RNA id: XM_043231950.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043231950.1
length 9955
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 2
gene id amigo3
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_025048114.1
NCBI id JAEQBD010000459.1
chromosome length 1423374
location 516883 ~ 528275 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K22529 AMIGO; amphoterin-induced protein

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU271710 lncRNA upstream 320294 186016 ~ 196589 (+) True G183212
TU271695 lncRNA upstream 441481 70263 ~ 75402 (+) True G183199
TU271682 lncRNA upstream 456128 47764 ~ 60755 (+) True nicn1
TU271683 lncRNA upstream 461215 54831 ~ 55668 (+) True G183189
TU271680 lncRNA upstream 469202 46644 ~ 47681 (+) False nicn1
TU271786 lncRNA downstream 63326 590365 ~ 590995 (+) True G183263
TU271783 lncRNA downstream 65221 592260 ~ 592520 (+) False G183263
TU271787 lncRNA downstream 66347 593386 ~ 593809 (+) True G183264
TU271791 lncRNA downstream 71689 598728 ~ 605197 (+) True G183268
XR_006248711.1 lncRNA downstream 86813 613852 ~ 616200 (+) True LOC122334030
XM_043231928.1 mRNA upstream 402667 106885 ~ 114216 (+) True LOC122334037
XM_043231929.1 mRNA upstream 456124 47425 ~ 60759 (+) False nicn1
XM_043231888.1 mRNA downstream 172206 699245 ~ 715085 (+) True LOC122334017
XM_043231892.1 mRNA downstream 172206 699245 ~ 715085 (+) False LOC122334017
XM_043231890.1 mRNA downstream 172206 699245 ~ 715085 (+) False LOC122334017
XM_043231891.1 mRNA downstream 172206 699245 ~ 715085 (+) False LOC122334017
XM_043231889.1 mRNA downstream 172206 699245 ~ 715085 (+) False LOC122334017
TU271886 other downstream 222821 749860 ~ 752052 (+) True G183328
unassigned_transcript_2690 other downstream 231185 758224 ~ 758295 (+) True trnag-ucc_28
TU271863 other downstream 256245 783284 ~ 786940 (+) True G183316
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TU272093 other downstream 726912 1253951 ~ 1258660 (+) True G183477

Expression Profile