RNA id: XM_043222225.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043222225.1
length 7829
RNA type mRNA
GC content 0.43
exon number 4
gene id elfn2a
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 7970345 ~ 8065690 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

tctctctctctctctctctctctctctctctctctctcgccagCTCAGTCCGTATCTCCGTCGGTCTGAGTCCTCAGCGCTGGCAAGGGATAATAAACTGCCTTTCCGCAGCAATACGTGGTCAACGGAACAGCCCACAACAGAGTGGACTTTGACAGAAGATTTGGCTGTTTTAAAGGCAGGGTCTTCCCTGGTTGGTGGCGAAGATCTAAGTAAACAAAGCTGTTACTGTGGCACAACTGACCTTTTGGATCTGAgttctactgaaaaaaaaagagaccagAACCATCCAAAAATATCCTATATACAGAGGGGAGTTCAAATTAAACCTTGAATGCTGATTTATTAGAGTGAAAAGTGAAAGAGCGGTTCTTGGGAGGGTAGGTGGCTGGAGCTGTGCCAGTCACGACTGgaaggaggagagagggagCGATAGATAAGACGAGGAAGGAAAGAGCAAGCCTCCTTACATTGCACTCCTTCCACTCTGCTGATGCATAGAAAATGATCCAAAGACTCACAGATTGAAAGCACTGCTCAGCGATTTAAAAGGGGAGCAGTCAAGAAGTCGAAGACCATGAGTTACAGCTGTGGCAAGCAACGCTATAAACCTATAACGCGGACTGCGTAAAATGGGGACTATGTTTGACATTATGGTTCCTGAACAGCTGTGACTGCCCTCAAGACACTTTTTACCCCCAGAACCTGTCTTTGTAATCCTATTGGCCGTCCATCTCCTGTgatcatttttcttattttgagcCCTAACCTCTTTCATTTCCACCTTGGTCAAAACAAATCCAGTTTTTGCTCAAAAATGGCTAGCAGGTTCAGCTTATCGTGTGCTTTTTCACCCTGCTTCCTCATCCTCTCTCTCCCTATTTTTCTCCTCCTTCATGCACCTTCTTTTGTGAGGGGTGACTGCTGGCTAATTGAAGGGGATAAAGGCTATGTGTGGCTGGCAATCTGCAGTCAGAACCAGCCTCCATATGAGACAATCCCACAGCATATTAACAACACCGTCCATGACTTGCGGCTGAATGAAAACAAGCTCAAAGCAATTTTCTTCAGCTCCCTCAGCCGATTCACCAACCTTACTGACCTCAACCTCACCAAGAATGAAATCTCCTACATTGAGGATGGTGCCTTCGCAGGACAGGCCAATCTACAGGTCTTGCAGTTGGGATATAACAAGCTAACCAACCTCACTGAGGGGATGCTGCGAGGGTTGGGTCGAATGCAGTGCCTGTATCTGCAGCATAACCTTATTGAGGTAATTGCAACCAATGCCTTCTGGGAGTGCCCAAGCCTTAGCAGTCTCGATCTTTCCTCTAATAAATTAGCAAGGCTGGATTCATCCACCTTTACTGTTTTGGGTGGACGGCTAATAGTGTGTGAACTGGCTGGAAATCCTTTCCATTGTGGCTGTGAGTTGTATGGCTTCCTTATCTGGCTAGAGGCATTTGACAATGTCACTCACACCTATGACAGGCTCCAGTGTGAGACCCCAAAAGAACTTTTTGGCTACCCTCTCCTGAGCCCTAGAGGTAATCATGGAAGAAATGCTCGTTCTATCCTGTCATCCATGTGTAAGGATGGAGTGATTGTTGGGGGCATAACAGCCCTGCCTCCTGACTTGGACTCTTCTGGGATGGGGATAGATATTTATGATCAGACGGGACCTTATCACCAGCCCACAGCTTCATCAACCACTGACCCAACATACAGCCCCACCATTAAGTTACAAATGGTTTCCCTCTCCTCTGCATCTCTCTTGGTTCAAATACCCAAGCCCTACAGTAAGATGTATATTCTAGTGCAGTATAACCACACCTTTGTGTCAGATGTCATgaacttaaataaaaagaaagagatcGTCAAACTAAACAACCTAATGGCCCACACAAATTACACCTTTTGTGTTGCCTCCATTCGCAATTCCCAGCGGTACAATCACACTTGTTTGTATTTTGCAACTCGGGCTCCAGGGCCCGATAACTTGAGTGCAACCCCTTCTACCACCACCCATTACATTATGACCATTCTAGGCTGCCTGTTTGGGATGGTCATTGTGTTGGGCTTGGTGTACTACTGCTTACGTAGGCGTCGAATGCAGGAGGAAAAGGAAAAGTCTATTAGTGTTAAGAAAACTATCTTAGAGATGCGCTATGGGCCAGAAGCAGCTGCTGCAGCAGCCAAGGACCCTTCAGCCTTGCAGAAACTTCATGACCAGTCTCATCATCAACACCACCACGGCAAGCTGTCCCAGTCAGCATCCTCCAGCTTGGGCGTCCTTCATAGTTCAGCCAATACCACCTCTTCTCGGCTTTCTTCCCTTCCGCAAGTGGAGAAAATGGCTACAGCTTTCTCAGAAGCCATGGCCGCCAATAAGGGCAACTACATGGATGTAAGAACGTCAGCAGGAGGAGAGGAGCGAGTAAGAGATGGAGTTGTAGCAGGGTCAGGGGATGAAATCACAAGGGATGAAAATGGGATTAATGGAGGAGATGACTCTGATGATGATGGCCGAGATTCAACATCGGAGATCTCTACCATTGCCAAGGAGGTGGACAAAGTAAATCAGATTATCAATAATTGCATTGACGCACTCAAACTAGACTCTGTAGCTGTTGTGGCAGCTGCTGCAGCCACTGCAACTACAGCAGATAACACTGCCTCTCCACCACCTCCTAGTGTCCCTTCATTAGCCAGGGGGCTAATTCCACTTTCCCCTACCATCACAGAGACATGCCAGATCATGTCGTCCCCTAAAATCCGTCCTCCACCCCCTGTTCCTCTTGTTTTGCCCCTTTCTGAGCGGCCCGGCATCAGTGGAGGTGGGTTTCTCTCCCCTCCTTACAGGGACCCACCCCCAGCTACAGCATCCCGGCCGTTGCAGAGGCAACTCAGTGCAGATGCTGCAGTTGTTCCTATCAACTCTGTCAAAAATCGCTGCAGCGTTTCTTCCGGAGGCTCTGTCAAAAGTGCTCGGGTCTTCAGTCTGGATGTCCCCGATCCTCGTAGCACAGAGCCATGCAAGTACCCTGAGAAAGGTAGCCCTGTTCGGTGCGGGGAGCCCATGGAGAGGTTGCCCTTAATAGGGGTTCAGGGAGTCAGTAATGGCAGAGGAGATGGTGGCAGCGGGGGTGGAGGGGGAGCCGGTGGTGGCAGTGGTGGTTCGGGTGGGTGTGGTGTTGTGGTCGGAGGTGGGGGCAGCACAGCTCAGCAGCACCACTTGGAGGTGCACCCAGACTACCACTGCTCAGAGCACCGACACTCCTTCCCCGCCCTCTACTATGAGGGTGCCACTGACTCCCCTGCCCAGAAAGTCTCCTTTCTAAAGCCTCTCACTCGCACCAAGAAGGACACTGCCTATTCACAGCTTTCTCCCCGCCACCACAATTACTCAGGGTATTCCTCTAGCCCTGAGTACTCCTCTGAGAGCACGCTTAAAATCTGGGAGCGCTTCCGACCATACAAGAAAAGCCCCCGTGAGGAGGCCTACATAGCCGCTGGCCATGCTCTTCGAAAGAAAGTGCAGTTTGCAAAGGATGAGGATCTCCATGACATTCTGGACTACTGGAAGGGGGTGTCAGCACAGCAGAAACTGTGATACTTGCAAGAGACTTGACAACAGGAGGTGAGGTTGTGGAGAACAGAAACAATGACTCTTGAGACAGCTCGGCAGACTCCATCAGCAGGTGCTTTGGTCCCTATAGGCCACCACAGAGACAAGTGTTCTGAAAGAGACAGAATTAAGCAGGTGTTCCAAGCTCATTAAGGCATAGATAAGCAACCAACCAGAAATGCACAGGAAATGTGGCACTTAAAAAGGCAACCGATTTCAGTTTAGAATCCCTCCATTTTACCTTGTGTACCACCTATGCTCTCTTGCACTGTAGTTTGACAAGATAATAGTCTTAAATGAGGAATTagtggttttattttacaaatgccTGGATATAGTCTCGAGTGACAGTGGTAACTAATGCTTGTCAAGATGATTGTTTTACAATGTTAATTAgtaagaggggaaaaaaaagaaaagtgagtTTCGCTTTGCTGAAGCCACAGGTCAAAACATGGATACCCTGTTCACACCCATTCCCTAATGTTTGTTCAAGCAAAGCATACTCATTGATTTGAGACACCTACTCATATTTTACACAGCATGTGTGGGACAAAGTTAGCAAACCAGAGGCAGCAATTTGGACATGCTTTGTATTTAAGTGTGGAAATTCGATAAAACAGTGTAAATTTCTTTTTGGCATTTGTTTGTGGAAAAACCAGCCTCAAAGacatttttctgttcatttgtaGATACTTCAgacagtttttatttctttctaaaaacagaaagagcaaaATGGGATTTAAGAATGGAAGCTTTGTCTGTTTGGTTTTAAAAGTGGCAGCTAGATATAGACACCAATGTTGTAATAGGCTGACATACACAAGGTTAccattatgtattaaatattgagGCATGTTACACAAAGGGTTTGCTTTGTTTAGCCTATTGGGAGGCAAAATGCCAAAGCTTTACTCAATGACACACTTTCACAAAATGGCAAACCTAATTTGGAAGCTATAATTtcatgaaatgttaaatatataatttcagaaTAACAGTCATACTGGCGTTTGAGTAAAAGTTTTCAATGGCCCGTTAAGCTTCTGACAGGCACAGAAATCCTTGAACAGGCTTCACATAtgtaaaatgcttattttttttaccaccaTTGATTCCACAGAATCCAATGCcatatttgcatttcaattattatttggTCAGGTCTACTTTTATTCAATACCGTAGTAGCTCTGCTGTTATTTCTCCCTATTGATCTGGCCTTCTTTTTCCTGTTAAAGCCCACTCCTCCTGACCTAATGTCGGTTATGGTCAAACTAGGGATGGTATGAAACAAATTCAATTATTTCTCACATCTCATTTTTTAAGACCTTGTTATTGTCCTCACATGGaaaattaattagtaatt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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K17568 ELFN2; protein phosphatase 1 regulatory subunit 29

