RNA id: TCONS_00009765


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009765
length 126
RNA type mRNA
GC content 0.34
exon number 6
gene id XLOC_004995
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 47773964 ~ 47797668 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gtgtgtagtagaaAAAGTAGTaaaaaGTCTTCTTTAAAGTCACGCATGAGTACGTGTAGAGTGTATCTGTTTACTGTAgttaacgagaattatgggagtgaaattggatttttccgtccttatttt

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179932

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010776 lncRNA upstream 163634 47606871 ~ 47610330 (+) False XLOC_004992
TCONS_00010777 lncRNA upstream 163634 47608339 ~ 47610330 (+) True XLOC_004992
TCONS_00011036 lncRNA upstream 193398 47580022 ~ 47580566 (+) True XLOC_004991
TCONS_00010775 lncRNA upstream 737544 47035721 ~ 47036420 (+) True XLOC_004984
TCONS_00009729 lncRNA upstream 1080521 46683212 ~ 46693443 (+) True XLOC_004976
TCONS_00011038 lncRNA downstream 531198 48328866 ~ 48330894 (+) False XLOC_005002
TCONS_00011037 lncRNA downstream 531198 48328866 ~ 48330894 (+) True XLOC_005002
TCONS_00011039 lncRNA downstream 616859 48414527 ~ 48419991 (+) False XLOC_005005
TCONS_00011040 lncRNA downstream 616872 48414540 ~ 48416504 (+) True XLOC_005005
TCONS_00011041 lncRNA downstream 750426 48548094 ~ 48573203 (+) False XLOC_005007
TCONS_00009764 mRNA upstream 39007 47698356 ~ 47734957 (+) True XLOC_004994
TCONS_00009763 mRNA upstream 106219 47663419 ~ 47667745 (+) True XLOC_004993
TCONS_00009760 mRNA upstream 232674 47446158 ~ 47541290 (+) False XLOC_004990
TCONS_00009762 mRNA upstream 233327 47448588 ~ 47540637 (+) True XLOC_004990
TCONS_00009761 mRNA upstream 233429 47448558 ~ 47540535 (+) False XLOC_004990
TCONS_00009767 mRNA downstream 109609 47907277 ~ 47928832 (+) False XLOC_004997
TCONS_00009768 mRNA downstream 111358 47909026 ~ 47929058 (+) False XLOC_004997
TCONS_00009769 mRNA downstream 120303 47917971 ~ 47924903 (+) True XLOC_004997
TCONS_00009770 mRNA downstream 147996 47945664 ~ 47959657 (+) False XLOC_004998
TCONS_00009772 mRNA downstream 147996 47945664 ~ 47959911 (+) False XLOC_004998
TCONS_00009746 other upstream 836009 46883844 ~ 46937955 (+) False XLOC_004982
TCONS_00009747 other upstream 836018 46915371 ~ 46937946 (+) True XLOC_004982
TCONS_00009724 other upstream 1170409 46603441 ~ 46603555 (+) True XLOC_004973
TCONS_00009703 other upstream 3146957 44626890 ~ 44627007 (+) True XLOC_004951
TCONS_00009686 other upstream 6313330 41460518 ~ 41460634 (+) True XLOC_004935
TCONS_00009795 other downstream 1018492 48816160 ~ 48825502 (+) False XLOC_005016