G93414


Basic Information

Item Value
gene id G93414
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000016
NCBI id null
chromosome length 12175457
location 962579 ~ 1040425 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU106289
CGAAGGTCTTACGGGTGTAGAACGACATGAGGGTGAGTAATTAACGACATTATTTTCATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTAACTGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTGCTTTAAGATATTCTAAACTGTAATTTATTACTCTGATGGCAAGGCTGAATTCACAGAAGTCTTCAGTGTCACATGATCCTTTAGAAATCATTCTAATATGCTGATTTGCTCAAGAAACTTTTTTTTCTGTGTGTAAACCATGGCACATTTTTTTCAGGATTCTTTGATGAATAGAAAATTCAAACAGAATTTATTTAAAATGGAAATATTTTGTAAGATTATGGCTTTACTTGCGCTTTTGATCAATTTAATGCATCCTTGCTAAATAAAAGTATTAATATTAAAAACTATACTGACCTTGAACTCTTGAACTGTAGTGTAATTTACTGTAAAATGCGCAGAACAATGCGTCAAACCATTTAGTATACAGTATAATAAAATATTAAGTTTTAGAATTATCCCTTAACGTATGAGGTTTCTTGAATATTAAATTTAACTATAAATATGTTTGTCACCATATTTTGAGTTAATTTTGACAATAAAATGGGTGAAAATATAGACTTAGATTACTTAAACTCTAGCAACTGCATAGCAAAATCCAAGCAACACTGGTGGTGAGTTTTGTACAGGCAAGCAGCACTCACATTTTCTGCTAAAACTGTAAATATGTACTTTTCCTGTTTCTCACAATTACCCAGAAACTCCTTGTTTTGGAATTGCTGAGCCCAATTGTGCACGTCATTTTCTAAAACAGCTCCACTTCCAGTTCTCTGCTATGATTCTGTACTTCCCCAAAGCTCACTCAGTCCTTCCTTTTGTTTTCCCATAATCTTTGAATAAGCATGAACCTGTTTTGTTTTTTTCTCTGCTGGAACCCAAAAAGCCTCCTCAGCATACAGGAGGCAGGAATAAAAGGTGTTTAGATTCGGCTGTAGTCTTTAGAGAGAATGGCAGAGGCTAATCTGGTGGCCTGCTCTGCACTGGTAAAGATGTAAACATGACGCTGGTGACCTCAGACGCAGGGAATACAATGGGCCCTCATGATTCCTCCAGTTTGTGCGTTTAAATCTTTGTAATGTTTTCTGAATGAGAGGAGAGAACACAGGTTCCTAAATGCGAATTGACATAGTAAATCATTTGTATCTCTTTGTATATATGGGCTGCGCTATTAATCAAGTAAATTAATAAGATTATGATCATGTCTGCCATGATTTGATAGTCAGTGAGTTCGTGCTAAACTGCAGGACTCAAACAGTCACATGAAACTGTAAACTTGCGTTGACAGCTTTATTGATCATAACAAGAGGGGGAGCAGTCTATTATTAATGTTTGCTCGCTTTCGCTGTATAATTTATTCTAAATCTAAATAACAGGGGGTTTGATGCTGAGAAAGAGGGCTAGTGAGAAGTTGACCCTTTAGGCACTGTCTTGGTTTAGTGATGTATAAAACAGCAAAAGATTAAAGGCCCGTTCACACCAAGCATGATAACTATAACAATAACTATATTAGTGTCCACACCCGAGGATTATAACATTCTGTTTATTCTAACCATGCTGCAGTTTTGCCGTTTGTTGCTTTAAATGTGTGAGCTCTTTAAACTAGGATGGATTCTGATTGGCTGTCAATGTTTTTATCGTTCATCAGCTGGAAAAAATCGTTCTGAAAGTGATTCCAGCTATATCATTTCTCTGTGCCATAATATTTGTGGTGTGGACTCTACTATTCTTTTATATTTAGAAGGATTTTTAGAACTATATCTTTATAGTAACTATATACTATATCGTTATCATTATAGTTATCGTCTTTTGTGTGAACGGGCCTTAATTCGAGAACACGTGGATGTGTAGCCTACATAAAGAATATGGCATGCTTCCCACACAAATTAAGTTTAAAGTAATCAAAATTAATGAGTCAAGTCATTACATTATCAGGATGAATAACAGACAACATCACTAATGAAAATGCTTTATTGCTTTACATTATTCTGTTTTTTTTATTATTACAAATTATATCAGCAAAGTTAAAATGTAAAGCAACAATCTGTACAAAAGAATTTACATAATCACAAATTTACTTATTTGATTAGTGACCTAGATATAGTGCAAACTCTTTAAAATTTCATATTCATTTTACACTGTAATGTTTCTGTTTTAATTTTTAAAAAAAATTTATTTATTTTTTTTAAGGTTTAAATTAGATTTTGTGGTCCCATATATTTGGACCCCAATGTGCATAAAATGCCCTATTTTTCCCTTTGACCCACGACCCACAAACAATCATGGTTATGTGGCTGATATTAGATACATGTGAAAAATGATTCTTGCTTGATTTCTTTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACATACACATGCACACGTATTCACCTGGTAACCGAGTCTCTAAGCGCAGGTGTGGTAAAGGGATCAGGTGTTTTGGAAAACAGCTTGAATATGTGTTAGTGGCTGAGGTGTGACAACAATATCTTCAGTGTGGAGCTGCTATAAAGGTCTTGTTAAGTGAAAATTATTCATATTTCTTACACTTGTATATGAAAACAAAAAGCACATGTTTATTGACATAGTATTTTCAAGCATTGCATTGCATTAAAATTGCATGAAAATTTGTATATATATGTGTAATCAGAATAAATTAATGTTCTCAGTTAATACAAGATGCTGACTGTCTGAATAAACAATTGACTAAATGTTTAAAGCATAAAACTTAAACCTAAATCTTAGCTTAAAACATCCTCCTCATTATAAACAAAGCATTTATGTAATCAAGCTCCAAAAATTACTCTTTTTGATATTGTGTGATCTGTGACGAATTGCAAATACATTTGCATATGACTGCCTCCAGAACAAGACTTTGACAAATAGTTTTACATCATCGCACCATAGCCCCGCCCACTGGCATTCAGTCGCTTAACGGCTGCTTAATCGGCCTACACAAGATGCGAGCATTGCGTCAAAAGCAAATAGAACATATTATAATCACTGATGCTATCTACACTGGACACAGTATACAGACGCGTATTTAGTTTCTGACATACTCTACGCATTTGAGTCTGTTGACAACGGGACAAATGGAAGAGTGAAAGAACGCTTGATTTGACATGTCCAGTTTAAACAGCTCATTCGCATCCCTGTACAGATTTTAGAAGGATCCCAACGCTAGAAACAAGTGGATGGTTTATTTTACTGCCATCCCGGATCGCATCGGAGGATTATATGTTTGTTTGGAGCATTTTGTTTTATAATCAAGGCACAGTGTAATGGAGAGTTTGCAAAGAAACTTTTGTTGAAAGATGAAGCAGCCAACTGTACTGGATCTGACAGCAGCTGCATCACAAACTACACGTAAATGATTTCATAATCCTTTGTCTGTAAATGACGGTTTTATATATATAATGTTTTCAAGACACTTACTCGTGTGCAATAGCGAGTGGGCGTTGATGTTTTCTTATGCAATGATGTTAGCCAATCATGAGAGTGGCCATTTACTGACAATCCTTAAAGGATCCGCACCTTAAAAACTGATTTCAGACAGAAGGTCAGAATGATGGTTGCAAATAATCATTTTTCCTCATATATATTTGTTTTTTTTTTAATATTATAAGTGAACCTCAAGGAACATTTTAAAATAATAATAATAATAATAAAACCTCCATGTCATCACCACTTTAATTTCATCACATTACAAAGTGACAGTCAAATTAGCATCAAATTACCTGCATTTGGCTTCCATGTGTTGAGCCGAATTGAATGAAGCATTTGAGCATGACATCAACATGTGAACAGCTTGACCATCAGTCAAAGAGCCATGTGCCAATGTGAACACCAAATCAGATGCTCAGTTCTTAGTCACCATTAAATCAAAATGGACATTTCCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTGTTTTTCTATGGAATATTGTACTATTTATTATAAATGATTTATCTGTGTAGTGTTGTCAAAAGTACCGGTACTTCGGTACCAAGTCGGTACTGAAATTTTGAAAATGTGACAATACCAGCATTTCTGTAGTACCGGTAGTACCGAGTATCCAGGTATATATTCGGTACCCACTGATAGGGTTGTGCCAGTATTTATGTGAATATGACACGAGTGAAGCACAAAGCTTTGTTTATAGAAGAAATAGGCTAATAGGTTAGCAATTAAATGTGACATCGCAGCCATGGAAAATTTTTGGTTCATGCTGAATGAGAGAGGTACGTCATACATTTAAGCTTTGTTGGCTTTGTATTCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGCGAATCACGATCTGGTCACGATCTGTTTTCCCAAATCTTCACTCATGCAGGGGATTATAAACGTTTCTTCCTTTGGTTCACTTTTAATTAGGCCTATTATATTCGCATTCTTTGCTGTGGTAAAGTAGAAAAAACACTGTAGGACAGAAACCTTTTTGCTTGCACGTCAATTTCTATTTAACACAGTTTGTGCTTGTTATTAGGCTTTATAAGGCACGTCAAGTTATTTGTATAGCTCGTTTCACACACTGGTGATTTTTAGTTTCGCTTTCTCTGGCAGCGCAAAATCAAACATAGCCTGAAAGTATGAAGATGAAACTAGCTCTTCAGACCTTTTACAACAAATGTCAGTTGCTTGTAACATCAGGAGATAACATGAAGATATTATTAAAGAGAAATGGTCTCTTTCCTGCTCGTGTCCCACATCCCTCTCAAAGCGCAGAGCGGCAGGCCATATGACGCATCTTTGTGTGGAAATAAAAAACGAATGTTTTTTAGAATAATACTTCACTTTCTTATTATTTAGGTTACCATTATTTACTGATATTTATTTCATAGTTTCACTGAAAGAATAGCTAAAATGAACACACACGTCTGTTTCAAAATGGATGTTTGAGCATTT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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU106289 True 6668 lncRNA 0.35 2 962579 1040425

