XLOC_007239 (aff2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_007239
gene name aff2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 20342553 ~ 20737102 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00014281
GCGGCGGTCTGTTCAGAATGAGTGACCGCCTCCAGCGAGCCCTGACTCCGCCTTCCGCAGGGCTGCGTGTCGCTGAGCGGAGAGAGGAGAGAGGCAGCGGCAGTGCGAGCTGCGCCGCGCTTCAGTGAGGGACACACTCAGTTCCTGCATATGCGGCCACCGGCACCTCACTGAAACACACCGACAATGGACCTATTCGAGTTTGACTTCTTCAGGGACTGGGAGCTGGAGCAACAGTGTCATTACGAGCAGGACCGCTCGGCGCTCAAGAAGAAGGAGTGGGAGCGAAGGACGCAGGAAGTGCAGCAGGATGAAGACTTGTTTTCTACCGGATTTAATCTGTTTGGTGAGCCATACAAGactaATAAAGGGGATGCCCTGGCTAATCGGGTACAAAACACACTTGGAAATTATGATGAAATGAAGGAGCTCCTGACCAGTCATTCTAACCAGAGTCACCTTGTGGGTATTCCTAAGAACTCTGTTCCCCAGACCCCAGTGGAGAAACCTGACCAGCCAGGCTTTTTCCCTGAGGCTCAGCGAAGCCGACCAGCTCTATCCCAACCTGGAAGCCACAGCACCTCTATGCCCCCACCCCCTGCTAACACCATACCAGGTTCAAGCGTCATGCATGGACATCAAGGCAAAAAGTCACGCTCTTCAGACTGGTCCCAAGGGGGTCACCGTTCAAGTGGTGTCCAGACCACGCAAGCGGCTAGTCGAGGGAAACACTCCAGTCATGAGCAGACCTCTAATAGACATGATCAGGACCAAGAGGACTCAAGTCCCAATCCTAATGGACCTACAACTTCGTCACACTCCAGCAGGAAGCAGGCACAAGCTGGCAAAGGTCCAGCTACAGCCGAGCTTGGCCTCGGAAAGTCTCCCGCTGAACAGGACTCATGTTCCCATGGCTCAAGCTCACCACTGGCCTCTACATCTCTGCTTCCCAGCGGCCTCTCGACGCCAACTTTTCCACAAGGCCTCCATTGCAAGCCCAGCAGCGCTGTGCAGCAGAAACCCACTGCCTATGTCAGGCCAATGGACGGCCAGGACCAGGTCCCCAATGATTCCCCAGAGCTTAAACCCCCTGTAGAGCTGGTGGAGGGGTACAATACTGTGCCATTTGGAGGTCTGTTGGATACCAAAAGCAGCACGACTGGGACCAAGGGCAAAATTCCTAAGCTGACACTGCCACAATCCGGGGAGGTCAGCCTGCCCAACGACTCCAACTGTGTGGAGGAAATTCTGCGGGAGATGACCCACTCCTGGCCTCCACCTCTCACTGCCATCCACACTCCAGGCAAAGCTGAACAGACCAAGTTTCCCATTCCATCAAAGgattCCCAGCATGTGACTTCAGGATATAATGCAAAACGCTGCAGTGTTCCTAGTAACAAGCCTGCGACCAAGTCAGTACCACAGAAGTCaatgcTTGAGGATGACCTGAAAATCAGCAGTGATGAAGAGGACAATGATCAGGCCGCTGAGAAGCCCAAGCCCAGGAGCACTGCACTCAATCTTCCTGGAAGCACAGCAGTACGGAGCAGCGAAGCGGCCGGCCACTCCAGCGGAGCGTCTGGAAGCTCCAGTGAATCTGAGAGCAGTTCTGAGTCTGATTCAGACAGCGAGAGCAGCTCTAGTGACAGTGAGTGCAACAGAGCGTCTCGCGCCGCCACACCAGAGcctgaaccaagCAAGTGGCAACTAgataagtggattaaaaaagtgAATCCTCACAATAAAGCACTAATTAACACCCAGGCAGATAGTCATGGGCTTAACAGTTCTCAACCTGATGAAAGCCAAACCTCTGAGAACCAGAGCTACAGCAAGAGCAAGCCCAGCACAGCCCTGGCACCAGCAGACCCCAAGGAGAGAACGTTGCTAAGTCCCATCCGAGAGAAAGCCAAACCCAAGGCTGGTCAGAAGGCTCCAGACAGCAAAAGCACCAAGGTGAAATCACCAGCCTCAGTGGAGCTCGCACCTCCCAGGAGAAGCACTGGAAAGAAGCAGCCCAAAAAGGTGGAGAGATCTTCCAGCAGTGAGGAGCACAACTGGCCAAGACCAGGAAACTCAAGTTCTACCCCAAAAGAGAAAGAGCCGCCGCCTTTAGAACCACCAAAACCTAGAGGCAAGGGCCCTGTGGTCAAGACTGCTCCAAGAAAGGAACCTCGGACCACCACAACAAGCACTGCACCAACTAACATCGCACCAGTTCCAGATAAAAAGAAGCACCGTGGACCCAATAAGATAATTCCCAAGTCTAAGGAATTCATAGAGACTGAGTCTTCTTCATCAGAGTGTCATTCGGACCCCGAGGAGCTCACTAAGGTTCAGCTTCCCTGTCCGGGTCCCAACACCCTAAGCCTGAAATCCAAGGATTGCAACAGCAATATCCTGAGTGTTAGTAGCCTTACCAGCACAAGCAGTACCTCCATTCCTGACCCAGGTGCCTCAGATCTCCTGGAAGAACACCTTTTTTCTCCTATCCCCATTGTACAAAATGAACTTTTGTCACCGCTGAGAGATTTTGAGGACATCAAGTCCCTTTGGGTTAAGATTGAACTCAGCTTCCTGTCGCGGATCCCAGGGCAAGACCCCCCAGAGCCTCCCCCAACCAAGGCTGAGTGCCGGGAGGTCAGCGTCAAGCACAGAAGGCAACAGTCGCCTGCCTCTATCCCTGCAGAAAAGAACCCAAGCAAATcgaagaggaaacacaagTCTGAGCACTGTGACGTGATGAGTGGTGGCAAGAAGCTTCGGTTGGACAAAGACACACTGCTGCTTCCTCCTTGTATCTCGCCAATACACAACCACAAGGTCTCCAGCACAAAAGATTCTTTAAAGAAGCAACCTCGCAAGAAGGATGATAAGTTGTTACCACCTCTACTATCCCCGTTGTCTGTTGAGCCAGTGGGACGTCCTCGGAGGAGCAGTGAATGCAGCTCCCTCAGTCAGGAAGGAAGCACATCCACCATCCCAAACAACCTCCCCTCCAGTCGTACAATACCTGCCTCCAGCTCCTCCTCGTCATCATCCTCATCACACAAACACCGCAAAGGAGAAAACAAAGCCTTCTCCCATTCCAAGACCAGCACTGAGGAAGACAGTCACAGCAAGCCATCGGGTGGTTTTCACGGCAATGGTCAGTCAGAAGCAGACCTCTGGTCAAACCCTTCAGCTCTGACAATGGAGCACATGGAGCCCCGGAGACCTAAACTCACATTTAATAGCACTGTTCACAGTGCAGATTACTACATGCAAGAAGCCAAGAAGTTGAAGCACAAGGCTGATGCTTTGATGGACAAATTCGGCAAAGCTGTGAATTATGCCGATGGGGCGCTTTCCTTCATCGAGTGTGGCAATGCCATGGAACGAGACCCGTTAGAGGCTAAGTCACCGTACACTATGTACTCTGAAACCGTAGAGCTCATCAGGTATGCAATGAGATTAAAGAACTTCACCAGTCATTCCGCAACAATAGCTGAGAAGAAGCTTGCTGTATTGTGcaaTCGTTGTTTGTCACTTTTGTACTTGCGAATGTTCAAGCTGAAGAAAGATCATGCGATGAAGTATTCCCGCTCACTAATGGAGTATTTCAAGAACTCTGCAAAGAGCTCGCAAGCACCTTCACCGTGGGGAGCCAATGGAAAGAGCACAGGTACCCCGTCCCCCATGTCCCTAAGCCCGTCTCCTGTCAGCTCGGTCAGCAGCAGCGCAGGAGCCATGGGTTCTTCCTCGGCCTCTGGAAGTGTGGCCATTCCCCAACGCATACACCACATGGCAGCCAGTCATGTCAACATCACCAACAACATCCTGCGCAGCTATGAACACTGGGAAACCGCTGACAAGCTGGCCCAGGAAAGTCAAGAGTTCTTTGTGGAGCTGGACTCAGTAATGGAACCATTGACGCAGCACAGCAGCATGACAGAACTGGTGCGCTACATACGCCAAGGACTGCACTGGCTTCGGCTGGAGGCCCATTTGTTATAGTGCTGGCGCTTCCACTGtgctcttcctctctctctgtctgtctttctctcacTCTCTTCCCCACCGTTCATCACTACCTCCACCATCTTTGCCATCCAGAACCTTGAGGGAAGTCGGCAGTTTACCACTAGCGAGCCTCAGAACTGTGAGTTTTTCCCTGGAGGGCTCCGTATCCTCGATCCTGCTTGATTCCTGTAAGCGTGTCAGGAAAATCTTGGGATTTCGAGGAAGGATGGCGCACTTCTGGGTCCTATCAGCACAACGGGTGGCCAAATTTATGCATCTGGTACAAGAACGGTAGCAGTGGGCAACTTGATAATGCTGTCGAACAAAATTCAACTAGTGACCTCTGTGTGCAAATCTCATTTGCTCTGCAAGGCAGGTTAGGCCAGAAATATACTTCACGCAAGTATAAAATGCCGGATATGAATGCTTGATTAGCATAGCTCAGTGCACAACAATGCTGAATATTCTAGATGTACAATATTAAACCTCAGCGATCGAGGGGTAAGAGCGATACCTTTGAAGTTTAGGGTCAGTacgataaatgttttaaaataagattatcctactcaccaagactgcatttatttcatcaaatacAGAAcaatttgtaaaatgttattgctcTATTCCTTATtccacatttgtacttaaaggtcaatattaattcctcaagggtacatattagtacctaaaagtacaaaagtgttcctcttaaatgtttaaggtactaatatatacttttaaggtaccaatttACCCAAGGTACCCTTTACATACAaacatgtaccttttgaaaaggtaccacccctgtGACTGCTCAtgaacctttatttttgagagtgatccttcagaaattactctattattattattattattattattattattattattattattattattatcatcatcattaatggtaatagtaataaaagcaagtataaatggagtaataatttcatttaaaactactaacaataattaatacataaatatttaataaataaatatttaacaagttaactttttttacatttaataaataccgccttgatgaacaaatcatttaaaaaaaaaagaaagaaaaaaattgacaCCAAACTGTTAAACGGTAGTTATATATCTGTGTCAATgacattacatataaaatatatacgcatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatttttattattaggttTACATAATTTGAAAGATTATTTATGACTTTGATTCAATTTCAAATTTTCTACAATAATTTAGAATTTTCAATGTTATGTCCTGATTTAAAAGAAAAGTTTAGACAAAGACAAAAGTtacgtcatcatttactcattctccacttgttccaaatgtGTTtgagttgaacacaaaggaagatatactgaagaacgTTGGGgaaacttgtaattttttttctactatggatgccaATGGTTGTTTTTTCCTCTAACATTGTTCAGAATATCATGCTTTGCGTTCAACTgaggaaagaaattcataaaagtttagaaccactggAGTGTAAGTAAACATtgagaaaattttcatttttttgatgaactatcactttcaaattgaattaaataattaggtcacactttattttgatggtccattcgttgaacttaagttacattgcatcaaaatgccaactaattcttataacattataagtagactgttaggttggggttagggttagtgtaaattgacatgtacttgcaaaatatcttatagtctgttaaatgtctgtttagcagcagtaataaaatattaagcagacattctactaataatcaaatggattatcaaaataaagtgtttttgatTCTaaactttcatatatatatacacattcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatacatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattaggacaTATTAAGTTGATTAGCTGTACAAAAATTTATgatgttccaaaatatttttgtgGCAGAGCATTTATCATGCTTATAATGGcactaataataatttcaaacatATGCTTTTTTAGCTTTATAATCTAGCAAATGATTTCCACAAAAATGTTACTAgttttagaatgatttctgagggATCACCTGACAAAAACAAATCAACTTAGTCAAGATAGaatgaaatgacattttaaataaagcaaaacaaaaaactattttaaattgttacaatATTTCCacaatacttctttttttttttggtgaaccaaagagacttttaaaaaaaaataaaattcaacctTTTTATATCGATAGCGCATACAaatatcatgaaaaaaaaaaacgtattgcAGCATGTAAGGAAATGGGAATTGATATCGTACAGACATTTCTATACTTGCGCCGAGTATATTTCAGGCCTCAGCACTGCGAGATTGAGTTACACAGGAATTAGGGTACAGATAAATGAGCTGTTAACACCGCATTCATCTCAAACACAGAAATTCACCCCATCTGGAGATTCACACATATCCATTTGAAATGGCTCTGATCTGTCAGGGCTTTTGTAAGGACGGCTGCGGCAGTCATCTATTCTCTCAAACGTCACCGTCTTTCTCTTTTACCGTGGCACTATGACAGCTGGCATCGGTGTGAAAAGAACCAAAGCTGCGTTCTCCGAGACACTTGGCGTCTTGCGTTTGCAGCAGCGGAGGCTGATGGGAGATTTTTCCCTGTGCAATTAActtatacatatgcacatatgaCAGATTGATATCTCTGAGAGGGCGGGTtatcagagattttttttttccccaatatgtACCATAATGACTGTGTTGTATATGACAGCTACTTTAACTGTTTGGTGTTTGTTCAATCTTGCATGTTAATGCAGAGAGGTAGAGGTAGAACCGAGGGGCATCAGCGTATTTCATGAGCACTATGAAAATTACATGCATTTtgtccagtttttttttcttaacgaATTTATGGCTGGCCTGATAATGTTTAACGTTAAGTTCTGATCTACAGAgagtttattaatgcatttttctAACAGACACTTCCAAAAACAAGCTTGGTCAGGATTTTATGACCAAAATGATTGCATCGTGATCAAatcacaaaactttttttaaacaattgttcATTCACCATGCGTAAACTCTTTACGGATGAGTTTAATGTTAAATATGAGGCAAAAATGTTGATCAGTGAGACACAAACTGTTTGTTCTTGCTGGTGTGTTCATTAATGTAGGTatttgagaatgtgtgtgtgtgtgcagattttCATTGGCAGGGTGTGTTCATTGTATTGTAAAGCTTCATATATCTGTCATGTGAATgtcagagcgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtttgtttgggtgAAATAGACATTTCACGAAGATTATTCTAAGTGCCTGCGTATCCAATGGAAATTTATTAGAGTCTATATTTAAGGATGACAATGGATCTGAATGATTTTCCATACCATATTGGTATAtccaatttttttctgttttcataacatgactatttatttattttctttgtaaaatgGCTGTTGTGGTACCTGTTTTTCGCTTTAAGTGCATTTCAGTTTTTTGGTTTTCTGCTCTGATGATGATAGAAAGTGACTGACGTCTAAGTGCATTTGAATTCTTTACATATTGTACAGCTTAATGTATACATCATTCCTCATTACCTCCTTTTACGGATGATTCCGGTTCACGCAACGTAGCGAGAAACGCTTACTGTCTATTATAGTGCAATACTCACTGTAGCACATCAAAAGCAATATGtcgatatttaaaaaaacaactatcAGAAAGTATTGTTTTCTAAATTAATTACAGCGCAAAAGTAAGTTTTATTCACTTCATGGACTTCGTCTGATGCatggctaaaaaaataaataaataaataaaataaaaagagtcaTTATGCAAATAGTGAAATTCTGCTGCCTGTGAACAATATTACCAGCTGTTTTTACTCATATGTGGCTGCTTTCTAAAATGTGTGTGGTTTTCTCCGGCATCTGTTGCTGTGCTTGTTTGAGTTATGCCAGTCTGCCAGAGAAATCTGTGGGCTTCTGGCAGTTCATCAGAAAGCGGCAGCACTGAAGTAAACAACCTGCTCTGCCTATTAGATGCACCTCTAATGCCCCAGTTTGTCTTGCAATAAAAAAGCCAAGTTTAGTTCTTTTAttctttagtttcttttttatatGTTGTTCCTGAATTGGAATTCAAGCAAGCAGGGGAAAAAAACTATTTGGTTTAATTTAGTTGCACACATTTGTTTCATAAAGCTAATTGTAAGAAGCTTTTTAATTCATTACATGATTGCAGTTTgattattacattataataaagaaaagtcACCTAATTGTTATCAATTTGGTTAACTGTAAGTATTGTTATTACTTTAGACTAAAATAAATGGGCACCCACCACTAAAAATGAGCTTTAAGAAACAAATGTGTAGTACAAGAAACCAAACTGGGTTTTTTCAACTTGCTTGAATCCCAATTCACGGACAACATATatcttttttataaattgttcctTAATAGGAATTCAAGCAAGGAGGAAAACCCCAATTTGTTTTAATGTAGTACACATTTGTTTCATAAAgctaataagcagtttttaacttaTTACATTGTTACAAATTGGTTATTACATTGTAATATAGAGAAGTCACCATAAATTTGATTTCAATGTTGTTAACCATAAGTATAAATATTACTCTGGACTAAAATCAAGGCAAAAAATCGGACACCCACCACTAAAAATTAGCTTTATGAAACAAATTGTCACCTTGCAATTATAAgtttctatctgcgttctgaatgatttggGGATAATGAGCTTTAAAGCTTTCGCATTCCAtagcatacagtatgtgtgtaatatttgtttttaaataaaattcttaaatgttaacaacttaaaaaaaaaaaaacatcccataatgtaaataagttgtcatttaataaaaatatgtcaataactcaattttgacaaaatgtgAGATTGAACTTTATAtatctaaggtgacgaaatgtgtGCCACTACATTAAACCAAATTGGGTTTTTTCTACTTGCTTGAATCCCAATTCAGAAACAACATATATCTTTTAATGTAATGTAGTAGCACACGTTTGTTTCATAAAGCTAATTTTaagaagttttttattttattacaatgttACAAATTGGCTATTACGttgtaataaagaaaatccaGCACACACGTCATTTTAATTTGGTTAACCATAAGTATGAATATTACTCTGAAATTAAAAAAGGCCACTCACCACTAAAATGAAACAGCCACTCAACAGTGATTATTTAAAACAGCCTTACTTGCCGAGATAAGTTCTAAGAACACCTGAGAGTGCAATATGGTTTGGCAcgataatcaaataaaaaagacaGCATTATAATTATATCAATTTGTAATCTGATGCACTGAACTAagatttttttgtgcattttgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaatcacttaTTTGAAAATGCATCCTGCACAAAAACAAATCTGCCAAAATTTGTATTAAGAAAAGGATAAAATCCAAagagaaaatgattttttttttatttttttttcattaaatcaaAATGAGTAGTAGTTTTCTAAAAGATATTTGTTCCCCATGATCAATGGCCCACTCAGATTCAAGTAATGTGTAATTTTGACCAATTTGGCAATTAGATTCTTATGGTTTTAATCAGATTTGATTTAAATCTggaattgaaatattaaaaatcataaccaACATAAGTTATACATGAAATACTGTGATGCAGTTTCCCAGCACTGGCTTTAATTAGATCTTTATCTGTAAGTCTCTATaagaatgatttataaatatatttgagaaaaaaagatgTCATTTTCTGCCACAATAAAACCTCTACAGTTTAACTCCTTAACTGTCGCACCATTTTTGAGTTCACACTTGGAAATGATATATGCATGCATATTAAATCTAGTTTGTTAAGATAAGTTCTGGATTAGACAAATGTAATACATATGTACAGAAAAGTAACAGTTCAGGgcttaatatttgaaataaaaaattaatattattattaactgaaAATAATTTCAAATTTGCATACAATTTCAAAAACATTAATGACCGGCAAATTTCATGTTTATTTGCTGTATTTGATTAATACAATGATAAAAAGGTTGTTCTTTGCATAAATAAGAGAAAAACTAGAATCAGTGTTAAAGTTTCATCATTAAAAGAGGCATTTTCAAATACTGACCAAACCAAgacaaaataaagatttatagTAATTCTATATTTTAAGCAATGAATATATCATCAATATTTACAGTTTGCGAAAATCACACCCATTCGTCAAATGAAGCCTAAATCATCAATGTTGTCCATAAAAGTGccactaaaaattaaaaaaataataataatatttgtttttgcaaatgaacTTTACATTGGATCGGTCTTGTTTTGcattttatcatatttattttaaaaccaacATTTGAAGCAGTCTGGAAAGCATGTTGCTTACTGTCcatcaataaaaaacaaaactgcacaaTGCTTTAACATTTACTTTGATGGTGTAGTATTTACATCACCTTTGCTTTTAACAaagtttaaatgctttaaattatACCAGTGCATTAGCAATTACACCACATCCCGTTTTGACTCCCTGTGCTTCTCAATGAGTTCTATACAACGATGAAGACAAAAGCCCATCAGGAAGAACAATCTCCAATTAAAGCAGCCTCAGCTTGAGGCTTTCTATTTGCTCTGCAGATTAAACATGTAAATAGCGCTTCGTTACCGTAAAACACCACATCATGTTATCAATTAAAGATCTTCCAATTCTGTCACTGATTAACAGGTGGCTTGTTCTACGgtacagttattaaaaaaaaaacagacatcatCAAAAAACCCTCATTTTTATTAAACTCGAGCACTTCTCAGTTTATCAAGCGTACGAATATCATATCAATTTCATTTATTTGCTGAATGAATCGTATTTAAAAAAGTCAGTTTCTAACTTCATCAGAGATTTCTTCTATGGAAAAAAGTACCTtgttgcaaatgccttgttacCAATGTAAACTGTAGAGAACAGTTATTTGCAGTCTTGTTCTGTCCGTTTGTCTTTCTCTGTACAGTATAAGGTTGTGCGCCATAATTTGTCTTCTTGAGATTGTAATCGCATTAAGGCATTGCATTCGACCCTATCCTAAGCCCATCCACAGCTTTGAATCTGTGAAGATATGCAACATCTCTCATTGCTTCCATGTCATACAAGTCAGCCTTTCTGCTACGTTCAACATTTTCAGTTCAACTTCACCGACTGGGAGAATAGAACTGTTGAATCAGAGTGTACAAATGGGTAACACGACAATGAATTCCTTACAGGAGAAAAGGTATTTACTGTACACAACAAGGCAATACTTACTTAAGGTGGAAAGCCATTGAAGTAACCAAATGAAAGTGCGTCGGTGGCATAATGCGTTCAAAACGATGTAAATGCCAGAGCAAAATCTAAAATTGAAATTGGAGCAACGTCCCAAAGAGCAGTTGATCTTGATGGAGCCTTATGGGAAATCATAGCGTTTCCTTTCCTTGTGGTTTCAAAAATGCAGCCATCATACTGTTAAAGAAAGTTTCATTTTGATAAAATATGCAAACAgatatggagaaaaaaataaactattacttAATGGCAAAGAAAAACAAGTTTCTTACGAGTTTTAATGCAGCATGACTCTTTCTACCGAGTAACTGTCATAATGGAAGTTGCGTTTAATTACTACTCGATTTCAAAGACGTCAGTATTGTTATATGTTGTAGACATATTTAAAGCTATCAGAAAGCAGTTCTGTGAAACTTGCGCTTTATAGAAATGCCTCAATGCTACCTATTGCCTAAAAAGATGTCGGTTTAAGGATTTCTACTTGGAGGGAAAAGGCCATTATCTGATTGTTGGTAAAGTTGTACACATTACTTGCAAGGACAGAAGATTTCAATGTTCTGGCATGCTGTAGaatttaggtttttgttttgtttctttttttgtacaGAGCAGGTGACCTGCAATGCTTTGAATTTATACATTGTATAGTTGTACCgattcattttaaaatgcgtTATGTATCGAAAAACCTTCCTGCCTGGTTAGCTTTGTATTTCCAATGTGTTGCACAAGTCCagcaattttgtttttttattattattgttctttttgttcttcttttttggctattgtatgtttattttataataaaactgtaaaacGTAATGAACAAAAC
>TCONS_00014282
GAGTGACCGCCTCCAGCGAGCCCTGACTCCGCCTTCCGCAGGGCTGCGTGTCGCTGAGCGGAGAGAGGAGAGAGGCAGCGGCAGTGCGAGCTGCGCCGCGCTTCAGTGAGGGACACACTCAGTTCCTGCATATGCGGCCACCGGCACCTCACTGAAACACACCGACAATGGACCTATTCGAGTTTGACTTCTTCAGGGACTGGGAGCTGGAGCAACAGTGCTTTCCTTACCCCATGTGGTGGACATTACCCTCTAGACTGACAACTTCTCTAGTTTCCTCCAAACCGGGCCTGCTCCGTGTGTGATGCCAGATGACTGTTATTTGGACCCCTCTGTAGCCTGAACACAGACCCCTGAAAGGTCaccgaaggaaaaaaaaatcacttagaaaaaaaagacaaagtgtGAGAGAAACAAGAGTTGGCTGGCAACAAGGCATGCGCTAATAGCACAATAAAACAATACTGTTAAGCGGCCCTT
>TCONS_00016196
GTTGATTAGCTGTACAAAAATTTATgatgttccaaaatATGCTTTTTTAGCTTTATAATCTAGCAAATGATTTCCACAAAAATGTTACTAgttttagaatgatttctgagggATCACCTGACAAAAACAAATCAACTTAGTCAAGATAGaatgaaatgacattttaaataaagcaaaacaaaaaactattttaaattgttacaatATTTCCacaatacttctttttttttttggtgaaccaaagagacttttaaaaaaaaataaaattcaacctTTTTATATCGATAGCGCATACAaatatcatgaaaaaaaaaaacgtattgcAGCATGTAAGGAAATGGGAATTGATATCGTACAGACATTTCTATACTTGCGCCGAGTATATTTCAGGCCTCAGCACTGCGAGATTGAGTTACACAGGAATTAGGGTACAGATAAATGAGCTGTTAACACCGCATTCATCTCAAACACAGAAATTCACCCCATCTGGAGATTCACACATATCCATTTGAAATGGCTCTGATCTGTCAGGGCTTTTGTAAGGACGGCTGCGGCAGTCATCTATTCTCTCAAACGTCACCGTCTTTCTCTTTTACCGTGGCACTATGACAGCTGGCATCGGTGTGAAAAGAACCAAAGCTGCGTTCTCCGAGACACTTGGCGTCTTGCGTTTGCAGCAGCGGAGGCTGATGGGAGATTTTTCCCTGTGCAATTAActtatacatatgcacatatgaCAGATTGATATCTCTGAGAGGGCGGGTtatcagagattttttttttccccaatatgtACCATAATGACTGTGTTGTATATGACAGCTACTTTAACTGTTTGGTGTTTGTTCAATCTTGCATGTTAATGCAGAGAGGTAGAGGTAGAACCGAGGGGCATCAGCGTATTTCATGAGCACTATGAAAATTACATGCATTTtgtccagtttttttttcttaacgaATTTATGGCTGGCCTGATAATGTTTAACGTTAAGTTCTGATCTACAGAgagtttattaatgcatttttctAACAGACACTTCCAAAAACAAGCTTGGTCAGGATTTTATGACCAAAATGATTGCATCGTGATCAAatcacaaaactttttttaaacaattgttcATTCACCATGCGTAAACTCTTTACGGATGAGTTTAATGTTAAATATGAGGCAAAAATGTTGATCAGTGAGACACAAACTGTTTGTTCTTGCTGGTGTGTTCATTAATGTAGGTatttgagaatgtgtgtgtgtgtgcagattttCATTGGCAGGGTGTGTTCATTGTATTGTAAAGCTTCATATATCTGTCATGTGAATgtcagagcgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtttgtttgggtgAAATAGACATTTCACGAAGATTATTCTAAGTGCCTGCGTATCCAATGGAAATTTATTAGAGTCTATATTTAAGGATGACAATGGATCTGAATGATTTTCCATACCATATTGGTATAtccaatttttttctgttttcataacatgactatttatttattttctttgtaaaatgGCTGTTGTGGTACCTGTTTTTCGCTTTAAGTGCATTTCAGTTTTTTGGTTTTCTGCTCTGATGATGATAGAAAGTGACTGACGTCTAAGTGCATTTGAATTCTTTACATATTGTACAGCTTAATGTATACATCATTCCTCATTACCTCCTTTTACGGATGATTCCGGTTCACGCAACGTAGCGAGAAACGCTTACTGTCTATTATAGTGCAATACTCACTGTAGCACATCAAAAGCAATATGtcgatatttaaaaaaacaactatcAGAAAGTATTGTTTTCTAAATTAATTACAGCGCAAAAGTAAGTTTTATTCACTTCATGGACTTCGTCTGATGCatggctaaaaaaataaataaataaataaaataaaaagagtcaTTATGCAAATAGTGAAATTCTGCTGCCTGTGAACAATATTACCAGCTGTTTTTACTCATATGTGGCTGCTTTCTAAAATGTGTGTGGTTTTCTCCGGCATCTGTTGCTGTGCTTGTTTGAGTTATGCCAGTCTGCCAGAGAAATCTGTGGGCTTCTGGCAGTTCATCAGAAAGCGGCAGCACTGAAGTAAACAACCTGCTCTGCCTATTAGATGCACCTCTAATGCCCCAGTTTGTCTTGCAATAAAAAAGCCAAGTTTAGTTCTTTTAttctttagtttcttttttatatGTTGTTCCTGAATTGGAATTCAAGCAAGCAGGGGAAAAAAACTATTTGGTTTAATTTAGTTGCACACATTTGTTTCATAAAGCTAATTGTAAGAAGCTTTTTAATTCATTACATGATTGCAGTTTgattattacattataataaagaaaagtcACCTAATTGTTATCAATTTGGTTAACTGTAAGTATTGTTATTACTTTAGACTAAAATAAATGGGCACCCACCACTAAAAATGAGCTTTAAGAAACAAATGTGTAGTACAAGAAACCAAACTGGGTTTTTTCAACTTGCTTGAATCCCAATTCACGGACAACATATatcttttttataaattgttcctTAATAGGAATTCAAGCAAGGAGGAAAACCCCAATTTGTTTTAATGTAGTACACATTTGTTTCATAAAgctaataagcagtttttaacttaTTACATTGTTACAAATTGGTTATTACATTGTAATATAGAGAAGTCACCATAAATTTGATTTCAATGTTGTTAACCATAAGTATAAATATTACTCTGGACTAAAATCAAGGCAAAAAATCGGACACCCACCACTAAAAATTAGCTTTATGAAACAAATTGTCACCTTGCAATTATAAgtttctatctgcgttctgaatgatttggGGATAATGAGCTTTAAAGCTTTCGCATTCCAtagcatacagtatgtgtgtaatatttgtttttaaataaaattcttaaatgttaacaacttaaaaaaaaaaaaacatcccataatgtaaataagttgtcatttaataaaaatatgtcaataactcaattttgacaaaatgtgAGATTGAACTTTATAtatctaaggtgacgaaatgtgtGCCACTACATTAAACCAAATTGGGTTTTTTCTACTTGCTTGAATCCCAATTCAGAAACAACATATATCTTTTAATGTAATGTAGTAGCACACGTTTGTTTCATAAAGCTAATTTTaagaagttttttattttattacaatgttACAAATTGGCTATTACGttgtaataaagaaaatccaGCACACACGTCATTTTAATTTGGTTAACCATAAGTATGAATATTACTCTGAAATTAAAAAAGGCCACTCACCACTAAAATGAAACAGCCACTCAACAGTGATTATTTAAAACAGCCTTACTTGCCGAGATAAGTTCTAAGAACACCTGAGAGTGCAATATGGTTTGGCAcgataatcaaataaaaaagacaGCATTATAATTATATCAATTTGTAATCTGATGCACTGAACTAagatttttttgtgcattttgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaatcacttaTTTGAAAATGCATCCTGCACAAAAACAAATCTGCCAAAATTTGTATTAAGAAAAGGATAAAATCCAAagagaaaatgattttttttttatttttttttcattaaatcaaAATGAGTAGTAGTTTTCTAAAAGATATTTGTTCCCCATGATCAATGGCCCACTCAGATTCAAGTAATGTGTAATTTTGACCAATTTGGCAATTAGATTCTTATGGTTTTAATCAGATTTGATTTAAATCTggaattgaaatattaaaaatcataaccaACATAAGTTATACATGAAATACTGTGATGCAGTTTCCCAGCACTGGCTTTAATTAGATCTTTATCTGTAAGTCTCTATaagaatgatttataaatatatttgagaaaaaaagatgTCATTTTCTGCCACAATAAAACCTCTACAGTTTAACTCCTTAACTGTCGCACCATTTTTGAGTTCACACTTGGAAATGATATATGCATGCATATTAAATCTAGTTTGTTAAGATAAGTTCTGGATTAGACAAATGTAATACATATGTACAGAAAAGTAACAGTTCAGGgcttaatatttgaaataaaaaattaatattattattaactgaaAATAATTTCAAATTTGCATACAATTTCAAAAACATTAATGACCGGCAAATTTCATGTTTATTTGCTGTATTTGATTAATACAATGATAAAAAGGTTGTTCTTTGCATAAATAAGAGAAAAACTAGAATCAGTGTTAAAGTTTCATCATTAAAAGAGGCATTTTCAAATACTGACCAAACCAAgacaaaataaagatttatagTAATTCTATATTTTAAGCAATGAATATATCATCAATATTTACAGTTTGCGAAAATCACACCCATTCGTCAAATGAAGCCTAAATCATCAATGTTGTCCATAAAAGTGccactaaaaattaaaaaaataataataatatttgtttttgcaaatgaacTTTACATTGGATCGGTCTTGTTTTGcattttatcatatttattttaaaaccaacATTTGAAGCAGTCTGGAAAGCATGTTGCTTACTGTCcatcaataaaaaacaaaactgcacaaTGCTTTAACATTTACTTTGATGGTGTAGTATTTACATCACCTTTGCTTTTAACAaagtttaaatgctttaaattatACCAGTGCATTAGCAATTACACCACATCCCGTTTTGACTCCCTGTGCTTCTCAATGAGTTCTATACAACGATGAAGACAAAAGCCCATCAGGAAGAACAATCTCCAATTAAAGCAGCCTCAGCTTGAGGCTTTCTATTTGCTCTGCAGATTAAACATGTAAATAGCGCTTCGTTACCGTAAAACACCACATCATGTTATCAATTAAAGATCTTCCAATTCTGTCACTGATTAACAGGTGGCTTGTTCTACGgtacagttattaaaaaaaaaacagacatcatCAAAAAACCCTCATTTTTATTAAACTCGAGCACTTCTCAGTTTATCAAGCGTACGAATATCATATCAATTTCATTTATTTGCTGAATGAATCGTATTTAAAAAAGTCAGTTTCTAACTTCATCAGAGATTTCTTCTATGGAAAAAAGTACCTtgttgcaaatgccttgttacCAATGTAAACTGTAGAGAACAGTTATTTGCAGTCTTGTTCTGTCCGTTTGTCTTTCTCTGTACAGTATAAGGTTGTGCGCCATAATTTGTCTTCTTGAGATTGTAATCGCATTAAGGCATTGCATTCGACCCTATCCTAAGCCCATCCACAGCTTTGAATCTGTGAAGATATGCAACATCTCTCATTGCTTCCATGTCATACAAGTCAGCCTTTCTGCTACGTTCAACATTTTCAGTTCAACTTCACCGACTGGGAGAATAGAACTGTTGAATCAGAGTGTACAAATGGGTAACACGACAATGAATTCCTTACAGGAGAAAAGGTATTTACTGTACACAACAAGGCAATACTTACTTAAGGTGGAAAGCCATTGAAGTAACCAAATGAAAGTGCGTCGGTGGCATAATGCGTTCAAAACGATGTAAATGCCAGAGCAAAATCTAAAATTGAAATTGGAGCAACGTCCCAAAGAGCAGTTGATCTTGATGGAGCCTTATGGGAAATCATAGCGTTTCCTTTCCTTGTGGTTTCAAAAATGCAGCCATCATACTGTTAAAGAAAGTTTCATTTTGATAAAATATGCAAACAgatatggagaaaaaaataaactattacttAATGGCAAAGAAAAACAAGTTTCTTACGAGTTTTAATGCAGCATGACTCTTTCTACCGAGTAACTGTCATAATGGAAGTTGCGTTTAATTACTACTCGATTTCAAAGACGTCAGTATTGTTATATGTTGTAGACATATTTAAAGCTATCAGAAAGCAGTTCTGTGAAACTTGCGCTTTATAGAAATGCCTCAATGCTACCTATTGCCTAAAAAGATGTCGGTTTAAGGATTTCTACTTGGAGGGAAAAGGCCATTATCTGATTGTTGGTAAAGTTGTACACATTACTTGCAAGGACAGAAGATTTCAATGTTCTGGCATGCTGTAGaatttaggtttttgttttgtttctttttttgtacaGAGCAGGTGACCTGCAATGCTTTGAATTTATACATTGTATAGTTGTACCgattcattttaaaatgcgtTATGTATCGAAAAACCTTCCTGCCTGGTTAGCTTTGTATTTCCAATGTGTTGCACAAGTCCagcaattttgtttttttattattattgttctttttgttcttcttttttggctattgtatgtttattttataataaaactgtaaaacGTAATGAACAAAACTAAGATGTagttatgttgtttttaaatgtttattgtctgtataaaatgatgaataaaaatgGTATGAGCCGACTTTAAAAAAGCATTCAAGTTTCAAGGTATTTCTGAGCAGATATGATCGAATTTAGGTTAAATGGTCATAAATGTCACAGAAACATTACTGAAACTGAAACgtac

Function

symbol description
aff2 Predicted to enable G-quadruplex RNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of RNA splicing. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be active in nuclear speck. Is expressed in intermediate cell mass of mesoderm. Human ortholog(s) of this gene implicated in X-linked intellectual developmental disorder 109. Orthologous to human AFF2 (AF4/FMR2 family member 2).

GO:

id name namespace
GO:0010468 regulation of gene expression biological_process
GO:0043484 regulation of RNA splicing biological_process
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0016607 nuclear speck cellular_component
GO:0002151 G-quadruplex RNA binding molecular_function

KEGG:

id description
ko03021 Transcription machinery

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-110411-190 Predicted to enable G-quadruplex RNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of RNA splicing. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be active in nuclear speck. Is expressed in intermediate cell mass of mesoderm. Human ortholog(s) of this gene implicated in X-linked intellectual developmental disorder 109. Orthologous to human AFF2 (AF4/FMR2 family member 2).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000052242

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00014281 False 12460 mRNA 0.39 21 20342553 20736925
TCONS_00014282 False 480 mRNA 0.53 2 20342572 20411073
TCONS_00016196 True 6499 lncRNA 0.32 2 20730546 20737102

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_007238 NA coding upstream 73159 20268011 ~ 20269394 (+)
XLOC_007237 fmr1 coding upstream 151272 20156477 ~ 20191281 (+)
XLOC_007236 CR318673.1 coding upstream 531068 19806641 ~ 19811485 (+)
XLOC_007235 NA coding upstream 626215 19712262 ~ 19716338 (+)
XLOC_007234 slitrk2 coding upstream 1080820 19258702 ~ 19261733 (+)
XLOC_007240 NA coding downstream 22527 20759629 ~ 20761559 (+)
XLOC_007241 NA coding downstream 104442 20841544 ~ 20845040 (+)
XLOC_007242 lygl1 coding downstream 155963 20893065 ~ 20898499 (+)
XLOC_007243 zgc:162941 coding downstream 163887 20900989 ~ 20908036 (+)
XLOC_007244 lygl2 coding downstream 174208 20911310 ~ 20917866 (+)
XLOC_007233 NA non-coding upstream 1342237 18992153 ~ 19000316 (+)
XLOC_007232 CT573252.1 non-coding upstream 1542995 18799434 ~ 18799558 (+)
XLOC_007254 NA non-coding downstream 556012 21293114 ~ 21293498 (+)
XLOC_007255 ndufs8b non-coding downstream 934005 21671107 ~ 21678917 (+)
XLOC_007259 NA non-coding downstream 1040455 21777557 ~ 21777836 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G125825 NA non-coding CI01000024 null 8027782 ~ 8027990 (-)
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G324909 NA non-coding CI01000110 null 2953232 ~ 2959837 (-)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G123660 NA non-coding NC_048566.1 CM023220.2 23252405 ~ 23252666 (-)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G203449 NA non-coding NC_035920.1 CM008323.1 5296402 ~ 5302881 (+)