RNA id: XM_043225878.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043225878.1
length 11994
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 6
gene id LOC122329559
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 12571028 ~ 12661848 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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XR_006250458.1 lncRNA downstream 300092 12267862 ~ 12270936 (-) False LOC122341243
XR_006250459.1 lncRNA downstream 300094 12267862 ~ 12270934 (-) False LOC122341243
TU28999 lncRNA downstream 300135 12265845 ~ 12270893 (-) True LOC122341243
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TU29346 lncRNA upstream 202462 12864310 ~ 12865162 (-) True G19677
TU29260 lncRNA upstream 238933 12900781 ~ 12902910 (-) True G19672
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XM_043235563.1 mRNA downstream 30866 12530109 ~ 12540162 (-) False sgsm3
XM_043235566.1 mRNA downstream 30870 12530109 ~ 12540158 (-) False sgsm3
XM_043228204.1 mRNA upstream 20142 12681990 ~ 12763090 (-) True cacna1aa
XM_043229414.1 mRNA upstream 312860 12974708 ~ 12980093 (-) True LOC122332086
XM_043229457.1 mRNA upstream 421361 13083209 ~ 13083734 (-) True LOC122332149
XM_043234627.1 mRNA upstream 445983 13107831 ~ 13111379 (-) True LOC122341259
XM_043234774.1 mRNA upstream 469088 13130936 ~ 13134638 (-) False yipf2
XR_006250490.1 other downstream 650261 11913002 ~ 11920767 (-) False LOC122341756
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unassigned_transcript_280 other upstream 388438 13050286 ~ 13050861 (-) True LOC122332129

Expression Profile