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000016_00959079_00960728 NA coding upstream 1519 958653 ~ 961060 (+)
CI01000016_00952494_00954683 NA coding upstream 7626 952494 ~ 954953 (+)
CI01000016_00885996_00887374 NA coding upstream 75101 885996 ~ 887478 (+)
CI01000016_00772375_00772848 NA coding upstream 189690 772270 ~ 772889 (+)
CI01000016_00569502_00581271 NA coding upstream 381080 569502 ~ 581499 (+)
CI01000016_01052539_01073915 NA coding downstream 12114 1052539 ~ 1075533 (+)
CI01000016_01122656_01129008 STT3B coding downstream 82231 1122656 ~ 1129008 (+)
CI01000016_01183747_01191853 GPD1L coding downstream 143322 1183747 ~ 1192858 (+)
CI01000016_01217119_01220858 EBAG9 coding downstream 176694 1217119 ~ 1221937 (+)
CI01000016_01238151_01242924 GDF6, GDF6A coding downstream 197566 1237991 ~ 1242960 (+)
G93409 NA non-coding upstream 29778 927840 ~ 932801 (+)
G93410 NA non-coding upstream 93642 862104 ~ 868937 (+)
G93423 NA non-coding upstream 122084 840166 ~ 840495 (+)
G93367 NA non-coding upstream 183408 778775 ~ 779171 (+)
G93364 NA non-coding upstream 188335 773794 ~ 774244 (+)
G93413 NA non-coding downstream 38403 1078828 ~ 1079935 (+)
G93434 NA non-coding downstream 44042 1084467 ~ 1084767 (+)
G93442 NA non-coding downstream 155285 1195710 ~ 1198373 (+)
G93476 NA non-coding downstream 171919 1212344 ~ 1212621 (+)
G93449 NA non-coding downstream 187773 1228198 ~ 1235846 (+)
G93406 NA other upstream 35047 905400 ~ 927532 (+)
G95439 NA other downstream 2821750 3862175 ~ 3862305 (+)
G95648 NA other downstream 3232211 4272636 ~ 4273905 (+)
CI01000016_04829592_04837305 NA other downstream 3794133 4829592 ~ 4837457 (+)
G95792 NA other downstream 4179455 5219880 ~ 5225941 (+)
CI01000016_05405791_05407797 AICDA other downstream 4365444 5405791 ~ 5407963 (+)

Expression


Co-expression Network