G134288



Basic Information


Item Value
gene id G134288
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000026
NCBI id null
chromosome length 17172400
location 12547658 ~ 12557425 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU152705
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>TU152706
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>TU152707
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>TU152708
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Function


GO:

id name namespace
GO:0016071 mRNA metabolic process biological_process
GO:0000375 RNA splicing, via transesterification reactions biological_process
GO:0000377 RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile biological_process
GO:0006397 mRNA processing biological_process
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome biological_process
GO:0016607 nuclear speck cellular_component
GO:0005681 spliceosomal complex cellular_component
GO:0005685 U1 snRNP cellular_component

KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU152705 False 978 lncRNA 0.32 4 12547658 12557353
TU152706 False 1050 lncRNA 0.31 4 12547658 12557425
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TU152708 True 978 lncRNA 0.31 3 12547658 12557425

Expression



Co-expression Network