RNA id: XM_043219360.1



Basic Information


Item Value
RNA id XM_043219360.1
length 13327
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 12
gene id LOC122324731
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056718.1
NCBI id CM032087.1
chromosome length 27616869
location 5934497 ~ 6031008 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence


taaatctgatCGGTCGGGACTGATTGCCCACACTGTCATTTTGGAAGTGATGAATCAAGTCCATTTGTTCAGACATTGCAGTCAACATCTAGTATATCTACATAGGTTGCCATAGTAATGGCAAAAGCCAAGAACAATGCCAAGAGACTGATGTACAGTAGCCGTCAGTTTGGAAAAGGAGAAAGGAAAACTGTTCATGACATTTTGTCTTGGAACGTTTGAAATACATCAGACAATACATTCTGTTGTTAAATTAAGGTATTTAAGcagcttttataaaaattacttgtaAAAATGTTGCAGGTGTTCATCTTGAGAACCATCttgtcaagttcttccacactgactcagtcaatcatttctttttaaatcttgcTTTCtagcattgtcatgttagaatagaaaaagtGTCCTGttagaagcacacaattccctagaGTATCgttatatgcataaatattatgGTTTGCACTCATGGAAATTACTAAAGTAGTCACGTCTGTTGATCAGAGGGGGTGACTCAATACTGATGGCAATATAGTGTACATTGGAATAAATGGAAGTATAGAAAAACGCAGACTCGTTCTCAGCATTGCGCTTCACACAGATATGAATTCACCAACCCGCAGCATCAACATCAGTATCAGCATCTATTTCAATATGTATCaggcataaaatgtaattaaattgagCCGATTGTCCTGGCATTTTGGGTAACACAACAAATAATCTATTCCGGAAGTTTTGGTGATGCCACGAAATTATCCACACAGAAATAGAAAAcctatttttataatttttctgtCTATCACAGCTATTTAGTACCATATCTGTGTAATTCTCTTGCTGACGCTAACTCTCCTGGGTTTTCTGCAACCATGATGCGTGTGCATCTCGGAAGTGGTCTATACATACACTTTCCAGCTAAAATGAACCATTTAAGCAGTGAAACATTTGTAAATTTTGTACATACTCTACGTTTTGCTGgggtttttaaagattaaatatcTGGTAAGTGGCGCTGAAACATGTAGCCAAATTTTCCCTCCATTGGGACAGAGACAtcttgcagtgtttttattatgtttcttCAGGCATGTATTGTGgtggttcagaattcaaatgtCCGGGGAGTGTCGCTAATAGGCTAATGCTCTTTTGTATTGGAAAATAACAAACCCCCTACAAAATGCATtctaaggattttttttatgatggatgaaAGTTTTGGACGCGTGAAGGACACAACTGGAGGTTGTATTTTTTCTTGAACGTGGGAAAATTTCAGTTTGCAATGACCTCAAGGCTTATTTCATCAAAACTTTGACCCTGTAAATCATACTTTGTgttaaaaagactaaaaagaaCTTGCAGAATTTCTGTCTCTCCCAGCATTaccaaaatattttgtgaagtAAGAATAGAAGCACATTGTAATATAATTGAAGTATAATTGCCAGTGTAATTGAAGAAAGTGCAGAAGTGTAATGCTAAGCTAACAGTTAGATGGGAATCTGCTCTCATATTAACACCAGACACTGTAATCAGCAgtattctgttttaaaattagATCCCACAATAAGCTTGTCAAGacattctgttcttttttttctccaacaCACATTGTAATTGTTAACAACCTAGTGATTAGCATCTCTCCTGTGCGCTAATGTGTTTCCCAAATGGAAATTATGGGCTTCCTAATGTGGCCATCTCAGGTTGTGTCCTCTTCCATCTGTGGTGACAATGatgcagaaatgaaaaaaaaaaaaaacgaaacagtgacatcatcaccatcatcatggTCATACAAGAAAGAGGATTCCTTTTTTAACAGGATCGATTTTTCCCCTCGACTGGATGTGAGGCATGGTTTTGACATTTACAGTGAGAGCAGAATAGATGATAGAGATGAAATAAGAGGAATACAGATTAGTATTCCAGAGCGAGCAGGGGCCAGTGGCAGTCGAGAATCCTGAATCCGGCATCCGGCTCCATGTTTTGCCGTGTGCCAGTGGAGTCCGTGGAAGATGCCGAGATCGCTGCAGAGGAGCTCTAAACGCACAGCTTAACACCAGCGCTGGGGAGATCggctctcctctcctctccactCCTCTGCTCTTGGGGAGGCGACGGGAAAGAGAgacagtagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggggaacaACCAGAAAAACGGGAAAAGATAGAGTagctaggtttttttttgttttttccaggcTGCTCGGACTATCTGCCCGTGTGTGTGAATTttcctgactctctctctctcataactGTCTTCTGGTTTTCCGGGATGGTTTGAAGAAGACTTGTATGTGATGCTTCCTGCACAGAGACCAGCAGTATTCGCCCTGGTCACCATCCCGAGATTTCAATGAGGATAGTAGCCTCGCTCCACCCAGGAACATGAAGGGCTTATCAGGTGGTCGTGCACCGCACCAGATTCCCACACTGCCCCCGTGTGGACTGGCGGAGTGCGAGCATCTTCATGACCTGCATGGCATGCACGTGACGGATCTGCGCCACTCCTACCTGCTCAGCCCCACGGAGACCTGCGCCATGGACTTCCATCATCGGCTCTCCCCCCGCAGCTCCATTCACTCCGATTGCATGATCATGTCACCCGTGGCGCTCACTTCCACTGCCCCCGCCGACCACGTCTCCAGCAGCAcctttcccagaatgcactacAGTTCGCAGTACTATGACCCAGCTGCCCGGGAAGACTGTGCAGCCATCACCACCTCAGCCACATCCGCTGCCGTCGCTGCTGCAACATCTGCCTCTCACCACGTCAGCAGCAAGAGCAACCGCATCCCCGCAAACCTGCTGGACCAGTTCGAAAAACAGCTTCCGCTTCATCGTGACGGCTTCCACACGCTCCAGTACCAACGCACATCTGCCGCCGCTGGTGGGGAGCAGCGCAGCGAGAGCCCCGGTCGCATCCGACACCTGGTGCACTCCGTCCAGAAGCTCTTCACCAAGTCCCACTCACTGGAGGGATCGTCTAAGATGAATGGCACCAAAGGTGAGAGTGGAGGCGGGGGAAGCCATCACCATCACCATGGCAATCATCACTCATCCAAGCATGGCAGCAAGCGCAGTAAAAGCAAGGAGCGTAGGCACCGGTCTGGGACAGGGGGCTGGTGGAGCTCGGATGACAACCTAGACAGCGACAGCACCTACCGTACGGCCAGCGCCTTGAGCCGCCACCACCATGAGCATGTCGGTCACAGTTTCCCAGAATCCATGCACACTCACTTTGGAGACCACTCTCTCAAAACCTCCAAAAGCAACAATGACGTCAAGTGTTCGGCCTGCGAGGGTCTGTCCATGGCACCTGAGGGGAAGTTCATGAAGAGGAGCTCCTGGTCAACACTTACCGTCAGCCAGGCCAAAGAGGCCTACCGAAAGTCCTCCCTAAACCTAGAGAAGCCCATGATGCATCAGGACCTTAAACCATCATTCCGGTCCTCACACTACCTACAGGTGCCTCAGGATGAGTGGGGGGGTTATCCAGGGATTGAGAGGGACGAGGAGATCCCGTGCCGTCGGATGCGTAGCAGTAGTTACGTCAAAGCCATGGGAGACGATGATAGCGGTGAGTCCGATACCAGCCCCAAGACGTCGCCTCAGAAGACTGTGCGTTCCGATGCCCTTGTCCTTAAATCAGCCATGCAGAGGCCACATATAGACACCCAAAGCTCTGGCTACCACTTGCAAACAACAAGAGATATGCGCCCTCACCCCAGCGTGTCTCTGGACCCAGCAACCAACTTCAACCCTCCACAGTTTCGCTCCAGAAACCAGAGCTACATGCGTGCAGTCAGTACCTTCAGTCAGGCAAGCTGTGTCAGCCAGGGGAAGAATCaaagtgagaaagagaaaggaagaggaaAAATTAAGGACTGCTATTCCTGTTTTTGTCTCTCAGGGATCCAGTTTCGTCTCCCTACTGCCTGTAGTGTGGATCGAACAGAAACCCCCACGCCAGCGGTAGTGACATATACACCTGACTACAAGAAGACCCCTCCACCTGTTCCTCCTCGTTCCACCACTAAGCCGCTGATTTCTGTAACGGCCCAGAGCAGCACGGAGTCGACGCAGGACGCGTACCACGAGGGTCGGCCGTCGCGGGGAGGGCTCGGGGCGCCGGATAGCCTCGGCCGGGTTATCTATAACTCCACCGACAGTCTGGATAGCGCAAAAGCGGTGACCCTGGCGATGGAAACCGCATCCAAGCGCCTGGCTTCTGCCGGGAGCTACAGCTCCGTTCAGACCTGCGATAAGGCCATCCTGGTGTCCAAAGCAGAGGAATACCTCAAGACTCCCCGCTCTTCCATCGGGATACAGGTGGAAGCGGCCACAGATTCTGAGACAGATAGTAAAGGTCTCCCACAGTATCAGTCTGTGGGTATCCAGGTGGAGGATGAGAAGAGACTTGGCCGCTTTAAACGGTCCAACAGTGTGACGACGGCAGTTCAGGCCGATTTGGAGCTGGAGGGGTTTCCTTCGACCGAAGACAAAAGTCTGCAGTTTGGAGGATTTCAGAGGCATTCTGAGCCCAGTACTCCCACACAGTACAACGTGGTTCGGACCGTGCGCACACAGGGCCTTTTTAGCTACCGTGAGGATTACAGGCCCTCCAGCGGTCCGCCCAGTCCGCAGCCCGAGCCCTGGCTGGTGGAGCCCGTTCACGAAGCAGCCGAGTCCGGCCGCGTGTCGCCTCTCCGCCGCGACGGAAGCTGGTTCATGCAGCTTCTCCACAGCGAGACTAAACGGTTGGAGGGATGGTGCAAAGACATGGAGCGTGAGGCGGAGGAGCACGACCTGTCGGAGGAGATTCTTGGGAAGATCCGGAGTGCTGTGGGCAGTGCTCACCTCCTCATGTCCCAGAAATTCCAGCAATTTTACTGGTTGTGTCAGCAAAATCTGGACCCCAGCGCTATGCCCCGCCCCACGGCTCAG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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU201458 lncRNA upstream 17960 6048968 ~ 6050633 (-) True G136388
TU201487 lncRNA upstream 97490 6128498 ~ 6145661 (-) True G136398
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TU201576 lncRNA upstream 243746 6274754 ~ 6278064 (-) False G136460
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XM_043219361.1 mRNA downstream 3375 5924066 ~ 5931122 (-) True zpax2
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XM_043219152.1 mRNA downstream 41206 5889481 ~ 5893291 (-) False si:ch211-22i13.2
XM_043220368.1 mRNA upstream 12356 6043364 ~ 6046192 (-) True grcc10
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XM_043220456.1 mRNA upstream 23513 6054521 ~ 6075953 (-) True ylpm1
XM_043219264.1 mRNA upstream 59676 6090684 ~ 6105516 (-) False syt14b
XM_043219258.1 mRNA upstream 59676 6090684 ~ 6105516 (-) False syt14b
XR_006247217.1 other downstream 3375 5924475 ~ 5931122 (-) False zpax2
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TU201577 other upstream 243746 6274754 ~ 6302976 (-) True G136460
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Expression Profile