RNA id: XM_043218603.1



Basic Information


Item Value
RNA id XM_043218603.1
length 12258
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 78
gene id adgrf6
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 18366767 ~ 18401190 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence


CTTTGACTCTGAGAAACAGCATTAATATCACAGACATCGATATGAATACTGTGTGTGGGTTAAATGGAACAGAATATGAGTGCCAGTGTGAGCAGGATCATGTCTGGCCCAGTGACACCTGCAGAGCCTAtcaggtgtgtgatggcattgTGGGAGGCACTTGTGGATGTATTCAAGCTCTCCCTTCAGAGGGTCCACTTTGCCTGAAAGatatCAATGAATGTAAAGATGCAGTATCAGTGTGTGGTCCATACTCAGATTGTATTAACTTCATTGGGAGTCACATGTGTTCATGCTGGAGTGGATTTAATACCTCCAATAAAGACAGTCCTGTGAGCCGTAACAACTCATGTCAGGatataaatgaatgtCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATTCCATCTGCACAAATCAGCTGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGGTTCACTGCAACAAACTCACTTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAgATGTGAATGAATGTCTTCAGACGATGGAGGTCTGTGGTCCAAACTCTCGTTGCACAAACTTAATTGGGAGTTACAGCTGTTCCTGCTTGACTGGATATACAGTAACAAATAGCAGTGAACTAGTCAGGGCCAGGAACCCATGCAATGTGACTCTGCCTTTGACTGAGTATCTGATTGAAATTCAGATCAATAGCATGGACAGCAGAATGACTGATCAGCTGAGGAACATCCTGATGTATTTCAGTTTGCCCTACACAATCAGTGACAGCACTAACATCACAGAAATCAACATAACTACTGTGTGTTCCCTGAATGAAACCCAGTATCAGTGTAAATGTGAGGGTCTGTTTGTTTGGCCGAATGACACGTGTTACTTATACGAGGCCTGTGATGTCATCACTAATGGTTCATGTACATGTATCAATGCCCTTCCAACCGACGGACAGTTCTGCCAAGTACTACCTTCTAAATACGTGATTGACATTGATTTGAGATTCTTTGACTTGTTCCTGGTGGATTACTTAAGAAATCTCGTCAGAAATATCAGCCTGCCTTTGACTCTGAGAAACAGCATTAATATCACAGACATCGATATGAATACTGTGTGTGGGTTAAATGGAACAGAATATGAGTGCCAGTGTGAGCAGGATCATGTCTGGCCCAGTGACACCTGCAGAGCCTAtcaggtgtgtgatggcattgTGGGAGGCACTTGTGGATGTATTCAAGCTCTCCCTTCAGAGGGTCCACTTTGCCTGAAAGatatcAATGAATGTAAAGATGCAGTATCAGTGTGTGGTCCATACTCAGATTGTATTAACTTCATTGGGAGTCACATGTGTTCATGCTGGAGTGGATTTAATACCTCCAATAAAGACAGTCCTGTGAGCCGTAACAACTCATGTCAGGatataaatgaatgtCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATTCCATCTGCACAAATCAGCTGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGGTTCACTGCAACAAACTCACTTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAGATGTGAATGAATGTCTTCAGACGACGGAGGTCTGTGGTCCAAACTCTCGTTGCACAAACTTAATTGGGAGTTACAGCTGTTCCTGCTTGACTGGATATACAGTAACAAATAGCAGTGAACTAGTCAGGGCCAGGAACCCATGCAATGTGACTCTGCCTTTGACTGAGTATCTGATTGAAATTCAGATCAATAGCATGGACAGCAGAATGACTGATCAGCTGAGGAACATCCTGATGTATTTCAGTTTGCCCTACACAATCAGTGACAGCACTAACATCACAGAAATCAACATAACTACTGTGTGTTCCCTGAATGAAACCCAGTATCAGTGTAAATGTGAGGGTCTGTTTGTTTGGCCGAATGACACGTGTTACTTATACGAGGCCTGTGATGTCATCACTAATGGTTCATGTACATGTATCAATGCCCTTCCAACCGACGGACAGTTCTGCCAAGTACTACCTTCTAAATACGTGATTGACATTGATTTGAGATTCTTTGACTTGTTCCTGGTGGATTACTTAAGAAATCTCGTCAGAAATATCAGCCTGCCTTTGACTCTGAGAAACAGCATTAATATCACAGACATCGATATGAATACTGTGTGTGGGTTAAATGGAACAGAATATGAGTGCCAGTGTGAGCAGGATCATGTCTGGCCCAGTGACACCTGCAGAGCCTAtcaggtgtgtgatggcattgTGGGAGGCACTTGTGGATGTATTCAAGCTCTCCCTTCAGAGGGTCCACTTTGCCTGAAAGatatcAATGAATGTAAAGATGCAGTGTCAGTGTGTGGTCCATACTCAGATTGTATTAACTTCATTGGGAGTCACATGTGTTCATGCTGGAGTGGATTTAATACCTCCAATAAAGACAGTCCTGTGAGCCGTAACAACTCATGTCAGGatataaatgaatgtCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATTCCATCTGCACAAATCAGCTGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGGTTCACTGCAACAAACTCACTTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAgATGTGAATGAATGTCTTCAGACGACGGAGGTCTGTGGTCCAAACTCTCGTTGCACAAACTTAATTGGGAGTTACAGCTGTTCCTGCTTGACTGGATATACAGTAACAAATAGCAGTGAACTAGTCAGGGCCAGGAACCCATGCAATGTGACTCTGCCTTTGACTGAGTATCTGATTGAAATTCAGATCAATAGCATGGACAGCAGAATGACTGATCAGCTGAGGAACATCCTGATGTATTTCAGTTTGCCCTACACAATCAGTGACAGCACTAACATCACAGAAATCAACATAACTACTGTGTGTTCCCTGAATGAAACCCAGTATCAGTGTAAATGTGAGGGTCTGTTTGTTTGGCCGAATGACACGTGTTACTTATACGAGGCCTGTGATGTCATCACTAATGGTTCATGTACATGTATCAATGCCCTTCCAACCGACGGACAGTTCTGCCAAGTACTACCTTCTAAATACGTGATTGACATTGATTTGAGATTCTTTGACTTGTTCCTGGTGGATTACTTAAGAAATCTCGTCAGAAATATCAGCCTGCCTTTGACTCTGAGAAACAGCATTAATATCACAGACATCGATATGAATACTGTGTGTGGGTTAAATGGAACAGAATATGAGTGCCAGTGTGAGCAGGATCATGTCTGGCCCAGTGACACCTGCAGAGCCTAtcaggtgtgtgatggcattgTGGGAGGCACTTGTGGATGTATTCAAGCTCTCCCTTCAGAGGGTCCACTTTGCCTGAAAGatatcAATGAATGTAAAGATGCAGTGTCAGTGTGTGGTCCATACTCAGATTGTATTAACTTCATTGGGAGTCACATGTGTTCATGCTGGAGTGGATTTAATACCTCCAATAAAGACAGTCCTGTGAGCCGTAACAACTCATGTCAGGatataaatgaatgtttgatCAGTCCATCTGTTTGTGGTCAATATTCCAACTGCACAAATCAAATGGGAAGTTACAGTTGCTTATGTTTGGATGGATTCAATGAAACCATTTCAAATCTTACTATCAACATCAATAACACATGTAGAGATGTGGATGAATGTGTTGAGATATCAGATGTCTGTGGACCAAACTCAATCTGTAACAACACTGTTGGGAGTCACAATTGCTCGTGCATGAGTGGATATAATGTAACAGACCCAAACCTCCCTATAACCAGGAACAACACATGTGAAGatataaatgaatgtCAGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATGCCAACTGCACAAATGTAATGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGATTCACTGCAACAAACTCACTTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAGATATAAATGAATGTCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATGCCAACTGCACAAATGTAATGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGGTTCACTGCAACAAACTCACTTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAGATGTGGATGAATGTGTTGAGATATCAGATGTCTGTGGTCCAAACTCAATCTGTAACAACACTGTTGGGAGTCACAATTGCTCGTGCATGAGTGGATATAATGTAACAAACCCAAACCTCCCTATAACCAGGAACAACACATGTGAAGatataaatgaatgtCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATGCCAACTGCACAAATGTAATGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGATTCACTGCAACAAACTCAAGTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAGATGTGGATGAATGTGTTGAGATATCAGATGTCTGTGGACCAAACTCAATCTGTAACAACACTGTTGGGAGTCACAATTGCTCGTGCATGAGTGGATATAATGTAACAGACCCAAACCTCCCTATAACCAGGAACAACACATGTGAAGatataaatgaatgtCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATGCCAACTGCACAAATGTAATGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGGTTCACTGCAACAAACTCACTTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGTAGAGATGTGGATGAATGTGTTGAGATGTCAGATGTCTGTGGTCCAAACTCAATCTGTAACAACACTGTTGGGAGTCACAATTGCTCGTGCATGAGTGGATATAATGTAACAGACCCAAACCTCCCTATAACCAGGAACAACACATGTGAAGatataaatgaatgtCTGTTCAGTTCACCTGTATGTGGTCCAAATTCCAACTGCACAAATGTAATGGGAAGTTATAATTGTTCATGTCTGGATGGATTCAGTGTAACAAACTCAAGTCTCCTCATCAGCAACAATAACACATGCTCAGATATA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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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XR_006247141.1 lncRNA upstream 48755 18449945 ~ 18452116 (-) True LOC122324299
TU206392 lncRNA upstream 48772 18449962 ~ 18452132 (-) False LOC122324299
TU206496 lncRNA upstream 197504 18598694 ~ 18598912 (-) True G139790
XM_043218608.1 mRNA downstream 2906 18354170 ~ 18363861 (-) True LOC122324297
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XM_043220579.1 mRNA downstream 16646 18343463 ~ 18350121 (-) False adgrf3b
XM_043219845.1 mRNA downstream 35715 18325927 ~ 18331052 (-) True pla2g7
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XM_043220536.1 mRNA upstream 4613 18405803 ~ 18409109 (-) True LOC122325498
XM_043220537.1 mRNA upstream 7968 18409158 ~ 18416776 (-) True LOC122325499
XM_043218609.1 mRNA upstream 18601 18419791 ~ 18431680 (-) True LOC122324298
XM_043218607.1 mRNA upstream 30643 18431833 ~ 18447372 (-) False LOC122324295
XM_043218605.1 mRNA upstream 30643 18431833 ~ 18447364 (-) False LOC122324295
XR_006247304.1 other downstream 16645 18343472 ~ 18350122 (-) True adgrf3b
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Expression Profile