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
XR_006247569.1 lncRNA downstream 18281 7900588 ~ 7952064 (-) False LOC122327072
XR_006247591.1 lncRNA downstream 18303 7900588 ~ 7952042 (-) False LOC122327072
XR_006247590.1 lncRNA downstream 18362 7900588 ~ 7951983 (-) False LOC122327072
XR_006247579.1 lncRNA downstream 18362 7900588 ~ 7951983 (-) False LOC122327072
XR_006247573.1 lncRNA downstream 22836 7900588 ~ 7947509 (-) False LOC122327072
TU223101 lncRNA upstream 143 8065832 ~ 8066111 (-) True G150735
TU223180 lncRNA upstream 45126 8110815 ~ 8111228 (-) False G150786
TU223182 lncRNA upstream 45126 8110815 ~ 8259777 (-) True G150786
TU223188 lncRNA upstream 45659 8111348 ~ 8259777 (-) False G150786
TU223206 lncRNA upstream 63490 8129179 ~ 8233188 (-) True G150798
XM_043222495.1 mRNA downstream 80460 7661788 ~ 7889885 (-) True lrp1ba
XM_043222494.1 mRNA downstream 308614 7659333 ~ 7661731 (-) True si:dkeyp-122a9.2
XM_043223883.1 mRNA downstream 338644 7629947 ~ 7631701 (-) True LOC122328180
XM_043223375.1 mRNA downstream 347906 7619350 ~ 7622439 (-) True LOC122327777
XM_043223374.1 mRNA downstream 351983 7611390 ~ 7618362 (-) False LOC122327776
XM_043223540.1 mRNA upstream 17751 8083440 ~ 8096442 (-) True mfng
XM_043223885.1 mRNA upstream 94739 8160428 ~ 8166968 (-) True LOC122328182
XM_043222457.1 mRNA upstream 134328 8200017 ~ 8213383 (-) True LOC122327250
XM_043222278.1 mRNA upstream 220683 8286372 ~ 8293208 (-) True tmem264
XM_043222250.1 mRNA upstream 239975 8305664 ~ 8308413 (-) True rpp21
XR_006247718.1 other downstream 351947 7609856 ~ 7618398 (-) False LOC122327776
XR_006247717.1 other downstream 351947 7609856 ~ 7618398 (-) True LOC122327776
TU222808 other downstream 915143 7030307 ~ 7055202 (-) False LOC122327113
TU222752 other downstream 1056787 6906000 ~ 6913558 (-) True G150492
TU222746 other downstream 1100799 6867843 ~ 6869546 (-) False mfsd6a
TU223633 other upstream 818432 8884121 ~ 8886941 (-) True G151107
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XR_006247693.1 other upstream 947859 9013548 ~ 9171929 (-) False nfia
XR_006247696.1 other upstream 947861 9013550 ~ 9171923 (-) False nfia
XR_006247694.1 other upstream 947861 9013550 ~ 9141867 (-) False nfia

Expression Profile