RNA id: XM_043256128.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043256128.1
length 10488
RNA type mRNA
GC content 0.38
exon number 5
gene id golga7bb
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056711.1
NCBI id CM032080.1
chromosome length 25085836
location 15581868 ~ 15607881 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

GGCGTCCAACATGATTCAGATTAGCTATATCTGGGTTCCAGCTATCGAAAATGACAAATGTTCCTGTTTGGCGGGAGAGCGGGTGTGTTTTGTTCAAGAATATCTTATTTTCGTGGCGTGTCAAGGCCGTTGGTTAAGGTGTGCTTTCCGATAGTCTTGCACGGCGGATTCCGCCAGATTTGTGCTTTGAAATGTTCATTTAGGGCTAAATCTAACGCCCGTATGCGGAGTGCGCCTCGCTTGTTTTTATTAGGGCCGCTCGTGGTTAAAACATGACTGCTCTTTGGTCCGCGTATCGGTCGAAGCCCATGAGCATCCAAACATCAGCGGCGCAATCGATAAATTTTTAAGAGTCTTCGCCTTTCCCAGTGAATTATGCAGTCTGTTTCATGCATGTGTGAGTCAGGCCGTTTCACCGCAATGATCGCCaggacaaatatattttttgcaacaaACAGACTCAGCGCAACATCAACCTgtcatcatttcatttcagatgGCATGTTAGGCGTTTATTAGgctaagataaaaaaaaaattatttatactaGGATTTACATCAGACACCAGTCCATCCTATATAATATGCACACCACCACCTGCATCTCAATACAGTTCTCCATCCACATGTACTGTACACTGTTAATACATTCACGGGTCACCTTCATCGTTACACTATACAACCTTTTTGAAcctcatttcaaatatattttagtgtttgAGATATTAATGGCAAGAATGAATGATTGAACCTTTTTAGtctttagaatttttttccagaatcTTCGGCATTAGCTGAAACTCACCGAGGAAAACgtgaatattgaatattgagCGCCAAGCAATGTCACTGTttcaatgcacatttttaaatgtgttttcggAAATGTTGGCTAATTTTCTGGCAAAATTCTCCGGAGGTTATGAACATTTTCTTCAGTGTTATCGGCTTTTACGTTTTCCTTAgattgtgtaatatttatttatttatttatttattttcctatacGTTTCGCAAATACAATGTTTCCAGAATTGCTAAATGTAACTTTCCCTTAATGTTTTCTCTGACAATGGCATAAGcgagtcatttttttaaacataataaggTTTAGTTAACGTaacattattgtaatatattttttgttagctggatactgtattattattgttggcAGTTAGTGTAGTCGCTTTAAACGTCTctagagaaaaagagaaaatggagAGCCTTTCTTTACTGATGAATTACTCTTTACCCCAGTATTTATGTGGTAAGATAGCCTACTCCTCTGGTGGTCCTGCTCCCCCTCTCTCAGAGTCTCCACGAAGATCCAGTGTATCTACAGACATGAAGTGAAGCACATCTGTACTTTCTGTACCCGTCACTCCTCCTCCATCAGCAGGACGCTGCTCCACCCTCTCCAGCGCGTTCATCTCTCCGTCCGTTCCTGTCCCCCGTCCCACGAGTGGAGAGGATTTCAGCACCGGGACAGATCCACCGGCGTCTCGGGCATCATGGCGACGGAGTTTCACAACCTTCAGGAGCTGCGTCACAGTGCATCTCTGGCCACCAAGGTCTTCATTCAGAGAGACTACAGTGATGGTACCATCTGCAAATTCCAGACCAAGTTCCCTGCAGAGCTGGACAGCAGGATCGAGAGGAGCCTGTTTGAAGAAACAGTGAAGACGCTCAACTGCTATTATGCAGAGGCTGAAAAGATTGGCGGTCAGTCCTACCTGGAAGGCTGCCTGGCTTGTGCTACGGCCTACATCATCTTCCTGTGCATGGAGACACGCTATGAAAAGATCCTAAAAAAGATCAGCATGTATATTCAGGAGCAGAACGAGAAGATCTATGCACCCAGAGGTTTGCTCCTCACAGACCCCATCGACAGAGGCATGAGAGTGATTGAAATCTCCATCTTTGAAGACAGTGGCTCCACCAGCACTAGCTCCACTGGAAGTTCTCCGTCCAGCGGCACGGCTCAATGACTGGAGGAGCAGCACCAGGGGTACGGGTACAGGGGGGCCGGTACGCTCCCCAAAATCCGCATGTTGAAACATGAGAGCACCagattttaaagaaagagagagagaggaagtacAGGTACTGCTCGCTCGCTTCTTCCAAACAACAAGCGCAAAGCCAGGAGCTTTAACTCACAAACACACCTCCCTTTCTTCACCTCATTTAATTCAGCGTCCTCTGCATTTCCATTAGTGACAGACACATGACAGATGAAAACGAAAGGTGATGAGCCTGACAATGTATGTCGATGAGTTGATTTGTCCTCATATTAATGTACCTCTGGTCGTAGTGTTTTGAAGACGGATTCTGAGGCTTTTTAGGAAGAGTACGGTTGATGTGATCTATGACCCAGATCTTTTGCAATAATCTTTGTTTTCAATCATCTGGCAACCCGGGTGTCAGAATGCTATTGGTAACGTGGCAGTGGGGGGAATCACAAAAAGCAAAACGAAAACAGACTTTCCAACACGGGAACACAAGTTTCTCAACAATCCCTGCATAAATCATTGCTTTTCCGAGACATAAGTATGTGAAATATCTGCAAAtatattatggtatttttatgcgTTAGGACAAATTGCATACAGCaccttaaatattttatttttatattttctgctctcttaaattttaaagttttaacaaTTTagttgtgttttgtatttgttgtttttaaatatatctgtatattttttttattataggtTGAGTTATAAGTATTTAGTACgtcaagttaaactaaacaaaGAGAAATAGTTGCCTTGGAAACTAGctaagtttttaatattttattacatttcacttaacatttactttttgttcaaataaacagctttatttGCAGGTTGCCCTTCATGCGAAACAGATCATTTCAAAACAGCTTCATAGTAATAAACGGAAAAAAGATAACTTTGACTGTTAGATAAATGTAAGGTCCATAAATTCAGTTCAGCTACTGTATAAGCAGCTCTAAGTAATGCCACTATTGAGCTAAGGCAATTCAGTGTTTCGGTTCAATAACAATATGATTCAATTtgtcaattttgaaaaatttgaCCAGCTACCATGTTTCAAAAAACACCTTAAACTTGCATGACCGGCTAATGGCTGGTTGGTTGCTGGTGTAAGATGGTTCCAAAACACAGCGTCCAGTTTAAGCTGGAGTTTCCAGCAGGGCTTTGGTGCTTATTTAGTTTGGACAGTGACTGAGCTCTCTCTATTCATCCCCATGATGTACCTCAGGGGCCAAATTCAGCAGTGCCTCAGTTCACTGGCAGACTTGACCCTTCGCAGCGCTCTAGGCTCATATTCCCTCTGTTAGTTCCACCACATACCTGCACCTCATAGATTCGGTGTCCGTGGAGGATAATCGCAAACGGCAGCCCTTCGAGCAGCATCTTTTgtagtgcatttatttatttatttattacataattatatttcgTACAATAAGCTCTACCTCTGGTTTGTACTTGTGCAGGGAGTCGAGAGAGCCAGTGTAGACAGGAGCGGGTCCAACATGTAAATGCACCTTAGACGGTTTATTTTGACTGATGTGTTTCAGAGAAGATTGACTCACCAGCTGTTCTGAATGAGCTGTGAGATTTTTCAGCGCTCTTGCTGGTTTCATGTGTTGCATATTTGCTAGATTCTCAGACATAATTCATGCAAGAATGCAAACTCGTTGTTTTCTTAAGAAATAGCCACCCTTTTTATATAGCGTTTAAGTAGAAACGTGGGCAGTAATAGCGCAATATTAATTGTGCCAGGAAAGTAGCGATGAGCCTTCTATATAAGGCAGTACTTGTATAAGACACATTTACatatgcattatgtaaaattatggaattatgtaaatgattatttttagagAGTCAAGCGAAGGATTTTGCACTGAATTACCACATAAACAAGTGGCACAATTTGCACACGCAAATGTAATCTTGAAACATTTAATTCACTATAGGATGAAAGGTAACTTTAACCATCAACCATATTGATTGAGGACAAGTCCCTCTAATATTGAGATTAGCAGTCATTGTCTGTTGTTACTATGGCTCCTGACTAAAGAGAAAATGCACAGGAAAGCAGGCATGCTTGTATTGCAAATGCAGGTCACATTtgcttttccattgttttaataatgcattattacgtttttaattttatcatgAATATTGtttgaaactgttttttttctatttcatgttttctgtcaACTCAATGCCCTGACAGTTGGATTTAAGTTTgggattaattttattaatttattatacaattgAAAACAACTGTagtttaaaatttatattattacccCTTGtgggtaaagctgaattttagtGGCCATTACTTCAGTAATATCTTGTCACAAGTCACAAGCGTCTGAAGTCCTTACTCTGCTcctcacttttgataaatttaataCGTAATTgctgagaaacatttctttctcaATCAATTGCTAAACAATATCTTACTGTCCCCAAACTGTACAGTATGAGAGGCCAAAAACATAATCAGAGTAGAGAGTGTCTGTTGCACGTTCAGTTTTCTATTCAAACAAGCCCtcttgattttaaattatttaagtaCATTCTCTCCATAATTTATCTGTCCATATTGTTCACCGTTTCtgattataaaattaaactgCCCGTTTTGGTTTTTTGCTGCTTGTGCCTTTAAGACATGCAAACACACTTTTGCATGTAAAACGAGCAAAATGACCTATTTGCTGCAAGCTTGTGGATTTGCTGTCTAACATACTGCAGTTTTTAACTGCCCTATCCTTCAGCCTTTTTGTAAAATACACCACATAAACAATCAGAGCAAAACTGGACTGAAATTATTAGGGACCTTGTTAAAAACCAGCCGAATAACTGCCATTAAGATAAACAAGCTCTTGCAGTATTTCATTCCTCACTGTGACTGGACAGGCGACTTTCTGGCTTTCAGGCAATGTTCTGTTTTCC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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
