XLOC_008944 (ankrd49)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_008944
gene name ankrd49
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 2850965 ~ 2857961 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00017659
aattaatttttacttTATTGACAAACGTTACACTTGTATTATTaagtttacaattaaataaattatataaaaacaattaaacagtataagtaaaaaatgataaaacaaacaaaataattaaattgggagatacagtggcgcagtaggtagtgctgtcgcctcacagcaagaaggtcgctggttcgaacctcggctcagttgtcgtttctttgtggagtttgcatgttttccctgcattcgcgtgggtttgctccggtttccccacagtccaaagacatgcggtacaggtgaattgggtaggctaaattgtttgtagtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtatgtttcccagagatgggttgcagcaggaagggcatccgatgcgtaaaaatgttctggataagttggcggttcattccgctgtggctaccccggattaataaagggactaagccgacaagaaaatagatggatggataattaaataaaaaataatggtaataataaaaaactataatataacaaaaatatttctttacgtcttttttttaattcaattcaaatttGCTTTATTAGCATCACAGTTGTGTTgcaatgtttatatttaaatagattatatattaaaacatagtagtagttattaaaaatattaataataaaacaataaaaatgaaataaatgtaataataataaaaatatgataatagaacaataataaaaaatcatttatCTTTCTCTCAATTCAATACAATTTTTCtatattggcatgacaaatgcattgcagtttttatatttaaatagatcatataaaaacaataacatagTAGTAGTCATTAAAAAATCGAAACAATacatattcaaattaaataaaagttataattGTACAATAATTTTCTttctgtccttccttccttcctttttcttCAGTGATGGATTTCCCAGAAGATTTCAACCAGCTAGAGCTGCTGGATCCTCATGTGATTCCCATGGGGACGAGGAGCAATTGGGCAGAAGAGGAAGAAGGAGAGGAAGAGGATGAAGCCATGCACACAGAGGAATGGCATCAACAACAGGAACTTCATTTACAGGACACTCCCTCTGAACTGATGTTATGGGCTGCCGAGAGGAACAGATGTGCAACGGTTGAGCGTCTCATTGCATTGGACCCGACGCTAGTCAATTGTCATGATAGCGACGGCTACACCCCTCTGCACCGCGCTGCCTACAGTGGCCATCACGACGTGGCGTCCGCTCTTTTAAAAGCCGGAGCGAATCTCCACGCGAGAACAGCCGACGATTGGATGCCGCTACATAGCGCCTGTCGCTGGGGTCACGCTAACGTAGCGTCTCTTCTTTTGCAGTGGGGGTCAGAAGTCAATGCGATGACAGCAGGTCGACTCACACCACTACAGCTGGCTGCTGGAAATGCCGCCGCAGGCAAAACCATTGAGCTTTTGCTATCACAGCGCACCCTAGAGGCGGGACTGAAAAACAGCGCAGGAGAGACCGCATATGATATCGCACATCGCACAAGTGAACTTCACAGACTGTTCGAGATCGTAGAGCCGTGTAATAACGTATATTAAGATATTTACGTGTTAGCTTAGCATTAAACTTGGCTTATGGCTTATGACATTGTACGaataaacatgaattattttttttcttttgtaatcgAGATTTGTAGTGACATATATTGATGTATAAACTTTGCTCAAGTCttgcatgtccaaactcggtcctggagggccggtgtcctgcaaagtttagttccaaacccaatcagacacacctgggctagctaatcaagctctgacTAGCCTTTCTAGagacatctttgcaggtgtgttgaggcaagttgaagttaaaatctgcaggacaccagccctccaggacagagtttggacacccctggcttaagtgaacaaaattttatttattttattttttcgctTTCACAGAATCTTGTAATAACAttgacatacagtgctcagctgtATTGGGTACACCCCCTTTTGAACATTAATAtgtttatctatttctcagtgaatctagatgattttttttttgcgcattttAGCATCAACTAATTGGTCATTATTGACAATGGAATGTTATCAACGTATGCCGTCATCAATTCGTTGGGAAGTTCACGGAAGATATGCGCAATGAAGCATACAGAACTAGTGTTGTGTCGAATTCAGCTTTCCCTATGTTTCCCCTCAGTTTATATTTCCACTACGCAAACTGTATTCTGTACAGAGCTGGTGTCAATCACTCTCTTGAGATcgtgccacagcatctcaatcaGGTTGAGGTCAGGATTCTGACTGGGCCACTCCACAAGCTGTATTTTCTTCTATTGAAGCCATTTTGTTGTTCATTTACTTCTTTGCGTTTGGGTCTTTGCATCACCCATCCTTTGCGTTTGGATAAAATTAGTTGAACAAATAATTTAGATACGTCGAAAGTAATCAAATtagttgtattttaataaaattctaTTGCAATTGATCATGCGAAAAGTTGATCGAACACATGAATCATCCAAACCCTGAATGCTGTTTTGAACAGAATAAAAACTCATTAAAGACTTTTTACccttgaaattaatttaaaaatgcattaataaagcTGCATCTTGCGAAAAACAAGAATTATTTGTCTCATTTGAGATGTTTAAATTGGATGTGCATCACGAAAGACCATCTTAACTCATCAGATTTATtgatattgctatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata
>TCONS_00017660
ATTAATTTCTGAGATGCCATAAGAGTAAATTAATACatgtaaaattaataaaagttcATACTTACACGGTGCTTCCAGCTGATGCCATACTAGGAGACTGCAGATACTAAAAACGGTCGTGCTGAtgttgtagaaaaaaataaagtacaaatctGTTGATGAGATCTAAAGTTTTAGCCAGTTAATACTACATACATATCGTCAGTAGGTAACATGCATGCTGAACATACAGAACAGCAAGGTTAATAacatatattgattaaaatacacttaattcTACATATTTGTAAGCTGAATTATgctaacaataaaaagaaaagcatAATACCTATGAAAAGCAAGAAAGCTCCTTAGACTGACACAGGAGTTCACATGTACACAATCTCCGCCCACTGTCGGAAGTCGCGGGAAGGTTTGTTTCCTTAGAATTCTGGGAAATGTATTTTATGAAAGCGAACTGACTGCGCAATTGATTGCGCAAAAAACTACACTTCCCAGCGTCACTTGCACATTTTGTGAGTTCAACGTGAAGACGGTTGGTCATTGCTGTTTTCTTGATGGATTTCCCAGAAGATTTCAACCAGCTAGAGCTGCTGGATCCTCATGTGATTCCCATGGGGACGAGGAGCAATTGGGCAGAAGAGGAAGAAGGAGAGGAAGAGGATGAAGCCATGCACACAGAGGAATGGCATCAACAACAGGAACTTCATTTACAGGACACTCCCTCTGAACTGATGTTATGGGCTGCCGAGAGGAACAGATGTGCAACGGTTGAGCGTCTCATTGCATTGGACCCGACGCTAGTCAATTGTCATGATAGCGACGGCTACACCCCTCTGCACCGCGCTGCCTACAGTGGCCATCACGACGTGGCGTCCGCTCTTTTAAAAGCCGGAGCGAATCTCCACGCGAGAACAGCCGACGATTGGATGCCGCTACATAGCGCCTGTCGCTGGGGTCACGCTAACGTAGCGTCTCTTCTTTTGCAGTGGGGGTCAGAAGTCAATGCGATGACAGCAGGTCGACTCACACCACTACAGCTGGCTGCTGGAAATGCCGCCGCAGGCAAAACCATTGAGCTTTTGCTATCACAGCGCACCCTAGAGGCGGGACTGAAAAACAGCGCAGGAGAGACCGCATATGATATCGCACATCGCACAAGTGAACTTCACAGACTGTTCGAGATCGTAGAGCCGTGTAATAACGTATATTAAGATATTTACGTGTTAGCTTAGCATTAAACTTGGCTTATGGCTTATGACATTGTACGaataaacatgaattattttttttcttttgtaatcgAGATTTGTAGTGACATATATTGATGTATAAACTTTGCTCAAGTCttgcatgtccaaactcggtcctggagggccggtgtcctgcaaagtttagttccaaacccaatcagacacacctgggctagctaatcaagctctgacTAGCCTTTCTAGagacatctttgcaggtgtgttgaggcaagttgaagttaaaatctgcaggacaccagccctccaggacagagtttggacacccctggcttaagtgaacaaaattttatttattttattttttcgctTTCACAGAATCTTGTAATAACAttgacatacagtgctcagctgtATTGGGTACACCCCCTTTTGAACATTAATAtgtttatctatttctcagtgaatctagatgattttttttttgcgcattttAGCATCAACTAATTGGTCATTATTGACAATGGAATGTTATCAACGTATGCCGTCATCAATTCGTTGGGAAGTTCACGGAAGATATGCGCAATGAAGCATACAGAACTAGTGTTGTGTCGAATTCAGCTTTCCCTATGTTTCCCCTCAGTTTATATTTCCACTACGCAAACTGTATTCTGTACAGAGCTGGTGTCAATCACTCTCTTGAGATcgtgccacagcatctcaatcaGGTTGAGGTCAGGATTCTGACTGGGCCACTCCACAAGCTGTATTTTCTTCTATTGAAGCCATTTTGTTGTTCATTTACTTCTTTGCGTTTGGGTCTTTGCATCACCCATCCTTTGCGTTTGGATAAAATTAGTTGAACAAATAATTTAGATACGTCGAAAGTAATCAAATtagttgtattttaataaaattctaTTGCAATTGATCATGCGAAAAGTTGATCGAACACATGAATCATCCAAACCCTGAATGCTGTTTTGAACAGAATAAAAACTCATTAAAGACTTTTTACccttgaaattaatttaaaaatgcattaataaagcTGCATCTTGCGAAAAACAAGAATTATTTGTCTCATTTGAGATGTTTAAATTGGATGTGCATCACGAAAGACCATCTTAACTCATCAGATTTATtgatattgctatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata

Function

symbol description
ankrd49 Predicted to be involved in positive regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be active in cytosol. Orthologous to human ANKRD49 (ankyrin repeat domain 49).

GO:

id name namespace
GO:0005575 cellular_component cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-050417-46 Predicted to be involved in positive regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be active in cytosol. Orthologous to human ANKRD49 (ankyrin repeat domain 49).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000023508

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00017659 False 2779 mRNA 0.37 2 2850965 2856362
TCONS_00017660 True 2409 mRNA 0.40 3 2850965 2857961

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008943 CABZ01086041.1 coding downstream 9288 2820768 ~ 2841677 (-)
XLOC_008942 NA coding downstream 34823 2813516 ~ 2816142 (-)
XLOC_008941 tgfb1a coding downstream 47652 2776506 ~ 2803313 (-)
XLOC_008939 ppp5c coding downstream 96909 2727670 ~ 2754056 (-)
XLOC_008940 CABZ01086049.1 coding downstream 114467 2736383 ~ 2736498 (-)
XLOC_008945 guca1c coding upstream 26750 2884711 ~ 2903475 (-)
XLOC_008946 CABZ01086029.1 coding upstream 60296 2918257 ~ 2931021 (-)
XLOC_008947 zgc:153184 coding upstream 73921 2931882 ~ 2973368 (-)
XLOC_008948 mlnr coding upstream 118159 2976120 ~ 2985599 (-)
XLOC_008949 fndc3a coding upstream 129632 2987593 ~ 3078600 (-)
XLOC_008933 NA non-coding downstream 225037 2618279 ~ 2625928 (-)
XLOC_008932 NA non-coding downstream 239795 2598804 ~ 2611170 (-)
XLOC_008928 NA non-coding downstream 522681 2323666 ~ 2328284 (-)
XLOC_008951 NA non-coding upstream 257376 3115337 ~ 3116262 (-)
XLOC_008952 NA non-coding upstream 302477 3160438 ~ 3162459 (-)
XLOC_008957 NA non-coding upstream 896605 3754566 ~ 3760957 (-)
XLOC_008970 NA non-coding upstream 1305617 4163578 ~ 4174873 (-)

Expression


Co-expression Network