XLOC_009280


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009280
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 27784550 ~ 27956162 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00019179
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>TCONS_00019182
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00019179 False 2451 lncRNA 0.42 5 27784550 27884677
TCONS_00019178 False 2368 lncRNA 0.41 4 27784550 27884677
TCONS_00019177 False 2321 lncRNA 0.41 4 27784550 27884677
TCONS_00019180 False 2621 lncRNA 0.42 6 27784550 27956162
TCONS_00019181 False 634 lncRNA 0.49 5 27791127 27956019
TCONS_00019182 True 1308 lncRNA 0.46 3 27841020 27884677

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009279 lhx1a coding downstream 73975 27703409 ~ 27710575 (-)
XLOC_009278 NA coding downstream 123433 27660245 ~ 27661117 (-)
XLOC_009275 AL954187.1 coding downstream 126095 27642233 ~ 27658455 (-)
XLOC_009277 AL954187.3 coding downstream 130258 27654176 ~ 27654292 (-)
XLOC_009276 AL954187.2 coding downstream 138014 27646419 ~ 27646536 (-)
XLOC_009282 CR391930.1 coding upstream 15136 27971298 ~ 27972474 (-)
XLOC_009283 dhrs13a.3 coding upstream 50606 28006768 ~ 28085563 (-)
XLOC_009284 NA coding upstream 54568 28010730 ~ 28015128 (-)
XLOC_009285 cryba1a coding upstream 130031 28086193 ~ 28107505 (-)
XLOC_009286 foxn1 coding upstream 173521 28129683 ~ 28161224 (-)
XLOC_009273 NA non-coding downstream 370549 27391544 ~ 27414001 (-)
XLOC_009291 CR478288.1 non-coding upstream 400683 28356845 ~ 28357872 (-)
XLOC_009292 CR478288.2 non-coding upstream 419351 28375513 ~ 28375627 (-)
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XLOC_009296 NA non-coding upstream 638381 28594543 ~ 28596509 (-)

Expression


Co-expression Network