XR_006252278.1 lncRNA upstream 49633 15506993 ~ 15532235 (+) False LOC122356093
XR_006252275.1 lncRNA upstream 50917 15506993 ~ 15530951 (+) True LOC122356093
XR_006252273.1 lncRNA upstream 50917 15506993 ~ 15530951 (+) False LOC122356093
XR_006252274.1 lncRNA upstream 50917 15506993 ~ 15530951 (+) False LOC122356093
XR_006252279.1 lncRNA upstream 50917 15506993 ~ 15530951 (+) False LOC122356093
TU139296 lncRNA downstream 32376 15640257 ~ 15640660 (+) True G94144
TU139317 lncRNA downstream 93546 15701427 ~ 15706978 (+) True G94162
TU139318 lncRNA downstream 93546 15701427 ~ 15706978 (+) False G94162
TU139321 lncRNA downstream 99235 15707116 ~ 15710154 (+) True G94163
TU139332 lncRNA downstream 153811 15761692 ~ 15761967 (+) True G94173
XM_043256050.1 mRNA upstream 263691 15314814 ~ 15318177 (+) True LOC122356934
XM_043256048.1 mRNA upstream 267212 15295849 ~ 15314656 (+) True tarbp1
XM_043256049.1 mRNA upstream 274012 15295849 ~ 15307856 (+) False tarbp1
XM_043256261.1 mRNA upstream 286674 15278360 ~ 15295194 (+) False zgc:172136
XM_043256260.1 mRNA upstream 286674 15279442 ~ 15295194 (+) True zgc:172136
XM_043254818.1 mRNA downstream 106312 15714193 ~ 15723743 (+) True slc25a28
XM_043255334.1 mRNA downstream 157073 15764954 ~ 15773545 (+) False got1
XM_043255333.1 mRNA downstream 158394 15766275 ~ 15773545 (+) True got1
XM_043254639.1 mRNA downstream 189552 15797433 ~ 15861462 (+) True hpse2
XM_043254640.1 mRNA downstream 192208 15800089 ~ 15861462 (+) False hpse2
XR_006252400.1 other upstream 267589 15295849 ~ 15314279 (+) False tarbp1
XR_006252370.1 other upstream 306634 15255074 ~ 15275234 (+) False fam135a
XR_006252421.1 other upstream 355685 15106458 ~ 15226183 (+) True LOC122357077
XR_006252357.1 other upstream 1214733 14354116 ~ 14367135 (+) False frmd6
TU138522 other upstream 1672265 13739607 ~ 13909603 (+) True G93613
XR_006252368.1 other downstream 256958 15864839 ~ 15870625 (+) False hps1
XR_006252369.1 other downstream 256958 15864839 ~ 15869803 (+) False hps1
TU139358 other downstream 265563 15873444 ~ 15877422 (+) True G94186
TU139356 other downstream 266390 15874271 ~ 15876678 (+) False G94186
TU139427 other downstream 296065 15903946 ~ 15904349 (+) False nkx1.2la

Expression Profile