LOC103037880 (LOC108432996)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103037880
gene name LOC108432996
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035897.1
NCBI id CM008300.1
chromosome length 26953843
location 9113479 ~ 9133571 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU3232
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>XM_007237176.3
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Function

NR:

description
PREDICTED: nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU3232 False 1819 lncRNA 0.48 2 9113492 9133571
XM_007237176.3 True 7700 mRNA 0.43 4 9113479 9128066

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103026958 nos2,LOC108432969 coding downstream 223020 8867321 ~ 8890459 (-)
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LOC103023547 LOC108432992,LOC103353587,LOC100691215,LOC108277929,LOC102314497 coding downstream 326430 8726331 ~ 8787049 (-)
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LOC103039097 serpinh1b,LOC103039097,LOC108433001,LOC108278262,LOC107588392,LOC107756564,LOC107666206 coding upstream 473345 9606916 ~ 9612718 (-)
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nlk nlk2,nlk,LOC107682651,LOC107666197,LOC106581270 other downstream 21367 8953877 ~ 9092112 (-)
LOC103031123 LOC108411357 other downstream 3392371 5703706 ~ 5721108 (-)
LOC111193783 LOC108442858 other downstream 4792139 4276909 ~ 4321340 (-)
LOC111193794 LOC108442858 other downstream 4841509 4267001 ~ 4271970 (-)
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G2783 NA other upstream 1448718 10582289 ~ 10582747 (-)
LOC103025442 lhx1a,LOC108427001,LOC108277614,LOC107743643,LOC105897175,LOC107669762,LOC107589700 other upstream 1521287 10654858 ~ 10684465 (-)
sarm1 sarm1,LOC107669752,LOC107743642,LOC107756984,LOC107685076 other upstream 2147638 11281209 ~ 11293882 (-)

Expression


Co-expression Network