XLOC_009067


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009067
gene name NA
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 14203675 ~ 14212777 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00017868
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>TCONS_00017869
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000098171

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00017868 False 6094 mRNA 0.43 7 14203675 14210382
TCONS_00017869 True 6138 mRNA 0.41 8 14205830 14212777

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009066 pnkp coding downstream 9467 14163193 ~ 14194208 (-)
XLOC_009065 si:ch211-116o3.5 coding downstream 105153 14085187 ~ 14098522 (-)
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XLOC_009063 NA coding downstream 139325 14062613 ~ 14064350 (-)
XLOC_009062 NA coding downstream 165448 14034254 ~ 14038227 (-)
XLOC_009068 NA coding upstream 16471 14229248 ~ 14232070 (-)
XLOC_009069 NA coding upstream 33313 14246090 ~ 14248047 (-)
XLOC_009070 dpf1 coding upstream 44455 14257232 ~ 14375571 (-)
XLOC_009071 BX957341.1 coding upstream 102577 14315354 ~ 14315470 (-)
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XLOC_009080 CR936977.1 non-coding upstream 670514 14883291 ~ 14884061 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000154_01515908_01519461 NA coding CI01000154 null 1515908 ~ 1519651 (+)