RNA id: XM_043224131.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043224131.1
length 11091
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 7
gene id fignl2
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056721.1
NCBI id CM032090.1
chromosome length 19062720
location 15759885 ~ 15808524 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

cattaaagggaGTACTTTAGTCAATGATAACGAGGATTATAGTGAATATAGCCTACACGACTGACTCGTTGACCTGATAAATAAGATGctgattaaaataacagttgGGCCGAAACTGCGAATCAGCTCGAACTATTCACAGAAGTAGCTTTTAAAGTGGGATTAAAAACACCTAATCGAGCCAATAATTATCCACATTATTGATTATAGGCTGCGTACCTCTTGtcgttttgtaaataaaatacgtATACGCGCGAATTTGAAGTTGGGACTATTACAAGACAAATAGTTATAAAATTcatgtcaaaatattaaaaagttcaaatttAGGCCGGTAATACCTATAACTCCCACAAGGGGGCGTTATTTAACTGATTGTCTTACTAACATAAGGTAATAACGTTTCgcacatttacatgtttttttaattgttttatatcatttaaacgGTGTACAGCACGTTGTTTTGTATAAGCGAGGTTTCATAACATATAGGCTTTCAGCCTTGTATTTGTCATGAAAGCGAGTTGTCGCGTTTATGGTTGCAGTTCATTCAAATATCTGAAGATGGCATAGTTTTTCTTAGTTTTACGCTACCTCTTCAATTCTATTTAGCTGTTCCACTTGTCCAGCCAAGGCCCCGTACTTAATGACTGATTCAAATTCATGAGTCTGTTATTACTGTAAACGTAGAGCTGGAAAAGTGTATGCCAAATTGCCATGGATGTTTAATTCATCTCATGAAATATTGAGTGCATTTCCTCCATTGTCTTGTACCCCAGTCAAAGTCATTACTGGTTGAggtattaattaataatgaatttgtttctgtattttcttctcATTGTGTTTCTACTTTATACAACTAAAAGAATGTTGTGCAGTCCAGGTGTTCATGCATATGTATTCATTACTACATAGcacttgtgtttgtgtttgcttgtgcttgtatttgcatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagagagagagagagagggggtatAGCAATATTAGCACGCGGCGCCTGGATGTCCTTGCTAGATTTGTAATAAGCAGACTGCATGTATTATTCAGGGCTGTGTGGACAGGTCCCACTCTGCTCCATGCTTTCTCGTCCTGGCCTGTCCCCCAGGGACTGCATGCCTAAATTACTATTTCTATTTGATATATTCTCATAGCCCAGCCCTTAAAATGCATAGGAAAAGAATGGTGTGTTGTGTGGGGGTCACTATGTGGCGGTCACTCTGTAGATGTCAGAGGTGGACTAGTGGATACAGATTTCTGCATTATTTTCCCGTGTCACCTTTCTTCGAGTACGCTGATCTGaatatgtcaaaaaaagaaGATTCTGCTTAATTGAATTGTGCCCacaacttattttattattgaatctTCCTGAATAATAAATCCCATGTTGTCCAGTAGCAGACAAGGTGAAATGGTTGGtggctgtttttaatttgatattattttttatctgcTTTCCATAACTGGGTCAGTAAAGAGCGTCCACTCAAGGAAAAggaaaactctttttaaaatctaCACGTGGTCTCGCCAagttatttctatttcattgaatgatttgcatttttaatgctttttacatttttacacatcgCAGATATTCGTTGGGGACATTTATTGACCAAGTtgtgtttgtaaaataatattatttaaaataataaatcaggtTACTTTTTGGCtcaaaagaaacaattattgtCGACTCTTTCATGTGTTCAGGCAGCCCTGAAAAAAGATATGGCTTCTTTTCAAGTAAACATGTTTTAGAGCCTGGAGTAGTTTCATTGGTTTCTCTCCAGATGCTGTTTCATGGCCAGAGCTGTGAGCTAATTACACCTTTGTTGCTAATGTTCCTGCCaataaacactgtaactgaGGTCAATAGTTTAGCCGAgcctttttttctccatttatttGGCCTGTTAATGATAGGATATCAGATTCCGATCTCTTTTTCCTGTTGTGGCCCCTCTTCGCTCCCCTGCTCCCTGCCATAGCCTGAAGGAGTGTGGAGCTGAGGCGAGCATCTGGGCAAGCCTGCTGAATGGGGCCCTTTCTTGCCGAAGCCTGCGGTCCGGCGAACACACAGCAACACACGCGCGCGCTGGCCTAGAGAGAACGGCTCCTATCATAACAACGCTTGGAAGCTCGCTTTTCACATCTCCTCCTTCTTTCCTCGCTAAACTCACACCCTTCCTTTTCTGTCATCTcctcctgttctgttctcaccTTTCACCCTCCCGCTCTCTCCCCCCGGTTCAGCGGTTAAAAAACCTTTCGGGTTTTGGACTGTGTAAATAAAACGGCGAAGATCTCTCGGCCAGAAAGATTTATTGAAATCCGAAGAGGCACGGTGGTCCAGGAGTCTGCCGAAGAGGTCAGATAGATGAAAATGACGAGATCATAAAATGCGGACAATGCtttggaaaggaaaaaaagcctGGATTCATTTGGTTGGGGGTGGGGGCCACGTTCCGCATGCAGTGGGCAGCTGAACTATTGTCTCAGGTTCGAATGATCTCGCAAATGAACAGACTCGTGAAGCCCTGCCCCTAACTGAAGAGCCGGTGCATCCCAAGGTCACATCTTAGGgatagaaatgaaatgaattggAGTAGAAGGACCTCTTATAGCCTGTTCAGATCAAGAACGATGACTAAATGCTTACTATATTAGCGCCCACACTAAAGCATCTTTAAAAGCTCTATAAACGGGAAGCATTTACAGTAGTTTCTGTTGCAGTTACAGAGGACTCCTTATCGTTATCGTCcttggtttaaaaaaagcatttcattttttaaacaaaactcaCTTGTAATATCATCCAAGGtcggtcatgtctttcagattTTTCCTCTAGTTGTGAGAGAAGACACTGCACACCCTTTTGAGCTGAAATCCTGTTAACCCATGACCCATCACTTGACCCAGTGAAGTGTTGGAGGGGACTGAAATCAAGAGTGAAACAATGAAACACTAAGAGTCACAGTCTTTTGCTTAAGTGGGTGAAGGTCTGTGATCAAGGACATTGAAGCAGATCTCTGCCGCCTTACCTGTCAGGCTTCCTGCTTGCTCCTCTACCTCTCACCTATTCCACTTGCGGGGCCATTAAGCTATCACGGACTAGGCTTGGGGGAAATGAAACATTGTCCAGAGCTGAAGGATTCCTGCGTGCTGAGGGGAGGACAGGCGGAGGGAGGGCTGTGTGATAGGATGATGAGGGGCAGACGTGGGGAAAGCGTACTATCAAAGCTGAAGGAATGCAGAAGTAGACTGATGCAGTCTGGAGTTCAGTCTGTCCTCTAAACACCTAATTACAACCAACAGaccagagacagaaagacactCTCCATACGATGACCTCCACACGGCAGTTTGGACAACATTGCTGGAAACTCTCCCATCGGGAAGGAAAATCAGTAACGAGAGACCTTTTAATATCGCTGTTGTTTCTTAACAAAGAGATAACTAGTGAATCATCTGTCATCAGTTCACTCACTattctttgcttttattttgatgagatATTCTGATATTAGTTTTTCTTGTTATAAATAGTAATGCGTAAGGTTTAGAGGCCAGCATAACCTCGTAATAAACTCATCTGAGCTGCTCTCCATACGAGGACAAAATGTCCTTGAGAGAAAATggtaaactgtaaaattattttgctcttttcagGTATGCAGTGGGACGTGACTGAACAATTACTTTGAAGAGTTTAAAGGgttggttcacccaaaaatgaaagcactgtcattaattactgtccctcatgtcgttccaacctgtaagacctttgtttatcttctcaACTACCACTTTTAAGGCTGAGAATGGCAGTAAGgatatcattaaaatagtccatatgaCATCACAGGCTCAGcctaattttatgaagctatgcaAATAATTTCTGTGtaggcaaaacaaaaataatgacttatgTCGGGCTCACACTGTGTgggttttttaacatttttctcagaCGGCCAAATTTCTGTCAGTCTACATTGTGGTATTCTCGTtaacaaacaattacaaaaatataaatcaaaagaCTGACAGGAAAGAGAAGACAGTGAagttgaataaatgcattatttttattttatctgagtttcataaaatgtaggtttaaccactgatgtcacatggaccgTTTTAACAATATCTTTACTAACTTTTTGGGacttgtgtttctgtctgtacaGGGTTAGAAACCACTCAGATTTCACCAagaatatcttcatttgtgttcacaAGATCAAGGTCTACGGGTTTGGAAacacatgaggGAAAGAAGAGGGCACAGAATTATTGGCAGAAGAAGGGTTAACTGAATCAGGAAATGCCACAAGCTGCTCTCAAACATGaaacactttttttacagtCCCAATGCGAGTTCAGGCCAGCGATGGACTACAGCCGTACAGACGCTAACCTGGGTTTCCCTGCAGAACTGTTGCCGTAATCGAGACCAGATCCGCAGAATGCTGAGTCCCATTGTTCCCTATAGCCTATTGAAGATGCACTGGAACCCGGAGCATGCACAGCCCCTGAGCCAGTGGCCTGAGCAGCATTTGGACGTGTCCTCCACCACCTCATCCCCTGCCCACAAGTCAGAGCTCTACCCCAGCCGCAGCCGTAGCTCTTACAGCTACGCCTGGGCAAATGATGACATCTCAGCCCTTACTGCCTCCAACCTGCTGAAGCGCTATGCTGAGAAATACTCTGGCATGCTAGACTCACCATACGAACGCCCTGCTGTGGGCACATACCCTGAACCTGGAGCCTTTGGGGCTCTTAACGGAGGCCAGAAAAGTGAACTGGAACCTTGGCCTCTAACGCACAGCACTGATGGGGGGTATCCCTTGGTGCCTCCTTCTTCTCATGATGGTCTGTCGGGACCAAAGGTGGTTCCAACATCAGCAGGGCCACCAGGTTCAGGCAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
XR_006247888.1 lncRNA downstream 42641 15699771 ~ 15717244 (-) False LOC122329227
XR_006247887.1 lncRNA downstream 42641 15699771 ~ 15717244 (-) False LOC122329227
TU234271 lncRNA downstream 57655 15621942 ~ 15702230 (-) True LOC122329227
TU234287 lncRNA downstream 78013 15680886 ~ 15681872 (-) True G158188
TU234264 lncRNA downstream 152805 15603848 ~ 15607080 (-) True G158174
TU234328 lncRNA upstream 3757 15812281 ~ 15812927 (-) True G158208
TU234357 lncRNA upstream 156229 15964753 ~ 15965763 (-) True G158227
TU234368 lncRNA upstream 199582 16008106 ~ 16008915 (-) False G158231
TU234426 lncRNA upstream 293101 16101625 ~ 16102214 (-) True G158282
TU234428 lncRNA upstream 309357 16117881 ~ 16118214 (-) True G158284
XM_043224130.1 mRNA downstream 3819 15737601 ~ 15756066 (-) False stat6
XM_043224128.1 mRNA downstream 3819 15737601 ~ 15756066 (-) False stat6
XM_043224129.1 mRNA downstream 3889 15737601 ~ 15755996 (-) True stat6
XM_043225119.1 mRNA downstream 35883 15719258 ~ 15724002 (-) False dtx3
XM_043225121.1 mRNA downstream 35883 15719258 ~ 15724002 (-) False dtx3
XM_043225011.1 mRNA upstream 6185 15814709 ~ 15860823 (-) False scn8aa
XM_043225006.1 mRNA upstream 6185 15814709 ~ 15860823 (-) False scn8aa
XM_043225012.1 mRNA upstream 6185 15814709 ~ 15860823 (-) False scn8aa
XM_043225007.1 mRNA upstream 6185 15814709 ~ 15860823 (-) False scn8aa
XM_043225010.1 mRNA upstream 6185 15814709 ~ 15860270 (-) True scn8aa
TU234273 other downstream 42635 15699269 ~ 15717250 (-) False LOC122329227
TU234274 other downstream 42635 15699269 ~ 15717250 (-) False LOC122329227
XR_006247853.1 other downstream 285508 15347417 ~ 15474377 (-) False magi3a
TU233895 other downstream 1170292 14581094 ~ 14589593 (-) True fitm2
TU233846 other downstream 1429101 14326966 ~ 14330784 (-) True G157909
TU234366 other upstream 199582 16008106 ~ 16008915 (-) True G158231
TU234433 other upstream 335309 16143833 ~ 16169834 (-) True G158288
TU234490 other upstream 432286 16240810 ~ 16243395 (-) True tac3a
TU234495 other upstream 549128 16357652 ~ 16358705 (-) False G158336
TU234864 other upstream 1368128 17176652 ~ 17179779 (-) False slc48a1a

Expression Profile