LOC111195508


Basic Information

Item Value
gene id LOC111195508
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035897.1
NCBI id CM008300.1
chromosome length 26953843
location 10753104 ~ 10756886 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022683060.1
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>XM_022683090.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022683060.1 True 3036 mRNA 0.37 4 10753104 10756886
XM_022683090.1 False 2943 mRNA 0.37 3 10753104 10756886

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC111195496 tekt1 coding downstream 240316 10509040 ~ 10512788 (-)
LOC103040855 NA coding downstream 933195 9817662 ~ 9819909 (-)
LOC103040551 NA coding downstream 938406 9812342 ~ 9814698 (-)
LOC103040232 samsn1 coding downstream 950424 9766040 ~ 9802680 (-)
LOC103039097 serpinh1b,LOC103039097,LOC108433001,LOC108278262,LOC107588392,LOC107756564,LOC107666206 coding downstream 1140386 9606916 ~ 9612718 (-)
LOC103043674 dhr13,LOC108427000,LOC107685074,LOC107589701,LOC107756995 coding upstream 315512 11072398 ~ 11076365 (-)
LOC103042223 cryba1a,LOC103042223,LOC108426912,LOC107743738,LOC108278232,LOC105898204 coding upstream 323962 11080848 ~ 11083883 (-)
foxn1 foxn1 coding upstream 363921 11120807 ~ 11135302 (-)
lrrc72 NA coding upstream 547704 11304590 ~ 11308672 (-)
arl4a arl4a,arl4aa coding upstream 952739 11709625 ~ 11713271 (-)
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G2731 NA non-coding downstream 464422 10275904 ~ 10288682 (-)
G2730 NA non-coding downstream 480579 10271530 ~ 10272525 (-)
G2835 NA non-coding upstream 26262 10783148 ~ 10783487 (-)
G2837 NA non-coding upstream 26918 10783804 ~ 10784140 (-)
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G2865 NA non-coding upstream 314147 11071033 ~ 11071239 (-)
G2881 unc119,LOC103043060 non-coding upstream 335284 11092170 ~ 11112806 (-)
LOC103025442 lhx1a,LOC108427001,LOC108277614,LOC107743643,LOC105897175,LOC107669762,LOC107589700 other downstream 68639 10654858 ~ 10684465 (-)
G2783 NA other downstream 170357 10582289 ~ 10582747 (-)
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hspa13 hspa13,LOC107682527,LOC107666191,LOC107714176 other downstream 997349 9746622 ~ 9755755 (-)
LOC103037880 LOC108432996 other downstream 1619533 9113479 ~ 9133571 (-)
sarm1 sarm1,LOC107669752,LOC107743642,LOC107756984,LOC107685076 other upstream 524323 11281209 ~ 11293882 (-)
LOC111192956 LOC108412924,LOC108444125,LOC108444119,LOC108416439 other upstream 1167116 11924002 ~ 11940744 (-)
G3297 sacs,LOC107593479,LOC107740366,LOC107670382 other upstream 1983258 12740144 ~ 12758513 (-)
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LOC111197384 NA other upstream 2373326 13130212 ~ 13135641 (-)

Expression


Co-expression Network