014272
cacttcagagtaCAGCGTCTATGCGACTTGATTCAACTGGGATCTGCTACACTGTAACAAATTGCTGtagtttttacagcaaaattatACAGGAATTTATTGTTTTAACATTTCACAAGTTATTATTGTAATTCGCAATGCATTATGGGTTAAACCAAGAGTTACAGTTGTTAACTGCAAATTTCTACGGGGACTGTAAATTAATATACAGGTAGGAGGTGTGTTAATGTAGATTCTGCGTTTTTACAACAACATGTTGTAGTGTGGAATTATGGGATTTCGCGGGCTGATGCAGATTTGAAATATGGTGGACTGGACAAGCGGGAGAAAACAGAAGGCATTATTCGTTAATTTCAAGGAACTTTGGTGAAAAAATCAAGACGTGGTGAATTAGGTTGTTGGAGGTGACTCGAATCTGATCGATAAAgATTTATAAAGGCATGTCCACGTTGGATGAGGACGTACGAGATGCTGTATTGGCAGTCCTACCTGGGCTATCAGAGGAGAAACTAGTGTCTCTTTTGAACAAATTGGCAAGCATAGGAGTTGAATCCAAATCTGACTTGCAGTTTGTTAAAGAGGACGATCTTCCTGATCACATCACACCAATACAGTGTCGTCGGCTCCTCAATGCATGGAATATAGAAGacaaaacAGTTTGTGCCAAAGTATCACCTTTAGAATCCACAAACATAGTCTTTGATGTATCACCAGTAAACTCACCATCTTCAAATTTCAGTTCCTCGTGTACACCAAGTGTCTCTAGCACAAACAGCTCCAGTTCAACTGTCGATTTAACTGTATGGCCTGAAAACTTTGAAGTTCCATGGAATCGGATGTCTTCTGGTATTAAAACTGCCACTGCACTGGGTAGACGCCCCACAGCTAAAGAACGCAGAGAAATGGTGAGAATCATTGTTGATGAGATGAGACAGACAGAGTTAAATCCATCAAAATCACAATGTCTGATTGTTGCAAAGAAGATTGTTAAACAGTACCCACAAAGCTTTGCTGATGTTTTGAAAGATGGCACAAGAATTGGGACTGGCTATGGATCCCTTTTGATACAGCTAAAAACAAGAGTGGAGCATGTTAATCTTGGCTGCTCATTTTCGAGACGCAGGAAACAAAAAAAGACCTCAAATTCACCACCCGAGGACACTGGACCAGGGCCTACTGACCAGTATGGATGTGTAAGGTGGCAGCCTGAGTGTCCTGTTGATGATACTGAAGAAAGTCTCCAAGAAAAGCAGGAAGAAATGAAGGACCTCTATAGTTGTAAGGGGCCAGCTGGAGCTCAAAAAGGACATCTAAGTCAATTAATGAAAGCTACATACTACCTCCAACGTAAATCGATTAATGCCTGTCCACCACCATCCATTGCTGAGTTGAAAAATGAGTGGCCATATCTTTTTACACCCAAAGAACTGTATAGCCACTTTAAGTCACTTACCAACATCAGCATTTTGGAAAGACTTGAGAAGTCCATGGAAGAAAAAGGAAAGATGATTCTTCAGTTTTTCCGTCAAAAGCCAGCAGGGACCAAAACAGATGAGATTCAGCGAATACTTCTGAAGTTTGATGATAGTGGAGCTTCAAGTTTCATTCCATGTGTGGTCCTTGTGCTTCTGTCacactttaaagaaaaaaacgaTGCACTGATTCTTCAGACGGATGTGTCAGCAACAGCAGGTGATGTGGAGAAAAGCTTGGTGCTTCCAGACTCTCCAAGACTAATTGTCTTAGggGACATTCTCACTGCAACTCAGTGGATGCTGAGCAACGAGGGACAAGTAGTTGTTGGTCCACACCCCAATTTCATAGGTGGATTTGCAGCTTTGTTTTCAAGCTACTACAACTTCAATCTGGTGTACCAGGAGCAGGCGTCTTGCACACTCGAATTTGTTCAAAGATGCTTTGTTGGAATCAATCCACCCACTGGGACCAAGGCAGCCACAGCAAAGATTGGAGGAAAAAAAGGTGGAAAGGTGTCAGAGAAGAGGAACCACACAGTCAATCCTCATGTTGGTACTCTTCTCAGAAAGCTAATGGACTTTGAATGGTTAAGCATGTAAGTGAGTTCAAAGTTCAAATACAGGACTTCTGCAAAATGAACAAACTTGTTATAGacacacatttataatattttgattgTTCAAGAACATCTTAAAGctatttgtactttattttttgaGAATGTTTTTCAGCAATGTTCAGCAacagaaatgttattttacaaGTTGAACTCTTAGAGTGCTCTGCtgtcagttttaaaaaaaatagtttattacAATTGTTTGTATAGACACGTGATGTTGTAACATTTGGGATATCTTTGGGatatcaaaatatcttatttactGCCACTTTTGACACTTTGTGAATATAGATAATTTTGTTAAAAGAAATTGTTTAAATGTGGTAAAGTGTTTTGGCATAGCTGATTCACTTTATTGAGTTTTAATCAACCCAGAATATTGCTTCAAATTTAAagtctttaataaaaaataaatgctgttattacaataattttgcatttgtttttttttttattattattaaaaatgtatagtgTTTGTTT
>TCONS_00014273
TTTCAGGAACTTTGGTGAAAAAATCAAGACGTGGTGAATTAGGTTGTTGGAGGTGACTCGAATCTGATCGATAAAgATTTATAAAGGCATGTCCACGTTGGATGAGGACGTACGAGATGCTGTATTGGCAGTCCTACCTGGGCTATCAGAGGAGAAACTAGTGTCTCTTTTGAACAAATTGGCAAGCATAGGAGTTGAATCCAAATCTGACTTGCAGTTTGTTAAAGAGGACGATCTTCCTGATCACATCACACCAATACAGTGTCGTCGGCTCCTCAATGCATGGAATATAGAAGacaaaacAGTTTGTGCCAAAGTATCACCTTTAGAATCCACAAACATAGTCTTTGATGTATCACCAGTAAACTCACCATCTTCAAATTTCAGTTCCTCGTGTACACCAAGTGTCTCTAGCACAAACAGCTCCAGTTCAACTGTCGATTTAACTGTATGGCCTGAAAACTTTGAAGTTCCATGGAATCGGATGTCTTCTGGTATTAAAACTGCCACTGCACTGGGTAGACGCCCCACAGCTAAAGAACGCAGAGAAATGGTGAGAATCATTGTTGATGAGATGAGACAGACAGAGTTAAATCCATCAAAATCACAATGTCTGATTGTTGCAAAGAAGATTGTTAAACAGTACCCACAAAGCTTTGCTGATGTTTTGAAAGATGGCACAAGAATTGGGACTGGCTATGGATCCCTTTTGATACAGCTAAAAACAAGAGTGGAGCATGTTAATCTTGGCTGCTCATTTTCGAGACGCAGGAAACAAAAAAAGACC
>TCONS_00014274
ATGTCCACGTTGGATGAGGACGTACGAGATGCTGTATTGGCAGTCCTACCTGGGCTATCAGAGGAGAAACTAGTGTCTCTTTTGAACAAATTGGCAAGCATAGGAGTTGAATCCAAATCTGACTTGCAGTTTGTTAAAGAGGACGATCTTCCTGATCACATCACACCAATACAGTGTCGTCGGCTCCTCAATGCATGGAATATAGAAGacaaaacAGTTTGTGCCAAAGTATCACCTTTAGAATCCACAAACATAGTCTTTGATGTATCACCAGTAAACTCACCATCTTCAAATTTCAGTTCCTCGTGTACACCAAGTGTCTCTAGCACAAACAGCTCCAGTTCAACTGTCGATTTAACTGTATGGCCTGAAAACTTTGAAGTTCCATGGAATCGGATGTCTTCTGGTATTAAAACTGCCACTGCACTGGGTAGACGCCCCACAGCTAAAGAACGCAGAGAAATGGTGAGAATCATTGTTGATGAGATGAGACAGACAGAGTTAAATCCATCAAAATCACAATGTCTGATTGTTGCAAAGAAGATTGTTAAACAGTACCCACAAAGCTTTGCTGATGTTTTGAAAGATGGCACAAGAATTGGGACTGGCTATGGATCCCTTTTGATACAGCTAAAAACAAGAGTGGAGCATGTTAATCTTGGCTGCTCATTTTCGAGACGCAGGAAACAAAAAAAGACCTCAAATTCACCACCCGAGGACACTGGACCAGGGCCTACTGACCAGTATGGATGTGTAAGGTGGCAGCCTGAGTGTCCTGTTGATGATACTGAAGAAAGTCTCCAAGAAAAGCAGGAAGAAATGAAGGACCTCTATAGTTGTAAGGGGCCAGCTGGAGCTCAAAAAGGACATCTAAGTCAATTAATGAAAGCTACATACTACCTCCAACGTAAATCGATTAATGCCTGTCCACCACCATCCATTGCTGAGTTGAAAAATGAGTGGCCATATCTTTTTACACCCAAAGAACTGTATAGCCACTTTAAGTCACTTACCAACATCAGCATTTTGGAAAGACTTGAGAAGTCCATGGAAGAAAAAGGAAAGATGATTCTTCAGTTTTTCCGTCAAAAGCCAGCAGGGACCAAAACAGATGAGATTCAGCGAATACTTCTGAAGTTTGATGATAGTGGAGCTTCAAGTTTCATTCCATGTGTGGTCCTTGTGCTTCTGTCacactttaaagaaaaaaacgaTGCACTGATTCTTCAGACGGATGTAAGTCTTAtagtgtatttttaaagtacataTTTTGTTCTTATAACCGAaaagtaaatgcattttaatCAAACCCCCCCCTCTCACTTTTTTCTTGTAGGTGTCAGCAACAGCAGGTGATGTGGAGAAAAGCTTGGTGCTTCCAGACTCTCCAAGACTAATTGTCTTAGGTAATGTACAATGTCCTGTAATAAAtctgtaaatttattaaataaactttgCAAGCATTTTTGTGTAAGTGTtgcttatatatttattaattttagggGACATTCTCACTGCAACTCAGTGGATGCTGAGCAACGAGGGACAAGTAGTTGTTGGTCCACACCCCAATTTCATAGGTGGATTTGCAGCTTTGTTTTCAAGCTACTACAACTTCAATCTGGTGTACCAGGAGCAGGCGTCTTGCACACTCGAATTTGTTCAAAGGTAAGAAAATGACTTAAATagaagttctgtcatcatttactcttcctcactTGTCATAAACATCTTTTAGTTCTCTttgcttttgttgaacacaaaagaatatattttgatgaAAGAAAAACACTTCTAATCATTCACTTCCAGAGTTTTTAGGTTGAACTACACCTTAAATACAactcaaatgcattttttattcatttatttaccctcAGGCTATCCAATATTTAGGTGACttaatgatttattatagtcTCATGCAAAAGTTAAATTATCAGTCTTTGCAAGAAACTAATTATGATGATAACTATTCTACTTTTAAACCATGTACAGGATAAGCCAGACAACTCTGGAGCTTGAGTTTTCTTTCACAGAAAGACATGTTAATTGTAAATCTTGTGTGAACCAAAATGattcttatttacacacattgtacctctgttgtaaataataaattCAGTTAATTTATGTTTCTGGTTGCGTGTTCCATCATATGACAGAAAGCTTGAGCTCTGGATTAGTTTGTTATGGCAGTGCtgtacaaacatttttttgtacaaACTGATTGTTTCCCTTCATATGACCACAATATATCTGTTATATCTATCTTTTTATGGTAGTCATTTACTTTCATTATAAAACTCACAACAGACCACAGTATCAGTTAAAACCTTAATTTTCAACTGAAGgaaactacactgcaaaaaatgcttttcttgcttagatttttggtcttgtttctagtctaaatatctaaaatttcttaaatcaagaagcaatttctagacaagcaaaacatattgtcttgttttgagaaataaaatgccaatattaagttagtttttccttatctgccaatggggtaagcaaaataatcttgttttttcttttgacgtgtaagattattttgcttaccccattggcagattattttgcttgttttaaggaaaaatgtaaaatttaggaattttaagatatttggactagaaacaagacaaaaaaaaatctaagtaagaaaagcatttttgcagtgtagttttattttattgtaaagctcCTGTCTTTATTTTATGACTGGTCTTTTTGCAGATGCTTTGTTGGAATCAATCCACCCACTGGGACCAAGGCAGCCACAGCAAAGATTGGAGGAAAAAAAGGTGGAAAGGTGTCAGAGAAGAGGAACCACACAGTCAATCCTCATGTTGGTACTCTTCTCAGAAAGCTAATGGACTTTGAATGGTTAAGCATGTAAGTGAGTTCAAAGTTCAAATACAGGACTTCTGCAAAATGAACAAACTTGTTATAGacacacatttataatattttgattgTTCAAGAACATCTTAAAGctatttgtactttattttttgaGAATGTTTTTCAGCAATGTTCAGCAacagaaatgttattttacaaGTTGAACTCTTAGAGTGCTCTGCtgtcagttttaaaaaaaatagtttattacAATTGTTTGTATAGACACGTGATGTTGTAACATTTGGGATATCTTTGGGatatcaaaatatcttatttactGCCACTTTTGACACTTTGTGAATATAGATAATTTTGTTAAAAGAAATTGTTTAAATGTGGTAAAGTGTTTTGGCATAGCTGATTCACTTTATTGAGTTTTAATCAACCCAGAATATTGCTTCAAATTTAAagtctttaataaaaaataaatgctgttattacaataattttgcatttgtttttttttttattattattaaaaatgtatagtgTTTGTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000101918

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00014272 False 2581 mRNA 0.39 7 18781082 18789781
TCONS_00014273 False 787 mRNA 0.41 3 18782610 18787057
TCONS_00014274 True 3423 mRNA 0.35 2 18785727 18789781

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_007230 NA coding upstream 249527 18508628 ~ 18531555 (+)
XLOC_007229 NA coding upstream 484963 18291282 ~ 18296119 (+)
XLOC_007228 NA coding upstream 788417 17967953 ~ 17992665 (+)
XLOC_007227 CU302200.1 coding upstream 1298928 17421668 ~ 17482154 (+)
XLOC_007226 rnf212 coding upstream 1364352 17397534 ~ 17416730 (+)
XLOC_007232 CT573252.1 coding downstream 9653 18799434 ~ 18799558 (+)
XLOC_007233 NA coding downstream 202372 18992153 ~ 19000316 (+)
XLOC_007234 slitrk2 coding downstream 468921 19258702 ~ 19261733 (+)
XLOC_007235 NA coding downstream 922481 19712262 ~ 19716338 (+)
XLOC_007236 CR318673.1 coding downstream 1016860 19806641 ~ 19811485 (+)
XLOC_007217 NA non-coding upstream 2471551 16306620 ~ 16309531 (+)
XLOC_007238 NA non-coding downstream 1478230 20268011 ~ 20269394 (+)

Expression


Co-expression Network