LOC111193183


Basic Information

Item Value
gene id LOC111193183
gene name NA
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035905.1
NCBI id CM008308.1
chromosome length 42966623
location 8476397 ~ 8517648 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU106430
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>TU106431
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>XM_022672666.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU106430 True 4191 lncRNA 0.39 2 8506577 8510794
TU106431 False 2587 lncRNA 0.40 3 8476397 8510794
XM_022672666.1 False 1482 mRNA 0.49 5 8510690 8517648

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G78890 NA non-coding downstream 44113 8428518 ~ 8432284 (-)
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G79064 NA non-coding upstream 1078364 9596012 ~ 9596425 (-)
LOC111193177 kcnh1,LOC108433307,LOC106904951,LOC103476431,LOC102309410,LOC103370850,LOC103137420,LOC101155792 other downstream 1255543 7198909 ~ 7220854 (-)
G78297 kdm1a other downstream 3290039 5184792 ~ 5186358 (-)
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G78023 scfd1 other downstream 4635827 3834562 ~ 3840570 (-)
prkd1 prkd1,LOC107590910,LOC107719483,LOC107733145 other downstream 4762040 3645097 ~ 3714357 (-)
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LOC111193185 stac,LOC107715935,LOC107670884 other upstream 132980 8650628 ~ 8655017 (-)
LOC103027354 LOC103027354,LOC108438753 other upstream 1517038 10034686 ~ 10071884 (-)
LOC103027264 NA other upstream 1776840 10294488 ~ 10336716 (-)
G79582 NA other upstream 2410992 10928640 ~ 10929596 (-)

Expression


Co-expression Network